1、申報的知識產權類型、獲取時間不符合要求。2、申報的專利暫未獲得授權，僅處于受理中。3、專利僅有授權通知書，無繳費單據，無法證明專利權處于法律保護狀態。4、非自有專利未辦理轉讓手續。5、轉讓的專利無原專利證書復印件或國家知識產權局出具的所有權轉讓證明，無法判斷原專利獲取時間和所有權人。1、研發費用核算不清、輔助賬不完整、不規范或暫未建立。需按《工作指引》相關要求編制研發費用輔助賬，歸集研發費用。2、研發費用真實性存疑，研發費大于管理費或占比過高。3、研發費歸集不合理，如研發人員人員年均費用遠低于一般人員水平，直接投入占研發費總額的比例過高，不同研發項目支出金額、結構完全一樣。4、委托外部研發的支出全額計入研發費，未按80%計入研發費。5、研發費用中其他費用占比超過20%。6、研發費用明細表和研發項目（RD）表不一致。7、委托外部研發支出與附件材料產學研合作協議所列不一致，如某研發項目為產學研合作項目，但該項目研發結構明細表中無委托外部研發支出。8、研發項目無證明材料，項目立項報告千篇一律，臨時拼湊。1、高新技術產品收入核算不清，歸集不規范。如總收入核算不準確，投資收益或營業外收入未計入總收入。2、高新技術產品不屬于領域目錄范圍。3、主要高新技術產品無知識產權關聯，或相關知識產權未授權、不在有效期。1、無科技成果轉化匯總表，無法判斷成果項數。2、科技成果轉化附件材料混亂、裝訂無序，與成果轉化匯總表中所列不一致。3、科技成果轉化證明材料單一，僅有轉化效果證明材料，如銷售合同、發票，樣品圖片等，無科技成果技術證明材料。1、科技人員材料簡單，格式不規范，不符合要求。如無花名冊、名冊中無法判斷是否為科技人員。2、人員數據申請書和附件材料不一致。3、花名冊中科技人員占比不達標。1、組織管理水平材料混亂，未針對評價標準逐項提供。2、證明材料單一，多數為制度或文件，無執行情況。如研發獎勵僅有制度，無落實情況。1、財務會計報告不完整，僅提供正文和會計報表，無附注。2、會計報表中各年度數據不一致，且無差異情況說明。如2015年報表中上年數據與2014年報表中期末數據不一致。3、會計報表附注披露的管理費用科目明細中無研發費用數據，或披露的研發費用數據與專項審計報告中研發費用數據不一致，差異較大。4、含子公司的企業會計報表為公司合并報表，含子公司數據。1、專項審計報告不完整，無編制說明。2、專項審計報告所附表格不規范，未按規定的樣式列示。如未分年度、分項目列示，所附表格單位為元，按要求應為萬元，保留兩位小數。3、專項審計報告中計算研發費占比、高新技術產品收入占比時，銷售收入、總收入口徑錯誤，銷售收入應為主營業務收入和其他業務收入之和，總收入是收入總額減去不征稅收入。4、專項審計報告中研發項目支出與申報材料中所附研發費輔助明細賬不一致。5、財務報表數據、稅務系統中報稅數據、專項審計報告數據，三者不一致，差異較大。1、企業的研究開發費用是以單個研發活動為基本單位分別進行測度并加總計算的。2、企業應對包括直接研究開發活動和可以計入的間接研究開發活動所發生的費用進行歸集，并填寫《高新技術企業認定申請書》中的“企業年度研究開發費用結構明細表”。3、企業應按照“企業年度研究開發費用結構明細表”設置高新技術企業認定專用研究開發費用輔助核算賬目，提供相關憑證及明細表，并按《工作指引》要求進行核算。1、人員人工費用包括企業科技人員的工資薪金、基本養老保險費、基本醫療保險費、失業保險費、工傷保險費、生育保險費和住房公積金，以及外聘科技人員的勞務費用。常見錯誤：（1）工資發放的名單與企業提供的研發部門人員的名單不符，出現了行政管理、財務和后勤人員工資；（2）計入了按工資總額計提的福利費、工會經費等。2、直接投入費用直接投入費用是指企業為實施研究開發活動而實際發生的相關支出。包括：——直接消耗的材料、燃料和動力費用；——用于中間試驗和產品試制的模具、工藝裝備開發及制造費，不構成固定資產的樣品、樣機及一般測試手段購置費，試制產品的檢驗費；——用于研究開發活動的儀器、設備的運行維護、調整、檢驗、檢測、維修等費用，以及通過經營租賃方式租入的用于研發活動的固定資產租賃費。常見錯誤：（1）領用的材料在多個項目間平均分配。