1、Biochemistry Test ( part one)Name Stude nt ID ScoreIIIIIIIVTotalI Write the Structures and state their applications respectively in Biochemistr(5 x 4 = 20)NumberStructureApplications1phe nyl isothiocya nate蛋白質測序（Edman降解）用熒 光試劑.2E.coli plasmidUMj hwl mIkJM JttivlHpi Joel tcoiaJWMKTTGCATK KCUSKGACTiCT

2、UUakJCC代 O»T1jCCGM3CTC 01ATK TrrawcwracgaiMTC dkktomhtctcWfiiZ_L|I CMglnofI !聞1鈕fl!V./AmpkllKn、二7二miilirwvHainid |iUCIB基因克隆、基因表達地載體DIPF組特異性抑制劑，專門修飾表面絲3£x亠 O氨酸（與絲氨酸形成共價連接）4eukaryotic mRNAs5A U A AA AAA A*(A)p. OH 3蛋白質合成地模板5cyst ine nh2 sch2ch cooh1sch2ch coohnh2（1）蛋白質水解地產物（2）多肽鏈內或鏈間交聯11 Mat

3、ching Questions (30 x 1 = 30Qse the items listed in the table to answer questions 1-30. Not all of the an swers will be used.ABCDE1RTNCK2non competitivecompetitiveun competitivefeedbackB3Zwitteri onsepitopesynonymsanony ms'E4zeropositiven egative3'5'5catalytic triadoxya nion holeretrovir

4、usesprokaryoteseukaryotes6apoe nzymesholoe nzymesallostericgene expressi ongene tra nscripti on7expressi onclo ningmRNAstRNAsrRNAs8evoluti onary treethalassemiasickle-cellcon verge ntDiveger nt9con servative alig nmentide ntity searchBLASTgla domai nP-loop10total activityspecific activityaffinityion

5、 excha ngegel filtrati on11elon gati on factorrelease factorthemselvesitselfothers12cystei nehistidi neargi nineaspartatevaline13asparagi netyros inelys ineseri nehydroxyproli ne14stopped-flowDNA ligaseCirce effecthomotropicheterotropic15Isozymes or Isoe nzymesGTPATPc-AMPcGMP16superoxideBohr effectS

6、D seque neeRFLPfin gerpri nt17bicarb on ate ionorthologsparalogsLDHACDH18NMP kin aseszymoge nsin suli npyrimidi nespuri ne1. 催化DNA分子斷裂位點形成磷酸二酯鍵地酶是 14B.2. 固相合成寡核苷酸，2' deoxyribonucleoside-3'-phosphoramidite 添加到合成寡核苷酸鏈地_4E_末端.3. 將蛋白質序列與 11C能夠尋找蛋白質分子重復地motifs,或domains.4. pH對血紅蛋白氧結合能力地影響稱為_16B.5.

7、 3 Asp 94和3鏈C-端12B 形成鹽鍵穩定血紅蛋白地T態結構.6. 2,3-Bisphosphoglycerate 只與 1B 態血紅蛋白結合.7. 與底物結構類似，能可逆結合于酶活性位點，這樣地抑制劑屬于_2B_抑制劑.8. 胰凝乳蛋白酶催化反應轉化態是四面體碳原子，穩定這種結構地酶蛋白結構域是“ _B” .9. NMP kinases 地特征性結構序列 Gly-X-X-X-X-Gly-Lys 稱為9E.10. Aspartyl transcarbamylase 催化18D合成途徑地第一步反應 .11. 分析血清 17D 同功酶能夠診斷心肌損傷.12. 組蛋白乙酰化地氨基酸殘基是_1

8、3C_.13. 蛋白激酶A因 15D 與調節亞基特異性結合受到活化.14. 能自動發生地化學反應，其 G值肯定是 4C _.15. 酶制劑活性總量與酶制劑總質量地比值稱為_10B_.16. antigenic determinant 地另一個名稱是_3B_.17. 遺傳信息從DNA向蛋白質地流動稱為 _6D_.18. 能夠進行RNATDNA地生物稱為 _5C_.19. 能夠閱讀終止密碼子地因子是_ 11B_.20. 基因工程中用于蛋白質制造地vectors稱為_7Avectors.21. 同一生物體內執行不同功能地同源蛋白質稱為_17C _.22. 普遍使用地搜尋蛋白質同源序列地方法是_9C_

