1、外文摘要信息獲取方式常用外文摘要數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed（核心內(nèi)容）EMBaseEngineering Village 2Web of ScienceScopusBIOSIS PreviewSciFinder Scholar一、PubMed簡(jiǎn)介（了解）二、認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)（了解）三、PubMed檢索特點(diǎn)（掌握）四、PubMed基本檢索（重點(diǎn)）五、PubMed高級(jí)檢索（重點(diǎn)）六、特征欄檢索（重點(diǎn)）七、PubMed檢索結(jié)果處理（重點(diǎn)）八、PubMed主題詞檢索（掌握）九、MyNCBI個(gè)性化服務(wù)（了解）PubMed主要內(nèi)容一、PubMed簡(jiǎn)介（了解）二、認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)（了解）三、PubMed檢索

2、特點(diǎn)（重點(diǎn)）四、PubMed基本檢索功能（重點(diǎn)）五、PubMed高級(jí)檢索功能介紹（掌握）PubMed（1）一、PubMed簡(jiǎn)介PubMed概況 (com; org; net)美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館（National Library of Medicine - NLM）國(guó)家生物技術(shù)信息中心（National Center for Biotechnology Information - NCBI）向因特網(wǎng)用戶提供免費(fèi)MEDLINE檢索服務(wù)(自1997-6-26起)收錄80多個(gè)國(guó)家5400多種生物醫(yī)學(xué)期刊的題錄與文摘，是世界上最權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。現(xiàn)有1809年以來的2200萬篇文獻(xiàn)記錄。每年增加60

3、余萬條文獻(xiàn)記錄。90%的文獻(xiàn)為英文；70%以上的文獻(xiàn)有摘要；截至2012年8月21日，PubMed收錄127種中國(guó)期刊（我校學(xué)報(bào)被收錄）合計(jì)21542篇論文 。 PubMed概況PubMed的外部鏈接功能 提供NCBI開發(fā)的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接，如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等。提供美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館多種資源的鏈接，如PubMed Central(PMC)全文。提供相關(guān)文獻(xiàn)（RELATED ARTICLES）的鏈接提供其它外部資源的鏈接，如生物醫(yī)學(xué)期刊網(wǎng)站全文鏈接、NCBI資源。出版商提供的電子文獻(xiàn)全文。外部鏈接使用教程常

4、用工具更多資源二、認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)作者AU題名TI來源SO記錄狀態(tài) PubMed記錄類型（狀態(tài)）PubMed除了1966年以前的OldMedline，其余文獻(xiàn)記錄按處理過程分4種類型（或狀態(tài)）PubMed - as supplied by publisher PubMed - in process PubMedPubMed - indexed for MEDLINE 屬于Medline收錄范圍，建立ti、au、ab等基本書目信息。不屬于Medline收錄范圍，但也建立ti、au、ab等基本書目信息。賦予MeSH、PT等字段并被index。三、PubMed檢索特點(diǎn) PubMed檢索特點(diǎn)檢索運(yùn)

5、算符AND、NOT、OR必須大寫。(vitamin c OR zinc) AND common cold支持截詞檢索（*），但對(duì)詞組無效。 如bacter*, 可以檢出以bacter為詞干的單詞bacteria、bacterium等最多600個(gè)單詞。 截詞檢索時(shí)，系統(tǒng)的自動(dòng)詞語匹配功能和MeSH自動(dòng)擴(kuò)展功能將不再被執(zhí)行，如：heart attack* 將不映射到 MeSH 詞 Myocardial Infarction。PubMed檢索特點(diǎn)強(qiáng)制檢索：雙引號(hào)“ ”或限定檢索字段 “gene silencing” gene silencing注意：所有的 、*、 ( )、- 都必須是英文狀態(tài)下輸入

6、。四、PubMed基本檢索功能1. 關(guān)鍵詞檢索 在檢索框中鍵入一個(gè)或多個(gè)單詞，如鍵入：vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy) 檢索詞可出現(xiàn)于PubMed記錄的標(biāo)題、摘要等全部可檢索字段。作者AU題名TI來源SOMEDLINE收錄文獻(xiàn)OLDMEDLINE文獻(xiàn)舉例甲型病毒（H1N1）性流感（flu,influenza）/豬流感swine flu檢索詞：H1N1;flu;influenza;swine flu 造血干細(xì)胞移植(hsct)治療地中海貧血檢索詞：hematopoietic stem cell tra

7、nsplantation；thalassemia2. 字段限定檢索篇名字段檢索 TI作者字段檢索 AU機(jī)構(gòu)字段檢索 AD刊名字段檢索 TA SO縮寫全稱縮寫全稱ABAbstractLALanguageADAffiliation（機(jī)構(gòu)）MHMeSH TermsAUAuthor（作者）PTPublication TypeDPPublication DateSOSourceCPPublication CountryTAJournal Title（刊名）TIABTitle/abstractTITitle（篇名）ISISSNTWText Words常用字段（檢索時(shí)大小寫都可以）篇名檢索在文章的標(biāo)題中進(jìn)行

