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文檔簡介

ICS11.020

CCSC05

團體標準

T/CRHAXXX—XXXX

耳聾基因篩查臨床實踐標準

Clinicalpracticestandardsforgeneticscreeningforhearingloss

(征求意見稿)

XXXX-XX-XX發布XXXX-XX-XX實施

中國研究型醫院學會??發布

T/CRHAXXX-XXXX

II

T/CRHAXXX-XXXX

引言

基因篩查是實現疾病群體預防、早診斷、早干預的重要舉措。遺傳性耳聾基因篩查在我國開展已有

10余年,在預防耳聾出生缺陷、減少聽力言語殘疾中發揮了重要作用。隨著遺傳性耳聾研究的深入、篩

查技術的發展、篩查工具的更新、實驗室條件的完善及政府政策的支持,形成了更多具有遺傳咨詢資質

的醫生隊伍,開展遺傳性耳聾基因篩查的地區逐漸增多。目前已覆蓋中國大部分省份的主要城市,受檢

人群從最初的耳聾個體或耳聾高危家庭成員轉變為覆蓋新生兒、婚前、孕前、產前的大規模人群篩查,

并且技術方法逐步多樣化。本文件圍繞耳聾基因篩查原則、流程、技術方法、報告解讀、遺傳咨詢等方

面進行闡述,旨在為從事此項工作的專業人員提供指導性意見,規范中國的耳聾基因篩查及篩查后的工

作流程,使耳聾基因篩查更有效地服務于耳聾的早期診斷、治療和預防。

遺傳性耳聾是典型的單基因病,遺傳異質性強,已知耳聾基因至少124個

(,網站更新日期2021年8月30日)。致病基因涉及核基因及線粒

體基因。遺傳模式涵蓋常染色體隱性遺傳、常染色體顯性遺傳、線粒體遺傳、伴性遺傳。在我國,耳聾

在新生兒中的發病率為1‰~3.47‰,遺傳因素致聾比例達50~60%[1,2]。雖然耳聾相關基因眾多,但是

中國人群中有明確的常見耳聾基因及其熱點致病變異。在中國人群中,耳聾基因致病變異攜帶率至少達

15%[3-6],另外,還有2.4‰[7]的線粒體耳聾易感變異攜帶者,這些個體對某些特定環境因素,特別是氨基

糖苷類抗生素易感而易發生耳聾。鑒定致病的高頻基因變異,是實施基因篩查的前提。開展特定人群的

耳聾基因篩查,可早期發現遺傳性耳聾患者、相關環境因素致聾易感者及潛在的耳聾生育高危群體,從

而實現遺傳性耳聾的早發現、早診斷、早干預及早預警。

國內應用基因篩查技術,針對新生兒、孕婦等目標人群的耳聾基因篩查工作得到了廣泛開展。據不

完全統計,全國范圍內已完成超過900萬例新生兒和孕前成人耳聾基因篩查及近26萬例孕期婦女的耳聾

基因篩查,目前僅有《遺傳性耳聾基因變異篩查技術專家共識》發表[8],該共識側重耳聾基因篩查實驗

室規范及管理。迄今,國內外均無針對耳聾基因篩查臨床實施、結果解讀、遺傳咨詢的指南或共識。因

此,有必要制定相關臨床工作指南,以指導耳聾基因篩查工作規范而有序地開展。近年來,國內外陸續

發布了一系列遺傳性疾病檢測的相關行業共識和指南,參考此類文件,結合中國國情,在耳聾基因篩查

取得階段性成果的基礎上,中國耳聾基因篩查與診斷臨床多中心研究協作組組織遺傳性耳聾相關領域的

專家,就遺傳性耳聾基因篩查的臨床應用形成以下工作指南,旨在為遺傳性耳聾基因篩查的臨床實踐提

供框架性的應用指導方案。

III

T/CRHAXXX-XXXX

耳聾基因診斷與遺傳咨詢臨床實踐標準

1范圍

本文件規定了耳聾基因篩查原則、篩查人群及時間,篩查流程、技術方法以及報告解讀、遺傳咨詢

等方面。

本文件中國的耳聾基因篩查及篩查后的工作流程。

本文件適用于具備臨床產前遺傳學診斷資質的醫院、第三方醫學檢驗機構或大學診斷實驗室等機構

進行遺傳性耳聾基因篩查應用。

本文件適用于從事耳聾防治工作的耳鼻咽喉科、醫學遺傳科、婦幼保健院、基因篩查診斷實驗室及

產前診斷機構等相關人員。

2規范性引用文件

本文件沒有規范性引用文件。

3術語和定義

本文件沒有需要界定的術語和定義。

4耳聾基因篩查的目的

遺傳性疾病的篩查可實現兩個目標:篩查一種疾病狀態,或篩查未患病個體的攜帶者狀態[1,2]。遺

傳性耳聾基因篩查的目的至少包括:

