外文數據庫認識PubMed——讓它融入您的科研認識PubMed——讓它融入您的科研日期時間地點批次內容1．3（星期五）第3-5節圖書館（三四樓電子閱覽室）12013010001～2013020079外文數據庫實習1．3（星期五）第6-8節圖書館（三四樓電子閱覽室）22013020080～2013040154外文數據庫實習1.5（星期日）8:30-11:00圖書館（三四樓電子閱覽室）3

2013040155～2013060241外文數據庫實習1.5（星期日）15:00-17:30圖書館（三四樓電子閱覽室）42013060242～2013060325外文數據庫實習郵箱：gdmcwxjs@126.com密碼：wxjs123456聯系QQ：1580123718電話：2388565一、

認識PubMed二、PubMed

檢索入門三、PubMed高級檢索四、PubMed醫學主題詞表檢索五、PubMed其他功能六、PubMed個性化服務認識PubMed——讓它融入您的科研標引質量高更新速度快信息量大使用方便選擇PubMed的n個理由一、認識PubMed網址：/pubmed

或/pubmed

或(com;org;net)由美國國立醫學圖書館（NationalLibraryofMedicine-

NLM）國家生物技術信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation-NCBI）向因特網用戶提供免費MEDLINE檢索服務一、認識PubMed一、認識PubMed收錄從1946年至今80多個國家和地區37種文字的5400多種生物醫學期刊上的文獻2000多萬條。每日更新（周二到周六），每天增加2000－4000

條完整記錄。PUBMED中90%的原文為英文文獻，79%有英文摘要。PubMedABDCMedlineOldMedlineIn

Process

CitationsRecordsuppliedbypublisher一、認識PubMedPUBMED收錄的文獻包括4個數據庫：

概況

A:Medline

是NLM最主要的文獻數據庫，覆蓋了醫學、獸醫、衛生等各個學科。收錄1966年以來生物醫學期刊上的文獻。該數據庫文獻的標識為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。

認識PubMed——讓它融入您的科研

B:OldMedline

收錄1946年至1965年期間發表的200萬篇生物醫學文獻，標識為[PubMed-OldMedline]。

認識PubMed——讓它融入您的科研目前通過PubMed可查到的最早文獻為1809年出版的Medico-chirurgicaltransactions上的文獻，且為免費全文。/pmc/articles/PMC2128800/?page=1

C：InProcessCitationsPubMED中每天增加的數據先放在此庫，新記錄只提供基本的題錄信息和文摘，沒有標引主題詞，其標識為：[PubMed-inprocess]。

InProcessCitations中的數據經標引部門標引后再加入到Medline數據庫之中。標識改為：[PubMed-indexedforMEDLINE]。D:Publisher-SuppliedCitations此外，出版商在印刷版期刊出版之前向PUBMED傳送的電子版內容將顯示[Epubaheadofprint]標識。由出版商以電子版形式直接傳送到PubMed，標識為：[PubMed-assuppliedbypublisher]，大部分出版商提供的文獻處于正在加工狀態，經標引后加入到MEDLINE中。此外，還有少部分出版商提供的文獻不進行標引，保持[PubMed-assuppliedbypublisher]標識或[PubMed]標識。認識PubMed——讓它融入您的科研PMID（PubMed唯一標識碼，PubMedUniqueIdentifier）PUBMED收錄的文獻均有PMID，作為PUBMED與其他數據庫聯系的標識及查找全文的標記。檢索提問區文獻匹配臨床咨詢特定主題咨詢期刊檢索主題檢索高級檢索一、認識PubMed二、PubMed檢索入門1.檢索字段及標識符2.邏輯運算3.自動匹配功能4.截詞檢索和禁用詞5.限定字段檢索6.短語檢索7.檢索結果二、PubMed檢索入門1.檢索字段及標識符21電子出版日期文獻出版日期數據加入PubMed日期文獻勘誤參考文獻勘誤全部著者姓名全部調研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻相關注釋基金編號基因符號期編號資助調研者資助調研單位國際標準期刊號美國立醫學圖書館識別號期刊全稱22最后修訂日期主題詞表詞規范詞確立日期系統組織的文摘版權擁有者題錄提供機構的識別號病史相關與原始記錄其他關鍵詞提供其他關鍵詞的機構數據提供者機構文章總頁數出版商提供數據時間期刊出版國數據庫文獻編號23作為主題詞的個人姓名出版狀態文獻類型出版模式（紙張或電子）參考文獻數已撤回的文獻酶或化學物質代碼正在撤消中的文章初版文獻修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數據二次文獻數據庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻內部處理代碼標準期刊縮寫文獻標題翻譯標題更新文獻文獻正在更新期刊卷號2.邏輯運算多個檢索詞間需用邏輯運算符號組配。

