1、第一節 pubmed pubmed概述概述1pubmed的檢索方法的檢索方法 2pubmed檢索結果的處理檢索結果的處理 3pubmed的其他工具與鏈接的其他工具與鏈接 4小結小結54.1.1 pubmed概述概述pubmed概述概述v什么是什么是pubmed？vpubmed的發展過程的發展過程vpubmed的收錄范圍的收錄范圍vpubmed的記錄來源的記錄來源vpubmed的常用字段的常用字段什么是什么是pubmed?v生物醫學研究領域應用最廣泛也最重要的數據庫，生物醫學研究領域應用最廣泛也最重要的數據庫，由美國國立衛生研究院（由美國國立衛生研究院（nih）下屬的美國國立）下屬的美國國立醫學

2、圖書館（醫學圖書館（nlm）的國家生物技術信息中心）的國家生物技術信息中心（ncbi）開發、維護）開發、維護v面向全世界免費提供最新的生物醫學信息面向全世界免費提供最新的生物醫學信息v每周每周5天更新數據，檢索功能完善，使用方便天更新數據，檢索功能完善，使用方便v整合在整合在ncbi的統一檢索平臺的統一檢索平臺entrez上，與該平臺上，與該平臺其他數據庫建立無縫鏈接，可實現跨庫檢索其他數據庫建立無縫鏈接，可實現跨庫檢索 /pubmed6pubmed發展過程發展過程1997-1983-1971-1879-pubmed網絡數據庫網絡數據庫med

3、line光盤數據庫光盤數據庫medline聯機檢索系統聯機檢索系統index medicus （im）檢索期刊）檢索期刊pubmed的收錄范圍的收錄范圍v收錄全世界收錄全世界80多個國家多個國家5200多種生物醫學期刊的多種生物醫學期刊的文摘及題錄數據文摘及題錄數據v絕大部分可回溯至絕大部分可回溯至1948年，最早回溯至年，最早回溯至1865年年v累積了累積了1900多萬條文獻記錄多萬條文獻記錄v部分文獻可直接獲取全文，包括：部分文獻可直接獲取全文，包括： pubmed central (pmc，收錄期刊780余種)：nlm開發的免費生物醫學數字化期刊全文數據庫 開放獲取（open acces

4、s，oa）期刊 部分出版商提供的免費文獻 v與出版商的電子期刊文獻同步發布，標注為與出版商的電子期刊文獻同步發布，標注為epub ahead of print（先于印刷版期刊發表的電子文獻）（先于印刷版期刊發表的電子文獻）或或epubpubmed的記錄來源的記錄來源v medline：pubmed主體部分主體部分pubmed-indexed for medlinev in-process citations： 尚未進行尚未進行mesh主題詞主題詞標引的最新文獻標引的最新文獻pubmed-in processv publisher supplied citations：出版商提供，：出版商提供，

5、但不被但不被medline收錄的文獻收錄的文獻pubmed - as supplied by publisherv oldmedline：部分：部分1966年以前出版且未被年以前出版且未被medline收錄的文獻收錄的文獻pubmed-oldmedline pubmed記錄的主要字段記錄的主要字段字段標識：字段名稱字段標識：字段名稱 ab：abstract ad：affiliation all：all field au：authors 1au：first author fau：full author name lastau：last author pmid：pubmed unique iden

6、tifier cy：country dp：publication date edat：entrez date gs：gene symbol gn：grant number 字段標識：字段名稱字段標識：字段名稱 is：issn la：language mh：mesh terms majr：mesh major topic sh：mesh subheadings pt：publication type so：source ta：journal title ti：title tw：text words uid：unique identifiers nm：substance number tiab：t

7、itle/abstract4.1.2 pubmed的檢索方法的檢索方法4.1.2 pubmed的檢索方法的檢索方法v 基本檢索基本檢索 自動詞語匹配檢索 著者檢索 期刊檢索 短語精確檢索 截詞檢索 字段限定檢索 布爾邏輯檢索v 高級檢索高級檢索 檢索史 組合檢索 檢索限定 索引檢索 主題詞檢索 期刊數據庫檢索 單篇引文匹配器 臨床查詢 專類查詢 pubmed主頁面主頁面基本檢索高級檢索登錄my ncbi自動詞語匹配檢索自動詞語匹配檢索(automatic terms mapping) v輸入有實際意義的檢索詞，點擊輸入有實際意義的檢索詞，點擊“search”，系，系統按照自動詞語匹配的原理進行

