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文檔簡介
1、 中 國 海 洋 大 學 實 驗 報 告 姓名: 周夢陽 專業年級: 07生物技術 學號: 040012007184 實驗時間:周二90節 教師: 孔凡娜 課程: 分子生物學實驗 題目: 基因組DNA的提取與電泳鑒定 一.【實驗目的】掌握基因組DNA的提取原理和方法二.【實驗原理】1、用機械的方法使組織和細胞破碎;加入SDS等離子型活性劑,溶解細胞膜和核膜蛋白;加入酚氯仿等表面活性劑使蛋白變性。離心,除去組織和變性蛋白,上清液中加入冰凍的無水乙醇使DNA沉淀,離心,棄上清,70%乙醇漂洗DNA;倒掉上清,風干,溶于滅菌的雙蒸水中。2、分子置于電場中以一定速度(遷移率)移向適當電極。遷移率同電場
2、強度、電泳分子所攜帶的靜電荷數成正比,還與介質的摩擦系數相關。一定電場強度下DNA分子的遷移率取決于核酸分子本身的大小和構型。3、瓊脂糖是D-和L-半乳糖殘基殘基通過(13)和(14)糖苷鍵交替構成的線狀聚合物。瓊脂糖凝膠可以形成直徑50nm-200nm的三維篩孔通道。瓊脂糖溶液的密度取決于瓊脂糖的濃度,我們所用的是經過化學修飾的低熔點(LMP)瓊脂糖,結構上比較脆弱,較低溫度下即可熔化。濃度越高,孔隙越小,分辨能力越強。瓊脂糖凝膠分辨DNA片段的范圍為0.2-50Kb;聚丙烯酰胺凝膠分辨力為1bp-1000bp。4、凝膠電泳中,加入溴化乙錠(簡稱EtBr)染料對核酸分子染色之后,將電泳標本放
3、置在紫外光下觀察,便可以十分敏感兒方便地檢測出凝膠介質中DNA的譜帶位置。三.【實驗材料與用品】材料:龍須菜用具:天平、離心管、高速離心機、水浴鍋、瓊脂糖凝膠電泳系統、瓊脂糖凝膠電泳系統等。藥品:液氮、緩沖液、SDS、蛋白酶K、tris飽和酚、氯仿、冰凍的無水乙醇、70%乙醇、RNA酶、TBE、瓊脂糖四.【實驗步驟】(一)基因組DNA的提?。?)將龍須菜從培養瓶中取出,吸干表面水分后用電子天枰秤取0.2g,液氮充分研磨后分裝到1.5ml的離心管中。(2)在裝有藻體粉末的離心管中加入900l提取緩沖液、90l 20%的SDS、10l 10mg/ml的蛋白酶K。充分混勻后于37水浴鍋中裂解30mi
4、n,每5min混勻一次。(3)12000轉離心10min,取上清。(4)加入等體積Tris飽和酚抽提,充分混勻后12000轉離心10min,取上清。(5)加入等體積氯仿抽提,充分混勻后12000轉離心10min,取上清。(6)加入等體積氯仿抽提,充分混勻后12000轉離心10min,取上清。(7)加入兩倍體積的無水乙醇,充分混勻后于-20半小時。(8)將上述溶液從冰箱中取出,12000轉離心10min,出現的沉淀即為基因組DNA。(9)倒掉上清,加入800l 70%的無水乙醇,洗沉淀,12000轉離心10min。洗兩次。(10)倒掉上清后,將沉淀晾干后加入50去離子水溶解。 (11)加入Rna
5、se消化30min。(12)-20保存備用(二)基因組DNA的電泳檢測(1)配制1%的Agarose膠(1gAgarose粉末,融于100ml1×TAE中)(2)分別在樣品槽中加入標準DNA marker和樣品DNA 3l(buffer與樣品DNA的混合物),電泳。(3)將瓊脂糖膠放在EB溶液中染色5-10分鐘。(4)使用凝膠成像系統拍照并檢驗。五.【實驗結果】我們是第2組,由下圖可見無明顯條帶,這說明樣品中混有蛋白質雜質,抽提不完全。六.【思考題】1、簡述DNA提取過程中各種試劑的作用。SDS:破壞細胞膜結構,使蛋白質變性,解聚核糖體,使DNA得以釋放。蛋白酶K:降解蛋白質乙醇:沉
6、淀DNATris:緩沖液EDTA:螯合劑,螯合酶活性中心的金屬離子,從而抑制DNase的活性酚氯仿:使蛋白質變性,同時抑制了DNase的降解作用。用苯酚抽提過程中,蛋白質與DNA分離,蛋白質與苯酚相似相溶,DNA溶于水相,離心分離后保持水相,加入酒精沉淀DNA。重蒸水:吸取DNA上面所粘附的離子RNA酶:降解混雜在DNA 中的RNA 2、簡述DNA提取過程中需要注意哪些問題。1)材料量不能太多,氯仿的加入量不能太少,且要充分搖勻,否則蛋白質變性不完全。2)苯酚具有高度腐蝕性,飛濺到皮膚、粘膜和眼睛會造成損傷,因此應注意防護。氯仿易燃、易爆、易揮發,具有神經毒作用,操作時應注意防護。3) 操作要
7、快,酚暴露在空氣和光線下易被氧化,呈紅色。4)收集細胞的多少是實驗成功與否的關鍵;5)沉淀中加1ml STE后,打散細胞團便于充分消化細胞;6)飽和酚吸取時記得吸取下層的有機相;7)乙醇沉淀時,要沿離心管壁向DNA溶液中加入無水乙醇,輕輕搖動離心管混和至體系完全均一,見白色絮狀DNA。3、查閱資料簡單介紹通過紫外分光光度計給核酸定量的原理。分光光度計計采用一個可以產生多個波長的光源,通過系列分光裝置,從而產生特定波長的光源,光源透過測試的樣品后,部分光源被吸收,計算樣品的吸光值,從而轉化成樣品的濃度。樣品的吸光值與樣品的濃度成正比??梢远咳苡诰彌_液的寡核苷酸,單鏈、雙鏈DNA,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波長260 nm。每種核酸的分子構成不一,因此其換算系數不同。定量不同類型的核酸,事先要選擇對應的系數。如:1OD 的吸光值分別相當于
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