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文檔簡(jiǎn)介
1、第 2 章 染色體與 DNA名詞解釋原癌基因: 細(xì)胞內(nèi)與細(xì)胞增殖相關(guān)的正常基因, 是維持機(jī)體正常生命活動(dòng)所必須的, 在進(jìn)化上高等保守。 當(dāng)原癌基因的結(jié)構(gòu)或調(diào)控區(qū)發(fā)生變異,基因產(chǎn)物增多或活性增強(qiáng)時(shí),使細(xì)胞過度增殖,從而形成腫瘤。復(fù)制:以親代DNA或RNA為模板,根據(jù)堿基配對(duì)的原則,在一系列酶的作用下,生成與親代相同的子代 DNA或RNA的過程。轉(zhuǎn)座子 (transposon 或 transposable element) : 位于染色體 DNA 上可自主復(fù)制和位移的基本單位。包括插入序列和復(fù)合轉(zhuǎn)座子。半保留復(fù)制:以親代DNA雙鏈為模板以堿基互補(bǔ)方式合成子代DNA,這樣新形成的子代 DNA中,一條
2、鏈來自親代DNA,而另一條鏈則是新合成的,這種復(fù)制方式叫半保留復(fù)制。染色體: 染色體是遺傳信息的載體,由 DNA、 RNA 和蛋白質(zhì)構(gòu)成,其形態(tài)和數(shù)目具有種系的特性。在細(xì)胞間期核中,以染色質(zhì)形式存在。在細(xì)胞分裂時(shí),染色質(zhì)絲經(jīng)過螺旋化、折疊、包裝成為染色體,為顯微鏡下可見的具不同形狀的小體。核小體:是構(gòu)成真核生物染色體的基本單位,是DNA 和蛋白質(zhì)構(gòu)成的緊密結(jié)構(gòu)形式,包括200bp左右的DNA和9個(gè)組蛋白分子構(gòu)成的致密結(jié)構(gòu)。填空題1 .真核細(xì)胞核小體的組成是DNA 和 蛋白2 .天然染色體末端不能與其他染色體斷裂片段發(fā)生連接,這是因?yàn)樘烊蝗旧w末端存在端粒結(jié)構(gòu)。3 .在聚合酶鏈反應(yīng)中,除了需要模
3、板 DNA外,還需加入引物、DNA聚合酶、dNTP和鎂離子。4 .引起 DNA 損傷的因素有自發(fā)因素、物理因素、化學(xué)因素。5 .DNA復(fù)制時(shí)與DNA解鏈有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)有拓?fù)洚悩?gòu)酶H、解螺旋酶、單鏈 DNA結(jié)合蛋 白。6 .參與DNA切除修復(fù)的酶有 DNA聚合酶I、 DNA連接酶、特異的核酸內(nèi)切酶。7 .在真核生物中 DNA復(fù)制的主要酶是 DNA聚合酶8。在原核生物中是 DNA聚合酶出。8 .端粒酶是端粒酶是含一段RNA 的逆轉(zhuǎn)錄酶。9 .DNA 的修復(fù)方式有錯(cuò)配修復(fù)、堿基切除修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)、 DNA 的直接修復(fù)。選擇題1 . 真核生物復(fù)制起點(diǎn)的特征包括(B)A.富含G-C區(qū) B.富含A
4、-T區(qū) C. Z-DNA D.無明顯特征2 .插入序列(IS)編碼(A)A.轉(zhuǎn)座酶B.逆轉(zhuǎn)錄酶C. DNA合成酶D.核糖核酸酶3 .紫外線照射對(duì)DNA 分子的損傷主要是(D)A.堿基替換B.磷酸脂鍵斷裂Co堿基丟失D.形成共價(jià)連接的喀咤二聚體4 . 自然界中以DNA 為遺傳物質(zhì)的大多數(shù)生物DNA 的復(fù)制方式(C)A.環(huán)式 B.D環(huán)式 C.半保留 D全保留5 .原核生物基因組中沒有(A)A.內(nèi)含子B.外顯子C.轉(zhuǎn)錄因子D.插入序列6 .關(guān)于組蛋白下列說法正確的是(D)A.為中性蛋白B.為酸性蛋白C.進(jìn)化上不具保守性D.染色體結(jié)合蛋白7 .DNA聚合酶I ( C)A.是復(fù)制酶,但不是修復(fù)酶B.沒有