8、檢索統按照自動詞語匹配的原理進行檢索vpubmed最具特色的檢索功能之一最具特色的檢索功能之一 智能化的檢索過程 基本原理：對輸入的檢索詞，首先在多個索引詞表進行搜索、比對，并自動轉換為相應的mesh主題詞、著者或刊名，再將檢索詞在all fields（所有字段）中檢索，并執行“or”邏輯運算。如有多個檢索詞或短語詞組，則繼續將其拆分為單詞后分別在all fields（所有字段）中檢索，單詞之間的邏輯關系為“and”vsearch details框詳細顯示自動詞語匹配的實際框詳細顯示自動詞語匹配的實際檢索式檢索式v有較好的查全率，同時保證一定的查準率有較好的查全率，同時保證一定的查準率v例如，

9、查找阿司匹林防治心肌梗死的文獻，最簡單例如，查找阿司匹林防治心肌梗死的文獻，最簡單的方法是在檢索框中直接輸入的方法是在檢索框中直接輸入heart attack aspirin三個詞，系統即進行自動詞語匹配檢索，三個詞，系統即進行自動詞語匹配檢索，detail欄欄目顯示目顯示pubmed實際執行的檢索式為實際執行的檢索式為(myocardial infarctionmesh terms or (myocardialall fields and infarctionall fields) or myocardial infarctionall fields or (heartall fields

10、and attackall fields) or heart attackall fields) and (aspirinmesh terms or aspirinall fields)著者檢索著者檢索v 在檢索框中輸入著者姓名，在檢索框中輸入著者姓名，pubmed自動執行著自動執行著者檢索者檢索v 一般姓在前名在后，姓用全稱，名用首字母一般姓在前名在后，姓用全稱，名用首字母例如，輸入smith sr可檢索出姓為smith，名的首字母為sr的所有著者的文獻v 為提高查準率，可將著者與著者單位、主題等信為提高查準率，可將著者與著者單位、主題等信息結合起來檢索息結合起來檢索v 2002年以后的文獻

11、，年以后的文獻，pubmed可實現對姓名全稱可實現對姓名全稱的檢索，而且姓名排列順序不限的檢索，而且姓名排列順序不限例如，輸入smith sr的姓名全稱steven r smith，可檢索出2002年以來該著者被pubmed收錄的文獻。v 通過字段限定檢索及組合檢索可實現更精確的著通過字段限定檢索及組合檢索可實現更精確的著者檢索者檢索例如，輸入smith sr 1au可檢索出第一著者為smith sr的所有文獻。 期刊檢索期刊檢索v 在檢索框中輸入期刊信息，在檢索框中輸入期刊信息，pubmed自動檢索出該自動檢索出該期刊的文獻：期刊的文獻：刊名全稱：如the american journal

12、of pathology標準的medline刊名縮寫：如am j pathol期刊的issn號：如0002-9440， am j pathol issn號v 當刊名與當刊名與mesh詞相同時，詞相同時，pubmed默認將其作為默認將其作為mesh詞檢索。為避免誤檢，可采用刊名字段限定詞檢索。為避免誤檢，可采用刊名字段限定檢索檢索例如，cell ta可檢索出在期刊cell被pubmed收錄的所有文獻v 利用利用pubmed的的journals database可查找期刊的可查找期刊的詳細信息詳細信息 短語精確檢索短語精確檢索v 短語精確檢索是將檢索詞加上雙引號進行強制短語精確檢索是將檢索詞加上雙

13、引號進行強制檢索檢索v 短語精確檢索時，短語精確檢索時，pubmed關閉自動詞語匹配關閉自動詞語匹配功能，直接將該短語作為一個檢索詞進行檢索，功能，直接將該短語作為一個檢索詞進行檢索，避免了自動詞語匹配時將短語拆分可能造成的避免了自動詞語匹配時將短語拆分可能造成的誤檢，可提高查準率誤檢，可提高查準率例如，輸入“metabolic syndrome”, pubmed在所有可檢索字段中查找含有短語詞組metabolic syndrome的文獻 截詞檢索截詞檢索v 在檢索詞后加在檢索詞后加“*”可實現截詞檢索，以提高查全可實現截詞檢索，以提高查全率率v 截詞檢索時，截詞檢索時，pubmed關閉自動詞

14、語匹配功能關閉自動詞語匹配功能 例如，輸入immun*可檢索出immun開頭的所有詞語，如immunity, immunology, immune, immunological等字段限定檢索字段限定檢索v字段限定檢索的形式：檢索詞字段限定檢索的形式：檢索詞 字段標識字段標識 例如，leukemia ti可檢索出篇名中含有leukemia的文獻 myocarditis majr可檢索出mesh major topic為myocarditis的文獻v字段限定檢索可提高查準率字段限定檢索可提高查準率布爾邏輯檢索布爾邏輯檢索v 支持支持and，or，not布爾邏輯運算布爾邏輯運算v 邏輯運算符要大寫邏

