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文檔簡介
1、分子生物化學(xué)補(bǔ)充復(fù)習(xí)題:1、 核酸可以分為哪二類,各自的主要分布場所?核酸分脫氧核糖核酸和核糖核酸兩類,DNA主要分布在細(xì)胞核的染色質(zhì)中(占95%),線粒體和葉綠體中也有(占5%)。RNA90%主要在細(xì)胞質(zhì)中,10%存在與細(xì)胞核中。rRNA主要存在于核糖體。2、 核酸分子雜交和探針?分子雜交(molecular hybridization)指具有一定同原序列的兩條核酸單鏈(DNA或RNA)在一定條件下通過堿基互補(bǔ)配對原則經(jīng)退火處理形成異質(zhì)雙鏈的過程。探針:已知序列的單鏈核酸片段3、 什么叫變性和復(fù)性?變性(denaturation)是指當(dāng)核酸溶液受到某些物理或化學(xué)因素的影響,使核酸的雙螺旋結(jié)構(gòu)
2、破壞,氫鍵斷裂,變成單鏈,從而引起核酸理化性質(zhì)的改變以及生物功能的減小或喪失。復(fù)性(renaturation):導(dǎo)致變性的因素解除后,因變性而分開的兩條單鏈即可再聚合成原來的雙螺旋,其原有性質(zhì)可得到部分恢復(fù)。此即為DNA復(fù)性。4、 Southern Blotting?5、Northern Blotting?6、Western Blotting?Southern Blotting雜交是指DNA與DNA的雜交。Northern Blotting雜交是檢測RNA的雜交。Western blotting 又稱為蛋白質(zhì)印記或免疫印記。 7、 熔解溫度(melting temperature, Tm)?指
3、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)解開一半時(shí)的溫度,決定于C-G堿基對的比例和DNA變性條件。8、 A、T、G、C、U的結(jié)構(gòu)式?9、限制性內(nèi)切酶?10、簡述嘌呤核苷酸的分解代謝途徑?腺嘌呤核苷酸及鳥嘌呤核苷酸有相應(yīng)的5”-磷酸化酶催化,加水脫磷酸生成腺苷。腺苷經(jīng)腺苷脫氨酶核苷磷酸化酶作用生成次黃嘌呤,次黃嘌呤經(jīng)黃嘌呤氧化酶作用變?yōu)辄S嘌呤,鳥苷經(jīng)核苷磷酸化酶作用生成鳥嘌呤,鳥嘌呤經(jīng)鳥嘌呤脫氨酶作用生成黃嘌呤(嘌呤分解代謝共同中間產(chǎn)物),黃嘌呤經(jīng)黃嘌呤氧化酶作用變?yōu)槟蛩帷?1、 簡述嘧啶核苷酸的分解代謝途徑? 首先通過核苷酸酶及核苷磷酸化酶的作用,分別除去磷酸和核糖,產(chǎn)生的嘧啶堿再進(jìn)一步分解。嘧啶的分解代謝主要在肝
4、臟中進(jìn)行。分解代謝過程中有脫氨基、氧化、還原及脫羧基等反應(yīng)。胞嘧啶脫氨基轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぁD蜞奏ず托叵汆奏は仍诙溧奏っ摎涿傅拇呋拢蒒ADPHH供氫,分別還原為二氫尿嘧啶和二氫胸腺嘧啶。二氫嘧啶酶催化嘧啶環(huán)水解,分別生成丙氨酸(alanine)和-氨基異丁酸(aminosiobutyrate)。丙氨酸和氨基異丁酸可繼續(xù)分解代謝。-氨基異丁酸亦可隨尿排出體外。尿嘧啶最終生成NH3、CO2及-丙氨酸。胸腺嘧啶降解成-氨基異丁酸。12、簡述嘌呤核甘酸與嘧啶核苷酸合成的異同點(diǎn)?嘌呤核苷酸與嘧啶核苷酸從頭合成過程中,嘌呤核苷酸合成的原料是天冬氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、CO2、一碳單位和PRPP。在5-磷酸
