李春英北京大學醫學圖書館2017年1月文摘索引型數據庫檢索與利用內容提要文摘庫概述PubMed文摘索引型數據庫概述報道和揭示文獻的外部特征（題名、著者、出處、卷期、頁碼、時間、文獻類型、語種），同時對文獻的內容進行摘要性描述的檢索工具。文摘報道和揭示的一般是單篇文章生物醫學領域中外文摘索引數據庫美國全科醫學文獻數據庫(Medline)荷蘭醫學文摘數據庫(Embase)美國生物學文摘數據庫(BIOSISPreviews)美國化學文摘數據庫(SciFinder)美國科學引文索引數據庫（SCI）中國生物醫學文獻數據庫（CBM）中文生物醫學期刊文獻數據庫（CMCC）文摘索引數據庫特點提供原文的摘要信息摘要信息包括：題目、作者、刊名，或同論文相關信息數據量大，文獻類型多、信息量大收錄文獻回溯年代長收錄文獻期刊種類多出版形式多樣文摘索引數據庫使用情況文摘數據庫的作用

1.可了解和把握某課題領域研究動態和研究現狀2.找到全文的重要和必要線索3.判斷自己課題的新穎性對不熟悉的語種文章，看英文摘要即可科研評價（學位）論文選題、開題、課題查新時文獻調研的重要途徑文摘索引數據庫掌握要領1.數據庫的概況2.數據庫的結構3.數據庫的檢索界面4.數據庫的檢索技巧與方法PubMed數據庫主要內容1.數據庫概況2.數據庫檢索機制3.數據庫的組成結構4.檢索界面5.檢索方法與技巧PubMed概況1.創建機構：美國國家醫學圖書館下設的美國生物技術信息中心(NCBI)2.類型：Web數據庫3.網址：/pubmed4.特色：具有收錄范圍廣、內容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點，部分文獻還可在網上直接免費獲得全文。5.學科范圍：生物醫學、生命科學、行為科學、生物工程、化學等學科。6.與Medline光盤數據庫的區別：檢索機制、檢索界面、檢索方法以及收錄文獻數量不同。PubMed數據來源1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE

2.InProcessCitations：每天收錄，尚未經規范處理的數據。3.Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的電子文獻，每條記錄標有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。PubMed檢索機制1．自動截詞轉換匹配功能(AutomaticTermMapping)對于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進行對照匹配和轉換，再進行檢索。詞表匹配轉換順序是：MeSH表(MeSHtranslationtable)、期刊刊名表(Journaltranslationtable)、全體作者表(Fullauthortranslationtable)、作者索引(AuthorIndex)、全體調查者表(Fullinvestigatortranslationtable)、調查者索引(InvestigatorIndex)。如果在以上6個表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復以上的過程，檢索時各個詞之間是AND邏輯關系。2．短語檢索(PhraseSearching)也可稱為強迫詞組檢索，即，如果要將短語作為一個詞組進行檢索，可用雙引號“”將其引起來。如：“drugtherapy”作為詞組進行檢索的詞，系統不進行自動轉換匹配，也不進行MeSH詞的擴檢。1.邏輯運算符：邏輯與：AND，邏輯或：OR，邏輯非：NOT。當一個檢索表達式中同時含有三個運算符時，運算順序從左至右，括號可以改變運算順序。2.截詞符：*，一個詞或字拼寫出部分字母后面加上一個截詞符，chem*表示用詞根進行檢索。Heartattack*會關閉自動轉換匹配檢索詞，myocardial

infarction,

myocardialstunning,

shock等詞3.雙引號：“”，表示對引號中的短語進行檢索。4.檢索字段標識符：[tag]，tag為字段名稱。[ti]，[au]，[ta]，[so]，[la]，[pt]。PubMed檢索運算符常用字段組成標識符字段名稱TITitleAUAuthorADAffiliationABAbstractDPPublicationDateEDATEntrezDateSOSourceTAJournalTitleAbbreviationMHMeSHTermsPTPublicationType

檢索界面基本檢索高級檢索MeSH

Database檢索限定檢索期刊查詢(JournalsDatabases)引文匹配器(CitationMatcher)臨床查詢(ClinicalQueries)打開搜狗瀏覽器用戶名：jf20120001 密碼：123456PubMed檢索方法1.基本檢索：在基本檢索界面下完成的檢索方法2.高級檢索：高級檢索界面下進行的檢索方法3.MeSHDatabase檢索：MeSH主題詞界面下進行的檢索方法基本檢索基本檢索1.關鍵詞、詞(詞組)或短語：2.作者：SmithJS或Smith[au]3.期刊刊名：GENETHERAPY[TA]，JAMA[TA]4.截詞：CHEMO*5.復雜表達式：CANCERANDTHERAPY6.#1AND#2

