附件1：廣東省人民醫院高性能計算系統I期建設需求一、項目概述廣東省人民醫院（廣東省醫學科學院）創建于1946年，下轄2個分院、6個門診部和6個研究所，托管2家醫院，綜合實力名列國內前茅，病人來源覆蓋國內外，深受廣大群眾信賴。2008年,廣東省醫學科學院恢復掛牌，與廣東省人民醫院合署辦公。2014年，與華南理工大學簽約合作共建華南理工大學醫學院、華南理工大學生命科學研究院和華南理工大學第一臨床學院。醫院整體科研實力雄厚，標志性科研項目成績斐然。“十二五”以來，獲得國家科技進步二等獎1項、省科學技術獎17項（其中一等獎2項）、中華醫學科技獎一等獎1項、授權專利130項，承擔國家和省級科研項目627項，獲得國家重點研發計劃重點專項5項、課題18項，發表SCI論文1447篇，總IF值5235.213。擁有4所廣東省重點實驗室，2006年起承擔臨床試驗項目818項，2018年新獲科研項目資助總額達6882.5萬元。根據廣東省人民醫院的規劃藍圖，作為廣東省高等醫學院校教學醫院，承擔了華南理工大學、南方醫科大學、中山大學、汕頭大學等多所院校理論教學和實習帶教任務，并結合生物信息綜合分析平臺、健康醫療大數據技術平臺、院內科學大數據管理與研究相關的系統生物醫學等建設需高性能計算平臺的需求，醫院擬建設一套生物信息綜合分析平臺、臨床大數據系統和系統生物醫學大數據系統，系統平臺包括高性能計算機系統及配套應用軟件的安裝調試。整體參照《信息安全技術網絡安全等級保護基本要求》(GB/T22239-2019)的“第三級安全要求”相關標準，機房基礎設施主要參照《電子信息系統機房設計規范》GB50714-2017中劃分的B級機房的規范要求設計。如果醫院已有符合監管要求的網絡、安全和機房，可以重用、擴容或整合。建設完畢后，面向省醫大數據相關的科研開放共享。二、項目原則本系統要求具備高性能、可擴展、高可靠、易管理，以支持今后不斷更新和升級的需要。要求系統解決方案的設計主要遵循以下設計原則：（1）先進性和成熟性充分采用符合國際標準的、先進并且成熟的計算機系統、存儲系統、以及操作系統等先進技術和產品。先進是指技術領先期長，在醫學科研和應用領域國內外技術市場領先；成熟是指產品線豐富完整、經過實踐檢驗、價格合理。這里所講的先進性是為了能夠運用當今國內、國際上最先進成熟的計算機軟硬件技術，使新建立的系統和采用的技術達到當代國際較先進水平，同時要兼顧實用性，避免盲目追求高精配置。（2）互聯性和開放性計算機系統選用開放式系統，具有多平臺多系統的互聯支持能力，以滿足多類型用戶開發和使用的要求。（3）高可靠性、高可用性、高可維護性高性能計算系統要求7×24小時的持續服務能力，因此在方案設計時，首先應考慮選用穩定可靠的產品和技術，使其具有優秀的RAS特性和必要的冗余容錯能力，為用戶提供高可用服務。要求系統在硬件配置、操作系統、以及系統管理等環節采取嚴格的安全可靠性措施，保證系統的正常運轉。（4）可縮放性和可擴展性系統不但要能滿足現階段的業務要求，而且要能滿足將來業務的增長和新技術發展的要求，要在原有設備繼續發揮作用的基礎上，保證用戶能方便地增加或調整設備，改善系統功能和性能，支持將來系統不斷更新和便于升級。系統結構應能支持主要的協議、標準和規范，應能運行當今流行的軟件環境下開發的各種應用系統并可以在線軟件升級、調配；同時應留有充分的擴展余地，并保證系統的完整性不受影響，保證系統可以平滑升級、擴容。（5）可管理性系統具有完善的管理措施和功能，便于設備的安裝、配置和維護，以及對各種軟硬件資源的分配、調度和管理，提高資源和資產利用率，減輕系統管理人員的工作負擔。三、總體要求（1）供應商應按照系統要求同時提供所需硬件配置明細表、系統軟件及應用軟件明細表、應有的配件明細表、線纜等。對于需求文件中未列出但系統正常運行又必需的各類部件以及軟件等，供應商必須補齊并將有關價格含入用戶需求書的價格中，否則將視為免費提供。（2）供應商所交付的硬件產品，其所有部件必須都是原廠原裝部件，而且產品應是交付前最新生產且未被使用過的全新產品，同時必須具有在中國境內的合法使用權。（3）本用戶需求書中列出了采購人可以接受的最小的技術指標。供應商英推薦的每一品目的軟硬件設備必須在速度、容量、性能等方面不低于表中所列的各項指標。（4）供應商人所提供的設備應符合下列工作環境準則：能夠在下列條件下運行環境溫度：+10℃-+35℃操作時：20%-80%非操作時：20%-80%電源：220V單相，或380V三相；50/60Hz（5）供應商必須承諾所有硬件產品提供原廠商不少于三年的免費保修服務。（6）供應商必須承諾簽訂合同前提供所投產品廠商合同期內、合同期滿后同類型產品價格均不可高于本次采購價格的承諾函。（7）對硬件系統進行調試，包括服務器節點、以太網絡、并行存儲系統等；確認硬件系統工作正常，網絡通訊正常。（8）供應商需提供承諾函，承諾在三年維保期內無條件配合醫院內在生物信息綜合分析平臺、臨床大數據系統和系統生物醫學大數據系統安裝、調試新增加的軟件。負責用戶需求文件中列出的所有應用軟件進行安裝、調優。對集群管理軟件系統進行安裝調試，確認軟件正常工作，軟件系統包括集群軟件系統、操作系統、并行環境、編譯器、數學庫等。軟件技術支持，原廠軟件系統3年技術支持服務，軟件升級服務。（9）供應商必須承諾免費為用戶開設不少于10小時容器調度和軟件集成方面的線上培訓課程，并且針對不同應用軟件定制GPU調度模板；免費為用戶開設不少于15學時的AI、GPU調度的線上培訓課程，提供詳實的培訓方案。