（企業應制定合適的政策及分配方法，或規范材料領用的核算）（2）提供的支撐材料顯示為批量生產領用，無法證明為研發領用。（3）運維費用未能區分生產或研發設備。3、折舊費用與長期待攤費用折舊費用是指用于研究開發活動的儀器、設備和在用建筑物的折舊費。長期待攤費用是指研發設施的改建、改裝、裝修和修理過程中發生的長期待攤費用。常見錯誤：（1）計提的折舊中混入了一些生產設備的折舊。（2）分攤的建筑物折舊無相關計算分攤依據，直接以固定比例簡單分配。4、無形資產攤銷費用無形資產攤銷費用是指用于研究開發活動的軟件、知識產權、非專利技術（專有技術、許可證、設計和計算方法等）的攤銷費用。常見錯誤：（1）中外合資企業計入了按收入比例計提的技術提成費。（2）一項具體的無形資產卻攤銷到幾個關聯度不高的研發項目。5、設計費用設計費用是指為新產品和新工藝進行構思、開發和制造，進行工序、技術規范、規程制定、操作特性方面的設計等發生的費用。包括為獲得創新性、創意性、突破性產品進行的創意設計活動發生的相關費用。常見錯誤：（1）概念不清，將委外研發全額計入了本科目。（2）支出內容與其他費用科目存在重合。6、裝備調試費用與試驗費用裝備調試費用是指工裝準備過程中研究開發活動所發生的費用，包括研制特殊、專用的生產機器，改變生產和質量控制程序，或制定新方法及標準等活動所發生的費用。為大規模批量化和商業化生產所進行的常規性工裝準備和工業工程發生的費用不能計入歸集范圍。試驗費用包括新藥研制的臨床試驗費、勘探開發技術的現場試驗費、田間試驗費等。常見錯誤：（1）未能準確區分研發試驗與規模批量化生產之間的界限，隨意計入一定比例的支出。（2）新藥研制的臨床試驗費包含在委托外部機構申報新藥批件的打包合同中，無法區分。7、委托外部研究開發費用委托外部研究開發費用是指企業委托境內外其他機構或個人進行研究開發活動所發生的費用（研究開發活動成果為委托方企業擁有，且與該企業的主要經營業務緊密相關）。委托外部研究開發費用的實際發生額應按照獨立交易原則確定，按照實際發生額的80%計入委托方研發費用總額。常見錯誤：（1）研發合同未明確約定研發成果歸委托方所有。（2）關聯單位之間的委外協議（為增加研發費總額，人為操縱）。（3）填報數據時未按80%折算。8、其他費用其他費用是指上述費用之外與研究開發活動直接相關的其他費用，包括技術圖書資料費、資料翻譯費、專家咨詢費、高新科技研發保險費，研發成果的檢索、論證、評審、鑒定、驗收費用，知識產權的申請費、注冊費、代理費，會議費、差旅費、通訊費等。此項費用一般不得超過研究開發總費用的20%，另有規定的除外。常見錯誤：（1）其他費用在上述列舉的范圍外無限擴大。（2）企業研發部門的招待費支出未核減。及口徑1、收入總額。《企業所得稅》第六條規定：企業以貨幣形式和非貨幣形式從各種來源取得的收入，為收入總額。包括：銷售貨物收入；提供勞務收入；轉讓財產收入；股息、紅利等權益性投資收益；利息收入；租金收入；特許權使用費收入；接受捐贈收入；其他收入。2、不征稅收入。《企業所得稅》第七條規定：收入總額中的下列收入為不征稅收入：財政撥款；依法收取并納入財政管理的行政事業性收費、政府性基金；國務院規定的其他不征稅收入。3、總收入。總收入是指收入總額減去不征稅收入。4、銷售收入。銷售收入為主營業務收入與其他業務收入之和。特別注意：所有與收入相關口徑，全部按照企業所得稅年度納稅申報表的口徑計算。收入總額與不征稅收入按照《中華人民共和國企業所得稅法》及《中華人民共和國企業所得稅法實施條例》的規定計算。僅供參考：收入總額=營業收入（主營業務+其他業務收入）+投資收益+營業外收入總收入=收入總額-不征稅收入（參照企業所得稅年度申報表A105040/A105000）申報材料涉及到研究開發費用數據的至少有九處，分別在：——申請書《企業基本信息表》——申請書《企業研究開發情況表》所有RD項目匯總——申請書《研究開發費用結構明細表》——研發費用專項審計報告——年度審計報告《利潤表》“管理費用”下其中數——年度審計報告財務報表附注“研發支出”或“管理費用”披露的明細項目——企業所得稅年度匯算清繳申報表A104000期間費用明細表第19行研究