15、輯運算符要大寫v 直接輸入幾個檢索詞，系統默認詞之間是直接輸入幾個檢索詞，系統默認詞之間是and的邏輯組配關系的邏輯組配關系v 可以輸入檢索式的序號進行布爾邏輯運算，如可以輸入檢索式的序號進行布爾邏輯運算，如#1 and #3 pubmed高級檢索頁面高級檢索頁面檢索史組合檢索檢索限定索引檢索臨床咨詢、專題咨詢、主題詞檢索、期刊檢索、單篇引文匹配器檢索史（檢索史（search history）v點擊點擊search history，顯示檢索史，包括檢索式，顯示檢索史，包括檢索式序號、檢索提問式、檢索時間及檢索結果數序號、檢索提問式、檢索時間及檢索結果數v單擊檢索式序號，顯示單擊檢索式序號，顯示

16、options選項，可執行選項，可執行and, or, not、delete（刪除檢索式）、（刪除檢索式）、go（直接檢索）、（直接檢索）、details（顯示檢索式詳情）、（顯示檢索式詳情）、save in my ncbi（把檢索式保存在（把檢索式保存在my ncbi）等不同操作等不同操作v檢索史最多保留檢索史最多保留8小時小時 pubmed高級檢索的檢索史高級檢索的檢索史點擊檢索式序號，顯示options選項組合檢索（組合檢索（search by author，journal，publication date，and more）v組合檢索可以實現多個字段的邏輯組配檢索組合檢索可以實現多個字

17、段的邏輯組配檢索v默認在最近一次檢索式的基礎上進行字段限定檢默認在最近一次檢索式的基礎上進行字段限定檢索，以提高查準率索，以提高查準率v檢索時，先選擇檢索字段，輸入檢索詞（點擊檢索時，先選擇檢索字段，輸入檢索詞（點擊index顯示該檢索詞的索引，幫助選詞），再確顯示該檢索詞的索引，幫助選詞），再確定檢索詞的邏輯關系，默認為定檢索詞的邏輯關系，默認為all of these（and），也可以選），也可以選any of these （or），點），點擊擊search，完成檢索，完成檢索 舉例：舉例：通過組合檢索查找通過組合檢索查找2000年以來美國路易斯安州年以來美國路易斯安州pennington

18、 biomedical research center的的smith sr在在diabetes上發表的文獻上發表的文獻 多個字段的組合檢索，提高查準率點擊index可幫助選詞檢索限定（檢索限定（limit by topics，languages, and journal groups）v檢索限定可以對檢索結果進行精確的限定，包括：檢索限定可以對檢索結果進行精確的限定，包括： full text, free full text, and abstracts（限定檢索結果含全文鏈接、免費全文或摘要） human or animals（研究對象） gender（性別） language（語種） ty

19、pe of article（文獻類型） ages（年齡） subsets（子集，可以按journal groups、topics等劃分）v注意：檢索限定一經選定，會保持激活狀態而在此注意：檢索限定一經選定，會保持激活狀態而在此后的檢索中持續起作用后的檢索中持續起作用 舉例：檢索舉例：檢索“羅格列酮治療羅格列酮治療老年人老年人糖尿病的糖尿病的隨機對照臨床試驗隨機對照臨床試驗的的英文英文文文獻獻”，可輸入，可輸入 diabetes mellitus rosiglitazone，再進行檢索限，再進行檢索限定定文獻類型選“隨機對照試驗（rct）”語種選“英語”年齡選“老年人”索引檢索（索引檢索（ind

20、ex of fields and field values）v索引檢索主要用于正確選擇檢索詞索引檢索主要用于正確選擇檢索詞v先選擇檢索字段，輸入檢索詞后點擊先選擇檢索字段，輸入檢索詞后點擊index，可，可顯示該詞的相關索引詞，選定檢索詞后點擊顯示該詞的相關索引詞，選定檢索詞后點擊and、or或或not，可以與最近一次的檢索式進行布爾，可以與最近一次的檢索式進行布爾邏輯運算邏輯運算 pubmed的索引檢索的索引檢索myocardial infarction的所有索引詞選定檢索詞后進行布爾邏輯運算mesh主題詞檢索（主題詞檢索（mesh） vmesh主題詞檢索是主題詞檢索是pubmed最具特色的