（10）整體群集計算性能不低于110TFlops，存儲可用空間不低于2PB（11）整體拓撲架構如下圖：四、采購清單采購設備及數量序號名稱配置描述數量1刀片機箱不低于以下參數：機箱高度不低于2U；全模塊化設計；節點在機箱前部安裝，支持節點前維護；IO/散熱/電源與節點完全解耦式設計，與節點分離安裝；網卡：配置4個管理端口；服務：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。102高性能計算刀片計算節點每節點不低于以下參數：CPU：2*IntelXeonGold6230N20C125W2.3GHz處理器或同等性能以上；內存：12*16GDDR42933MHzRDIMM，采用六通道配置；硬盤：2*960GB企業級2.5寸SSD盤；IB卡:MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器；網卡：10Gb2SFP+端口管理模塊：企業版；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。403高性能計算大內存計算節點每節點不低于以下參數：CPU：4*IntelXeonGold6230N20C2.3GHz150W處理或同等性能以上；內存：2TBDDR42933MHzRDIMM；硬盤：2*960GB企業級2.5寸SSD盤；IB卡：MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器；網卡：10Gb2個SFP+端口；管理模塊：企業版；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。34高性能計算管理登錄服務器節點每節點不低于以下參數：CPU：2*IntelXeonGold6230N20C2.3GHz處理器或同等性能以上；內存：12*16GDDR42933MHzRDIMM，采用六通道配置；硬盤：2*960GB企業級2.5寸SSD盤；陣列卡：配置RAID0/1/5帶2GB閃存PCIe12Gb適配器；IB卡:MellanoxConnectX-42x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器；網卡：10Gb2個SFP+端口；管理模塊：企業版；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。25高性能計算GPU計算節點每節點不低于以下參數：CPU：2*IntelXeonGold6230R26C2.1GHz處理器或同等性能以上；內存：12*32GDDR42933MHzRDIMM，采用六通道配置；硬盤：2*960GB企業級2.5寸SSD盤；IB卡:MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器；GPU卡：2*NVIDIATeslaV10032GBPCIe被動式GPU網卡：10Gb2個SFP+端口；管理模塊：企業版；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。146高性能計算GPU計算集群整體要求：高性能分布式多機多GPU集群，集群節點服務器數量不低于2臺。每節點不低于以下參數：CPU：2*IntelXeonGold6230R26C2.1GHz處理器或同等性能以上；內存：12*32GDDR42933MHzRDIMM，采用六通道配置；硬盤：2*960GB企業級2.5寸SSD盤；IB卡:MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器；GPU卡：4*NVIDIATeslaV10032GBPCIe被動式GPU網卡：10Gb2個SFP+端口；管理模塊：企業版；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。17高性能存儲及并行文件系統整體要求：高性能分布式存儲，包含3300TB裸容量計IO讀寫性能超過20GB/s）。可用存儲不低于2PB。每節點不低于以下參數：CPU：2*IntelXeonGold624018C150W2.6GHz；內存：12*16GBDDR42933MHzRDIMM；系統盤：2*300GB10KSAS12Gb熱插拔；存儲硬盤：418*8TB7.2KNL-SAS；陣列卡：配置RAID0/1/5陣列卡帶2GB閃存PCIe12Gb適配器；IB卡:2*MellanoxConnectX-5EDRIBVPIDual-portx16PCIe3.0HCA；網卡：1Gb2個電口端口；電源：2*1100W白金級熱插拔電源；軟件：滿足所投標數量的商用版本的并行文件系統，非開源，并可提供原廠技術支持服務。；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。18計算網絡交換機不低于以下參數：端口：36PortEDR100Gb/sInfiniband智能交換機；線纜：25條3米MellanoxEDRIBQSFP28銅纜，4條10米MellanoxEDRIBQSFP28主動光纜；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。39管理網絡交換機整體要求不低于以下參數：知名品牌千兆交換機4臺，萬兆交換機2臺，核心交換機根據組網需求，同時支持1G管理網和10G數據網，不低于以下參數：千兆交換機：端口：48Port1Gb，帶4個10Gb上行端口；萬兆交換機：48Port10Gb萬兆交換機；線纜配置：56條5mOM3LC-LC光纖，200條3米CAT6雙絞線；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。