5、模板依賴性C.有5' -3'外切酶活性D. 5' -3'聚合酶活性極強(qiáng)簡(jiǎn)述 DNA 復(fù)制的過程DNA的復(fù)制過程可被分為 3個(gè)階段,即復(fù)制的起始、延伸和終止。每個(gè)DNA復(fù)制的獨(dú)立單元主要包括復(fù)制起始位點(diǎn)和終止位點(diǎn)。DNA 復(fù)制的起始包括預(yù)引發(fā)和引發(fā)兩個(gè)階段。在預(yù)引發(fā)階段, DNA 解旋解鏈,形成復(fù)制叉,引發(fā)體組裝;在引發(fā)階段,在引發(fā)酶的催化下以 DNA 鏈為模板合成一段短的 RNA 引物。復(fù)制時(shí)DNA鏈的延伸由DNA聚合酶催化,以親代DNA鏈為模板,引發(fā)體移動(dòng),從5' -3'方向聚合子代 DNA鏈。當(dāng)子鏈延伸到達(dá)終止位點(diǎn)是,DNA復(fù)制就終止了,切除
6、RNA引物, 填補(bǔ)缺口, 在 DNA 連接酶的催化下將相鄰的岡崎片段連接起來形成完整的 DNA 長(zhǎng)鏈。試述真原核生物的 DNA 復(fù)制的特點(diǎn)的不同之處真核生物染色體有多個(gè)復(fù)制起點(diǎn), 多復(fù)制眼,呈雙向復(fù)制, 多復(fù)制子。 原核生物的染 色體只有一個(gè)復(fù)制起點(diǎn),單復(fù)制子也呈雙向復(fù)制。真核生物岡崎片段長(zhǎng)約 200bp 比原核生物略短。真核生物 DNA 復(fù)制速度比原核慢, 速度為10003000bp/min(僅為原核生物的 1/201/50 )。真核生物復(fù)制的終止在端粒處,原核生物的復(fù)制叉相遇時(shí)即終止。真核生物染色體在全部復(fù)制完之前起點(diǎn)不再重新開始復(fù)制; 而在快速生長(zhǎng)的原核生物染色體 DNA 復(fù)制中,起點(diǎn)可
7、以連續(xù)發(fā)動(dòng)復(fù)制。真核生物快速生長(zhǎng)時(shí),往往采用更多的復(fù)制 起點(diǎn)。真核生物有多種DNA聚合酶,DNA聚合酶8是真正的復(fù)制酶,在 PCNA存在下有持續(xù)的合成能力。PCNA稱為增殖細(xì)胞核抗原,相當(dāng)于大腸桿菌DNA聚合酶出的3-夾子,RFC蛋白相當(dāng)于夾子裝配器。原核生物的DNA聚合酶有三種 DNA聚合酶出DNA的真正復(fù)制酶:多亞基酶,含十種亞基,該酶 DNA 合成的持續(xù)能力強(qiáng)。真核生物線性染色體兩端有端粒結(jié)構(gòu), 它是由許多成串的重短復(fù)序列組成, 端粒功能是穩(wěn)定染色體末段結(jié)構(gòu),防止染色體間的末端連接,并可補(bǔ)償滯后鏈5'-末段在消除RNA 引物后造成的空缺,使染色體保持一定長(zhǎng)度。端粒酶是含一段RNA
8、 的逆轉(zhuǎn)錄酶。RPA真核生物的單鏈結(jié)合蛋白;RNaseHI和MF-1切除RNA弓I物,DNA聚合酶£填補(bǔ)缺口。簡(jiǎn)述半保留復(fù)制的生物學(xué)意義DNA 的復(fù)制過程(以大腸桿菌為例)復(fù)制起始:( 1 ) 、拓?fù)洚悩?gòu)酶解開超螺旋。(2)、Dna A蛋白識(shí)別并在 ATP存在下結(jié)合于四個(gè) 9bp的重復(fù)序列。(3)、在類組蛋白(HU、ATP參與下,Dan A蛋白變性13個(gè)bp的重復(fù)序列,形成開鏈復(fù)合物。(4) 、Dna B借助于水解ATP產(chǎn)生的能量在 Dna C的幫助下沿5' -3'方向移動(dòng),解開DNA 雙鏈,形成前引發(fā)復(fù)合物。( 5 ) 、單鏈結(jié)合蛋白結(jié)合于單鏈。( 6 ) 、引物合