5、核糖分子基礎(chǔ)上逐步加合先形成嘌呤環(huán),再逐步形成IMP,再轉(zhuǎn)變成AMP 、GMP。主要在肝臟,其次是小腸黏膜和胸腺細(xì)胞合成。終產(chǎn)物IMP AMP GMP抑制PRPP合成酶和PRPP酰胺轉(zhuǎn)移酶. 嘧啶核苷酸的合成原料是天冬氨酸、谷氨酰胺、CO2、PRPP、一碳單位、(僅胸苷酸合成),在形成氨基甲酰磷酸的基礎(chǔ)上先形成嘧啶環(huán),再與磷酸核糖結(jié)合形成嘧啶核苷酸,其產(chǎn)物UMP 反饋抑制氨基甲酰磷酸合成酶II。PRPP合成酶即影響嘌呤核苷酸合成也影響嘧啶核苷酸合成。13、 簡述嘌呤及嘧啶的補(bǔ)救合成途徑及其意義? 大多數(shù)細(xì)胞更新其核酸(尤其是RNA)過程中,要分解核酸產(chǎn)生核苷和游離堿基。細(xì)胞利用游離堿基或核苷重
6、新合成相應(yīng)核苷酸的過程稱為補(bǔ)救合成。與從頭合成不同,補(bǔ)救合成過程較簡單,消耗能量亦較少。由二種特異性不同的酶參與嘌呤核苷酸的補(bǔ)救合成。腺嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶催化PRPP與腺嘌呤合成AMP. 人體由嘌呤核苷的補(bǔ)救合成只能通過腺苷激酶催化,使腺嘌呤核苷生成腺嘌呤核苷酸。 嘌呤核苷酸補(bǔ)救合成是一種次要途徑。其生理意義一方面在于可以節(jié)省能量及減少氨基酸的消耗。另一方面對某些缺乏主要合成途徑的組織,如人的白細(xì)胞和血小板、腦、骨髓、脾等,具有重要的生理意義。14、 簡述嘧啶核苷酸的從頭合成調(diào)節(jié)上微生物與哺乳動(dòng)物的差異?在細(xì)菌中,天冬氨酸氨基甲酰轉(zhuǎn)移酶(ATCase)是嘧啶核苷酸從頭合成的主要調(diào)節(jié)酶。在大腸桿
7、菌中,ATCase受ATP的變構(gòu)激活,而CTP為其變構(gòu)抑制劑。而在許多細(xì)菌中、UTP是ATCase的主要變構(gòu)抑制劑。在動(dòng)物細(xì)胞中,ATCase不是調(diào)節(jié)酶。嘧啶核苷酸合成主要由CPS-調(diào)控。UDP和UTP抑制其活性,而ATP和PRPP為其激活劑。第二水平的調(diào)節(jié)是OMP脫羧酶,UMP和CMP為其競爭抑制劑。此外,OMP的生成受PRPP的影響。15、什么叫外顯子和內(nèi)含子?內(nèi)含子:DNA及hnRNA分子中的能轉(zhuǎn)錄而不能編碼氨基酸的序列。外顯子:DNA及hnRNA分子中的能轉(zhuǎn)錄又能編碼氨基酸的序列。16、 什么叫管家基因和奢侈基因?奢侈基因(Luxury gene):即組織特異性基因(tissue-sp
8、ecific genes),在高等生物中,奢侈基因選擇性表達(dá),所以它只在特定的細(xì)胞內(nèi)表達(dá)。(例如血紅蛋白基因只在血細(xì)胞內(nèi)表達(dá),所以血紅蛋白基因便是奢侈基因。)管家基因(house-keeping genes):在所有細(xì)胞中都能表達(dá)的基因,與細(xì)胞分化無關(guān),其產(chǎn)物是對維持細(xì)胞基本生命活動(dòng)所必需的。如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因與核糖體蛋白基因等。17、什么叫基因家族?定義:真核細(xì)胞中,許多相關(guān)的基因常按功能成套組合,被稱為基因家族。特點(diǎn):是具有顯著相似性的一組基因,編碼相似的蛋白質(zhì)產(chǎn)物。同一家族中的成員有時(shí)緊密的排列在一起,成為一個(gè)基因簇;更多的時(shí)候,它們卻分散在同一染色體的不同部位,甚
9、至位于不同染色體上,具有各自不同的表達(dá)調(diào)控模式。18、 什么叫進(jìn)化鐘?某一蛋白在不同物種間的取代數(shù)與所研究物種間的分歧時(shí)間接近正線性關(guān)系,進(jìn)而將分子水平的這種恒速變異稱為“分子鐘”。分子進(jìn)化鐘。19、遺傳信息傳遞的中心法則?是指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復(fù)制過程。這是所有有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。在某些病毒中的RNA自我復(fù)制(如煙草花葉病毒等)和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄成DNA的過程(某些致癌病毒)是對中心法則的補(bǔ)充。20、 DNA的二級結(jié)構(gòu)?DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)21、 DNA雙螺