邏輯運算符AND、OR、NOT必須大寫系統將“空格”默認為ANDVitaminc

coldVitamincANDcold在多個檢索詞間可使用布爾邏輯運算符“AND”、“OR”、“NOT”，需注意的是，邏輯運算符的優先順序為從左向右，可通過加括號提高運算的優先級。維生素C或維生素E與癌癥的關系1.VitaminCORvitaminEANDcancer2.(VitaminCORvitaminE)ANDcancer3.CancerAND(VitaminCORvitaminE)4.CancerANDVitaminCORvitaminE3.自動匹配功能(AutomaticTermMapping,ATM)對于輸入檢索框中未加標識的檢索詞，PubMed依次在下列詞表中查找匹配的內容：MeSHtranslationtableMeSH轉換表Journalstranslationtable刊名轉換表

Phraselist短語詞表

Authorindex作者及合作者索引當用戶在基本檢索界面輸入檢索詞時，PubMed在后臺將檢索詞依次到上面轉換表中進行詞語的核對，如果在第一個表中查不到相應的詞，則到第二個表中檢索，至到找到為止。

如果在上述幾個表中都找不到匹配的短語，系統將短語拆開，繼續到這四個表中搜索，短語斷開部分為AND關系。

如果拆到的單詞在上述幾個表中還是找不到匹配詞，將到所有字段中去搜索這些單詞，單詞之間的邏輯關系也是AND

Searchdetails:"ascorbicacid"[MeSHTerms]OR("ascorbic"[AllFields]AND"acid"[AllFields])OR"ascorbicacid"[AllFields]OR"vitaminc"[AllFields]如不滿意，可修改再search二、PubMed檢索入門4.截詞檢索和禁用詞截詞符：*一般只作“后截斷”使用，表示0-N個字符。

如：輸入treat*

檢出treatment、treats、treated、treating等截詞符：？一般只作“后截斷”使用，表示0-1個字符。

備注：-

不執行自動匹配功能；

-截詞檢索只限于單詞，對詞組無效.PubMed在檢索時忽略一些常用的英語詞匯，下表為禁用詞列表二、PubMed檢索入門5.限定字段檢索檢索詞[字段名]

例：著者檢索(authors)：-姓全稱在前，名首字母在后

JohnSmithSmithJ-以AU作為限定字段 如：CooperSL[au]，”CopperSL”[au]

YaoKT[au]（姓在前，名縮寫在后）二、PubMed檢索入門期刊檢索（journals）：-刊名全稱檢索 例：NewEnglandJournalofMedicine[so]-MEDLINE認可的標準刊名縮寫檢索 例：NEnglJMed[so]-國際標準期刊號檢索 例：0028-4793[so]二、PubMed檢索入門例：檢索JosephLeventhal研究干細胞移植的文獻直接輸入檢索式：Stemcelltransplantation

ANDLeventhalJ[AU]二、PubMed檢索入門6.短語檢索對于輸入PubMed的多詞詞組，由于英文單詞間存在“空格”，PubMed會默認運算“AND”，則將其拆分成單個詞，分別進行檢索并以AND進行組配，如：singlecell相當于檢索singleANDcell。若不想進行邏輯組配，可通過加“”強制將其作為一個詞組進行檢索：如：“singlecell”