9、成酶(Dna G 蛋白)開始合成RNA 引物。鏈的延長(zhǎng)(岡崎片段的合成) :在DNA聚合酶 山的催化下,以四種 5'-脫氧核甘三磷酸為底物,在 RNA引物的3'端以磷酸二酯鍵連接上脫氧核糖核苷酸并釋放出焦磷酸。 DNA 鏈的延伸同時(shí)進(jìn)行前導(dǎo)鏈和滯后鏈的 合成。兩條鏈方向相反。6、PCR的基本原理?PCR是在試管中進(jìn)行的 DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)細(xì)胞內(nèi) DNA半保留復(fù)制的機(jī)理,以 及體外 DNA 分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合酶以dNTP為原料使引物沿著
10、單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PCR全過程每一步的轉(zhuǎn)換是通過溫度的改變來控制的。需要重復(fù)進(jìn)行DNA 模板解鏈、引物與模板DNA 結(jié)合、DNA 聚合酶催化新生DNA的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸3個(gè)步驟構(gòu)成PCR反應(yīng)的一個(gè)循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進(jìn)行,就可使目的 DNA得以迅速擴(kuò)增。DNA模板變性:*II板雙鏈 DNA禪鏈 DNA, 94 Co退火:引物+單鏈 DNA?雜交鏈,引物的 Tm值。引物的延伸:溫度至 70 C左 右,Taq DNA聚合酶以4種dNTP為原料,以目的 DNA為模板,催化以引物3'末端為起點(diǎn)的5'-3'DNA鏈延伸反應(yīng),形成新生 DNA鏈。新合成的引
11、物延伸鏈經(jīng)過變性后又可作為下 一輪循環(huán)反應(yīng)的模板 PCR就是如此反復(fù)循環(huán),使目的DNA得到高效快速擴(kuò)增。第三章啟動(dòng)子:是一段位于結(jié)構(gòu)基因5,端上游區(qū)的DNA 序列,能活化RNA 聚合酶,使之與模板DNA 準(zhǔn)確地相結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。指RNA 聚合酶識(shí)別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段特定的 DNA 序列。 增強(qiáng)子:能強(qiáng)化轉(zhuǎn)錄起始的序列稱為增強(qiáng)子。轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,按照堿基配對(duì)原則合成RNA,即將DNA所含的遺傳信息傳給RNA,形成一條與DNA鏈互補(bǔ)的RNA的過程。RNA的編輯:是某些 RNA,特另1J是mRNA的一種加工方式,它導(dǎo)致了DNA所編碼的遺傳信息的改變。外顯子 (Exon) :真核
12、細(xì)胞基因 DNA 中的編碼序 列,這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA 并進(jìn)而翻譯為蛋白質(zhì)。內(nèi)含子 (Intron) : 真核細(xì)胞基因 DNA 中的間插序列, 這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA, 但隨即被剪除而不翻譯。復(fù)制子: 生物體的復(fù)制單位稱為復(fù)制子( replicon) , 是在同一個(gè)復(fù)制起點(diǎn)控制下的一段DNA序列。轉(zhuǎn)錄單元:是一段啟動(dòng)子開始至終止子結(jié)束的 DNA 序列。轉(zhuǎn)錄起點(diǎn):是與新生 RNA鏈的第一個(gè)核甘酸相對(duì)應(yīng)的DNA鏈上的堿基,通常為一個(gè)喋吟。轉(zhuǎn)錄開始時(shí)模板上的第一個(gè)堿基,在原核中常為A或G,而且位置固定。填空 1 轉(zhuǎn)錄的基本過程包括:模板識(shí)別,轉(zhuǎn)錄起始,轉(zhuǎn)錄的延伸,轉(zhuǎn)錄的終止。2 基因表達(dá)包括:轉(zhuǎn)錄