110萬兆下一代防火墻每節點不低于以下參數：高度：標準2U；接口：8個10/1000MBase-TX和4個SFP接口，4個SFP+萬兆接口，2個擴展槽位；支持IPSecVPN和SSLVPN模塊：200個并發用戶；性能：最大整機吞吐：40Gbps；每秒新建連接數：18萬；最大并發連接數：1000萬；服務：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。211機柜套件每套件不低于以下參數：機柜規格：42U機柜；PDU：≥2組24口防浪涌pdu電源；保修：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。1012KVM1U機架式；≥24個RJ-45接口的端口；支持刀片服務器；支持PS/2、USB、SunLegacy及串口(RS-232)連接；本地控制端支持USB鍵盤與鼠標；支持跨平臺服務器環境；支持級聯113高性能集群管理軟件商業版集群管理軟件，License覆蓋計算系統所有服務器商業版提供軟件著作權登記證書及供應商承擔全部知識產權糾紛的承諾函；提供集群部署、集群管理、集群監控、告警處理、作業調度及管理、集群報表等功能。可一個或多個軟件實現。114集群編譯環境IntelC/C++/Fortran,MKL,TBB,IPP、Advisor、Inspector、Vtune、MPI、Tracetool115編譯器Intel?ParallelStudioXEClusterEditionforLinux,commercialedition116融合計算云平臺管理軟件下一代的云計算IaaS云平臺，管理包括計算、存儲和網絡在內的數據中心的各種資源。117免疫組學、全基因組學等基于特征分析需要的生命科學相關的應用軟件詳見五、產品規格參數（二）軟件平臺2.免疫組學、全基因組學等基于特征分析需要的生命科學相關的應用軟件及其衍生版本8718集成及技術服務提供平臺集成、調優及原廠專家培訓服務1五、產品規格參數（一）硬件參數1、刀片機箱技術要求設備名稱指標項技術規格要求刀片機箱品牌國際知名品牌刀片機箱全模塊化設計，模塊化設計，各主要組件不停電維護。計算刀片和IO獨立維護。可管理和維護性配置獨立的熱插拔刀箱管理模塊，擁有4個管理端口。對刀箱內部刀片統一管理，包括：節點狀態、刀箱電源風扇的狀態、電源及風扇管理、日志管理等功能。IPMI2.0接口SNMPv3.0RESTRedfishHTML5，無需獨立Java/activex客戶端。多個刀箱管理模塊串聯(≥7個串聯)，通過單一管理界面統一管理。電源配置N+N冗余白金級熱插拔電源，電源輸出功率≥2000W。風扇配置冗余系統風扇配件配置滑軌套件服務3年7*24小時保修服務，4小時上門服務。2、高性能計算刀片計算節點服務器技術要求設備名稱指標項技術規格要求計算節點服務器品牌國際知名品牌，與GPU節點服務器為同一品牌。處理器類型配置兩個Intel至強處理器主頻≥2.3GHz且單個Intel至強處理器≥20核，L3緩存≥27MB，125W處理器或以上（SPECCFP2017Rate≥200），可選最大可支持至28核205W處理器。性能要求提供采用節點機型基于所投處理器型號配置時SPECCFP2017Rate浮點測試性能不低于200，要求提供測試結果鏈接證明，不接受估算/推算結果。內存配置數目配置≥12*16GBDDR42933MHzRDIMM。內存擴展能力最大支持擴展≥16個內存插槽，滿足未來擴展性需求。內置硬盤容量及數目配置≥2塊2.5英寸960GBSSD硬盤,支持擴展至6個2.5英寸SAS/SSD，滿足未來擴展性需求。M.2支持支持M.2SSD系統啟動，支持RAID1。陣列控制器支持獨立12GbSAS/SATARaid卡，支持Raid0/1/10/5/50。I/O擴展支持≥2個PCIe3.0x8設備。或≥1個PCIe3.0x16設備。

可維護性可不開箱維護PCIE設備。IB卡≥1個MellanoxEDR100GbInfiniBand適配器。網卡配置≥10GbSFP+2端口可信平臺模塊配置符合中國國家可信計算標準的可信計算密碼模塊。可管理和維護性1）通過瀏覽器訪問帶外管理界面，可以收集和查看硬件資產信息、系統日志和診斷信息，監控服務器系統運行狀態、健康情況和性能信息，實時監控服務器用電情況，監控捕捉操作系統掛起時的視頻顯示內容，設置事件日志轉發和自動通報。符合CIM、IPMIv2.0、SNMPv3、DCMIv1.5、Redfish標準的RESTAPI。2）帶內和帶外方式配置服務器設置和更新系統/適配器固件，圖形化BIOS/UEFI配置、RAID配置等，并可以將BIOS/UEFI配置信息和RAID配置信息等保持到USB或網絡文件，并復制到其它服務器。3）顯示實時和歷史服務器用電數據和溫度圖形，顯示系統資源利用率歷史記錄；基于HTML5的遠程控制臺和遠程控制，無需Java和ActiveX插件。服務3年7*24小時保修服務，4小時上門服務。環境認證產品通過中國環境標志產品認證，要求提供證書掃描件供查證。廠商資質產品原廠商具備ISO14001環境管理體系認證和ISO9001質量管理體系認證證書，要求提供證書。產品原廠商服務體系通過信息技術服務管理體系。ISO/IEC20000認證和信息安全管理體系。ISO/IEC27001認證，要求提供證書掃描件供查證。3、高性能計算大內存計算節點服務器技術要求設備名稱指標項技術規格要求大內存計算節點服務器品牌國際知名品牌，與GPU節點服務器為同一品牌。