21、檢索功能最具特色的檢索功能之一，能保證較好的查全率和查準率之一，能保證較好的查全率和查準率 主題詞對同一概念的不同表達方式進行了規范 主題詞可以組配相應的副主題詞，使檢索結果更加專指 主題詞的樹狀結構表：系統默認對含有下位概念的主題詞進行擴展檢索（點選do not explode this term則不進行擴檢） 應用major topic（主要主題詞）檢索，可以使檢索結果更加準確v注意：用注意：用mesh詞檢索時，只檢索來源于詞檢索時，只檢索來源于medlilne的文獻，不檢索的文獻，不檢索pubmed其他來源的文其他來源的文獻（包括獻（包括in-process， supplied by p

22、ublisher, oldmedline等）等） 舉例：用舉例：用mesh主題詞檢索有關艾滋病流行病學的文獻主題詞檢索有關艾滋病流行病學的文獻v檢索步驟檢索步驟1. 進入mesh database主頁面，在檢索框中輸入aids，點擊go，系統提供與aids相關的所有主題詞及其含義2. 瀏覽選詞，確定aids的規范化mesh主題詞為acquired immunodeficiency syndrome，點擊進入主題詞細覽頁面，包括主題詞定義，副主題詞(subheadings)，入口詞或款目詞(entry terms)，相關參照(see also)，樹形結構(mesh tree)3. 在subhea

23、dings中點選epidemiology（流行病學）4. 點選restrictions search to major topic headings only（檢索結果限定為主要主題詞）5. 在sent to下拉菜單中點選search box with and，檢索框中出現檢索式acquired immunodeficiency syndrome /epidemiologymajr，點擊search pubmed，可得檢索結果 mesh主題詞檢索主頁面主題詞檢索主頁面輸入入口詞aidsaids的規范化主題詞及含義aids的相關主題詞mesh主題詞細覽頁面主題詞細覽頁面選擇副主題詞“流行病學”限

24、定檢索結果為主要主題詞（major topic）確定主題詞及副主題詞后，點選search box with and點擊search pubmed完成檢索mesh主題詞的其他信息主題詞的其他信息mesh主題詞的入口詞或款目詞mesh主題詞的相關參照mesh主題詞的樹形結構期刊數據庫檢索（期刊數據庫檢索（journals）v期刊數據庫檢索可查詢期刊數據庫檢索可查詢pubmed及及entrez平臺其平臺其他數據庫所收錄的期刊信息他數據庫所收錄的期刊信息v提供提供topic、刊名全稱、刊名全稱、medline刊名縮寫、刊名縮寫、issn等檢索途徑，也可以按學科（等檢索途徑，也可以按學科（subject

25、 terms）進行瀏覽）進行瀏覽v在在journal database主頁面主頁面 點擊limits可以按語種、不同子集及其他字段進行期刊檢索 點擊lists of all entrez journals，鏈接到entrez平臺所收錄期刊一覽表（包括pubmed收錄的所有期刊） 點擊links to full-text web sites，可鏈接到linkout journal lists頁面，了解能提供期刊全文的web站點 舉例：查詢舉例：查詢pubmed收錄了哪些生理學方面的期刊？收錄了哪些生理學方面的期刊？輸入刊名關鍵詞”生理學”某種期刊的詳細信息期刊的基本信息單篇引文匹配器（單篇引文匹

26、配器（single citation matcher）v單篇引文匹配器主要用于查找某一篇文獻的準確單篇引文匹配器主要用于查找某一篇文獻的準確信息信息v點擊點擊journal citation matcher，在系統給出的，在系統給出的選項中輸入已知信息，點擊選項中輸入已知信息，點擊go，返回符合要求的，返回符合要求的文獻信息文獻信息 journal：輸入刊名的任何有效信息，系統會主動給出提示，幫助選擇正確的刊名 date：輸入期刊的出版日期 volume、issue、first page：輸入期刊的卷、期、起始頁碼 author name：輸入著者 title works中：輸入文獻篇名中的任

27、意詞舉例：已知舉例：已知2008年年circulation上有關于心源性休克的綜述文獻，查詢該篇文上有關于心源性休克的綜述文獻，查詢該篇文獻的準確信息獻的準確信息輸入刊名、年份、題名中的詞等已知信息臨床查詢（臨床查詢（clinical queries）v臨床查詢是專門為臨床醫生設計的檢索服務，包臨床查詢是專門為臨床醫生設計的檢索服務，包括括 search by clinical study category 查找疾病的etiology、diagnosis、therapy、prognosis及clinical predictions guides文獻，綜合考慮檢索結果的敏感性（broad，sen