使用“”后，系統不進行自動轉換匹配和擴展檢索。二、PubMed檢索入門二、PubMed檢索入門7.檢索結果文獻類型分類顯示設置FreeArticle:提供免費全文的鏈接。FreePMCArticle:PUBMED提供的完全免費的全文鏈接。二、PubMed檢索入門PMC(PubMedCentral，公共醫學中心)生命科學期刊資源中心免費提供約1199種期刊的200多萬篇全文/pmc/二、PubMed檢索入門認識PubMed——讓它融入您的科研二、PubMed檢索入門三、PubMed高級檢索三、PubMed高級檢索限定字段檢索Searchingbyaspecificfield三、PubMed高級檢索Searchingbyaspecificfield三、PubMed高級檢索可選擇邏輯運算符增加一行或減少一行系統會根據輸入，生成檢索式，通過edit修改。檢索歷史History-Combiningsearchesusinghistory檢索史按檢索式運行的順序列出各檢索式，包括檢索式序號、檢索策略、檢索時間、檢索到的文獻條數。檢索史最多保存100條檢索式，檢索史將在離開PubMed或其他Entrez數據庫8小時后消失。

三、PubMed高級檢索三、PubMed高級檢索History-Combiningsearchesusinghistory

點擊檢索式序號將彈出一選項菜單，提供的選項包括布爾邏輯操作符AND,OR,NOT,點擊相應的操作符菜單，將把該條檢索策略加入到檢索框中，并與檢索框中現有的檢索式進行選中的邏輯組配。

三、PubMed高級檢索History-Combiningsearchesusinghistory認識PubMed——讓它融入您的科研文獻太多，如何保證查全和查準？四、PubMed醫學主題詞表檢索何為MeSH？MeSH是MedicalSubjectHeadings的縮略詞，即醫學主題詞，是用規范化的醫學術語來描述生物醫學概念。論述文獻中心的主題詞稱主要主題詞論述主題某一方面的內容的詞稱為副主題詞

4.1MeSHDatabase的運用四、PubMed醫學主題詞表檢索詞義解釋四、PubMed醫學主題詞表檢索副主題詞四、PubMed醫學主題詞表檢索組建檢索式：1.先addtosearchbuilder2.Searchpubmed認識PubMed——讓它融入您的科研五、PubMed其他功能實現單篇文章的一對一檢索實現多篇文章的一次性檢索一次最多可檢索PubMed中100條文獻紀錄,獲得文獻的PMID認識PubMed——讓它融入您的科研

選擇相應類別選擇檢索范圍檢索結果更加貼近臨床的需要五、PubMed其他功能認識PubMed——讓它融入您的科研限定于各類不同的醫學臨床主題進行檢索五、PubMed其他功能認識PubMed——讓它融入您的科研實現PubMed與核酸和蛋白質序列數據庫、基因組數據庫、分類學數據、圖書等數據庫之間的多向鏈接,多向查詢五、PubMed其他功能認識PubMed——讓它融入您的科研與PubMed建立聯系的網站，如某篇文獻所對應期刊的出版商，文獻全文、相關數據庫及網站等。五、PubMed其他功能認識PubMed——讓它融入您的科研五、PubMed其他功能認識PubMed——讓它融入您的科研eUtils(EntrezProgrammingUtilities)

通過eUtils這個程序設計模塊,可以通過我們自己設計的應用程序平臺,獲取NCBI數據庫的數據,從而實現這些數據資源的深度開發使用。實現自動化的大批量的從Entrez數據庫下載數據。并且提供了幾種常用的語言以供選擇，像Perl,Python,Java,和C++等。五、PubMed其他功能認識PubMed——讓它融入您的科研免費期刊的獲取PubMed提供了免費全文期刊網址

PubmedCentral

/pmc/journals/向作者索要作者主頁

五、PubMed其他功能認識PubMed——讓它融入您的科研六、PubMed的個性化服務認識PubMed——讓它融入您的科研保存檢索式(生成URL或HTML實現共享)檢索結果的分類過濾特定功能的參數設置六、PubMed的個性化服務認識PubMed——讓它融入您的科研經由2000多位專家學者的評價推薦，提供目前世界上最重要的生物學論文資訊及研究趨勢。特色是收錄每篇具有科學價值的文獻，而不考慮這些文獻在哪在些期刊里發表PubMed里檢索出最核心的文獻——Facultyof1000與pubmed的完美結合六、PubMed的個性化服務認識PubMed——讓它融入您的科研PubMed快速檢索功能的實現NCBISearchToolkit安裝NCBISearchToolkit劃詞右擊直接進行pubmed檢索六、PubMed的個