確診先天性遺傳性耳聾患者,結合聽力檢測結果,實現早期干預。

早期發現遲發性遺傳性耳聾的患者,給予有效防治措施,可以延緩聽力下降。

明確藥物性聾易感基因變異攜帶者,通過指導用藥,避免耳聾的發生。

早期發現聽力正常的耳聾基因變異攜帶者,為其本人及家庭成員的婚育提供準確的遺傳咨詢。。

通過早期預防和干預,減少社會和家庭經濟投入。根據原衛生部衛生發展研究中心經濟學評價

報告,中國新生兒耳聾基因篩查投入產出比為1:7.27[9]。

5耳聾基因篩查對象及推薦時間

新生兒

所有新生兒出生3天左右,完成足跟血或臍帶血采集。

聽力正常個體

包括有婚配生育要求的聽力正常個體及有耳聾家族史者,建議婚前、孕前或孕早期進行耳聾基因篩查。

推薦夫妻同時進行篩查及后續必要的基因診斷,以提高篩查或診斷的準確性和效率。

耳聾患者

1

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建議耳聾患者直接進行耳聾基因診斷,而不是基因篩查。

6耳聾基因篩查位點的選擇

目前國內耳聾基因篩查產品眾多,覆蓋基因范圍和致病變異位點各有不同,對于常見耳聾基因(GJB2、

SLC26A4、線粒體基因)篩查位點的選擇多數較統一;但因為各個產品依據的數據庫不同,對于非常見

耳聾基因致病變異位點的選擇存在較大差異。原則上,耳聾基因篩查位點應選擇具有明確耳聾致病性的

變異,優先選擇基于大規模耳聾人群分子流行病學調查確定的、等位基因頻率高的致病變異[2,10-16]。

目前,已經獲得國家藥品監督管理局(NMPA)批號的耳聾基因篩查試劑盒中的變異位點見表1。正

在審批中的變異位點包括GJB2基因c.109G>A、c.257C>G、c.508_511dupAACG、c.427C>T、c.35dupG和

SLC26A4基因c.916dupG。

表1耳聾基因篩查包含的致病變異位點

基因名稱遺傳模式核苷酸變化氨基酸變化中國人群攜帶率

GJB2常染色體c.235delCp.Leu79Cysfs*30.018

NM_004004.6隱性遺傳c.299_300delATp.His100Argfs*140.005

c.176_191delGCTGCAAGAACGTGTGp.Gly59Alafs*180.0012

c.35delGp.Gly12Valfs*20.0001

c.167delTp.Leu56fs0

c.109G>Ap.Val37Ile0.0693-0.125

c.257C>Gp.Thr86Arg0.0003

c.508_511dupAACGp.Trp172Thrfs*400.0003

c.427C>Tp.Arg143Trp0.0003

c.35dupGp.Val13Cysfs*350.0006

SLC26A4常染色體c.919-2A>Gaberrantsplicing0.0134

NM_000441.2隱性遺傳c.2168A>Gp.His723Arg0.0027

c.1174A>Tp.Asn392Tyr0.0008

c.1226G>Ap.Arg409His0.001

c.1229C>Tp.Thr410Met0.0008

c.1975G>Cp.Val659Leu0.0013

c.2027T>Ap.Leu676Gln0.0007

c.589G>Ap.Gly197Arg0.0003

c.1707+5G>Aaberrantsplicing0.0003

c.281C>Tp.Thr94Ile0.0003

c.2162C>Tp.Thr721Met0.0001

c.916dupGp.Val306Glyfs*24—

2

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線粒體遺m.1494C>T0.0002

12SrRNA

傳m.1555A>G0.0021

c.916dupG目前尚無文獻報道中國人群攜帶率,解放軍總醫院聾病分子診斷中心數據顯示其在2000例正常人群中