10、旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性因素?堿基堆積力是使DNA結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要因素 氫鍵AT之間有兩條氫鍵,CG之間由三條氫鍵,GC對含量越多,DNA分子越穩(wěn)定 相反電荷的穩(wěn)定作用磷酸基團(tuán)上的負(fù)電荷與介質(zhì)中的陽離子形成離子鍵,有效屏蔽靜電斥力。22、 DNA復(fù)制的基本原則?DNA的半保留復(fù)制,半不連續(xù)復(fù)制方式,需要RNA作為引物和復(fù)制通常雙向進(jìn)行。23、 原核生物DNA復(fù)制的基本方式?型復(fù)制、滾環(huán)復(fù)制、D環(huán)復(fù)制24、什么是端粒酶?細(xì)胞中有種酶負(fù)責(zé)端粒的延長,其名為端粒酶。含有一個(gè)RNA分子和具有催化活性的蛋白質(zhì),是一種反轉(zhuǎn)錄酶。25、誘發(fā)突變主要包括哪些因素?誘發(fā)突變(induced mutation) :誘變劑誘發(fā)
11、的突變(一)物理誘變1、電離:x射線 g射線 a 射線 b 射線 質(zhì)子 中子2、非電離:紫外線 加熱(二) 化學(xué)誘變1.堿基類似物 如: 5-溴尿嘧啶(5-bromouracil,5-BU);氨基嘌呤(2-aminopurine 2-AP);迭氮胸苷(AZT, azidothymidine) 2.堿基的修飾劑 :亞硝酸(introus acid, NA);羥胺; 烷化劑,它們的作用是使堿基烷基化3.DNA插入劑 :原黃素(proflavin);吖啶橙(acridine orange);溴化3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶鎓 etnidium bramide); ICR的復(fù)合物等。26、什
12、么叫位點(diǎn)特異性重組?位點(diǎn)特異性重組是在專一酶的作用下,在DNA特定為電商發(fā)生的斷裂和重接,從而產(chǎn)生精確地DNA重排方式。其只發(fā)生在特殊DNA區(qū)域,有短的同源順序,供重組蛋白識別。27、 什么叫轉(zhuǎn)座子?轉(zhuǎn)座子又稱跳躍因子,是存在于染色體DNA上可自主復(fù)制和位移的基本單位,其實(shí)質(zhì)是基因組上不必借助于同源序列就可引動(dòng)的DNA片段,他們可以直接從基因組內(nèi)的一個(gè)位點(diǎn)移到另一個(gè)位點(diǎn)。28、 遺傳多樣性的檢測方法有哪些?形態(tài)學(xué)標(biāo)記,細(xì)胞學(xué)標(biāo)記,生化標(biāo)記,分子標(biāo)記30、真核生物轉(zhuǎn)錄的基本過程?31、什么是RNA聚合酶?RNA聚合酶(RNA polymerase):在RNA合成過程中指導(dǎo)NTP同模板DNA或模板
13、RNA堿基配對,并催化磷酸二酯鍵的形成的一類酶。32、 什么是DNA聚合酶?DNA聚合酶是以脫氧核苷酸三磷酸為底物,沿模板的3'5'方向,將對應(yīng)的脫氧核苷酸連接到新生DNA鏈的3'端,使新生鏈沿5'3'方向延長的一類酶。33、簡述原核基因組與真核基因組有那些異同。DNA鏈;4催化dNTP加到生長中的DNA鏈的3'-OH末端;5催化DNA合成的方向是5'區(qū)別: 1、真核生物基因組指一個(gè)物種的單倍體染色體組(1n)所含有的一整套基因。還包括葉綠體、線粒體的基因組。 原核生物一般只有一個(gè)環(huán)狀的DNA分子,其上所含有的基因?yàn)橐粋€(gè)基因組。 2、原核
