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文檔簡介
1、張發(fā)寶張發(fā)寶生物谷網(wǎng)站生物谷網(wǎng)站上海北岸信息技術(shù)有限公司上海北岸信息技術(shù)有限公司檢索檢索(retrieve)查找查找(search, find)有四層含義:1 如何有效查找到所需文獻2 如何查全,查精所需文獻3 如何整理、歸納文獻4 從文獻中得出有意義的結(jié)論Select-選擇合適的數(shù)據(jù)庫Search-如何精確查找文獻Sort-文獻的篩選與歸類Systematize-文獻管理軟件的使用 Strategy-如何從文獻中發(fā)現(xiàn)idea? 1 期刊類、專利類、新聞類、會議類、書籍類等數(shù)據(jù)庫;其它是專門的數(shù)據(jù)庫,如藥物數(shù)據(jù)庫,中草藥數(shù)據(jù)庫,疾病數(shù)據(jù)庫等。 最常用的期刊類。 中文:維普,萬方,CNKI三大期
2、刊知識庫。超星、書生之家書籍庫。 英文:Pubmed、SD、EBSCO、Springer、NPG、Ei Village、CAS、Kluwer 1 關(guān)鍵詞檢索 2 組合檢索、二次檢索、回溯檢索 如何將檢索到的文獻進行篩選和歸類。檢索一直有一個問題:不熟練檢索的同學(xué)往往拼命查資料;而熟悉檢索的同學(xué)往往內(nèi)容太多,大量時間在重復(fù)檢索和查找已檢索過的內(nèi)容。 正常:Search : Sort = 3 : 7 往往:Search : Sort = 5 : 5 1 只保留重要的資料-不要什么文獻都要!許多新手往往只要查到的資料,就一定要保存下來,哪怕僅僅是相關(guān)。時間長了,這些不重要的資料,往往占住你主要地方。
3、 2 一定要精細分類,并錄入數(shù)據(jù)庫。傳統(tǒng)的電腦中按文件夾分類已不能適應(yīng)時代的發(fā)展了。務(wù)必要用合適的軟件進行歸類。 3 要分精讀與速讀兩類 Reference Manage和Endnote優(yōu)點:處理英文較方便,前者屬于老牌軟件商了。但后者信息更新快,尤其是文獻檢索更新更快,近來應(yīng)用更廣。同時Endnote還能支持中文期刊的格式,這也是比較優(yōu)秀的一面。不利:價格比較貴,界面為英文的。 這是國內(nèi)近年來發(fā)展最快的一款軟件,同類軟件還有文獻王,但前者運行效率更高,適用面更廣,對中英文支持都非常完善,升級更快,值得期待。文獻怎么看?多看還是少看?文獻怎么看?多看還是少看?-看少了什么都不懂;看多了什么都不
4、做了。-走進文獻,走出文獻走進文獻,走出文獻 1 文章背后的故事 2 文章與文章間的idea溝通。 許多文獻你閱讀完以后,覺得很完善,這一塊似乎已經(jīng)perfect了,實際上你需要更多思考這篇文章的缺陷,即使是CNS上的,同樣有漏洞,這些漏洞有時是作者回避的,或尚未研究的東西,這里面就是新的idea來源。 如何讀出文章背后的故事,這非常重要。讀文獻有兩個境界,一是入,二是出。先要按作者意思去讀文獻,讀懂它;其次按作者的方法去自己假設(shè),從更高角度 看這篇文章,還有哪些不完善的地方? 如ES細胞培養(yǎng)的例子,一開始文獻是記錄XXX培養(yǎng)成功,保持不分化狀態(tài)。你認為很高興,但你是否注意到他曾經(jīng)失敗過多少次
5、,或者說正常培養(yǎng)就失敗。那么這背后到底是什么因素導(dǎo)致成功?什么因子? 有時有些文獻中一句話,里面可能是一個大課題。如ES細胞在無血清培養(yǎng)下會向神經(jīng)細胞方向分化,因此必需有血清培養(yǎng)。這是常識,但為什么呢?這就一個大課題。 細胞凋亡需要ATP參與,是主動過程,這句話背后包含了這一層含義:ATP是凋亡必需的。但同樣有另一個常識,細胞在死亡過程中ATP往往下降,這其中存在一個矛盾,就也是idea.案例案例1:低氧導(dǎo)致細胞死亡。:低氧導(dǎo)致細胞死亡。這是常識,但是是否存在一種細胞,給它各種各樣的刺激仍不會死亡?其機理是什么?案例2:為什么成年以后,心臟細胞,腦細胞不分裂了,而有些細胞卻可以分裂?-是不是因
6、為細胞周期缺失了某些因子?如果人為補充這些因子又如何?案例3:細胞周期分裂大家都認為是G0-G1-S-M,那么我們能逆向進行嗎?案例4:大象細胞大還是細胞多? 為什么案例5:蛇等有毒動物為什么不毒自己?蛇毒與Na通道關(guān)系 案例1:細胞周期中Cyclin D是必需的 -如果我knockout這個基因呢? 案例2:大腸桿菌不能產(chǎn)生糖蛋白,這是基因工程上最頭疼的難題。 -能否人為轉(zhuǎn)入產(chǎn)生糖蛋白相關(guān)基因,讓大腸桿菌也能產(chǎn)生人類的糖蛋白? 案例3:癌癥是干細胞? 案例4:SiRNA,CaM的發(fā)現(xiàn) 案例5: TNF基因無法被SiRNA將相似的文獻做比較,總結(jié)異同案例1:做骨髓間質(zhì)干細胞(MSC)分化時:
7、A+B-誘導(dǎo)向神經(jīng)細胞分化 C+E誘導(dǎo)向內(nèi)皮細胞分化 B+F誘導(dǎo)向脂肪細胞分化B在在MSC分化中作用分化中作用案例案例2:離子通道屬性在高等生物神經(jīng)細胞上研究已相對透徹。可以引出以下幾個問題:(1)特殊物種:線蟲,果蠅,蛇,或一些突變體上呢?(2)特殊類型細胞:腫瘤細胞,胚胎干細胞,腎上皮?(4)同一通道放在不同細胞上呢?如NMDA受體轉(zhuǎn)到腎上皮呢? 如已知 ABC 和 FGC ,那么C可能是連接BG的關(guān)鍵,這里面可能會出現(xiàn)新的idea. 案例1:如長期關(guān)節(jié)炎患者,往往冠心病發(fā)生少。如服阿斯匹林可以減少心臟病 案例2:長期服用抗生素患者,患冠心病機率也下降-冠心病與支原體相關(guān)學(xué)說 案例3:神經(jīng)細胞中觀察到同一種信號分子在細胞中不同位置作用不同。那么在其它細胞呢? 案例4:睡眠足,白天記憶好,why?-hypothesis: GABA對學(xué)習(xí)和記憶作用的多面性 案例5:RA,As2O3促白血病分化;低氧可以促進干細胞分化; 不要看不起gap junction的工作,這是絕大部分工作的源
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