28、sitive search，查全率較高）與特異性（narrow，specific search，查準率較高） finding systematic reviews 提供systematic reviews、meta analysis、reviews of clinical trials、guidelines等循證醫學文獻 medical genetics searches 查詢疾病的遺傳學文獻，有all 、diagnosis、differential diagnosis、clinical description、management、genetics counseling、molecular

29、genetics、genetics testing等選項pubmed的臨床查詢（的臨床查詢（clinical queries）頁面）頁面檢索系統評價等循證醫學文獻檢索疾病的遺傳學文獻查找疾病的病因、診斷、治療、預后等信息專題查詢（專題查詢（special queries）v專題查詢匯總整合了專題查詢匯總整合了pubmed提供的其他專題檢索提供的其他專題檢索功能（功能（directory of topic-specific pubmed queries），并提供相應的鏈接，包括：），并提供相應的鏈接，包括： 不同的學科專題（subjects）設立的子集（subsets）：如aids，toxico

30、logy、cancer、history of medicine等 不同的期刊專輯（journal collections） 4.1.3 pubmed檢索結果的處理檢索結果的處理檢索結果顯示檢索結果顯示vpubmed檢索結果顯示默認為檢索結果顯示默認為summary格式，包格式，包括：括： 篇名 著者 刊名 出版年月及卷期頁碼 pmid號 記錄狀態（indexed for medline; in process；) 相關文獻（related articles）鏈接 如有免費全文，則有free article鏈接vsummary顯示格式的頁面右側有多個欄目，主顯示格式的頁面右側有多個欄目，主要包括

31、：要包括： limits activated：處于激活狀態的檢索限定點擊，remove去除限定，change更改限定 filter your results：結果過濾，包括綜述、免費全文等 titles with your search terms：提供20條篇名中包含了檢索詞的文獻記錄（密切相關文獻） free full-text articles in pubmed central：在pubmed central中能直接獲取全文的文獻 find related data：鏈接到ncbi其他數據庫中檢索 search details：詳細顯示pubmed實際完成的檢索式 recent act

32、ivity：顯示最近8小時內在ncbi的操作記錄 pubmed檢索結果的檢索結果的summary顯示格式顯示格式處于激活狀態的檢索限定檢索結果濾過（綜述、免費全文）篇名中包含了檢索詞的密切相關文獻pubmed central中的免費全文點擊display setting可更改顯示格式、每頁顯示條數及排序方式相關文獻及免費全文鏈接pubmed檢索結果的檢索結果的abstract顯示格式顯示格式出版類型、mesh主題詞出版商的全文鏈接保存及輸出格式pmid號及記錄狀態最近的操作記錄檢索結果保存及輸出檢索結果保存及輸出v 點擊檢索結果顯示頁面的點擊檢索結果顯示頁面的send to下拉菜單，下拉菜單，

33、pubmed提供了以下保存及輸出方式，包括：提供了以下保存及輸出方式，包括：1. file：選中文獻記錄以文件的形式保存（ 用medline格式保存文件可以將結果直接轉入endnote等文件管理軟件）2. clipboard（剪貼板）：瀏覽、選擇選所需文獻，在send to中選擇clipboard，點選add to clipboard，選中文獻用綠色提示“item in clipboard” 。剪貼板中最多可保存500條記錄，保存時間為8小時。點擊clipboard鏈接，顯示所有暫存文獻，再集中進行處理3. collections：注冊了my ncbi的用戶可以選擇collections將檢索

34、結果保存在my ncbi中，特別是對那些尚不確定是否相關的檢索結果，可以先保存在collections中，以后再登錄my ncbi對這些文獻記錄進行瀏覽、刪除、排序4. email：將選中的檢索結果直接發送到指定的電子郵箱中。一次最多發送200條文獻記錄5. order：如果用戶無法獲取選中文獻的全文，可用order選項通過loansomedoc文獻傳遞系統向nlm訂購全文，這項服務需支持一定的費用6. rss feed：點擊rss圖標，再點擊create rss即可訂閱，隨時瀏覽追蹤這一檢索策略的最新檢索結果 4.1.4 pubmed的其他工具與鏈接的其他工具與鏈接my ncbi（我的（我的