13、和翻譯兩個(gè)階段。3RNA的編輯方式:堿基突變,尿甘酸的缺失和添加。4 在原核生物中, -35 區(qū)與 -10 區(qū)之間的距離大約是1619bp5 帽子結(jié)構(gòu)的功能: 1在翻譯中起識(shí)別作用2 使 mRNA 免遭核苷酸的破壞6原核生物只有一種 RNA聚合酶而真核生物有三種,每一種都有其特定的功能。聚合酶I合成rRNA,聚合酶H合成 mRNA,聚合酶出合成tRNA和5s rRNA。三種聚合酶都是具有多亞基 的大的蛋白復(fù)合體。7轉(zhuǎn)錄因子通常具有兩個(gè)獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域:一個(gè)結(jié)合 DNA, 一個(gè)激活轉(zhuǎn)錄。8 在真核細(xì)胞mRNA 的修飾中,"帽子 "結(jié)構(gòu)由甲基組成,"尾" 由多聚
14、腺嘌呤組成。9 原核生物的絕大部分起啟動(dòng)子都存在共同的序列, 即位于 -10bp 處的 區(qū)和 -35bp 處的 區(qū),他們都是 RNA聚合酶與啟動(dòng)子結(jié)合的位點(diǎn),能與因子相互識(shí)別而具高度親和性。真核生物中,在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游-25-35bp 處有 區(qū)和位于-70-80bp 處 的區(qū)。選擇題1 8因子的結(jié)合依靠(AA 對(duì)啟動(dòng)子共有序列的長(zhǎng)度和間隔的識(shí)別B 與核心酶的相互作用C 翻譯起始密碼子的距離D 轉(zhuǎn)錄單位的長(zhǎng)度2 下列哪一項(xiàng)是對(duì)三元轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的正確描述(C)AS因子、核心酶和雙鏈 DNA在啟動(dòng)子形成的復(fù)合物B全酶、TFI和解鏈DNA雙鏈形成的復(fù)合物C全酶、模板DNA和新生RNA形成的復(fù)合物D 三
15、個(gè)全酶在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)形成的復(fù)合物3 8因子和DNA之間相互的最佳描述是(C)A游離和與DNA結(jié)合的8因子的數(shù)量是一樣的,而且 8因子合成的越多,轉(zhuǎn)錄起始的機(jī)會(huì) 越大B 8因子通常與 DNA結(jié)合,且沿著 DNA搜尋,直到在啟動(dòng)子碰到核心酶,他與DNA的結(jié)合不需要依靠核心酶C8因子通常與DNA結(jié)合,且沿著 DNA搜尋,直到碰到啟動(dòng)子,再有核心酶存在時(shí)與之結(jié) 合D 8因子加入三元復(fù)合物而啟動(dòng)RNA合成4 8因子專一性表現(xiàn)在(B)AS因子修飾酶催化8因子變構(gòu),使其成為可識(shí)別應(yīng)激啟動(dòng)子的8因子B不同基因編碼識(shí)別不同啟動(dòng)子的8因子C不同細(xì)菌產(chǎn)生可互換的 8因子D8因子參與起始依靠特定的核心酶5 在大腸桿菌
16、的熱激反應(yīng)中,某些蛋白質(zhì)表達(dá)的開啟和關(guān)閉的機(jī)制是(C)A 溫度升高使特定阻抑蛋白失活B 編碼熱敏感蛋白的基因的啟動(dòng)子區(qū)域在較高溫度下發(fā)生變形C在高溫時(shí)合成新的8因子,調(diào)節(jié)熱激基因的表達(dá)D高溫時(shí),已存在的聚合酶8因子與啟動(dòng)子的結(jié)合能力強(qiáng)6 真核生物中 rRNA 包括(D)A 28s,23s,5s rRNA B 23s,16s,5s rRNAC 23s,16s,5.8s rRNA D 28s,23s,5.8s,5s rRNA7 內(nèi)含子的剪切位點(diǎn)具有的特征(A)A 5, -GU, 3 , -AG B 5, -AG, 3 , -GUC 5, -GA, 3, -UG D 5, -UG, 3, -GA8
