1、基因組學實驗教學大綱 一、課程基本信息1課程編號：1117024092課程類別：課內實驗3課程性質：選修課4學時/學分：10學時/0.5學分5先修課程：分子生物學、基因工程、遺傳學6適用專業：生物技術專業二、課程目標及學生應達到的能力一、課程簡介本課程是生物技術專業的一門專業選修課程，適宜于已有分子生物學和遺傳學基礎的學生?；蚪M學是隨著人類等基因組計劃的完成，獨立形成的一門重要的生物學科。本課程講授基因組學的基本技術和原理，同時講授基因組學中的熱點和最新進展，以達到掌握一定的專業知識同時拓寬知識面的目的。二、課程目標通過實驗教學與操作練習，達到以下課程目標課程目標1 掌握常用的分析軟件及數據

2、庫構建方法；課程目標2 熟悉常用的分子圖形學及分子模擬軟件的使用；課程目標3培養學生分析處理大規?；蚪M數據的能力。課程目標對畢業要求的支撐關系畢業要求畢業要求指標點課程目標對畢業要求的支撐關系知識4：專業知識系統掌握命科學技術的基本理論、基礎知識和實驗基本技能1、2能力2：應用知識的能力從事生物技術及其相關領域科學研究與生產的能力；具有一定的生物技術產品研發能力。1、2、3三、課程教學內容與學時分配本課程課內實驗學時為10學時，主要內容如下：知識單元知識點學時課程目標教學方式序號描述描述要求1常用基因組學數據庫的使用1.NCBI、DDBJ和EMBL中基因組學數據庫的使用和數據格式；理解21、

3、2、3講授操作2. NCBI的數據庫查詢與下載方法；掌握2基因組中開放閱讀框與轉錄調控序列分析1.使用ORFfinder預測基因組中的開放閱讀框；掌握41、2、3講授討論操作2.使用CpG Plot預測基因的CpG island位置；掌握3.使用PolyAH預測基因可能的轉錄終止的位置掌握4.使用PromotorScan尋找基因上游序列里可能的轉錄因子調控區域掌握3基因組密碼子偏好性及剪切位點的分析使用CodonW分析基因的密碼子使用偏好，了解密碼子偏好分析中各指數的含義掌握41、2、3講授討論操作練習兩種預測剪切位點的軟件的使用，NetGene2和Spidey掌握四、課程教學方法實驗教學方法

4、包括：課前書寫預習報告、實驗課老師講解示范操作、互動討論實驗方案、學生分小組協同或獨立參與操作、書寫實驗報告等方面。重點培養學生實驗操作技能和分析、解決專業問題的能力。五、課程的考核環節基因組學實驗環節按15%占比記入平時成績；其中實驗表現50%、實驗報告50%，成績以“優秀、良好、中等、及格和不及格”五個等級評定實驗成績。實驗成績評分標準如下：等級完成情況得分優秀實驗過程表現優秀，實驗報告內容整齊清晰，結果分析全面90-100分良好實驗過程表現較好，實驗報告內容完整，結果分析較為準確80-89分中等實驗過程表現一般，實驗報告內容較為完整，缺少結果分析70-79分及格有請假現象，實驗過程表現一般，實驗報告內容馬虎，缺少結果分析60-69分不及格有曠課現象或未提交實驗報告60分以下六、本課程與其它課程的聯系與分工先修課程和教學環節：分子生物學、基因工程、遺傳學后續課程和教學環節：本課程是生物技術專業生物信息技術方向的一門專業選修課程，適宜于已有分子生物學和遺傳學基礎的學生。本課程講授基因組學的基本技術和原理，同時講授基因組學中的熱點和最新進展，以達到掌握一定的專業知識同時拓寬知識面的目的。通過學習使學生具備基因組學分析，能運用基因組學知識分析鑒定重要的功能基因。培養學生分析處理大規模基因組數據的能力。七、建議教