生存分析

第1頁生存分析主要內容生存過程描述生存時間分布特點預計生存率預計平均生存時間繪制生存率曲線生存過程統計推斷生存時間影響原因研究第2頁生存分析需具備資料生存時間或稱時間變量觀察結果或稱截尾變量暴露變量及混雜原因第3頁腎移植例普通手術(A組):391520202630414664+64135223365450596+680+900+900+改進手術(B組):

1070+70+120225366390+475+518+647+801+1001+1045+1045+第4頁手術方式生存時間觀察結果treattimeoutcome1311911411146116411640………………190002101………………28010210010210450210450第5頁生存資料定義(1)將數據定義為生存資料格式stset時間變量[，failure(截尾變量)]failure(截尾變量)stata以全部不等于0非缺失值為預期出現結果；若failure選擇項缺省，則stata默認全部紀錄均出現結果第6頁生存資料定義(2)四個變量---定義數據庫后，stata系統自動產生_st /*數據庫中該條統計是否被定義為生存資料_d /*該條統計是否出現預期結果_t /*觀察對象被隨訪時間_t0 /*觀察對象第一次被觀察到時間(開始過程時間為0)第7頁stsettime,failure(outcome)

failureevent:outcome!=0&outcome<.obs.timeinterval:(0,time]exitonorbefore:failure------------------------------------------------------------------33totalobs.0exclusions------------------------------------------------------------------33obs.remaining,representing18failuresinsinglerecord/singlefailuredata11370totalanalysistimeatrisk,atriskfromt=0earliestobservedentryt=0lastobservedexitt=1045第8頁生存資料描述stci,[by(分組變量)選擇項]p(#)/*生存時間百分位數level(#)/*可信區間可信度media/*計算中位生存時間，為默認選項rmean/*計算平均生存時間第9頁.stci,by(treat)failure_d:outcomeanalysistime_t:time|no.oftreat|subjects50%Std.Err.[95%Conf.Interval]-------+-------------------------------------------------------------1|196446.8995204502|14..225.-------+-------------------------------------------------------------total|33365143.400164.第10頁.stci,rmeanby(treat)failure_d:outcomeanalysistime_t:time|no.ofrestrictedtreat|subjectsmeanStd.Err.[95%Conf.Interval]-------+-------------------------------------------------------------1|19297.0329(*)83.96867132.457461.602|14766.4481(*)116.2397538.622994.274-------+-------------------------------------------------------------total|33512.9716(*)83.84662348.635677.308(*)largestobservedanalysistimeiscensored,meanisunderestimated.第11頁生存率預計輸出生存率、生存概率標準誤等統計量stslist[,by(分組變量)選擇項]failure/*輸出死亡函數(1-S(t))level /*要求所輸出可信區間可信度第12頁.stslist,by(treat)failure_d:outcomeanalysistime_t:timeBeg.NetSurvivorStd.TimeTotalFailLostFunctionError[95%Conf.Int.]-------------------------------------------------------------------------------treat=1319100.94740.05120.68120.9924…...6803010.23680.10150.07580.44759002020.23680.10150.07580.4475treat=21014100.92860.06880.59080.98967013020.92860.06880.59080.9896…...10013010.67530.13440.34640.864710452020.67530.13440.34640.8647-------------------------------------------------------------------------------第13頁繪制生存（死亡）曲線(1)繪制Kaplan-Meier生存(死亡)曲線stsgraph[,by(分組變量)separate選擇項]failure/*指定繪制“死亡”曲線，缺省時繪制生存曲線Gwood/*繪制生存(或死亡)曲線及其Greenwood可信區間lost/*在曲線上標出該時間點截尾值例數第14頁第15頁繪制生存（死亡）曲線(2)繪制Kaplan-Meier生存曲線與Cox預測曲線stcoxkm[,by(分組變量)separate繪圖命令選擇項]第16頁第17頁生存率比較ststest分組變量[,選擇項]

logrank/*進行log-rank檢驗，為缺省值第18頁.ststesttreatfailure_d:outcomeanalysistime_t:timeLog-ranktestforequalityofsurvivorfunctions|EventsEventstreat|observedexpected------+-------------------------1|148.572|49.43------+-------------------------Total|1818.00chi2(1)=6.71Pr>chi2=0.0096第19頁例8.8某臨床試驗比較A，B兩治療方案對某病治療效果，A組(group=0)12人，B組(group=1)13人。病人分組后檢驗其腎功效(kidney)，功效正常者記為0，不正常者記為1；治療后生存時間為stime(天)；問不一樣治療方案及腎功效對病人生存時間是否有影響?第20頁編號NO.治療生存觀察腎功效kidney編號NO.治療生存觀察腎功效kidney方案時間結果方案時間結果Groupstimecensorgroupstimecensor108111311801020852001416321030521115122400040220101611951050631117176106081018170107019760019113118012960020123119014600021112961010063112212101011013280023170010120365002411811251199000例8.8第21頁Cox百分比風險模型(1)預計Cox百分比風險模型命令格式為stcox[協變量][,nohr選擇項]nohr/*指定輸出回歸系數b而不是危險比exp(b)level(#)/*可信區間可信度第22頁例8.8Stsetstime,failure(censor)Stcoxgroupkidney,nolognohrfailure_d:censoranalysistime_t:stimeCoxregression--Breslowmethodforties

No.ofsubjects=25Numberofobs=25No.offailures=17Timeatrisk=15334LRchi2(2)=22.67Loglikelihood=-35.707534Prob>chi2=0.0000------------------------------------------------------------------------------_t|_d|Coef.Std.Err.zP>|z|[95%Conf.Interval]-------------+----------------------------------------------------------------group|1.243078.59931772.070.038