17、部分原核基因的轉(zhuǎn)錄終止子在終止位點(diǎn)前均有(A)A回文序列 B多聚T序列C TAT峙列 D多聚A序列9 mRNA5,端帽子結(jié)構(gòu)為(C)A pppmG B GpppG C m7GpppG D GpppmG 簡(jiǎn)答題1 增強(qiáng)子的特點(diǎn) 1 有遠(yuǎn)距離效應(yīng)2 無方向性3順勢(shì)調(diào)節(jié)4 無物種和基因的特異性 5具有組織的特異性6有相位性,其作用與DNA 的構(gòu)象有關(guān)7有的增強(qiáng)子可以對(duì)外部信號(hào)產(chǎn)生反應(yīng)。2 比較 DNA 復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)相同點(diǎn):都以 DNA 鏈作為模板,合成方向均為5,端到3,端,聚合反應(yīng)均遵循堿基配對(duì)原則,通過核苷酸之間形成的 3 , , 5, -磷酸二酯鍵使核苷酸鍵延長(zhǎng)。不同點(diǎn):復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩條
18、鏈均被復(fù)制模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄)原料DntpNTP酶DNA 聚合酶RNA聚合酶產(chǎn)物子代雙鏈DNA (半保留復(fù)制)mRNA tRNA rRNA配對(duì)方式A-T G-CA-U A-T G-C引物RNA引物不需要引物DNA 復(fù)制與轉(zhuǎn)錄的異同相同點(diǎn):都需要模板都以三磷酸核甘酸為底物(NTP或dNTP)合成方向都是 5f'3'不同點(diǎn)轉(zhuǎn)錄不需引物;只轉(zhuǎn)錄DNA分子中的一個(gè)片段(稱為轉(zhuǎn)錄單位或操縱子,operon);雙鏈 DNA 中只有一條鏈具有轉(zhuǎn)錄活性(稱為模板鏈) ;哪個(gè)基因被轉(zhuǎn)錄與特定的時(shí)間、空間、生理狀態(tài)有關(guān)。RNA聚合酶無校對(duì)功能。原核生物與真核生物mRNA 的比較( 1 ) 、原
19、核生物mRNA 的半衰期短; 2) 2) 、許多原核生物mRNA 以多順反子形式存在; 3) 、原核生物5'端無帽子結(jié)構(gòu), 3'或只有短的 poly(A) 。(4)、真核生物mRNA5'端有帽子結(jié)構(gòu),(5)、絕大多數(shù)真核生物 mRNA3'具有poly(A)尾巴,是轉(zhuǎn)錄后加上的,是mRNA從核到質(zhì)轉(zhuǎn)移所必需的形式,提高 mRNA 的穩(wěn)定性。大腸桿菌的轉(zhuǎn)錄過程:(1)、識(shí)別階段:RNA聚合酶在亞基的引導(dǎo)下結(jié)合于啟動(dòng)子上;( 2) 、 DNA 雙鏈局部解開;( 3 ) 、起始階段:在模板鏈上通過堿基配對(duì)合成最初 RNA 鏈;( 4 ) 、延伸階段:核心酶向前移動(dòng), R
20、NA 鏈不斷生長(zhǎng);( 5 ) 、終止階段: RNA 聚合酶到達(dá)終止子;( 6)、RNA和RNA聚合酶從DNA上脫落。論述題1 真核生物轉(zhuǎn)錄的前體hnRNA 如何加工為成熟的mRNA?真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)組成:5,端存在帽子結(jié)構(gòu),3,端通常具有poly(A)尾巴,無內(nèi)含子, 部分堿基發(fā)生甲基化。5,端加帽:當(dāng)RNA聚合酶H聚合的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物達(dá)到25堿基長(zhǎng)時(shí),在其5,端加上一個(gè)以5,-3,方向相連的7-甲基鳥昔帽,防止 5,核甘酸外切酶的攻擊,有利于剪接、轉(zhuǎn)運(yùn)和翻譯的進(jìn)行;3 , 端加尾:很多真核生物的 hnRNA 的 3 , 端經(jīng)過剪切后再加上多聚A 殘基即 poly(A)尾巴,這有助于整個(gè)分子的