35、ncbi）vmy ncbi：提供個性化服務，非常實用的文獻管：提供個性化服務，非常實用的文獻管理工具理工具vpubmed主頁的右上方有登錄主頁的右上方有登錄my ncbi 按鈕按鈕v用戶注冊并建立用戶注冊并建立my ncbi賬號后，可以管理在賬號后，可以管理在ncbi所有數據庫的檢索過程及檢索結果，追蹤了所有數據庫的檢索過程及檢索結果，追蹤了解所在研究領域的最新進展解所在研究領域的最新進展 v my ncbi的主要功能：的主要功能：1. 保存檢索策略及email定期自動更新檢索結果完成檢索后，點擊save search，進入my ncbi的my saved data頁面，在name of se

36、arch欄中輸入檢索策略的名稱，點擊save，系統自動提示是否需要通過email定期自動發送新的檢索結果，以及發送的頻率、格式保存檢索策略后，登錄my ncbi主頁面，點擊saved searches子欄目下已保存的各個檢索策略，即可完成檢索點擊saved searches子欄目下的manage按鈕，可以對保存的多個檢索策略進行排序、刪除、更改2. 保存檢索結果 瀏覽并選定檢索結果后，在send to菜單中選擇collections，即進入my ncbi中的collections子頁面 默認為建立一個新文件保存選定的檢索結果，輸入文件名，系統自動提示保存了多少條記錄；也可以將檢索結果添加到已有

37、的文件記錄中 保存檢索結果后，只要登錄my ncbi主頁面， 點擊collections子欄目下的文件名，即可顯示已保存的檢索結果 點擊collections子欄目下的manage按鈕，可以對保存的檢索結果進行刪除、排序、重命名、合并、共享等操作 3.過濾檢索結果 my ncbi的過濾器（filter）提供了個性化的檢索結果過濾功能在my ncbi主頁面，點擊左欄的search filters，點選pubmed，進入pubmed filters，點擊frequently requested filters可對檢索結果進行過濾，有綜述、臨床試驗、免費全文、全文、最近5年的文獻、英文、人類、有摘要

38、等多個選項，勾選所需的項目，即可完成檢索結果過濾的設置。以后只要登錄my ncbi后檢索pubmed，檢索結果顯示頁面右側會顯示已設定的過濾結果，方便用戶瀏覽選擇4.建立個人書目記錄（my bibliography）以及其他感興趣著者的文獻記錄（other citations）5.my ncbi頁面的recent activity可以顯示最近6個月用戶的檢索記錄，包括檢索時間、檢索的數據庫、檢索結果、瀏覽的文獻等 pubmed中中my ncbi主頁面主頁面my ncbi中保存的數據（檢索策略、檢索結果、個人書目及操作記錄）設置檢索結果過濾在在my ncbi中保存及管理中保存及管理檢索結果及檢索

39、策略檢索結果及檢索策略點擊manage進入檢索結果管理頁面點擊edit對檢索結果進行編輯（刪除、排序、共享、重命名等）點擊setting可設置email定期發送檢索結果點擊manage進入檢索策略管理頁面外部鏈接（外部鏈接（linkout）vpubmed主頁主頁more resources欄目下有欄目下有linkout外部鏈接外部鏈接vpubmed及及ncbi的其他數據庫通過的其他數據庫通過linkout與其與其他外部資源與服務建立鏈接，包括在線全文數據他外部資源與服務建立鏈接，包括在線全文數據庫、生物學數據庫、圖書館館藏信息、消費者健庫、生物學數據庫、圖書館館藏信息、消費者健康信息、研究工具

40、等康信息、研究工具等批量引文匹配器（批量引文匹配器（batch citation matcher）v點擊點擊pubmed主頁的主頁的pubmed tools欄目下的欄目下的batch citation matcher，進入批量引文匹配器，進入批量引文匹配器，主要用于批量核對文獻信息主要用于批量核對文獻信息v檢索時輸入的格式為：檢索時輸入的格式為： 刊名年卷起始頁碼著者核對文獻的標識 返回的結果含有文獻記錄的唯一識別碼pmidv用用batch citation matcher一次可核對不超過一次可核對不超過100條文獻，檢索結果可通過條文獻，檢索結果可通過email發送或直接存入發送或直接存入文

41、件中文件中 臨床試驗數據庫（臨床試驗數據庫（clinical trials）v點擊點擊pubmed主頁主頁more resources欄目下的欄目下的clinical trials，進入美國國立醫學圖書館研制開，進入美國國立醫學圖書館研制開發的臨床試驗數據庫發的臨床試驗數據庫 /vclinical trials收錄了美國及全世界收錄了美國及全世界170多個國家多個國家經注冊登記的經注冊登記的8萬多個臨床試驗的詳細信息，目萬多個臨床試驗的詳細信息，目前包含有前包含有8萬多條，是十分重要的循證醫學萬多條，是十分重要的循證醫學信息信息資源資源4.1.4