14、生物的染色體分子量較小,基因組含有大量單一順序(unique-sequences),DNA僅有少量的重復(fù)順序和基因。 真核生物基因組存在大量的非編碼序列。包括:.內(nèi)含子和外顯子、.基因家族和假基因、重復(fù)DNA序列。真核生物的基因組的重復(fù)順序不但大量,而且存在復(fù)雜譜系。 3、原核生物的細(xì)胞中除了主染色體以外,還含有各種質(zhì)粒和轉(zhuǎn)座因子。質(zhì)粒常為雙鏈環(huán)狀DNA,可獨(dú)立復(fù)制,有的既可以游離于細(xì)胞質(zhì)中,也可以整合到染色體上。轉(zhuǎn)座因子一般都是整合在基因組中。 真核生物除了核染色體以外,還存在細(xì)胞器DNA,如線粒體和葉綠體的DNA,為雙鏈環(huán)狀,可自主復(fù)制。有的真核細(xì)胞中也存在質(zhì)粒,如酵母和植物。 4、原核生
15、物的DNA位于細(xì)胞的中央,稱為類核(nucleoid)。 真核生物有細(xì)胞核,DNA序列壓縮為染色體存在于細(xì)胞核中。 5、真核基因組都是由DNA序列組成,原核基因組還有可能由RNA組成,如RNA病毒。34、原核生物啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)?有三個(gè)功能部位:一個(gè)是起始部位,此處有轉(zhuǎn)錄生成的RNA鏈中第一個(gè)核苷酸互補(bǔ)的堿基對。另一個(gè)是再轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游-10堿基對處有一段富含A-T堿基對的TATAAT序列,稱Pribnow框。還有一個(gè)是識別部位,其位置在-35堿基對附近,序列特征為TTGACA,這是RNA聚合酶的初始識別部位。35、什么叫核酶? 是指一種可以催化特定生化反應(yīng)的RNA分子,具有酶的特性,能自我催化
16、分解。36、什么是密碼子?什么叫起始密碼子和終止密碼子?在mRNA的開放閱讀框架區(qū),以每三個(gè)相鄰的核苷酸為一組,代表一種氨基酸或者起始和終止信號,這種三聯(lián)體形式的核苷酸序列稱為密碼子。共有64個(gè)密碼子,閱讀方向是5-3起始:編碼甲硫氨酸的密碼子同時(shí)也作為多肽鏈合成的起始信號,多為AUG終止:不編碼任何氨基酸,只作為肽鏈合成終止信號,有UAA、UAG、UGA等。37、RNA主要有哪幾類?各自的功能?RNA主要有mRNA、rRNA、tRNA三種:mRNA是合成蛋白質(zhì)多肽鏈的直接模板,其開放閱讀框架內(nèi)每相鄰的三個(gè)核苷酸組成密碼子,他們代表氨基酸或肽鏈合成的起始終止等信號。rRNA與多種蛋白質(zhì)分子構(gòu)成
17、核蛋白體,是蛋白質(zhì)的合成場所。tRNA是氨基酸的運(yùn)載體,tRNA即可通過其反密碼子與mRNA序列中的密碼子結(jié)合,又可借助其氨基酸臂與氨基酸結(jié)合,因而能夠按mRNA的遺傳密碼將特定的氨基酸運(yùn)載到核蛋白體上合成多肽鏈。38.tRNA的三葉草結(jié)構(gòu)特點(diǎn)?氨基酸臂、D環(huán)、反密碼子環(huán)、額外環(huán)和可變環(huán)、TC環(huán)(1)3"端含CCA-OH序列。因?yàn)樵撔蛄惺菃喂赏簧斐鰜恚⑶野被峥偸墙釉谠撔蛄邢佘账釟埢?A)上,所以CCA-OH序列稱為氨基酸接受臂(amino acid acceptor arm)。CCA通常接在3"端第4個(gè)可變苷酸上。3"端第5-11位核苷酸與5"端第1