21、穩(wěn)定;剪接:在真核生物的mRNA加工過程中,內(nèi)含子序列被切除,兩側(cè)的外顯子片段連接。剪接反應(yīng)在核內(nèi)進(jìn)行,需要內(nèi)含子有5, -GU, AU-3,以及一段分支點(diǎn)序列。其過程是:內(nèi)含子先以一個(gè)具尾的環(huán)狀分子或套索狀分子形式被刪除,然后被降解,剪接包括snRNP與保守序列結(jié)合,形成剪接體,在其內(nèi)發(fā)生剪接與連接反應(yīng);編輯;甲基化修飾:當(dāng)序列為 5, -RRACX-3時(shí)會(huì)在第6位N原子位置發(fā)生甲基化。2 概括細(xì)菌細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄過程轉(zhuǎn)錄是通過RNA聚合酶的作用,以一條 DNA鏈為模板產(chǎn)生一條單鏈 RNA過程。步驟如下: 與RNA聚合酶全酶的結(jié)合:一個(gè)RNA聚合酶全酶分子與待轉(zhuǎn)錄的 DNA編碼序列上游的啟 動(dòng)子序
22、列松弛的結(jié)合。起始: RNA 聚合酶往下游移動(dòng)了幾個(gè)核苷酸到達(dá)啟動(dòng)子的另一段短序列 -Pribnow 框, 緊密 地與DNA結(jié)合。DNA上的啟動(dòng)子區(qū)域解鏈, RNA便從Pribnow框下游的幾個(gè)核甘酸處開始 合成,通常是 DNA的反義鏈作為模板,合成幾個(gè)核甘酸后,8因子被釋放并循環(huán)使用,以下步驟不再需要8因子。延伸:RNA聚合酶核心酶沿著 DNA模板移動(dòng),使DNA解鏈,與DNA模板的下一堿基互補(bǔ) 核昔三磷酸聚合到鏈上。RNA聚合酶繼續(xù)在 DNA上移動(dòng),RNA鏈從模板鏈被釋放出來,DNA雙螺旋重新形成。當(dāng)所有編碼序列被轉(zhuǎn)錄后, RNA 聚合酶移動(dòng)一個(gè)終止序列,即終止子。轉(zhuǎn)錄復(fù)合體解體,RNA聚合
23、酶和新形成的 RNA從DNA模板上脫落下來。3、復(fù)雜轉(zhuǎn)錄單位的原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的加工方式有幾種?分別是什么?( 1 )剪、利用多個(gè)5'端轉(zhuǎn)錄起始為點(diǎn)或接位點(diǎn)產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。(2)、利用多個(gè)加poly (A)位點(diǎn)和不同的剪接方式產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。(3)、雖無剪接,但有多個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)或加poly (A)位點(diǎn)的基因。第四章.SD序列:在原核生物 mRNA起始密碼AUG上游,存在49個(gè)富含喋吟堿的一致性序列,如-AGGAGG稱為S-D序列。位于原核生物起始密碼子上游7-12個(gè)核甘酸處的保守區(qū),該序列與16SrRNA3端反向互補(bǔ)。又稱為核蛋白體結(jié)合位點(diǎn)( ribosomal binding si