芯片組IntelC624芯片組或以上，支持Intel至強可擴展處理器家族銅牌、銀牌、金牌及鉑金處理器產品。處理器類型配置四個Intel至強處理器主頻≥2.3Hz且單個Intel至強處理器≥20核，L3緩存≥27MB，125W（以SPECCFP2017Rate≥400），可選最大可支持至28核205W處理器。性能要求提供采用節點機型基于所投處理器型號配置時SPECCFP2017Rate浮點測試性能不低于400，要求提供測試結果鏈接證明，不接受估算/推算結果。內存配置數目≥2TBDDR42933MHzRDIMM，最大支持9TB內存擴展或最大支持48根內存插槽。內存擴展能力實配≥48條內存插槽。硬盤要求2塊960GB熱插拔2.5寸SSD硬盤，最大支持16個硬盤擴展，支持前置直連U.2NVMeSSD硬盤。支持內置兩個M.2且支持RAID0/1可切換SAS/SATA/U.2硬盤不用更換背板。陣列卡配置12Gb陣列卡配1GB閃存，支持0/1/10/5/50RAID級別，可選RAID6/60,最大支持4GB閃存。網卡配置≥10GbSFP+2端口IB卡≥1個MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器電源實配電源2個80+鉑金電源，1+1熱插拔冗余電源。支持240V高壓直流。冷卻系統6個冗余熱插拔系統風扇。I/O擴展最大支持8個PCIe插槽，包括一個內置陣列卡專用插槽，六個標準PCIe插槽，與一個LOM專用插槽。USB接口提供前置USB口或其他端口可連接手機管理服務器。工作溫度支持工作溫度最高支持0-45攝氏度，并提供國家級認證機構相關證明材料。高可用滿足平均無故障時間MTBF的m1值≥150000小時，并提供國家級認證機構相關證明材料故障定位針對處理器，內存，內部存儲，風扇，電源，陣列卡等關鍵部件的故障預報警機制。針對處理器，內存插槽，風扇，電源，CPU板的LED故障報警指示燈可選的手機故障診斷面板。服務3年7*24小時保修服務，4小時上門服務。4、高性能計算管理登錄服務器節點服技術要求設備名稱指標項技術規格要求登錄/管理節點服務器品牌國際知名品牌，要求與GPU節點服務器為同一品牌芯片組IntelC624芯片組或以上，支持Intel至強可擴展處理器家族銅牌、銀牌、金牌及鉑金處理器產品。處理器類型配置兩個Intel至強處理器主頻≥2.3Hz且單個Intel至強處理器≥20核，L3緩存≥27MB，125W處理器或以上（以SPECCFP2017Rate≥200），可選最大可支持至28核205W處理器性能要求提供采用節點機型基于所投處理器型號配置時SPECCFP2017Rate浮點測試性能不低于200，要求提供測試結果鏈接證明，不接受估算/推算結果。內存配置數目配置≥12*16GBDDR42933MHzRDIMM，最大支持9TB內存擴展或最大支持24根內存插槽。內存擴展能力實配≥24條內存插槽。硬盤要求配置≥2塊2.5英寸960GBSSD硬盤，最大支持26個硬盤擴展，支持前置直連U.2NVMeSSD硬盤。支持內置兩個M.2且支持RAID0/1。可切換SAS/SATA/U.2硬盤不用更換背板。陣列卡配置12Gb陣列卡配1GB閃存，0/1/10/5/50RAID級別，可選RAID6/60,最大支持4GB閃存。網卡配置≥10GbSFP+2端口。IB卡≥1個MellanoxConnectX-42x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器。電源實配電源2個80+鉑金電源，1+1熱插拔冗余電源。支持240V高壓直流。冷卻系統支持6個冗余熱插拔系統風扇。I/O擴展最大支持8個PCIe插槽，包括一個內置陣列卡專用插槽，六個標準PCIe插槽，與一個LOM專用插槽。USB接口提供前置USB口可連接手機管理服務器。工作溫度支持工作溫度最高支持0-45攝氏度，并提供國家級認證機構相關證明材料高可用滿足平均無故障時間MTBF的m1值≥150000小時，并提供國家級認證機構相關證明材料故障定位針對處理器，內存，內部存儲，風扇，電源，陣列卡等關鍵部件的故障預報警機制。針對處理器，內存插槽，風扇，電源，CPU板的LED故障報警指示燈可選的手機故障診斷面板。服務3年7*24小時保修服務，4小時上門服務。5、高性能計算GPU計算節點服務器技術要求設備名稱指標項技術規格要求GPU計算節點服務器品牌國際知名品牌，要求節點服務器為同一品牌芯片組IntelC624芯片組或以上，支持Intel至強可擴展處理器家族銅牌、銀牌、金牌及鉑金處理器產品。處理器類型配置兩個Intel至強可擴展處理器主頻≥2.1GHz且單個Intel至強處理器≥26核，L3緩存≥35MB，150W，，可選最大可支持至28核205W處理器。內存配置數目≥12*32GBDDR42933MHzRDIMM，最大支持9TB內存擴展或最大支持24根內存插槽。內存擴展能力實配≥24條內存插槽。硬盤要求2塊960GB熱插拔2.5寸SSD硬盤，最大支持26個硬盤擴展，支持前置直連U.2NVMeSSD硬盤。支持內置兩個M.2且支持RAID0/1。可切換SAS/SATA/U.2硬盤不用更換背板。陣列卡配置12Gb陣列卡配1GB閃存，支持0/1/10/5/50RAID級別，可選RAID6/60,最大支持4GB閃存。網卡配置10GbSFP+2端口。GPU≥2個NVIDIATeslaV100S32GBPCIe被動式GPU。Ib卡≥1個MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器。電源實配電源80+鉑金電源，1+1熱插拔冗余電源。