18、-7位核苷酸形成螺旋區(qū),稱為氨基酸接受莖(amino acid acceptor stem)。(2)TC環(huán)(TCloop)。TC環(huán)是第一個(gè)環(huán),由7個(gè)不配對的大基組成,幾乎總是含5"GTC3"序列。該環(huán)涉及tRNA與核糖體表面的結(jié)合,有人認(rèn)為GTC序列可與5SrRNA的GAAC序列反應(yīng)。(3)額外環(huán)或可變環(huán)(extro variable loop)。這個(gè)環(huán)的堿基種類和數(shù)量高度可變,在3-18個(gè)不等,往往富有稀有堿基。(4)反密碼子環(huán)(anticodon loop)。由7個(gè)不配對的堿基組成,處于中間位的3個(gè)堿基為反密碼子。反密碼子可與mRNA中的密碼子結(jié)合。毗鄰反密碼子的3&q
19、uot;端堿基往往為烷化修飾嘌呤,其5"端為U,即:-U-反密碼子-修飾的嘌呤。(5)二氫尿嘧啶環(huán)(dihydr-Uloop或D-loop)由8-12個(gè)不配對的堿基組成,主要特征是含有(2+1或2-1)個(gè)修飾的堿基(D)。(6)上述的TC環(huán),反密碼子環(huán),和二氫尿嘧啶不分別連接在由4或5個(gè)堿基組成的螺旋區(qū)上,依次稱為TC莖,反密碼子莖和二氫尿嘧啶莖。此外,前述的15-16個(gè)固定堿基幾乎全部位于這些環(huán)上。39、 簡述原核生物轉(zhuǎn)錄的基本過程?轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),轉(zhuǎn)錄的起始,RNA合成的延伸,RNA合成的終止。(1)模板識別:形成轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物全酶形成后就通過一種嘗試錯(cuò)誤的方式去尋找啟動(dòng)子,它是
20、依靠亞基尋找并識別-35序列(識別機(jī)制:氫鍵互補(bǔ)學(xué)說),然后全酶與-35序列結(jié)合,這樣就形成一個(gè)所謂的封閉的啟動(dòng)子復(fù)合物。但是結(jié)合并不是很牢固,而是在其附近進(jìn)行滑動(dòng),這時(shí)候就形成所謂的開放式啟動(dòng)子復(fù)合物結(jié)構(gòu)。在RNA聚合酶上有兩個(gè)核苷酸位點(diǎn),一個(gè)是起始核苷酸位點(diǎn),一個(gè)是延長核苷酸位點(diǎn)。在開放式的啟動(dòng)子復(fù)合物中,RNA聚合酶的起始位點(diǎn)和延長位點(diǎn)被相應(yīng)最初的兩個(gè)核苷酸前體充滿,然后在這兩個(gè)核苷酸之間形成一個(gè)磷酸二酯鍵,這樣的話呢,就形成了一個(gè)三元復(fù)合體,即由RNA聚合酶、DNA模板、新形成的RNA短鏈共同組成一個(gè)所謂的三元復(fù)合物。(2) 流產(chǎn)起始三元復(fù)合物一旦形成,亞基并不是馬上就脫離下來。這時(shí)候
21、的RNA聚合酶已經(jīng)結(jié)合到轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上,但是并不往下移動(dòng),而是在這個(gè)三元復(fù)合物中合成了一段程度為29個(gè)核苷酸的RNA短鏈。然后這個(gè)短鏈從三元復(fù)合體中釋放出來這才算是轉(zhuǎn)錄的成功開始,這個(gè)時(shí)候,RNA聚合酶再重新開始合成RNA。sigam因子就被釋放出來,于是轉(zhuǎn)錄繼續(xù),并且隨著RNA聚合酶的移動(dòng),形成的RNA不斷延伸。(3)轉(zhuǎn)錄延伸因子從全酶上脫離, RNA聚合酶核心酶變構(gòu),繼續(xù)沿DNA鏈移動(dòng),按照堿基互補(bǔ)原則,不斷聚合RNA。在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長,延長的RNA鏈不斷的被釋放出來。(4)轉(zhuǎn)錄終止轉(zhuǎn)錄的終止作用需要有終止子提供終止信號,這種終止信號稱為終止子。但是真正起終止