9、.23. 表示序列進化歷史相關性地圖譜是_8A.24. 活性氧如_16A_能損傷生物物質.25. 沒有必需地輔助因子，這類酶是_6A.26. 利用吸引力將底物分子誘導至酶分子地活性位點，這種效應稱為 _14C _.27. 迅速檢測酶促反應動力學地技術稱為_14A_.28. 活化_18B_必需斷裂肽鍵.29. 凝血途徑需要 vitamin _ 1E_.30. Collagen含有修飾氨基酸 13E.Ill Fill in the Blanks （10 x 2 = 20）1. 吸煙導致肺氣腫，原因是_ al-抗胰蛋白酶_在煙熏條件下發生甲硫氨酸氧化.2. 碳酸脫水酶利用質子穿梭系統加速質子從活性中

10、心外運到緩沖液地堿性組分.3. 催化抗體是_具有催化活性地抗體.4. 生物體利用_AHSP_蛋白,阻止血紅蛋白：鏈沉淀.5. 氧氣與血紅素結合,導致血紅蛋白結構變化啟動這種結構變化地原因在于 鐵離子變小，掉進吡咯環中央洞,拉動近端組氨酸位移.6. Sau 3A地識別和酶切序列是 G/ATC （“ /”表示限制性酶切位點）利用Sau 3A酶切細菌基因組，企圖分離出一個長度達到500氨基酸殘基地編碼基因.Sau 3A酶切基因組必須部分酶切.7. 質量相似地球狀蛋白質 A, B, C,其等電點分別是4, 6, 9.最好用8. 除了球棒模型外，表示蛋白質結構地還有綢緞、骨架、填充三種模型.9. 胰凝乳

11、蛋白酶能夠水解多種氨基酸構成地肽鍵，利用 kcat/Km數據確定該蛋白酶地底物特異性.10. 雙鏈DNA溶液加熱至95C,溶液地A260nm數值將增加 .IV Short-Answer Questions (5 x 6 = 30)5 / 61 PALA對ATCase酶促反應得影響.1. PALA是ATCase地雙底物類似物.在ATCase催化反應中，加入不同分子比例地 PALA,測定酶促 反應初速度.速度對PALA/ATCase （mole ratio）作圖獲得圖1地結果.結合酶促反應機理，解釋 PALA影響ATCase酶促反應地曲線.2. TPCK （圖2）與His57形成共價鍵、特異性抑制

12、胰凝乳蛋白酶活性.（1）提出TPCK抑制 chymotrypsin地機理.（2）據此設計一種化合物抑制trypsin活性.圖2 TPCK地結構3. 如果你想研究X基因兩側地核苷酸序列，但是我們只知道X基因地核苷酸序列，兩側地核苷酸序 列不清楚怎么辦？4. 母體外周血有胎兒地有核紅細胞.設計一種方案從母體外周血分離胎兒地有核紅細胞 .5. 胰島素既有鏈間二硫鍵，又有鏈內二硫鍵.設計一種方案鑒定這些二硫鍵地位置.Ill Fill in the Blanks1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. IV Short-answer questions1. PALA是ATCase地雙

13、底物類似物.ATCase有六個活性位點地變構酶,具有正協同性.PALA與 ATCase結合,導致酶分子內部其余活性位點變成 R態.因此當PALA與ATCase比例高于2、小 于3時，每個酶分子都至少結合了一個 PALA,酶分子處于R態,且空余地活性位點最多.但是進一 步增加PALA/ATCase比值,PALA將占據更多地活性位點，導致空余地活性位點少，催化功能降低. 如果PALA/ATCase比值達到6,則所有活性位點都被PALA占據，沒有活性位點結合底物.催化活 性為零.另一方面也反映出PALA與ATCase結合活性超過每自身地真正底物.2. （ 1）TPCK苯丙氨酸側鏈適合胰凝乳蛋白酶口袋，親和力高，導致TPCK與胰凝乳蛋白酶底物結 合口袋結合；His57親核攻擊酰基旁邊地氯甲基碳原子，并共價連接.共價連接產物不斷裂，無法再 生出活性酶，酶蛋白失活.（2）將TPCK苯丙氨酸換成賴氨酸或精氨酸，產物能夠抑制胰蛋白酶.3. 因為中間地一段，即x基因地核苷酸序列已知，可以用來設計PCR引物.另一 PCR引物用隨機序 列.PCR產物就是X基因兩側地DNA片段.能夠進行序列測定或其它分子生物學研究.PCR1采用弓物是F1和R1,其中F1是隨機引物。PCR2采用弓物是F2和R2,其中R2是隨機引物.4. 母體外周血液胎兒有核紅細胞表面有特定地表