24、te , RBS) 正轉(zhuǎn)錄調(diào)控:負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控:填空題1 . tRNA的種類有:起始 tRNA和延伸tRNA,同工tRNA,校正tRNA。2 . tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)為三葉草型,三級(jí)結(jié)構(gòu)為倒L型。tRNA結(jié)構(gòu)3 .原核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA 是甲酰甲硫氨酰-tRNA(fMet-tRNA fMet ) ,它攜帶的氨基酸是甲酰甲硫氨酸(fMet ) , 而真核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA 是甲硫氨酰-tRNA(Met-tRNAMet ) ,它攜帶的氨基酸是甲硫氨酸( Met ) 。4 新生肽鏈每增加一個(gè)氨基酸單位都要經(jīng)過AA-tRNA 與核糖體的結(jié)合,肽鍵形成,移位三步反應(yīng)。5 . 核糖體的作用位
25、點(diǎn)有: A 位點(diǎn)、 P 位點(diǎn)、 E 位點(diǎn)。5 在真核生物中蛋白質(zhì)合成起始時(shí)先形成起始因子和起始tRNA 復(fù)合物,再和40S 亞基形成 40S 起始復(fù)合物。6 氨酰tRNA 合成酶既能識(shí)別氨基酸,又能識(shí)別相應(yīng)的tRNA。7 .多肽合成的起始密碼子是AUG,而UAA, UAG, UGA是終止密碼子。8遺傳密碼的特點(diǎn)包括連續(xù)性,簡(jiǎn)并性,擺動(dòng)性,普遍性與特殊性。9 .核酸復(fù)制時(shí),DNA聚合酶沿模板鏈 3'-5'方向移動(dòng);轉(zhuǎn)錄時(shí),RNA聚合酶沿模板鏈 3'-5'方向移動(dòng);翻譯時(shí),核糖體沿模板鏈5'- 3'方向移動(dòng)。10 原核生物蛋白質(zhì)合成形成起始復(fù)合物時(shí),
26、其mRNA 先與核糖體的 30S 亞基結(jié)合,然后再與結(jié)合起始因子和GTP的甲酰甲硫氨酰-tRNA結(jié)合,形成30S起始復(fù)合物,然后再與 50S形成70S起始復(fù)合物。選擇題1 在蛋白質(zhì)合成中催化肽鍵合成的是(D)A.延長(zhǎng)因子 EF-Ts B.延長(zhǎng)因子EF-Tu C.啟動(dòng)因子IF3 D.轉(zhuǎn)肽酶2 翻譯后加工過程的產(chǎn)物是(B)A. 一條多肽鏈B. 一條多肽鏈或一條以上的多肽鏈C.多條多肽鏈D.多肽鏈的降解產(chǎn)物3 .已知某蛋白質(zhì)多肽鏈編碼序列為 GGA,則其mRNA轉(zhuǎn)錄本(A)A.以5'GGA3'為模板,沿轉(zhuǎn)錄本5'-3'方向延長(zhǎng)B.以5GGA3'為模板,沿轉(zhuǎn)錄本
27、3'-5'方向延長(zhǎng)C.以3GGA5'為模板,沿轉(zhuǎn)錄本5'-3'方向延長(zhǎng)D.以3GGA5'為模板,沿轉(zhuǎn)錄本 3'- 5'方向延長(zhǎng)4 .細(xì)菌核糖體RNA 中大亞基由以下物質(zhì)組成(C)A. 5S rRNA , 18S rRNA, 5.8S rRN保口 49 種蛋白質(zhì)B. 5S rRNA , 28S rRNA, 5.8S rRN#口 49 種蛋白質(zhì)C. 5S rRNA , 23S rRN母口 34 種蛋白質(zhì)D. 5S rRNA , 16S rRNAF口 34 種蛋白質(zhì)5 .肽鏈生物合成時(shí)信號(hào)肽序列(B)A.決定糖類殘基的附著點(diǎn)B.將新生肽