支持240V高壓直流。冷卻系統6個冗余熱插拔系統風扇。I/O擴展最大支持8個PCIe插槽，包括一個內置陣列卡專用插槽，六個標準PCIe插槽，與一個LOM專用插槽。USB接口提供前置USB口可連接手機管理服務器。工作溫度支持工作溫度最高支持0-45攝氏度，并提供國家級認證機構相關證明材料高可用滿足平均無故障時間MTBF的m1值≥150000小時，并提供國家級認證機構相關證明材料故障定位針對處理器，內存，內部存儲，風扇，電源，陣列卡等關鍵部件的故障預報警機制。針對處理器，內存插槽，風扇，電源，CPU板的LED故障報警指示燈可選的手機故障診斷面板。服務3年7*24小時保修服務，4小時上門服務。6、高性能計算GPU計算集群技術要求設備名稱指標項技術規格要求高性能計算GPU計算集群品牌國際知名品牌，要求節點服務器為同一品牌體系結構集中式或分布式多機多GPU計算、存儲，全冗余架構，任意一個服務器的故障不影響整個系統的使用，無硬件單點故障。高性能計算GPU計算集群節點服務器數≥2臺。每個高性能計算GPU計算集群節點配置：≥2個Intel至強CPU，每個CPU的核必須≥26核心，主頻≥2.1GHz，L3緩存≥35MB，≥384GBDDR4內存，≥2塊960GB熱插拔2.5寸SSD硬盤，≥4個NVIDIATeslaV100S32GBPCIe被動式GPU。芯片組IntelC624芯片組或以上，支持Intel至強可擴展處理器家族銅牌、銀牌、金牌及鉑金處理器產品。處理器類型配置兩個Intel至強可擴展處理器主頻≥2.1GHz且單個Intel至強處理器≥26核，L3緩存≥35MB，150W，處理器或以上，可選最大可支持至28核205W處理器。內存配置數目≥12*32GBDDR42933MHzRDIMM，最大支持9TB內存擴展或最大支持24根內存插槽。擴展性節點可平滑在線橫向擴展、縮減或遷移。硬盤要求2塊960GB熱插拔2.5寸SSD硬盤，最大支持8個硬盤擴展，支持前置直連U.2NVMeSSD硬盤。支持內置兩個M.2且支持RAID0/1。可切換SAS/SATA/U.2硬盤不用更換背板。支持硬盤類型支持SSD、NL-SAS硬盤，支持SSD和NL-SAS硬盤混插。陣列卡配置12Gb陣列卡配1GB閃存，支持0/1/10/5/50RAID級別，可選RAID6/60,最大支持4GB閃存。網卡配置10GbSFP+2端口。GPU≥4個NVIDIATeslaV100S32GBPCIe被動式GPU。Ib卡≥1個MellanoxConnectX-41x100GbE/EDRIBQSFP28VPI適配器。電源實配電源2個80+鉑金電源，1+1熱插拔冗余電源。支持240V高壓直流。冷卻系統支持6個冗余熱插拔系統風扇。I/O擴展最大支持8個PCIe插槽，包括一個內置陣列卡專用插槽，六個標準PCIe插槽，與一個LOM專用插槽。USB接口提供前置USB口等其他接口可連接手機管理服務器。工作溫度支持工作溫度最高支持0-45攝氏度，并提供國家級認證機構相關證明材料高可用滿足平均無故障時間MTBF的m1值≥150000小時，并提供國家級認證機構相關證明材料故障定位針對處理器，內存，內部存儲，風扇，電源，陣列卡等關鍵部件的故障預報警機制。針對處理器，內存插槽，風扇，電源，CPU板的LED故障報警指示燈可選的手機故障診斷面板。服務3年7*24小時保修服務，4小時上門服務。7、高性能存儲及并行文件系統技術要求設備名稱指標項技術規格要求高性能存儲及并行文件系統品牌國際知名品牌，要求節點服務器為同一品牌體系結構集中式或分布式存儲，全冗余架構，存儲節點無主從差異，任意一個服務器的故障不影響整個系統的使用，無硬件單點故障。每個存儲控制器配置：≥2個Intel至強CPU，每個CPU須≥18核心，主頻≥2.6GHz或以上處理器。≥192GBDDR4內存，≥2*300G10K2.5系統盤。擴展性存儲系統可平滑在線橫向擴展、縮減或遷移。存儲容量當前配置≥418個硬盤，單盤容量≥8TB，裸容量不低于3.3PB，要求使用企業級NL-SAS硬盤。可用存儲容量不低于2PB。支持硬盤類型支持SSD、NL-SAS硬盤，支持SSD和NL-SAS硬盤混插。前端主機端口支持10Gb、56GbFDRIB、100GbEDRIB等接口。后端數據連接采用12GbSAS或IB連接存儲磁盤柜，需采用冗余鏈路，避免單點故障。總體性能指標單存儲節點實測輸出讀/寫帶寬：≥20GB/s（測試工具：采用IOZONE，寫入文件需≥所有測試節點和存儲節點內存總和的2倍。）要求提供相關證明材料。性能要求采用IOZONE，供應商所投存儲設備的測試性能如果達不到用戶需求要求，須承諾無條件免費提供足夠的相同型號的存儲和硬盤，直至達到用戶需求要求的讀/寫性能。數據保護方式支持RAID6或相當的數據保護模式，支持副本數據保護方式。數據恢復支持磁盤故障快速恢復，當前配置下10TB硬數據重建時間≤10個小時磁盤監控自動監控磁盤性能狀態，探測到磁盤部件性能下降影響存儲性能時，應自動提前替換(從系統全局熱備盤)。多站點支持支持遠程多存儲集群災難恢復，具備災備功能。數據條帶范圍64KB到16MB。可管理性基于B/S架構的web統一圖行管理界面。數據快照現有配置下，最大snapshot配置數量≥256個。數據分層支持SSD緩存、支持數據自動分層，可設置靈活策略，在不同存儲層間進行數據移動。數據壓縮支持在線自動壓縮。數據遷移支持信息生命周期管理，可根據策略自動遷移或備份數據。遠程同步支持和遠程存儲系統主動數據同步。QoS支持IO的QoS。