RECOMBINATION重組Introduction

引言同源重組（Homologousrecombination）涉及兩條攜帶同樣遺傳位點的染色體間的DNA序列交換。位點特異性重組（Site-specificrecombination）發生在兩個特異序列之間。轉座（Transposition）指的是轉座子移到基因組的新位點。拷貝選擇（Copychoice）是一種RNA病毒使用的重組。A:同源重組可能發生在兩條同源DNA的任意位點上.1.同源重組B:Double-strandbreaksinitiaterecombination.

雙鏈斷裂引發重組.DNA(受體)雙鏈體的雙鏈斷裂引發重組.核酸外切酶作用產生3'單鏈末端,它能進一步攻擊其他(供體)雙鏈體.新合成的DNA代替被降解的物質.這產生一個重組的聯合分子,其中兩個DNA雙鏈體由異源雙鏈體DNA連接而成.重組由雙鏈斷裂啟動,然后產生3

單鏈末端,其中的一個移到同源雙鏈體上.C:ThebacterialRecBCDsystemisstimulatedbychisequences.

chi位點激活細菌的RecBCD系統.RecBCD復合體有核酸酶與解旋酶的活性.它結合到DNA的chi位點下游,解開雙鏈體,從3

端到5

端降解一條鏈直到chi位點為止.chi位點引發RecD亞基的丟失以及核酸酶活性.RecBCD核酸酶從一邊開始向chi位點前進,當它前進時，它降解DNA；在chi位點，它進行核酸酶內切,而后失去RecD,并只保留解旋酶活性.D:Strand-transferproteinscatalyzesingle-strandassimilation.

鏈轉移蛋白催化單鏈同化.RecA與單鏈或雙鏈DNA形成微絲,催化含3'端游離的單鏈DNA與DNA雙鏈體上的對應區段發生置換.在部分雙鏈體分子和完整雙鏈體DNA分子之間,RecA介導鏈的交換,它產生了與重組中間體的結構一樣的聯合分子.E:TheRuvsystemresolvesHollidayjunctions.

Ruv系統解開Holliday連接點.Ruv復合體作用于重組接點.RuvA識別重組接點,而RuvB是一個催化分叉遷移的解旋酶.RuvC切割重組接點,產生重組中間體.F:

基因敲除小鼠2:Specializedrecombinationinvolvesspecificsites.專一性重組涉及特異位點.專一性重組在特異位點進行,但位點不一定是同源的.

噬菌體通過噬菌體位點和大腸桿菌染色體上att位點的重組整合到細菌染色體上.通過線性前噬菌體末端位點之間的重組使得噬菌體從細菌染色體上外切出來.

噬菌體的int編碼整合酶來催化整合反應.A:通過在attB和attP之間的相互重組,噬菌體環狀DNA轉變成線性的前噬菌體;而通過在attL和attR之間的相互重組,前噬菌體能被外切出來.B:Site-specificrecombinationinvolvesbreakageandreunion.

位點專一性重組涉及斷裂和重連.attB和attP產生7個bp交錯的切口,末端以十字架狀連接.attB和attP的共同核心序列的交叉切割允許十字架狀的連接,使相互之間能產生重組連接點.C:Lambdarecombinationoccursinanintasome.

噬菌體重組發生在整合體中.

噬菌體整合發生在一個包含宿主蛋白IHF的大復合體中.切割反應需要Int和Xis,并且需識別前噬菌體DNA末端作為底物.Int和Xis結合到attP的不同位點,在核心區域的Int識別位點包括被切割位點.D:GATEWAYCloning

CreRecombinaseE:P1Phage4.轉座子轉座子(可轉座元件)是一段DNA序列可以將自身(或一個拷貝)插入基因組的新位點,并且和目的位點沒有任何聯系.轉座事件本身可以造成刪除,倒置或將宿主序列移到一個新位點.基因組內序列變化的主要原因是轉座子移動到新的位點,它對基因表達可能有直接影響.其相關序列間的不等交換引起重排,轉座子的拷貝提供不等交換的靶序列.16.2Insertionsequencesaresimpletranspositionmodules.

插入序列是簡單的轉座模塊.插入序列是編碼轉座所需的酶的一種轉座子,它的兩側是短反向末端重復序列.轉座子插入的靶序列在插入過程中被復制,在轉座子兩端先形成兩個短正向重復序列.正向重復序列的長度為5-9bp,是任一轉座子的特征.轉座子具有的反向末端重復序列能夠在靶位點的兩翼產生正向重復序列.圖中,靶序列為5bp,轉座子末端的反向重復序列為9bp,數字1-9表示堿基序列.16.3CompositetransposonshaveISmodules.

復合轉座子含有IS模塊.轉座子可以攜帶編碼轉座以外的其他基因.復合轉座子有一個中心區,其兩側的端部各有一個IS元件.復合轉座子的一個或兩個IS元件都能進行轉座.復合轉座子