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文檔簡(jiǎn)介
生物信息學(xué)第二講序列檢索第一頁,共十九頁,2022年,8月28日(一)NCBI簡(jiǎn)介NCBI即美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(),于1988年11月4日立法建立,NCBI的主要任務(wù)是發(fā)展新的生物資訊技術(shù),以增進(jìn)對(duì)于健康和疾病相關(guān)的基本遺傳分子的理解。第二頁,共十九頁,2022年,8月28日(二)NCBI數(shù)據(jù)檢索
例子1:下載水稻waxy基因打開NCBI網(wǎng)址:選擇目標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)Nucleotide輸入檢索詞檢索基因序列第三頁,共十九頁,2022年,8月28日第四頁,共十九頁,2022年,8月28日第五頁,共十九頁,2022年,8月28日第六頁,共十九頁,2022年,8月28日第七頁,共十九頁,2022年,8月28日第八頁,共十九頁,2022年,8月28日第九頁,共十九頁,2022年,8月28日
例子2:下載2002年3月至12月提交的水稻mRNA序列打開NCBI網(wǎng)址:選擇目標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)Nucleotide輸入檢索詞及限制條件檢索基因序列第十頁,共十九頁,2022年,8月28日第十一頁,共十九頁,2022年,8月28日第十二頁,共十九頁,2022年,8月28日
例子3:下載玉米(Zeamays)的PEP羧化酶(PEPcarboxylase)蛋白質(zhì)序列打開NCBI網(wǎng)址:選擇目標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)Protein輸入檢索詞檢索蛋白質(zhì)序列第十三頁,共十九頁,2022年,8月28日第十四頁,共十九頁,2022年,8月28日第十五頁,共十九頁,2022年,8月28日第十六頁,共十九頁,2022年,8月28日第十七頁,共十九頁,2022年,8月28日第十八頁,共十九頁,2022年,8月28日2.檢索長(zhǎng)度為501個(gè)氨基酸的乙醛脫氫酶
(acetaldehydedehydrogenase)的蛋白質(zhì)
序列。作業(yè)1.檢索迄今為止發(fā)表在Nature上的人類基
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