I/O協議支持多種I/O協議：POSIX、NFSv4、SMBv3.0、支持OpenStackCinder(block方式)、OpenStackSwift(object方式)、S3（object方式）。并行文件系統配置主流成熟的商業并行文件系統，并提供所有服務器端和客戶端使用授權。客戶端支持支持原生的Linux、windows客戶端。文件系統功能提供客戶端數據緩存與預讀功能：支持在客戶端內存中記錄最近的I/O，減少訪問磁盤的次數。支持客戶端SSD緩存。支持海量小文件讀寫，每個文件系統最多2的63次方個文件。服務3年7*24小時保修服務，4小時上門服務。8、計算網絡交換機技術要求設備名稱指標項技術規格要求Infiniband交換機品牌國際知名品牌技術要求1U高度；≥36個100Gb/sinfinibandEDR端口。總吞吐量≥7Tb/s,端口間延遲≤90s。交換機內置子網管理器。采用冗余電源,冗余風扇。線纜配置≥25條3米MellanoxEDRIBQSFP28銅纜，配置≥4條10米MellanoxEDRIBQSFP28主動光纜服務：三年原廠4小時免費上門保修（配件+人力）。9、管理網絡交換機技術要求設備名稱指標項技術規格要求千兆以太網交換機品牌采用知名品牌交換機技術要求48個1Gb端口，4個上行萬兆端口。性能要求交換容量≥432Gbps

轉發率≥144Mpps

MAC地址≥16K功能要求IPv4和IPv6的靜態路由、RIP/RIPng、OSPFv2/OSPFv3等三層路由協議線纜每臺交換機配置≥4條5m進口原裝OM3LC-LC光纖

≥48條3米CAT6千兆網線滿足硬件管理網絡和系統管理網絡配置要求。服務三年原廠免費上門保修（配件+人力）。萬兆以太網交換機品牌采用知名品牌交換機，與千兆以太網交換機為同一品牌技術要求48個10Gbps光端口交換機。性能要求交換容量≥3.2T轉發率≥1900Mpps功能要求冗余電源冗余散熱支持RIP，OSPF，BGP，RIPng，OSPFv3，BGP4+支持VRRP、VRRPV3、IPEvent、GR、IPFRR、NSR、DLDP、BFD線纜每臺交換機配置≥20條5m進口原裝OM3LC-LC光纖服務三年原廠免費上門保修（配件+人力）。10、防火墻技術要求設備名稱指標項技術規格要求安全設備萬兆下一代防火墻標準2U設備，冗余電源。配置≥8個10/1000MBase-TX,≥4個SFP接口，≥4個SFP+萬兆接口，≥2個擴展槽位。IPSecVPN和SSLVPN模塊（200個并發用戶）。性能：最大整機吞吐量：≥12Gbps；每秒新建連接數：≥18萬；最大并發連接數：≥1000萬。服務：三年原廠免費上門保修（配件+人力）。11、機柜技術要求設備名稱指標項技術規格要求機柜和電源插座具體要求要求黑色，前后都為網格≥2組24口防浪涌pdu電源。服務：三年原廠免費上門保修（配件+人力）。12、KVM技術要求設備名稱指標項技術規格要求KVM切換器具體要求1U機架式；≥24個RJ-45接口的端口，滿配連接模塊；支持刀片服務器；支持PS/2、USB、SunLegacy及串口(RS-232)連接；本地控制端支持USB鍵盤與鼠標；支持跨平臺服務器環境；支持級聯；服務：三年原廠免費上門保修（配件+人力）。（二）軟件平臺1、高性能計算系統基礎平臺軟件名稱名稱模塊功能描述要求操作系統操作系統市場主流的企業級Linus操作系統，如CentOSLinus7高性能計算系統基礎平臺集群管理軟件軟件許可證數量商業版集群管理軟件，License覆蓋計算系統所有服務器。總體要求提供軟件著作權登記證書及供應商承擔全部知識產權糾紛的承諾函；提供B/S架構的集群部署、集群管理、集群監控、告警處理、作業調度及管理、集群報表等功能。可一個或多個軟件實現。集群管理1.用戶管理:支持通過Web頁面管理多種用戶角色，如系統管理員、運維管理員、站點管理員、組管理員、普通用戶等，支持用戶權限配置管理;提供統一的WEB界面來管理集群系統；根據不同的用戶角色權限展現不同的Web界面；支持自定義設置Web頁面展現內容。2.監控告警功能：針對高性能集群可分組管理和監控不同的功能節點。在WEB頁面監控節點的運行關鍵狀態（如CPU，內存使用率，網絡，硬盤使用率，計算資源，存儲資源等）。并能針對監控項自定義告警設置,包含溫度預警、計算超負荷預警、提供自動化巡檢報告、系統體檢、系統運行情況提醒等信息；軟件提供限額設置、區間設置等條件設置預警。須提供相關功能截圖以供驗證。3.存儲管理：支持和NFS、S3、GPFS、Lustre、HDFS等文件系統無縫對接，提供Web頁面對文件系統初始化、文件目錄設置、磁盤配額設置、目錄配額設置。4.提供基于命令行的集群環境配置工具軟件，實現了整個所有節點的SSH/RSH無密碼訪問、網絡連通檢測、IPMI配置、NFS配置、停止系統無用服務、同步集群時間、同步集群用戶、同步文件。5.支持手機端APP客戶端或微信端，使用語音、短信以及照片等形式幫助用戶及時反映集群故障和問題。針對計算集群平臺軟硬件故障，最高可達到分鐘級響應，及時響應和排除故障。須提供相關功能截圖以供驗證。6.提供集群問題庫可找到同類問題解決方法，并且支持生成故障處理的結果和記錄報告，可統計集群軟硬件歷史故障和問題。與后臺集群無縫集成，給管理員形成一站式的集群硬件和軟件，監控和報表的平臺。7.所有HPC軟件接口直接向用戶開放，用戶可以非常方便的要求定制或進行二次開發。8.提供集群管理軟件著作證書。作業調度1.提供靈活的資源管理機制：可以通過自定義腳本實現外部資源的管理；可以定義節點間共享和非共享資源；管理自定制的靜態和動態資源，用于調度系統的資源匹配，比如磁盤空間，操作系統類型等等；支持資源地圖映射配置，管理員可以配置各個節點的資源歸屬。