8、檢索字段標(biāo)識(shí)TI檢索舉例：篇名中檢索亞健康的相關(guān)文獻(xiàn)檢索詞：subhealth，sub-health構(gòu)建檢索表達(dá)式：Subhealthti OR sub-healthti 查作者文章被收錄。 西方人姓名書寫格式：first name、 Middle Name、last name。美國(guó)肯尼迪總統(tǒng)： John Frank Kenedy，Kenedy為 last name（姓）Frank為 middle name，比較少見，多看到 John F. Kenedy，中間名用縮寫。 如果姓名中間有逗號(hào)，逗號(hào)前肯定是姓。 Kenedy， John F. Kenedy jf作者檢索 中國(guó)人姓名格式：first

9、 name、last nameShi-zhen Zhong（ Shi zhen Zhong ） zhong szShizhen Zhong zhong s 當(dāng)作者三個(gè)字以上的中國(guó)人時(shí)，注意這兩種格式都要檢索。即：Zhong szau OR zhong sau “姓”+空格+“名首字母縮寫”例如鍵入phillips c，系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在作者字段內(nèi)進(jìn)行檢索。如果想進(jìn)行更精確的檢索，可以用雙引號(hào)將作者名引起來，再加au（作者字段標(biāo)識(shí)符），如：phillips cau。Phillips CBPhillips C檢索舉例查找鐘世鎮(zhèn)院士發(fā)表的顯微外科學(xué)(microsurgery)論文檢索姚開泰院士發(fā)表的鼻咽癌

10、(nasopharyngeal carcinoma,NPC)論文機(jī)構(gòu)檢索查某一機(jī)構(gòu)發(fā)表論文被收錄情況機(jī)構(gòu)字段 AD檢索南方醫(yī)院發(fā)表的SARS論文南方醫(yī)院：nanfang hospital; south hospital;southern hospital表達(dá)式：SARS AND nanfang hospitalad思考題：如何查全南方醫(yī)院發(fā)表的文獻(xiàn)？nanfang hospitaladnan fang hospitaladsouthern hospitaladsouth hospitalad還有其它的檢索形式嗎？有！錯(cuò)誤的拼寫形式 nangfang hospitalad nang fang h

11、ospitalad 輸入期刊全名，如：molecular biology of the cellmol biol cell” Journal Name），系統(tǒng)自動(dòng)轉(zhuǎn)換；鍵入期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式如：mol biol cell，或期刊的ISSN（國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)出版物代碼）如：1059-1524進(jìn)行檢索； 如果期刊名恰好是MeSH詞表中的詞或一個(gè)單詞，如：Gene Therapy，Science，Cell等，加ta（雜志名稱） ?？麢z索如果雜志全名中包括括弧或方括號(hào)，鍵入時(shí)應(yīng)該予以取消，例如雜志名為：J Hand Surg Am，檢索時(shí)應(yīng)轉(zhuǎn)成：J Hand Surg Am.語種為中文的期刊直接用漢語拼音 南

12、方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)：Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao（繼承 Di 1 jun yi da xue xue bao）26 七月 202240檢索問題檢索南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)（原第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào)有多少篇文獻(xiàn)被收錄，最早收錄時(shí)間是哪一年？提示：中文刊名用拼音。五、 PubMed高級(jí)檢索高級(jí)檢索檢索策略編輯器（search builder edit）搜索器(builder)索引(show Index list 特征欄)檢索史(Search History 特征欄)檢索史索引搜索器高級(jí)檢索界面檢索策略編輯器搜索器（Search Builder）Choose a field to sea

13、rch：選定檢索字段Enter search term(s)：輸入檢索詞 Click the Show Index link to display a list of terms, if desired：點(diǎn)擊索引鏈接查看索引表 Change the default AND operator, if necessary. 改變字段/算符Click the Add to Search Box button. 單擊添加到檢索框按鈕Repeat steps as necessary 視情況重復(fù)上述步驟Click Search to run your query, or click Preview to

14、 see the result count of your query in the Search History section. 單擊搜索運(yùn)行查詢；或點(diǎn)擊預(yù)覽在檢索史區(qū)顯示查詢結(jié)果數(shù)量。 舉例小劑量阿斯匹林治療高血壓Small dose; aspirin;hypertension方法：通過搜索器和索引表將檢索詞逐一導(dǎo)入1、輸入Small dose ，點(diǎn)擊SHOW INDEX2、在新界面選擇索引表中的一個(gè)或多個(gè)索引詞，加入到檢索框。3、 aspirin、hypertension同理。最后搜索。4、可以改變默認(rèn)字段和邏輯算符。5、檢索史直接顯示于高級(jí)檢索界面的檢索史區(qū)查看索引表輸入檢索詞點(diǎn)選高