22、作用的不是DNA序列本身而是由此轉(zhuǎn)錄出來的RNA,在這一點(diǎn)上啟動(dòng)子和終止子是不同的。40、 簡述肽鏈合成的主要過程?氨基酸的活化、肽鏈合成的起始、肽鏈的延長、肽鏈合成的終止。41、什么叫分子伴侶?分子伴侶(molecular chaperones) 是細(xì)胞中一大類蛋白質(zhì),是由不相關(guān)的蛋白質(zhì)組成的一個(gè)家系,它們介導(dǎo)其它蛋白質(zhì)的正確裝配,但自己不成為最后功能結(jié)構(gòu)中的組分。分子伴侶是細(xì)胞內(nèi)一類可識別肽鏈的非天然構(gòu)象、促進(jìn)各功能域和整體蛋白質(zhì)正確折疊的保守蛋白質(zhì)。42、 肽鏈剪接的常見方式有哪些?N端fMet或Met的切除、N端信號序列的切除、前體的剪切、蛋白質(zhì)的剪接等。(1)肽鏈N端fMet或Met
23、的切除。蛋白質(zhì)剛剛被合成時(shí)都以fMet(formyl Met,見于原核生物)或Met(見于真核生物)開始。肽鏈合成后,其N端fMet或Met殘基通常在氨肽酶的催化作用下被切除,部分原核生物的蛋白質(zhì)保留Met,但需要在脫甲酰酶的作用下去除甲酰基。(2)信號序列的切除,需要被運(yùn)輸?shù)礁骷?xì)胞器及細(xì)胞外的蛋白質(zhì)N端一般有一段信號序列,用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)的輸送,這一信號序列通常在完成任務(wù)后被相應(yīng)的蛋白水解酶切除。(3)蛋白與多肽前體的切除,胰島素、甲狀旁腺素、生長激素等激素初合成后是無活性的前體,經(jīng)蛋白水解酶切去中間的部分肽段而成熟。(4)蛋白質(zhì)的剪接,指前體蛋白中間的蛋白質(zhì)肽段被剪切出來,其兩側(cè)的肽鏈通過新
24、的肽鍵連接起來,形成成熟蛋白質(zhì)的加工過程,包括分子內(nèi)的轉(zhuǎn)換、中間產(chǎn)物的形成、Asn的環(huán)化、肽鍵的斷裂和形成等步驟,其中肽鍵的斷裂和形成是蛋白質(zhì)剪接的關(guān)鍵反應(yīng)。43、什么叫信號肽?N端的一段或幾段特殊的氨基酸序列,可用于引導(dǎo)蛋白質(zhì)定向進(jìn)入細(xì)胞中的特定部位,這些特殊的氨基酸序列稱為信號肽,是決定蛋白質(zhì)定向運(yùn)輸最重要的原件。44、 什么叫同源重組?同源重組(Homologous Recombination)是指發(fā)生在同源序列的DNA分子之間或分子之內(nèi)的重新組合,其發(fā)生依賴于大片段同源DNA序列的配對、鏈斷裂、交換和再連接。45、 非編碼RNA的分類?非編碼RNA(Non-coding RNA)是指不
25、編碼蛋白質(zhì)的RNA。其中包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和microRNA 等多種已知功能的 RNA,還包括未知功能的RNA。非編碼RNA 從長度上來劃分可以分為3類:小于50 nt,包括microRNA,siRNA,piRNA;50 nt到500 nt,包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA,SLRNA,SRPRNA 等等;大于500 nt,包括長的mRNA-like 的非編碼RNA,長的不帶polyA 尾巴的非編碼RNA等等。46、原核生物轉(zhuǎn)錄終止的類型?一類是不需要任何輔助因子,核心酶就能夠在某些終止信號上獨(dú)立完成轉(zhuǎn)錄的終止,這種終止子稱為不依賴因子的終止子。