的攜帶率為0.0005

7常用遺傳性耳聾基因篩查技術及檢測樣本選擇

為了滿足群體性篩查需求,用于遺傳性耳聾基因篩查的檢測技術,應具有快速、準確、高通量、低

成本的特點,并盡可能選擇已獲得國食藥監械批號的篩查試劑盒。目前,可用于耳聾基因篩查的常用檢

測技術包括:微陣列芯片法、PCR-熒光探針法、熒光PCR法、熒光PCR熔解曲線法、PCR+導流雜交法、突

變擴增系統(amplificationrefractorymutationsystem,ARMS)PCR-熔解曲線法、聯合探針錨定聚合

測序法、飛行質譜法、基于下一代測序技術的已知耳聾致病變異篩查等。

推薦使用Sanger測序方法對所有篩查技術檢出的陽性結果進行驗證并對陰性結果進行定期抽檢。

對篩查對象或其監護人,應充分告知檢測的意義、方法和局限性,經篩查對象或其監護人知情同意

并簽署知情同意書后,方可進行標本采集。標本類型包括血斑、全血、新生兒的臍帶血等。應根據實驗

室條件及人員技術水平,選擇合適的篩查技術及工具(試劑盒),并采用試劑盒使用說明所推薦的陽性

質控品、陰性質控品、相應樣本及DNA提取試劑盒。

8耳聾基因篩查實驗室的質量控制及信息管理

開展遺傳性耳聾基因檢測的篩查實驗室必須取得國家衛生健康委員會臨床檢驗中心或省級臨床檢

驗中心的臨床基因擴增檢驗實驗室技術驗收合格證書。篩查實驗室采用的遺傳檢測方法、實驗室質控、

技術標準、檢測流程、術語規范等須符合國家衛生主管部門已發布的相關規定及標準,如國家衛生健康

委頒布的《醫療技術臨床應用管理辦法》(2018年)、《醫療機構臨床基因擴增檢驗實驗室工作導則》

(2010年)、《醫療機構臨床基因擴增檢驗實驗室管理辦法》(2010年)、《遺傳病相關個體化醫學檢

測技術指南(試行)》(2015年)等。篩查實驗室技術人員應具有扎實的分子生物學理論基礎,熟練的

實驗操作技能,接受過耳聾基因診斷相關知識培訓,參加臨床基因擴增檢驗培訓并取得《臨床基因擴增

檢驗實驗室技術人員上崗證》。

分子檢驗技術在實際操作和檢驗的過程中,必須有嚴格的質量控制和管理體系,對爭議結果需要使

用兩個不同的技術檢測方案進行復查和驗證。實驗室質控原則上可以采用Sanger測序法或已獲批的其他

耳聾基因篩查試劑盒方法。

篩查機構應妥善保存臨床遺傳篩查樣本、原始數據及檢測報告,相關遺傳材料及信息的采集、保藏、

利用需遵循《中華人民共和國人類遺傳資源管理條例》(2019)。實驗室應建立基因檢測電子信息管理

系統,對標本接收、基本信息錄入(導入)、檢測過程記錄、質量控制、報告審核、報告打印、統計分析

等環節進行有效管理。如有條件,應建立互聯網+信息系統,以便篩查區域內自助查詢結果,獲得結果

報告,召回或隨訪信息等[8]。

9耳聾基因篩查結果

耳聾基因篩查結果通常分為兩種:

通過

未檢出篩查基因的變異位點。

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未通過

檢出篩查基因的變異位點。包括以下兩種情況:

a)遺傳性耳聾高風險者

具體包括:

1)檢出常染色體隱性遺傳基因的雙等位基因致病變異。

2)檢出線粒體基因m.1555A>G或m.1494C>T或其他明確的使用氨基糖甙類藥物后能致聾的均質或

異質性變異。針對以上基因篩查未通過者,建議進行遺傳咨詢和耳科專科就診,盡早完成耳聾基因

診斷和聽力診斷。

b)攜帶者

為疑似病例或致病變異攜帶者。

10耳聾基因篩查報告及內容

篩查報告應該以制式報告形式,包含至少但不限于以下五個方面的內容:

基本信息:包括被檢測者的個體識別信息、唯一編號標識等以及其他相關必要信息,如姓名、

性別、出生日期、采集樣本時間、樣本性質、樣本采集單位信息、門診號及住院號、送檢醫師

信息等;

篩查使用的方法及所使用檢測方法的局限性:除了明確寫出篩查所使用的方法及包含的基因變

異位點外,還應說明該檢測不能排除已篩查基因位點之外的該基因其他位點的致病變異和其他

耳聾基因的致病變異;