42、 pubmed小結小結 pubmed的自動詞語匹配檢索一般適合檢索經驗有限的初級用戶，也適合對課題做初步檢索。檢索經驗豐富的用戶，或者對查全率查準率有較高要求的檢索課題，需要仔細分析課題，編制比較完備的檢索策略，綜合運用pubmed提供的各種高級檢索功能 主題詞檢索是pubmed最具特色的功能之一，能保證較好的查準率及查準率。主題詞組配副主題詞使檢索結果更為專指，限定在主要主題詞檢索能使結果更準確。但是主題詞檢索也有一些固有的缺陷，比如很多專指的概念沒有相應的主題詞，一些新出現的概念要幾年后才收錄為主題詞。這種情況下，采用字段限定檢索等方法也能得到較好的查準率。此外，主題詞檢索還可能會漏掉一些

43、最新的文獻（in process citations） 熟練運用pubmed 的檢索限定、臨床查詢、引文匹配等工具，能大大提高檢索效率。此外，個性化服務工具my ncbi功能強大，能保存、管理在pubmed中的所有檢索過程及檢索結果 第二節 embase 一、概一、概 況況 v荷蘭荷蘭elsevier（愛思唯爾）出版公司出版。（愛思唯爾）出版公司出版。v生命科學領域最重要的四種文獻檢索工具之一。生命科學領域最重要的四種文獻檢索工具之一。 v收錄來自收錄來自70多個國家的多個國家的7200多種同行評審期刊，多種同行評審期刊，數據每日更新，每年新增大約數據每日更新，每年新增大約60多萬篇文獻。多萬

44、篇文獻。v學科覆蓋范圍涉及廣泛。學科覆蓋范圍涉及廣泛。v提供提供emtree主題詞表輔助檢索，詞表整合了主題詞表輔助檢索，詞表整合了nlm的的mesh詞表，共計包括詞表，共計包括5.5萬多個藥物、萬多個藥物、生物醫學和生物學術語，生物醫學和生物學術語，22萬多個同義詞，大約萬多個同義詞，大約2萬個萬個cas化學物質登記號。化學物質登記號。二、檢索運算符與運算規則二、檢索運算符與運算規則v布爾邏輯運算符：布爾邏輯運算符：and、or和和notv鄰近度算符：鄰近度算符：near/n和和next/nv截詞符：截詞符：*號和號和?號號v短語檢索：詞組或短語必須加上引號短語檢索：詞組或短語必須加上引號v

45、字段限定符：主要包括字段限定符：主要包括“：”號和號和“/”號號v多種運算符的聯用：多種運算符的聯用：(symptom* near/5 (headache* or head ache):ti,ab 三、檢索方法與技巧三、檢索方法與技巧v快速檢索快速檢索v高級檢索高級檢索v藥物檢索藥物檢索v疾病檢索疾病檢索v文章檢索文章檢索vemtree主題詞表輔助檢索主題詞表輔助檢索v期刊瀏覽期刊瀏覽v著者檢索著者檢索（一）快速檢索（一）快速檢索（quick search）v對輸入的檢索式進行全文檢索，即在全字段范圍對輸入的檢索式進行全文檢索，即在全字段范圍內的檢索。內的檢索。v可輸入任意的單詞、詞組或檢索表

46、達式，可進行可輸入任意的單詞、詞組或檢索表達式，可進行布爾邏輯檢索、鄰近度檢索、截詞檢索和字段限布爾邏輯檢索、鄰近度檢索、截詞檢索和字段限定檢索。定檢索。vautocomplete功能利用后臺詞表為用戶指引功能利用后臺詞表為用戶指引推薦合適的主題詞，供用戶選擇。推薦合適的主題詞，供用戶選擇。v勾選輸入框下的勾選輸入框下的extensive search選項，系統選項，系統將對檢索式進行擴詞檢索。將對檢索式進行擴詞檢索。（一）快速檢索（一）快速檢索（quick search）快速檢索界面（二）高級檢索（二）高級檢索（advanced search）v檢索表達式的編制方法與規則與快速檢索相同。檢索

47、表達式的編制方法與規則與快速檢索相同。v提供多種對檢索式進行修飾和限定的方法。提供多種對檢索式進行修飾和限定的方法。v提供五種檢索式的修飾方法。提供五種檢索式的修飾方法。map to preferred terminology（匹配主題詞檢索）also search as free text（還作自由詞檢索）include sub-terms/derivatives（擴展下位詞和派生詞檢索）search terms must be of major focus in articles found（主題詞加權檢索）search also for synonyms, explosion on pr