26、第二類是需要輔助因子蛋白才能完成終止,稱為依賴因子的終止子。47、 轉(zhuǎn)錄調(diào)控的順式作用元件?真核生物:啟動(dòng)子,增強(qiáng)子,沉默子和絕緣子原核生物:啟動(dòng)子48、原核生物DNA復(fù)制過程中需要哪些元件?除DNA聚合酶外,還包括使DNA模板雙鏈解鏈的解旋酶、消除前進(jìn)時(shí)產(chǎn)生的拓?fù)鋺?yīng)力的拓?fù)洚悩?gòu)酶、保護(hù)解開的DNA單鏈的單鏈結(jié)合蛋白、合成RNA引物的引物酶和鏈接相鄰DNA片段的DNA連接酶。49、 乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)?乳糖操縱子含Z、Y及A三個(gè)結(jié)構(gòu)基因,分別編碼-半乳糖苷酶、透酶和乙酰基轉(zhuǎn)移酶,一個(gè)操縱序列O、一個(gè)啟動(dòng)序列P及一個(gè)調(diào)節(jié)基因I。Z-編碼-半乳糖苷酶:將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖Y-編碼-半乳糖苷透過
27、酶:使外界的-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。A-編碼-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶:乙酰輔酶A上的乙酰基轉(zhuǎn)到-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。50、簡述色氨酸操縱子通過弱化作用調(diào)控轉(zhuǎn)錄的機(jī)制?trp操縱子轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)控是通過弱化作用實(shí)現(xiàn)的。在大腸桿菌trp operon,前導(dǎo)區(qū)的堿基序列包括4個(gè)分別以1、2、3和4表示的片段,能以兩種不同的方式進(jìn)行堿基配對,1 - 2和3 -4配對,或2 - 3配對,3 - 4配對區(qū)正好位于終止密碼子的識別區(qū)。前導(dǎo)序列有相鄰的兩個(gè)色氨酸密碼子,當(dāng)培養(yǎng)基中Trp 濃度很低時(shí),負(fù)載有Trp 的tRNATrp也就少,這樣翻譯通過兩個(gè)相鄰色氨酸密碼子
28、的速度就會很慢,當(dāng)4區(qū)被轉(zhuǎn)錄完成時(shí),核糖體滯留1區(qū),這時(shí)的前導(dǎo)區(qū)結(jié)構(gòu)是2 - 3配對,不形成3 - 4配對的終止結(jié)構(gòu),所以轉(zhuǎn)錄可繼續(xù)進(jìn)行。反之,核糖體可順利通過兩個(gè)相鄰的色氨酸密碼子,在4區(qū)被轉(zhuǎn)錄之前,核糖體就到達(dá)2區(qū),這樣使2 - 3不能配對,3 - 4 區(qū)可以配對形成終止子結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄停止。51、 什么是增強(qiáng)子?增強(qiáng)子是由兩個(gè)或兩個(gè)以上的增強(qiáng)子元件組成,能夠遠(yuǎn)距離作用調(diào)節(jié)啟動(dòng)子來增加轉(zhuǎn)錄效率的DNA序列,與啟動(dòng)子不同,他能雙向提高上游下游基因的轉(zhuǎn)錄效率。增強(qiáng)子(enhanser)是真核生物中通過啟動(dòng)子來增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄的一種遠(yuǎn)端遺傳性順式作用元件,有效的增強(qiáng)子可以位于5、3、甚至基因內(nèi)部的內(nèi)含子中,
29、其基本核心元件常由812bp組成,常形成回文序列,并以單拷貝或者多拷貝的串聯(lián)形式存在。52、什么叫順式元件和反式作用因子?順式作用元件(cis-acting element)存在于基因旁側(cè)序列中能影響基因表達(dá)的序列。順式作用元件包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、調(diào)控序列和可誘導(dǎo)元件等,它們的作用是參與基因表達(dá)的調(diào)控。順式作用元件本身不編碼任何蛋白質(zhì),僅僅提供一個(gè)作用位點(diǎn),要與反式作用因子相互作用而起作用。反式作用因子是指能直接或間接地識別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。有時(shí)也稱轉(zhuǎn)錄因子。真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子由他的編碼基因表達(dá)后,通過與特異的順式作用元件的識別、結(jié)合,反式激活