篩查結果:針對篩查結果的解讀,一般采用表格方式,提供基因名稱、基因涉及的遺傳模式及

基因變異信息;

篩查結論:分為“通過”和“未通過”,“未通過”包括遺傳性耳聾患者和攜帶者。對結論為

“未通過”者,報告中應明確建議需要進一步遺傳咨詢;

篩查實施者、報告簽發者、簽發時間及篩查機構聯系方式等信息。

11針對篩查結果的遺傳咨詢原則

針對耳聾基因篩查結果的遺傳咨詢,既具有一定共性,也具有個體差異性。開展遺傳咨詢的人員,

應具有國家認證的醫師資格證書和醫師執業證書、接受過耳聾基因篩查與診斷及遺傳咨詢相關理論知識

的培訓,并具有醫學遺傳學或臨床遺傳學專業背景,與臨床醫師配合針對檢測結果進行解讀并對患者進

行遺傳咨詢。

針對篩查結果的遺傳咨詢工作需遵循以下原則:

基因型表型對應性

對于耳聾基因篩查報告,臨床醫師首先需要結合受檢者臨床信息,結合報告中提供的明確變異

信息進行評估,綜合判斷報告中的篩查結果是否與臨床表型相符;必要時需要與篩查實驗室進行討

論,或完善相關檢查以協助明確篩查結果。

篩查未通過的后續處理

對基因篩查為“未通過”,或者基因篩查“通過”但聽力篩查“未通過”者,均應建議到具有

進一步診斷及遺傳咨詢資質的醫療單位進行聽力學、影像學和耳聾基因診斷,以進一步明確診斷,

獲得更為準確的遺傳咨詢和康復指導。

遺傳咨詢內容

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可以包括針對疾病診斷結果的解釋和為家屬進行疾病知識的科普;針對不同遺傳模式提供家庭

成員患病或再發風險的評估;提供治療干預方面的建議和對患兒未來聽力語言發育的評估等。如果

家庭有再生育需求,還應提供給家庭產前咨詢的一般知識。

遺傳咨詢應遵循的倫理學原則

保護隱私原則、非指導性原則、自愿和尊重原則、平等原則、教育原則等

12不同人群的遺傳咨詢要點

12.1新生兒

12.1.1線粒體基因變異(如m.1555A>G均質或異質性變異)

受檢者及母系家族成員均為藥物敏感個體,應終生慎用氨基糖甙類抗生素或在醫師指導下用

藥[17,18]。

12.1.2GJB2或SLC26A4的純合或復合雜合致病變異

初步確定為GJB2或SLC26A4相關遺傳性聾,需進一步行耳聾基因診斷、聽力學診斷,確定病因

后行早期干預、積極康復(SLC26A4基因相關耳聾應行影像學檢查,如顳骨CT及頭顱MRI);

