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文檔簡介
1、 GEL EQ凝膠成像使用指南1. 打開主機電源與計算機電源.2. 點擊凝膠成像軟件,進入QUANTITY ONE操作界面.3. 在FILE菜單中,選擇GEL EQ菜單,進入圖像采集界面4. 點擊LIVE/FOCUS菜單,采集圖像.(根據被掃膠的要求, 在凝膠成像主機面板上選擇UV/WHITE紫外光/白光).(如需使用透射白光,則把白光臺電源打開,把白光臺放在底板上,把膠放在白光臺上.)5. 調節光圈大小,點擊IRIS下OPEN/CLOSE;調節聚焦,點擊FOCUSE下NEAR/FAR按鈕;調節遠近即大小,點擊ZOOM下相應按鈕,直到滿意為止.6. 爆光時間一般選擇自動AUTO EXPOSE即
2、可.7. 若圖像上有高亮紅點,說明爆光過度,則須縮小光圈.8. 圖像調好后,點擊SAVE鍵保存.若需保存為其他格式,則在FILE菜單下選擇導出,保存為JPEG/TIFF格式文件.9. 關于分析處理見Quantity One應用講義Quantity One應用講義本講義介紹Quantity One的兩個重要分析功能:定量分析和分子量確定。Quantity One軟件HelpàQuick Guide快捷指南提示如何實現一個功能,如定量分析(Volumes Quick Guide),電泳條帶分析(Band Analysis),差顯分析(Differential Display Analys
3、is),克隆計數(Colony Counting Analysis)等。快捷指南下有1,2,3步驟,根據提示完成。一 定量分析功能快捷指南Volumes Quick Guide,此功能能對任意所選區域進行定量分析,此分析可以報告2個結果:相對濃度和絕對濃度(如有濃度標準樣品)1 選擇成像系統或打開已保存的文件(軟件可以控制Bio-Rad所有的成像系統如GelDoc,ChemiDoc,VersaDoc,GS-800,FX,如不是Bio-Rad成像系統所攝取的圖象,將圖象保存為Tiff文件格式,軟件也可進行分析處理)2 Zoom Box,縮放,對圖象進行放大觀察3 Transform轉化,調節圖象
4、的對比度黑白4 Volume Rect Tool 矩形區域選擇,如U15 Volume Free hand Tool自由畫筆選擇區域,可以勾勒出無規則形狀,如U26 Volumn Contour Tool等高線勾勒區域,自動連接濃度濃度相同的點,如U3上面3種方法選擇需要定量的區域。雙擊所選區域,出現如下窗口,定義樣品類型,如未知樣品Unkonwn(U1,U2即待計算樣品),背景Background(B1,B2,軟件在算濃度時會將此區域的濃度自動扣除) 或標準樣品Standard(Std1,Std2, 如果該樣品是濃度標準樣品,即定量標準,需在濃度concentration一欄輸入該樣品的濃度
5、)。7 Select Tool選擇不同區域8 Print Image打印圖像9 Volume Analysis Report 定量報告結果,打開出現如下窗口,選擇要報告的參數,主要有2個參數Volume和Concentration。Volume為相對濃度,如有濃度標準樣品(Std),軟件可報告Concentration絕對濃度。 二條帶分析功能Band Analysis介紹用此功能對泳道內的所有條帶進行分子量確定,相對濃度分析1,2,3同上4,5,6確定泳道lane,并可對泳道進行各種調整(實際實驗中泳道往往不是垂直的而出現各種變形。在軟件的工具欄中有一Lane Tool圖標,包含有更多泳道編
6、輯工具。Band Tool條帶編輯工具包Lane Tool泳道編輯工具包7Lane Background去除泳道背景,建議不做8Detect Band,檢測泳道內的條帶,打開出現如下窗口,一般可通過調節sensitivity靈敏度來調節檢測出的條帶,或通過人工編輯來增加/減少條帶。打開工具欄中Band Tool條帶編輯工具包可看到更多編輯工具(如上圖)10. Standard輸入分子量標準,軟件自帶有許多Bio-Rad的分子量標準,如你用的是自己的標準,進入New Standard建立新的分子量標準,軟件可以選擇標準單位是MW(蛋白質)還是BP(核酸)等(左下圖)。在Protein-Stand
7、ard對話框中輸入分子量數值,完成后單擊賦值圖標(右下圖),回到圖象文件上單擊標準樣品的泳道,軟件自動將所輸的分子量數值和泳道內的條帶一一對應。賦值圖標:告訴軟件哪條是分子量標準樣品的泳道輸入分子量數值10. Band Attribute條帶屬性,在完成第9步以后,軟件已自動計算出了其他未知條帶的分子量,打開band attribute選擇要報告的參數,這里我們選擇Molecular Weight,圖象上可以看到所有條帶的分子量(紅顏色標記),標準分子量為藍色標記。11. Match,跳過不做12. Print Image打印圖象13. All Lane Report所有泳道條帶結果報告。打開窗口,選擇要
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