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文檔簡介

1、H松巨盹臼了 1幷干是為I魁怪合話前舟恥啟虐,E垛凰【話的盤格自I SD5-FAGE &TWSIU 下層肢h不同遙盧的d$_pge狩窗胺的曇桂好曲范因=5口占GE分蛋底般度50 150KD嚥底30-QtOkD20-BOO訛腹T2-60k315%藪注!如舷制菲匪性險 彗都肉菽宵彷,刃蔑肢申不加10%SDSPr可配融用冼怪FAftFfo.SDS勒膠的有效分離范闔丙烯聯胺濃度L512.5107.55,01乩上業ThZOkDaLfi-lcDa30-J20kDa60-212 kDa1.配膠緩沖液系統對電泳的影響?在SDS- PAG環連續電泳中,制膠緩沖液使用的是 Tris HCL緩沖系統,濃縮膠是,分離

2、膠; 而電泳緩沖液使用的 Tris -甘氨酸緩沖系統。在濃縮膠中,其pH環境呈弱酸性,因此甘氨酸解離很少,其在電場的作用下,泳動效率低;而CL離子卻很高,兩者之間形成導電性較低的區帶,蛋白分子就介于二者之間泳動。 由于導電性與電場強度成反比, 這一區帶便形成 了較高的電壓剃度, 壓著蛋白質分子聚集到一起,濃縮為一狹窄的區帶。 當樣品進入分離膠后,由于膠中pH的增加,呈堿性,甘氨酸大量解離,泳動速率增加,直接緊隨氯離子之后, 同時由于分離膠孔徑的縮小,在電場的作用下,蛋白分子根據其固有的帶電性和分子大小進行分離。所以,pH對整個反應體系的影響是至關重要的,實驗中在排除其他因素之后仍不能很好解 決

3、問題的情況,應首要考慮該因素。2樣品如何處理?工根據樣品分離目的不同,主要有三種處理方法:還原 SDS處理、非還原SDS處理、帶有烷基化作用的還原SDS處理。1)還原SDS處理:在上樣buffer中加入SDS和 DTT (或 Beta巰基乙醇)后,蛋白質構象被解離,電荷被中和,形成 SDS與蛋白相結合的分子,在電泳中,只根據分子量來分離。一 般電泳均按這種方式處理,樣品稀釋適當濃度,加入上樣Buffer,離心,沸水煮5min,再離心加樣。2)帶有烷基化作用的還原 SDS處理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并經久牢固的保護SH基團,得到較窄的譜帶;另碘乙酸胺可捕集過量的 DTT,而防止銀染時的紋

4、理現象。100ul 樣品緩沖液中10ul 20 %的碘乙酸胺,并在室溫保溫30min。3) 非還原SDS處理:生理體液、血清、尿素等樣品,一般只用1 %SDS沸水中煮3min,未 加還原劑,因而蛋白折疊未被破壞,不可作為測定分子量來使用。SDS電泳凝膠中各主要成分的作用?聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺與為蛋白質電泳提供載體,其凝固的好壞直接關系到電泳成功與否,與促凝劑及環境密切相關;制膠緩沖液:濃縮膠選擇,分離膠選擇,選擇tris HCL系統,TEMED與 AP AP提供自由基,TEMED是催化劑,催化自由基引起的聚合反應進行;十二烷基硫酸鈉(SDS :陽離子去污劑,作用有四:去蛋白質電荷、解離蛋

5、白質之間的氫鍵、取消蛋白分子內的疏水作用、 去多肽折疊。提高SDS電泳分辨率的途徑?聚丙烯酰胺的充分聚合, 可提高凝膠的分辨率。建議做法:待凝膠在室溫凝固后,可在室溫下放置一段時間使用。忌即配即用或4度冰箱放置,前者易導致凝固不充分,后者可導致SDS結晶。一般凝膠可在室溫下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。一般常用的有氨基黑、考馬斯亮藍、銀染色三種染料,不同染料又各自不同的染色方法,具體可參照郭堯君編著的蛋白質電泳技術手冊P82-103。5“微笑”(兩邊翹起中間凹下)形帶原因?主要是由于凝膠的中間部分凝固不均勻所致,多出現于較厚的凝膠中。 處理辦法:待其充分凝固再作后續實驗?!鞍櫭迹▋蛇呄蛳轮?/p>

6、間鼓起)形帶原因? 主要出現在蛋白質垂直電泳槽中,一般是兩板之間的底部間隙氣泡未排除干凈。 處理辦法:可在兩板間加入適量緩沖液,以排除氣泡。為什么帶出現拖尾現象?主要是樣品融解效果不佳或分離膠濃度過大引起的。處理辦法:加樣前離心;選擇適當的樣品緩沖液, 加適量樣品促溶劑;電泳緩沖液時間過長, 重新配制;降低凝膠濃度。為什么帶出現紋理現象? _ 主要是樣品不溶性顆粒引起的。處理辦法:加樣前離心;加適量樣品促溶劑。什么是“鬼帶”,如何處理?“鬼帶”就是在跑大分子構象復雜的蛋白質分子時,常會出現在泳道頂端(有時在濃縮膠中)的一些大分子未知條帶或加樣孔底部有沉淀,主要由于還原劑在加熱的過程中被氧化而失

7、去活性,致使原來被解離的蛋白質分子重新折疊結合和亞基重新締合,聚合成大分子,其分子量要比目標條帶大,有時不能進入分離膠。但它卻于目標條帶有相同的免疫學活性,在WB反應中可見其能與目標條帶對應的抗體作用。處理辦法:在加熱煮沸后,再添加適量的DTT或Beta巰基乙醇,以補充不足的還原劑;或可加適量EDTA來阻止還原劑的氧化。為什么溴酚藍不能起到指示作用? 2我們在實驗中常會遇到溴酚藍已跑出板底,但蛋白質卻還未跑下來的現象。主要與緩沖液和分離膠的濃度有關。處理辦法:更換正確 pH值的Buffer ;降低分離膠的濃度。為什么電泳的條帶很粗?電泳中條帶很粗是常見的事,主要是未濃縮好的原因。處理辦法:適當

8、增加濃縮膠的長度;保證濃縮膠貯液的pH正確();適當降低電壓;為什么電泳電壓很高而電流卻很低呢?這種現象一般初學者易出現。 比如電壓50v以上,可電流卻在5mA以下。主要是由于電泳槽 沒有正確裝配,電流未形成通路。包括: a.內外槽裝反;b.外槽液過少;c.電泳槽底部的絕 緣體未去掉(比如倒膠用的橡膠皮)。處理辦法:電泳槽正確裝配即可。濃縮膠與分離膠斷裂、板間有氣泡對電泳有影響嗎?這主要出現在初學者中, 一般對電泳不會有太大的影響。前者主要原因是拔梳子用力不均勻或過猛所致;后者是由于在解除制膠的夾子后,板未壓緊而致空氣進入引起的。凝膠時間不對,或慢或快,怎么回事?通常膠在30MIN-1H內凝。如果凝的太慢,可能是 TEMED APS劑量不夠或者失效。APS應該 現配現用,T

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