艾滋病的藥物治療AidsdrugtherapySearchdetails檢索過程("acquiredimmunodeficiencysyndrome"[MeSHTerms]OR("acquired"[AllFields]AND"immunodeficiency"[AllFields]AND"syndrome"[AllFields])OR"acquiredimmunodeficiencysyndrome"[AllFields]OR"aids"[AllFields])

("drugtherapy"[Subheading]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields])OR"drugtherapy"[AllFields]OR"drugtherapy"[MeSHTerms]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields]))修改后的檢索結果高級檢索高級檢索MeSHDatabase檢索輸入查找的主題詞Aidsdrugtherapy主題詞注釋樹狀結構表款目詞檢索步驟查看檢索歷史限定檢索1.限制檢索或條件檢索：Limits(1)日期：①Dateofpublication[DP]原始文獻出版日期；②EntrezDate[EDAT]文獻首次錄入PubMed日期；③MeSHDate[MHDA]文獻被MeSH詞條標引日期。(2)地址：單個詞加標識符[ad](3)帶有摘要文獻的檢索：CANCERANDhasabstract(4)數據庫子集的限定：特殊主題的檢索AMERICANANDhistory[sb]2.限定檢索結束后，及時取消限定條件

限定檢索限定檢索點擊取消PubMed幾種檢索方法的選擇基本檢索高級檢索MeSH

Database檢索舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻基本檢索1.檢索表達式：

childrenasthmadrugtherapy2.直接輸入檢索框中，進行檢索檢索過程（Search

details）

("child"[MeSHTerms]OR"child"[AllFields]OR"children"[AllFields])

AND

("asthma"[MeSHTerms]OR"asthma"[AllFields])AND

("drugtherapy"[Subheading]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields])OR"drugtherapy"[AllFields]OR"drugtherapy"[MeSHTerms]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields]))修改檢索式：

child[MeSH

Terms]ANDasthma[MeSH

Terms]AND"drugtherapy"[Subheading]舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻MeSH

Database檢索1.確定主題詞：childasthma

drugtherapy(副主題詞)2.查找主題詞舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻高級檢索1.確定檢索詞：childasthmadrugtherapy2.選擇檢索字段3.輸入檢索詞JournalsDatabases主題、刊名全稱或縮寫、ISSN單篇文獻匹配器臨床咨詢特殊專題咨詢檢索結果顯示保存打印顯示格式Summary(簡要格式)Abstract（文摘格式）MEDLINE保存格式1.File(文件)2.Format（格式）檢索策略的存儲和調用使用MyNCBI(Cubby)首先要登記注冊保存檢索策略定期瀏覽新的檢索結果注冊或登錄個人帳號注冊后的功能保存、修改、刪除檢索式其它功能全文鏈接相關文獻鏈接相關數據庫的鏈接RSS閱讀器的使用全文鏈接全文鏈接檢索練習1.檢索有關“禽流感(birdflu)預防控制方面”的文獻2.檢索微量元素缺乏(traceelements)與皮膚病(skindiseases)關系的文獻（限英文綜述）3.利巴韋林（ribavirin）治療SARS方面的綜述文獻4.眼結核(oculartuberculosis)引起失明(blindness)的文獻5.北京大學韓濟生教授發表的英文文獻6.CANCERLETTERS期刊上查找有關基因治療方面的文獻1.檢索過程和步驟2023/2/575（1）分析課題，提煉出兩個主題概念，并明確概念之間的相互關系如下：預防控制禽流感事物與特征的關系2023/2/576（2）選擇檢索方式為敘詞檢索，在PUBMED數據庫中即為選擇MeSH入口進行檢索。（3）編制檢索策略。

InfluenzainBirds/preventionandcontrol

（禽流感/預防控制）

其中主題詞為：InfluenzainBirds（禽流感）副主題詞為：preventionandcontrol（預防控制）2.檢索過程和步驟2023/2/577（1）分析課題，提煉出兩個主題概念，并明確概念之間的相互關系如下；皮膚病微量元素缺乏因果關系此外，課題還要求只要英文綜述文獻。綜述英文+2023/2/578（2）選擇檢索方式為敘詞檢索，在PUBMED數據庫中即為選擇MeSH入口進行檢索。此外，PUBMED數據庫提供有檢索結果濾鏡（ResultFilters），可對檢索結果按照不同分面進行顯示，其中有按照文獻語種、文獻類型等分面的顯示。2023/2/5782023/2/579（3）編制檢索策略。

TraceElements/deficiency（