受檢者父母再生育前可行胚胎植入前診斷(preimplantationgeneticdiagnosis,PGD)或

產前診斷;受檢者配偶及直系親屬婚育前應篩查相應基因;此類篩查結果提示受檢者的人工

聽覺植入干預預后良好。需要特別說明的是,GJB2基因c.109G>A目前被認定為致病變異,但

其具有臨床表型變異度較大、外顯率不確定等特點[6,19],因而,尚不建議在臨床實施針對該位

點的產前診斷。

12.1.3GJB2或SLC26A4基因的單等位基因致病變異

應結合聽力篩查結果綜合判斷,可能為攜帶者或相關遺傳性聾患者,應進一步行耳聾基因診

斷,必要時行顳骨影像學檢查及遺傳咨詢;對于聽力篩查通過者,仍建議在3個月齡后完成診

斷性聽力檢查,并進行密切隨診;受檢者配偶及直系親屬婚育前應篩查相應基因。

12.1.4GJB3基因的純合或單雜合變異

GJB3基因據報道與高頻聽力損失相關[20],但40歲前發病者罕見。有研究證實,攜帶GJB3

c.538C>T雜合突變的35例個體(年齡23歲-37歲)聽力正常[21]。因此,本指南認為如果攜帶該

基因變異者通過了新生兒聽力初篩,建議進入常規兒童保健流程,除非有聽力下降的表現,

否則不需要進行聽力定期檢查;如果攜帶該基因變異者沒有通過初次聽力篩查,需要42天后

進行復篩,仍未通過者則需要進一步行診斷性聽力檢查,確診耳聾者需行高通量耳聾基因診

斷,以明確耳聾的病因。GJB3基因的相關變異不能作為產前診斷的指征。

12.1.5針對第2、3條,對于聽力篩查通過者,建議盡早(3個月)完成診斷性聽力檢查,并密切隨診,

發現聽力下降應及時干預。

12.1.6對于聽力篩查未通過者,均應在3個月完成診斷性聽力檢查;確診為耳聾者,應行耳聾基因診

斷及巨細胞病毒檢測并行早期干預、積極康復;平時應注意避免各種聽力損傷因素,如噪聲、

藥物、外傷、上呼吸道感染等;聽力急劇下降時給予及時治療。

12.1.7遺傳咨詢流程(以新生兒耳聾基因篩查為例,在圖中聽力篩查簡稱“聽篩”,基因篩查簡稱

“基篩”)。

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圖1新生兒耳聾遺傳咨詢流程圖

用藥預警指未來應用氨基糖甙類抗生素發生耳聾的風險預警

12.2孕婦

一旦明確其為常染色體隱性遺傳耳聾基因致病變異攜帶者,建議其配偶盡早進行相關基因診斷,如

果夫妻雙方均為該隱性遺傳基因致病變異攜帶者,則胎兒有25%可能性獲得來自父母的雙等位基因致病

變異而成為遺傳性耳聾患者。這種情況下,經過遺傳咨詢、在夫妻雙方知情同意的前提下,可以行產前

診斷。需要特別說明的是,針對個別表型變異度較大、外顯率不確定的變異,不建議進行產前診斷。如

果孕婦本人為耳聾患者或有明確的耳聾家族史,建議進行詳細的聽力診斷及耳聾基因診斷[9,10,19]。

12.3聽力正常的受檢者

一旦明確其為常染色體隱性遺傳耳聾基因致病變異攜帶者,經遺傳咨詢后,應建議其配偶進行相關

基因診斷,如果夫妻雙方均為該隱性遺傳基因致病變異攜帶者,則胎兒有25%可能性同時獲得來自父母

的致病變異而成為耳聾患者。這種情況下,經過遺傳咨詢后,在夫妻雙方知情同意的前提下,可建議行

胚胎植入前診斷或產前診斷。此外,對于有耳聾家族史、聽力正常的常染色體隱性遺傳耳聾基因致病變

異攜帶者,還應建議其家族中耳聾患者進行基因診斷。

13其他需要注意的事項

基因篩查的局限性,受檢者“通過”篩查,并不代表受檢者沒有攜帶耳聾相關基因致病變異,

因為篩查只覆蓋了部分基因的熱點致病變異。

因技術限制或其他因素可能造成假陽性或假陰性結果,對于基因篩查結果與臨床表現不符的

受檢者,應進行復核或建議行耳聾基因診斷。

基因篩查結果可能會給受檢者及家庭帶來焦慮情緒,建議篩查“未通過”者及監護人盡早就

診和咨詢,與醫師進行有效溝通。

不建議對GJB3基因c.538C>T及其它致病性不明或存爭議的變異攜帶者進行PGD或產前診斷。

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線粒體基因變異不應作為產前診斷的指征。

遺傳咨詢時,應盡可能將基因篩查結果和聽力等各種表型、家族史、檢查檢驗結果相結合進

行綜合分析,以獲得更多信息綜合指導遺傳咨詢。

應充分考慮到基因篩查理論及技術的局限性,以及耳聾遺傳異質性和表型多樣性,咨詢時不

應使用過于肯定的語氣或輕易地下定論。

特別注意的是,基因篩查結果不能直接應用于開展PGD或產前診斷,詳細的基因診斷結果及規

范的遺傳咨詢是開展上述工作的前提。

14小結與展望

耳聾基因篩查不同于基因診斷,其基于中國人群遺傳性耳聾相關基因突變攜帶率高的客觀情況,主

要適用于正常聽力群體,實施于婚前、孕前及出生后,目的是篩出耳聾高風險個體或家庭,使之有機會

得到早期診斷和干預,并通過有效措施預防耳聾出生缺陷及避免耳聾發生。

隨著基因科學的進步及人們對遺傳性耳聾認識的加深,基因篩查位點將會進一步增加,隨之篩查效

率也會進一步提升,遺傳咨詢也將日臻完善。但基因篩查變異位點的選擇需要有充足的致病性證據支持,

不能忽視分子流行病學及臨床表型數據在變異致病性判斷中發揮的作用。

7

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