30、另一基因轉(zhuǎn)錄,故稱反式作用因子。53、原核生物DNA聚合酶的種類及其功能?DNA聚合酶I:(1)聚合作用:在引物RNA-OH末端,以dNTP為底物,按模板DNA上的指令由DNApol I逐個(gè)將核苷酸加上去,就是DNApol I的聚合作用。(2)3'5'外切酶活性校對作用: 主要功能是從35方向識別和切除不配對的DNA生長鏈末端的核苷酸。(3)53外切酶活性切除修復(fù)作用:53外切酶活性就是從53方向水解DNA生長鏈前方的DNA鏈,主要產(chǎn)生5-脫氧核苷酸。(4)這種酶活性在DNA損傷的修復(fù)中可能起著重要作用。對岡崎片段5末端DNA引物的去除也依賴此種外切酶活性。DNA聚合酶:在DN
31、A復(fù)制過程中負(fù)責(zé)清除RNA引物,以及修復(fù)功能。DNA聚合酶:修復(fù)功能DNA聚合酶:復(fù)制功能54、真核生物RNA聚合酶的種類及其功能?有三種:即 RNA聚合酶I、II、III。RNA聚合酶I存在于核仁中,其功能主要是負(fù)責(zé)合成5.8S rRNA, 18S rRNA, 28S rRNA;RNA聚合酶II存在于核質(zhì)中,負(fù)責(zé)合成mRNA和snRNA;RNA聚合酶III也存在于核質(zhì)中,其功能是合成tRNA,和5S rRNA以及轉(zhuǎn)錄某些特殊序列如Alu序列。55、復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的差異?復(fù)制 轉(zhuǎn)錄模板不同: 兩股鏈均復(fù)制 模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對稱轉(zhuǎn)錄)原料不同: dNTP NTP 酶不同: DNA聚合酶 RNA聚合酶(
32、RNA-pol)產(chǎn)物不同: 子代雙鏈DNA) mRNA,tRNA,rRNA配對不同: A-T , G-C A-U , T-A , G-C機(jī)制不同:半保留復(fù)制 全保留復(fù)制56、DNA標(biāo)記的基本分類?基于DNA-DNA雜交的DNA標(biāo)記、基于PCR的DNA標(biāo)記、基于PCR與限制性內(nèi)切酶技術(shù)相結(jié)合的DNA標(biāo)記、基于單核苷酸多態(tài)性的DNA標(biāo)記。57、 原核生物和真核生物mRNA的異同?相同點(diǎn):都是由DNA到RNA;都需要相關(guān)的酶系統(tǒng);都有啟動(dòng)子、都有調(diào)控,如原核生物的終止子和真核的增強(qiáng)子等等。 從分子結(jié)構(gòu)上來看,真核生物和原核生物的mRNA是完全一樣的,都是核糖核酸,由四種核糖核苷酸組成,并且都是由基因轉(zhuǎn)錄而來。不同點(diǎn):(1)原核生物mRNA常以多順反子的形式存在。真核生物mRNA一般以單順反子的形式存在。(2)原核生物mRNA的轉(zhuǎn)錄與翻譯一般是偶聯(lián)的,真核生物轉(zhuǎn)錄的mRNA前體則需經(jīng)轉(zhuǎn)錄后加工,加工為成熟的mRNA與蛋白質(zhì)結(jié)合生成信息體后才開始工作。(3)原核生物mRNA半壽期很短,一般為幾分鐘。真核生物mRNA的半壽期較長,有的可達(dá)數(shù)日。(4)原核與真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)也不同。真核生物mRNA由5端帽子結(jié)構(gòu)、5
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