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文檔簡介
DB32/T××××—2019PAGE4豬鏈球菌9型PCR檢測技術規程范圍本標準規定了豬鏈球菌9型PCR檢測技術所用的儀器設備和主要試劑、引物、方法步驟、結果判定、廢棄物處理和防止污染的措施等要求。本標準適用于豬鏈球菌9型的PCR檢測。規范性引用文件下列文件對于本文件的應用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T
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分析實驗室用水規格和試驗方法NY/T541獸醫診斷樣品采集、保存與運輸技術規范《病死及病害動物無害化處理技術規范》(農醫發〔2017〕25號)術語和定義下列術語和定義適用于本文件。3.1豬鏈球菌9型Streptococcussuisserotype9屬于鏈球菌屬的一種細菌,根據其莢膜多糖抗原的差異,可分為1-31、33及1/2共33個血清型。豬鏈球菌9型是豬鏈球菌的一個血清型,不僅對豬致病性很強,而且可以感染特定的人群,是一種人獸共患病病原菌。4儀器設備和主要試劑4.1儀器設備高速離心機、水浴鍋、PCR儀、核酸電泳儀、凝膠成像系統。4.2主要試劑生理鹽水、超純水、蛋白酶K、2×PCRMix、瓊脂糖(電泳級)、DNA分子量標準(DL2000Marker)。5引物5.1上游引物:5′-GGCTACATATAATGGAAGCCC-3′。5.2下游引物:5′-CCGAAGTATCTGGGCTACTG-3′。6方法步驟6.1樣品處理6.1.1病料樣品處理采用差速離心法,取約5g病料(肝或肺或腦組織),剪碎研磨,用5mL生理鹽水混懸,先2000r/min離心2min,去除大組織塊,取上清液,后10000r/min離心5min,棄上清液,沉淀以200μL超純水重懸,備用。6.1.2待檢培養物樣品處理取待檢液體培養物(純培養物或混合培養物)1mL10000r/min離心5min,棄上清,沉淀以200μL超純水重懸,備用。陰性對照:THB培養基。陽性對照:豬鏈球菌9型標準菌株(22083)的THB培養物。陰性、陽性對照也同樣處理,對每個樣品進行編號標記。6.2DNA提取取6.1獲得的樣品及對照,每200μL加入3μL蛋白酶K(20mg/mL),42℃作用1h,煮沸5min,10000r/min離心5min,上清作為模板DNA。6.3PCR擴增6.3.1反應條件按25μL體系進行,2×PCRMix12.5μL,上游引物(10pmol/μL)1.0μL,下游引物(10pmol/μL)1.0μL,模板DNA2.0μL,超純水8.5μL。按如下條件進行PCR反應。95℃5min,然后進入循環94℃30sec,55℃30sec,72℃30sec,35個循環,于72℃延伸10min,4℃保存。6.3.2電泳將PCR反應產物于1.2%瓊脂糖凝膠進行電泳,電壓為120V,時間30min。6.3.3結果觀察用凝膠成像系統觀察結果,并進行拍照。7結果判定7.1檢測結果成立條件陽性對照的PCR產物電泳后在389bp的位置上出現一條特異性條帶,陰性對照PCR產物電泳后沒有條帶(見附錄A),檢測結果成立;否則,結果不成立。7.2結果判定7.2.1在檢測結果成立的前提下,如果檢測樣品中PCR產物電泳后在389bp的位置上出現一條特異性條帶,判為陽性,即該樣品為豬鏈球菌9型核酸陽性。7.2.2在檢測結果成立的前提下,如果檢測樣品中PCR產物電泳后在389bp的位置上未出現一條特異性條帶,判為陰性,即該樣品為豬鏈球菌9型核酸陰性。7.2.3如果陽性對照無相應的目的條帶,可能是存在操作失誤,該檢測需要重復進行;如果陰性對照有相應的目的條帶,可能是陰性對照存在污染或是操作失誤,該檢測需要重復進行。8廢棄物處理和防止污染的措施檢測過程中的廢棄物,應做好無害化處理。檢測過程中防止交叉污染的措施見附錄B。附錄A(資料性附錄)豬鏈球菌9型PCR產物電泳圖M12M122000bp——1000bp2000bp——1000bp——750bp——500bp——250bp——100bp————389bpM——DNA分子量標準(DL2000Marker);1——陽性對照;2——陰性對照。圖A.1豬鏈球菌9型PCR產物電泳圖
附錄B(規范性附錄)檢測過程中防止交叉污染的措施B.1抽樣和制樣過程抽樣和制樣工具,應清洗干凈,121℃,15min~20min滅菌,一套清潔工具限于一個樣品使用。存放樣品的容器應該經過清洗、滅菌,或為一次性滅菌容器。B.2檢測過程B.2.1PCR實驗室應分為樣品制備區、前PCR區、PCR區、后PCR區。將模板提取、PCR反應液配制、PCR循環擴增及PCR產物的鑒定等步驟分區或分室進行。實驗室的運作應從“凈區”到“臟區”單方向進行。B.2.2實驗過程中,應穿實驗服和戴手套,手套要經常更換。各區要有專用實驗服,經常清洗。B.2.3各區所有的試劑、器材(尤其是移液器)、儀器都應專用,不得帶出該區。B.2.4所有溶液、水、耗材和器具要121℃,15min~20min滅菌,避免核酸和(或)核酸酶污染。每種溶液應使用高質量的成分和超純水。所有試劑應該以大體積配制,然后分裝成僅夠一次使用的量進行貯存。B.2.5裝有DNA模板或
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