2.支持基礎的調度策略在集群中共存：先進先出，搶占，回填，支持CPU/內存等多種資源的高級預約功能，絕對優先級，獨占等；可以配置隊列在不同時間段的不同策略和內容。例如在工作時間和非工作時間采取不同的調度策略，以提高集群的效率。3.高級調度策略的支持：支持動態優先級調度，可以根據需要給不同影響因素定義不同的加權值，來決定用戶作業的動態優先級。因素包括CPU加權參數，運行時間加權參數，用戶自定義加權調整參數等；根據用戶對資源的使用量，動態調整用戶當前作業啟動和運行順序。支持具有層次關系的份額控制。支持動態的優先級控制，系統會根據用戶使用資源的歷史和現狀對用戶的優先級進行排序來控制用戶使用資源。支持CPU綁定（processorbinding）調度，將作業按照BALANCE，PACK或CPU列表等方式將作業綁定到PROCESSOR上。支持脫離于隊列調度之外的全局調度策略配置，管理員可以配置全局的資源使用規則。支持基于網絡拓撲結構的智能調度：并行作業按照BALANCE，EXCLISIVE或指定并行程序部署在空余資源最多或者最少的計算單元內，使得計算性能達到最優，防止資源浪費。支持GPU的調度：用戶可以用過系統觀察GPU資源的使用狀態。應用在通過LSF的調度策略被派發之后，再根據GPU的共享、獨占模式來使用GPU資源。4.支持自定義調度器和其它底層調度：用戶可以通過系統提供的API自定制調度器和調度策略。支持諸如SLURM，SGICPUSET，RMS等底層調度環境。作業控制和管理：1.作業運行限制：管理員可對運行作業的內存大小、運行時間、CPU時間等設置使用限制，可對不滿足要求的作業進行中止或自動重新調整優先級。2.自定義作業控制：管理員可以通過定制的腳本對作業的屬主、申請的資源、提交的時間等進行單個或多個指標的同時控制，不符合要求，可自動拒絕該作業。作業管理：管理員在WEB頁面或者命令行對作業按照項目名稱、用戶名（組）、機器名（組）、作業名、作業狀態等作業相關的信息進行作業的查詢；對支持按照作業調度優先級顯示作業排隊情況，方便用戶動態掌握作業等待情況；對作業的控制可實現包括保留、釋放、掛起、恢復、重新運行等操作。計算系統編譯器和并行環境編譯器和并行環境IntelClusterStudio軟件工具包，提供IntelC/C++/Fortran編譯器，IntelMKL高性能數學函數庫，IntelMPI,MVAPICH,OpenMPI并行環境軟件等。高性能計算系統并行軟件系統基本要求提供商業版并行文件系統，要求支持原生Linux、Windows客戶端，支持NFS、CIFS、HTTP、SWIFT、S3等協議。關鍵功能要求提供統一的命名空間。良好支持Windows、Linux系統的統一、混合數據存取訪問功能。具有Windows和Linux操作系統本地客戶端，不接受采用NFS、CIFS客戶端訪問方式。支持OPA、InfiniBand兩種網絡的RDMA通訊訪問，支持萬兆以太網、千兆以太網等多種網絡的統一數據存取訪問功能；支持OPA、InfiniBand網絡和以太網同時數據存取訪問功能。具備良好的容錯和恢復功能，支持元數據和目標數據的多副本數據復制，提供方便的用戶管理和數據備份支持。在不停止服務的情況下，可支持存儲系統在線擴充和縮小容量，支持動態加入和移除磁盤，支持在線升級。支持元數據分布在所有I/O服務器管理。高速、低速存儲系統要求做到共用單一統一命名空間管理，對前端應用透明，可以方便定制數據分層管理策略，必須提供如下自動數據分層管理策略：用戶半年以上未訪問的數據自動遷移到低速存儲系統用戶指定目錄或指定后綴的文件自動遷移到低速存儲系統。過大（比如超過20GB）的用戶文件自動壓縮。融合計算云平臺管理軟件總體要求本項目配置云計算軟件許可證數量滿足所投硬件數量，不限虛擬機實例數的軟件授權,不接受OEM產品。品牌要求軟件原廠商為中國品牌，且具有《計算機軟件著作權登記證書》，需通過中國可信云開源解決方案認證。須提供相關證書復印件。計算虛擬化要求提供物理機高可用功能，當一臺宿主機發生故障時，之上的虛擬機可以在集群之內的其它宿主機上重新啟動，保障業務連續性。云平臺能夠采用Passthrough方式調度和使用NVIDIATeslaV100GPU加速卡。提供虛擬機在線遷移功能，實現虛擬機在不同宿主機之間遷移，保障業務連續性。支持計算節點的無限水平熱擴展，可以按需擴展單個或者多個計算節點，在擴展的同時不影響業務的正常運行、不停機。提供虛擬機在線熱添加CPU，虛擬機不重啟。能夠按節點設置超售比，指定計算節點設置CPU和內存超售比。提供批量部署虛擬機。提供在線更改虛擬機配置功能，包括虛擬機的CPU、內存和磁盤。提供虛擬機組管理，并且可設置虛擬機組內虛擬機是否開啟親和性配置。提供虛擬機異常狀態自動重啟。虛擬機創建時可以注入用戶自定義腳本，實現用戶對虛擬機個性化配置。提供計算節點按組配置及管理，用戶可選擇指定計算節點組創建虛擬機。虛擬機創建時可以選擇多個虛擬網絡。可以為虛擬機配置多個安全組。提供安全組開啟和關閉配置功能。虛擬機創建可以指定私有網絡IP地址。虛擬機可以綁定指定公網IP地址。