序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析怎樣思想，就有怎樣的生活序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析怎樣思想，就有怎樣1第五章序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析第五章2警相似性和同源性關系序列的相似性和序列的同源性有一定的關系,一般來說序列間的相似性越高的話,它們是同源序列的可能性就更高,所以經(jīng)常可以通過序列的相似性來推測序列是否同源正因為存在這樣的關系,很多時候對序列的相似性和同源性就沒有做很明顯的區(qū)分,造成經(jīng)常等價混用兩個名詞。所以有出現(xiàn)A序列和B序列的同源性為80%說警相似性和同源性關系3餐序列相似性比較和序列同源性分析序列相似性比較:將待研究序列與DNA或蛋白質(zhì)序列庫進行比較,用于確定該序列的生物屬性,也就是找出與此序列相似的已知序列是什么。完成這一工作只需要使用兩兩序列比較算法。常用的程序包有BLASTFASTA等餐序列相似性比較和序列同源性分析4序列同源性分析:將待研究序列加入到一組與之同源但來自不同物種的序列中進行多序列同時比較,以確定該序列與其序列間的同源性大小。這是理論分析方法中最關鍵的一步。完成這作須使用多序列比較算法。常用的程序包有CLUSTAI等序列同源性分析:5Blas程序BLAST是一個基于序列相似性的數(shù)據(jù)庫搜索程序。是“局部相似性基本査詢工具”(BasiclocalAlignmentSearchTool的縮寫。Blast是一個序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多個獨立的程序,這些程序是根據(jù)查詢的對象和數(shù)據(jù)庫的不同來定義的。Blas程序6Blas程序的選擇Blast是一個序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多個獨立的程序這些程序是根據(jù)查詢的對象和數(shù)據(jù)庫的不同來定義的Blas程序的選擇7主要的blast程序程序名查詢序列數(shù)據(jù)庫搜索方法Blastn核酸核酸核酸序列搜索逐一核酸數(shù)據(jù)庫中的序列Blastp蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)序列搜索逐一蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的序列Blastx核酸蛋白質(zhì)核酸序列6框翻譯成蛋白質(zhì)序列后和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的序列逐一搜索「Tblastn蛋白質(zhì)核酸蛋白質(zhì)序列和核酸數(shù)據(jù)庫中的核酸序列6框翻譯后的蛋白質(zhì)序列逐一比對TBlastx核酸核酸核酸序列6框翻譯成蛋白質(zhì)序列,再和核酸數(shù)據(jù)庫中的核酸序列6框翻譯成的蛋白質(zhì)序列逐一進行比對主要的blast程序8Blas資源主站點:/blaSt/(i網(wǎng)絡版)ftp:/ftp,ncbi.nlm./blast/(單機版)Blas資源9其他站點:/blast/nema.cap.ed.ac.uk/ncbi_blast.html其他站點:10Blast結果Blast結果會列出跟查詢序列相似性比較高符合限定要求的序列結果,根據(jù)這些結果可以獲取以下一些信息。查詢序列可能具有某種功能查詢序列可能是來源于某個物種查詢序列可能是某種功能基因的同源基因Blast結果11序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件12序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件13序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件14序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件15序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件16序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件17序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件18序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件19序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件20序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件21序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件22序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件23序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件24序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件25序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件26序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件27序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件28序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件29序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件30序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件31序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件32序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件33序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件34序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件35序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件36序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件37序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件38序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件39序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件40序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件41序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件42序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件43序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件44序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件45序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件46序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件47序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件48序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件49序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件50序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件51序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件52序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件53序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件54序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件55序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件56序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件57序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件58序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件59序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件60序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件61序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件62序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件63序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件64序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件65序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件66序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件67序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件68序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件69序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件70序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件71序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件72序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件73序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件74序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件75序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件76序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件77序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件78序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件79序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件80序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件81序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件82謝謝！21、要知道對好事的稱頌過于夸大，也會招來人們的反感輕蔑和嫉妒。——培根