15、頻詞實(shí)習(xí)(1)篇名中包含SARS的論文（Severe acute respiratory syndrome，SARS）阿司匹林（aspirin）臨床應(yīng)用于高血壓（hypertension）Piotr J Durka發(fā)表的英文綜述，要求保存下來。細(xì)胞病理學(xué)(cell pathology, (cytopathology)論文 誰最早提出定量病理學(xué)quantitative pathology休克綜合征（shock syndrome）的臨床病理學(xué)(clinical pathology)研究2000年以來丁彥青教授發(fā)表的病理學(xué)論文 PubMed (2)六、特征欄檢索(重點(diǎn))七、PubMed檢索結(jié)果的處理

16、(掌握)八、PubMed主題詞檢索(掌握)九、MyNCBI個(gè)性化服務(wù)(了解)六、特征欄檢索1. Limits(限定檢索) 2. Show Index（查看索引）3. History（檢索史）4. Clipboard（剪貼板） 5. Details（檢索策略細(xì)節(jié)） 用于查看檢索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換1、 限定檢索(limits)設(shè)置與選擇檢索條件，包括日期、文獻(xiàn)類型、語種、子集（subsets）、年齡段、性別、文本選擇（有無摘要/全文）等。研究對(duì)象：人類或動(dòng)物（Humans or Animals）出版物類型包括：臨床試驗(yàn)、評(píng)論、信件、Meta分析、實(shí)踐指南、隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn)、綜述。全文鏈接（Full Text

17、或 Free Full Text）、有摘要（Abstracts）。年齡選擇性別選擇出版時(shí)間文本選擇文獻(xiàn)類型檢索舉例姚開泰院士1985年以來發(fā)表的鼻咽癌（nasopharyngeal cancer）論文分析 姚開泰；1985年以來；nasopharyngeal cancer主體檢索時(shí)間選擇時(shí)間選擇2、檢索史（Search History）各檢索式可以進(jìn)行邏輯組配，可以#n代替檢索式。3、查看索引查看索引4、剪貼板(clipboard)點(diǎn)擊剪貼板加入剪貼板5、檢索策略細(xì)節(jié)檢索策略細(xì)節(jié)七、PubMed檢索結(jié)果處理（一）顯示格式設(shè)置 (Display Settings)（二）文件保存（10000篇）(

18、Send to File)（三）放進(jìn)剪貼板 (Send to Clipboard)（四）發(fā)送電子郵件 (Send to E-mail)（五）結(jié)果排序 (Display Settings - Sort by)（六）存為館藏 (Send to Collections)（一）顯示格式設(shè)置（Display Settings）題錄格式：作者、題名、出處顯示格式Summary格式（默認(rèn)）顯示格式Abstract格式顯示格式MEDLINE格式導(dǎo)入NoteExpress的必選格式（二）文件保存（三）放進(jìn)剪貼板（Clipboard）將每次選中的檢索結(jié)果暫時(shí)保存至此；最后集中處理（下載存盤或發(fā)E-mail）；最多

19、500條記錄；斷開連接后仍可保存8小時(shí)。選取記錄，將記錄發(fā)送到Clipboard記錄保存到Clipboard后有提示信息在Clipboard中查看保存的記錄在檢索歷史中顯示Clipboard操作歷史（四）發(fā)送電子郵件（五）結(jié)果排序 (Display Settings - Sort by) 排序字段：1、Recently Added（收錄日期）2、Pub Date（出版時(shí)間）3、First Author（第一作者）4、 Last Author （最后一名作者）5、Journal（刊名）6、Title（篇名）（六）存為館藏 (Send to Collections)八、PubMed主題詞檢索MeS

20、H (Medical Subject Headings) PubMed記錄中的醫(yī)學(xué)主題詞(MeSH)是由標(biāo)引員為PubMed中的Medline文獻(xiàn)所人工指定的詞。 例：ascorbic acid是MeSH Terms，而vitamin c則不是。標(biāo)引員使用能恰當(dāng)描述文章內(nèi)容的最相關(guān)MeSH詞。通常一篇文章可有多個(gè)MeSH詞。PubMed能自動(dòng)地為輸入的檢索詞尋找相應(yīng)的MeSH詞用戶利用一個(gè)MeSH詞能找出所有有關(guān)該主題的文獻(xiàn) 不同拼寫：leukemia(s), leukaemia(s)leukemia同義詞：tumor(s), tumour(s), cancer(s),neoplasm(s) neoplasmsMeSH (Medical Subject Headings) MeSH詞獨(dú)有特征主要MeSH詞(MAJOR TOPIC): MeSH term as main subject of the article (*)次要MeSH詞擴(kuò)展(EXPLODE)：chosen MeSH term and all more