2、免疫組學、全基因組學等基于特征分析需要的生命科學相關的應用軟件及其衍生版本序號軟件說明1Annovar用于對接異位點進行基因功能等的相關注釋2apache-ant一個將軟件編譯、測試、部署等步驟聯系在一起的自動化工具3BAMStats從BAM文件生成統計信息、合并多個示例、用于驗證生成的統計信息文件的工具4Bamtools提供了一個快速、靈活的C++、API工具包，用于讀取、寫入和操作BAM文件5bcl2fastq是一款由illumina官方提供的將bcl文件轉化為fastq文件的文件轉換工具6bedtools處理基因組信息分析的強大工具集合7bedtools2-2.19.1處理基因組信息分析的強大工具集合8binaries一個二進制包，里面包括了編譯好的可供直接使用的程序，只需把它解壓縮到你想要安裝的目錄即可使用9blasr第三代測序比對軟件10blast序列對比軟件11blat序列對比軟件12boostBoost庫由Boost社區組織開發、維護，其目的是為C++程序員提供免費、同行審查的、可移植的程序庫13bowtie短序列比對工具14Burrows-WheelerAligner（bwa）一款將序列比對到參考基因組上的軟件15Circos主要用于基因組序列相關數據的可視化，已應用于多個領域，如影視作品中的人物關系分析，物流公司的訂單來源和流向分析等16clustalomega多序列比對排列工具17clustalw多序列比對排列工具18Cluster聚類分析、熱圖可視化的軟件19cmake-編譯工具20Config-General-2.56一款快速應用軟件配置工具21COPE一種精確的基于k-mer的對端讀取連接工具，以促進基因組組裝22Cpat轉錄本蛋白編碼能力預測軟件23cramtools-2.1一組Java和api工具，用于有效地壓縮序列讀取數據24cufflinks主要用于基因表達量的計算和差異表達基因的尋找25cutadapt-1.4.1是一款在一定容錯率的情況下，對高通量測序的數據進行識別/剪切/去除序列的軟件26Cytoscape一款網絡顯示和分析軟件。軟件的核心部分提供了網絡顯示、布局、查詢等方面的基本功能。27EigenstratEIGENSTRAT主要用于計算PCA顯著的主成分，并將主成分加入到協變量中，從而進行相關分析的一款計算軟件28Emboss序列分析軟件包29fastq_screen_v0.4.2針對一組序列數據庫篩選FastQ格式的序列庫30fastQC用于高通量序列數據的質量控制工具。31FASTX過濾不合格序列工具32fastx_toolkit過濾不合格序列工具33FLASH測序數據拼接工具34GenomeAnalysisToolkit（GATK）是用來處理高通量測序數據的一套軟件，主要注重于變異的查找、物種的數據分析35HISAT能夠將RNA-Seq的讀取與基因組進行快速比對36HMMER用于搜索序列數據庫中的序列同源物，并進行序列比對。37Homer用于Motif查找和二代數據分析的工具。38HtseqHTSeq是使用Python編寫的一支用于進行基因Count表達量分析的軟件，能根據SAM/BAM比對結果文件和基因結構注釋GTF文件得到基因水平的Counts表達量39IgBLAST一款專一的blast工具，主要用于比對抗體（immunoglobulin,IG）或T細胞受體（Tcellreceptor，TR）序列。40IGVTools最常用的NGS數據可視化工具41JAVA編譯語言42MACS注釋和可視化ChIP-seq結果43MACS2注釋和可視化ChIP-seq結果44MAFFT(Multiple

alignment

program

for

amino

acid

or

nucleotide

sequences)多重序列比對45miRDeep2用于新microRNA的預測，以及microRNA的定量46MISO是一款經典的可變剪切分析工具，與rmats類似，該軟件也支持對可變剪切事件進行定量和差異分析47MUSCLE是一款蛋白質水平多序列比對的軟件，在速度和精度上都優于ClustalW。48MySQLserver數據庫軟件49ncbi-blast-2.2.28+是一款基本局部對齊搜索、序列相似性搜索工具50PAML利用DNA或Protein數據使用最大似然法進行系統發育分析的軟件51Pandaseq雙端測序，用于涉及到兩端拼接的軟件52Pca是一種數學降維方法,利用正交變換(orthogonaltransformation)把一系列可能線性相關的變量轉換為一組線性不相關的新變量，也稱為主成分，從而利用新變量在更小的維度下展示數據的特征53PeakSplitter經典的peak注釋軟件54Penncnv一個免費的軟件工具，用于從SNP基因分型微陣列數據進行拷貝數變異（CNV）檢測。目前，它可以處理來自Illumina和Affymetrix來源的數據55Perl編譯語言56PHP編譯語言57PHYLIP進化樹分析、構建進化樹的軟件58Picard一個用來處理高通量測序（HTS）的數據和格式的Java命令行工具箱59Picard-tools一個用來處理高通量測序（HTS）的數據和格式的Java命令行工具箱60Pindel用于檢查結構變異工具61pip-1.5.6Python包管理工具包62Plink運算軟件，用于數據處理、質量控制的基本統計、群體分層分析、單位點的基本關聯分析、家系數據的傳遞不平衡檢驗、多點連鎖分析、單倍體關聯分析、拷貝數變異分析，以及Meta分析等等63Python編譯語言64RepeatMasker一款專門用于基因組重復序列識別注釋和分類統計的軟件，幾乎適用于所有物種。是研究基因組、非編碼RNA、轉座子和著絲粒領等相關領域的必備軟件65rMATS一款對RNA-Seq數據進行差異可變剪切分析的軟件。66RNA-SeQC計算RNA-Seq數據并對質量控制的計量學的java程序67Rstudioserver一個集成開發環境，需要調用R軟件68Rsyncserver一個非常靈活的命令行網絡同步工具69Samtools一個用于操作sam和bam文件的工具合集70SeqP