22、業(yè)精于勤，荒于嬉；行成于思，毀于隨。——韓愈

23、一切節(jié)省，歸根到底都歸結為時間的節(jié)省。——馬克思

24、意志命運往往背道而馳，決心到最后會全部推倒。——莎士比亞

25、學習是勞動，是充滿思想的勞動。——烏申斯基供婁浪頹藍辣襖駒靴鋸瀾互慌仲寫繹衰斡染圾明將呆則孰盆瘸砒腥悉漠塹脊髓灰質(zhì)炎(講課2019)脊髓灰質(zhì)炎(講課2019)謝謝！21、要知道對好事的稱頌過于夸大，也會招來人們的反感輕83序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析怎樣思想，就有怎樣的生活序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析怎樣思想，就有怎樣84第五章序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析第五章85警相似性和同源性關系序列的相似性和序列的同源性有一定的關系,一般來說序列間的相似性越高的話,它們是同源序列的可能性就更高,所以經(jīng)常可以通過序列的相似性來推測序列是否同源正因為存在這樣的關系,很多時候對序列的相似性和同源性就沒有做很明顯的區(qū)分,造成經(jīng)常等價混用兩個名詞。所以有出現(xiàn)A序列和B序列的同源性為80%說警相似性和同源性關系86餐序列相似性比較和序列同源性分析序列相似性比較:將待研究序列與DNA或蛋白質(zhì)序列庫進行比較,用于確定該序列的生物屬性,也就是找出與此序列相似的已知序列是什么。完成這一工作只需要使用兩兩序列比較算法。常用的程序包有BLASTFASTA等餐序列相似性比較和序列同源性分析87序列同源性分析:將待研究序列加入到一組與之同源但來自不同物種的序列中進行多序列同時比較,以確定該序列與其序列間的同源性大小。這是理論分析方法中最關鍵的一步。完成這作須使用多序列比較算法。常用的程序包有CLUSTAI等序列同源性分析:88Blas程序BLAST是一個基于序列相似性的數(shù)據(jù)庫搜索程序。是“局部相似性基本査詢工具”(BasiclocalAlignmentSearchTool的縮寫。Blast是一個序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多個獨立的程序,這些程序是根據(jù)查詢的對象和數(shù)據(jù)庫的不同來定義的。Blas程序89Blas程序的選擇Blast是一個序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多個獨立的程序這些程序是根據(jù)查詢的對象和數(shù)據(jù)庫的不同來定義的Blas程序的選擇90主要的blast程序程序名查詢序列數(shù)據(jù)庫搜索方法Blastn核酸核酸核酸序列搜索逐一核酸數(shù)據(jù)庫中的序列Blastp蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)序列搜索逐一蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的序列Blastx核酸蛋白質(zhì)核酸序列6框翻譯成蛋白質(zhì)序列后和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的序列逐一搜索「Tblastn蛋白質(zhì)核酸蛋白質(zhì)序列和核酸數(shù)據(jù)庫中的核酸序列6框翻譯后的蛋白質(zhì)序列逐一比對TBlastx核酸核酸核酸序列6框翻譯成蛋白質(zhì)序列,再和核酸數(shù)據(jù)庫中的核酸序列6框翻譯成的蛋白質(zhì)序列逐一進行比對主要的blast程序91Blas資源主站點:/blaSt/(i網(wǎng)絡版)ftp:/ftp,ncbi.nlm./blast/(單機版)Blas資源92其他站點:/blast/nema.cap.ed.ac.uk/ncbi_blast.html其他站點:93Blast結果Blast結果會列出跟查詢序列相似性比較高符合限定要求的序列結果,根據(jù)這些結果可以獲取以下一些信息。查詢序列可能具有某種功能查詢序列可能是來源于某個物種查詢序列可能是某種功能基因的同源基因Blast結果94序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件95序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件96序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件97序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件98序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件99序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件100序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件101序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件102序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件103序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件104序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件105序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件106序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件107序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件108序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件109序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件110序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件111序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件112序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件113序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件114序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件115序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件116序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件117序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件118序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件119序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件120序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件121序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件122序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件123序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件124序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件125序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件126序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件127序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件128序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件129序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件130序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件131序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件132序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件133序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件134序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件135序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件136序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件137序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件138序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件139序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件140序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件141序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件142序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件143序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件144序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件145序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件146序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件147序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件148序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件149序列的同源性比較及分子系統(tǒng)學和分子進化分析共83課件150