48、eferred terminology（還檢索同義詞及主題詞擴展檢索）v提供多種檢索式的限定檢索方法提供多種檢索式的限定檢索方法 。（一）快速檢索（一）快速檢索（quick search）快速檢索界面高級檢索界面（三）藥物檢索（三）藥物檢索（drug search）v專為檢索藥物信息而設計的檢索途徑，檢索界面、專為檢索藥物信息而設計的檢索途徑，檢索界面、檢索式修飾和限定方法與高級檢索基本相同。檢索式修飾和限定方法與高級檢索基本相同。v針對藥物檢索增設針對藥物檢索增設17種藥物副主題詞和種藥物副主題詞和47種給種給藥途徑的限定選擇。藥途徑的限定選擇。v可輸入藥物屬名、專利商品名，實驗室代碼和化可

49、輸入藥物屬名、專利商品名，實驗室代碼和化學名來檢索藥物信息，如學名來檢索藥物信息，如claritin、loratadine、sch 29851等。等。v輸入的檢索詞會強制轉換匹配輸入的檢索詞會強制轉換匹配emtree藥物主題藥物主題詞進行檢索。詞進行檢索。藥物檢索界面（四）疾病檢索（四）疾病檢索（disease search）v專為檢索疾病信息而設計的檢索途徑，檢索界面、專為檢索疾病信息而設計的檢索途徑，檢索界面、檢索式修飾和限定方法與高級檢索基本相同。檢索式修飾和限定方法與高級檢索基本相同。v針對疾病檢索的需要增設針對疾病檢索的需要增設14種疾病副主題詞的限種疾病副主題詞的限定選擇，如定選擇

50、，如complication、congenital d i s o r d e r 、 d i a g n o s i s 、 d i s e a s e management等，這樣可以增強疾病檢索深度，等，這樣可以增強疾病檢索深度，提高查準率。提高查準率。v輸入的疾病名稱檢索詞會強制轉換匹配輸入的疾病名稱檢索詞會強制轉換匹配emtree疾病主題詞進行檢索。疾病主題詞進行檢索。疾病檢索界面（五）文章檢索（五）文章檢索（article search）v利用某些已知信息檢索某篇或某類文獻的檢索途利用某些已知信息檢索某篇或某類文獻的檢索途徑。徑。v文章檢索提供作者、期刊名稱、刊名縮寫、期刊文章檢索

51、提供作者、期刊名稱、刊名縮寫、期刊分類編號、分類編號、issn號碼、期刊卷、期號及文章起號碼、期刊卷、期號及文章起始頁等多個字段檢索，并可進行出版日期范圍限始頁等多個字段檢索，并可進行出版日期范圍限制，對刊名和刊名縮寫字段還能進行精確查找。制，對刊名和刊名縮寫字段還能進行精確查找。文章檢索界面（六）（六）emtree主題詞表輔助檢索主題詞表輔助檢索vemtree是是embase數據庫提供用戶對生物醫學數據庫提供用戶對生物醫學文獻進行主題分析、標引和檢索時使用的權威性文獻進行主題分析、標引和檢索時使用的權威性主題詞表。主題詞表。 v利用系統內嵌的利用系統內嵌的emtree主題詞表，提供用戶瀏主題

52、詞表，提供用戶瀏覽探索該詞表、選擇最合適的主題詞、查核主題覽探索該詞表、選擇最合適的主題詞、查核主題詞的用詞范圍、瀏覽主題詞樹結構并最終構建一詞的用詞范圍、瀏覽主題詞樹結構并最終構建一個有效的主題詞檢索策略的過程。個有效的主題詞檢索策略的過程。 v提供兩種查詢瀏覽主題詞的方法：提供兩種查詢瀏覽主題詞的方法： 查找主題詞（find term） 按類瀏覽主題詞（browse by facet）emtree主題詞表輔助檢索界面，在find term后輸入檢索詞，查找主題詞。主題詞查詢結果，use：后為規范主題詞，前面則為款目詞。主題詞樹狀結構表，以及擴展檢索和主要主題詞檢索選項添加到檢索框進行檢索按類瀏覽主題詞（browse by facet） （七）期刊瀏覽（七）期刊瀏覽（journals）v提供用戶按刊名字順瀏覽期刊（提供用戶按刊名字順瀏覽期刊（browse journals），按字順找到