28、鏈導(dǎo)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)C控制蛋白質(zhì)分子的最終構(gòu)象D.具有疏水性6 .真核生物的翻譯起始復(fù)合物在何處形成(B)A.起始密碼子AUG處B. 5'端的帽子結(jié)構(gòu)C. TATA!D.CAAT框7 .蛋白質(zhì)生物合成的終止信號(hào)由(D)A. tRNA識(shí)另1JB.EF識(shí)別C.IF (或eIF )識(shí)別D.RF識(shí)另8 .能編碼多肽鏈的最小DNA 單位是( A)A.順反子B.操縱子C啟動(dòng)子 D.復(fù)制子9 .參與原核生物肽鏈延長(zhǎng)的因子是(C)A IF1 B. IF2 C.EF-Tu D.RF110 . 參與真核生物肽鏈延長(zhǎng)的因子是(D)A. eRF B. eIF1 C.EF-Tu D.eEFI”簡(jiǎn)答題:1 簡(jiǎn)述核糖體的結(jié)
29、構(gòu)及功能特點(diǎn):答:核糖體的結(jié)構(gòu):真核生物:由60S大亞基和40S小亞基組成的80S的核糖體;原核生物:由50S大亞基和30S小亞基組成的70S的核糖體功能特點(diǎn):合成蛋白質(zhì) 。在單個(gè)核糖體上,包括至少5 個(gè)功能活性中心,在蛋白質(zhì)合成過程中,各有專一的識(shí)別作用和功能: mRNA 的結(jié)合部位-小亞基,結(jié)合或接受 AA-tRNA的部位-大亞基A位,結(jié)合或接受肽基tRNA部位-大亞基,肽基轉(zhuǎn)移部位-大亞基P位,形成肽鍵部位(轉(zhuǎn)肽酶中心)-大亞基E位。2 .簡(jiǎn)述氨基酸的活化過程答:游離的氨基酸必須經(jīng)過活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化反應(yīng)由氨酰tRNA合成酶催化。活化分兩步:活化:aa + ATP
30、+ E氨基酰-AMP釋放出PPi轉(zhuǎn)移:氨基酰-AMP轉(zhuǎn)移到tRNA并釋放出 AMP。3、論述蛋白質(zhì)的翻譯過程。答:蛋白質(zhì)的翻譯即合成過程可分為四個(gè)階段:氨基酸的活化、肽鏈合成的起始、 延伸和終 止。 氨基酸的活化:游離的氨基酸必須經(jīng)過活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化反應(yīng)由氨酰tRNA合成酶催化,最終氨基酸連接在tRNA的3'端合成氨酰-tRNA。 肽鏈合成的起始: 核蛋白體大小亞基分離, mRNA 在小亞基上定位結(jié)合, 起始氨基酰tRNA與小亞基結(jié)合,核蛋白體大亞基結(jié)合。肽鏈的延伸:肽鏈的延長(zhǎng)是在核蛋白體上連續(xù)性循環(huán)式進(jìn)行,每次循環(huán)增加一個(gè)氨基酸,分為以下三步:(一)進(jìn)位:根
31、據(jù)mRNA下一組遺傳密碼指導(dǎo),使相應(yīng)氨基酰-tRNA進(jìn)入核蛋白體 A 位。 (二)成肽 :肽酰轉(zhuǎn)移酶將相鄰的兩個(gè)氨基酸相連形成肽鍵,該過程不需要能量的輸入;(三)轉(zhuǎn)位:移位酶利用GTP水解釋放的能量使核糖體沿mRNA移動(dòng)一個(gè)密碼子,釋放出空載的tRNA并將新生肽鏈運(yùn)至 P位點(diǎn)。 肽鏈合成的的終止與釋放: 釋放因子識(shí)別并與終止密碼子結(jié)合, 水解 P 位上多肽鏈與tRNA之間的二脂鍵,接著,新生肽鏈和 tRNA 從核糖體上釋放,核糖體大、小亞基解體,蛋白質(zhì)合成結(jié)束。4、原核生物翻譯的起始過程( 1 )核糖體大小亞基分離 2) 30s小亞基通過 SD序列與mRNA模板相結(jié)合(3)在IF-2和GTP的
32、幫助下fMet-tRNAfMet進(jìn)入小亞基的 P位,tRNA的反密碼子與 mRNA 上密碼子配對(duì)。(4)帶有tRNA、mRNA和三個(gè)翻譯起始因子的小亞基起始復(fù)合物與50s的大亞基結(jié)合,GTP水解釋放翻譯起始因子。5、以大腸桿菌為例簡(jiǎn)述蛋白質(zhì)合成的過程從以下四個(gè)方面詳細(xì)論述( 1 )氨基酸的活化:( 2 )肽鏈合成的起始:( 3 )肽鏈的延生:( 4 )肽鏈合成的終止:第六章乳糖操縱子模型內(nèi)容( 1 ) Z、 Y、 A 基因產(chǎn)物由同一條多順反子mRNA 分子所編碼。(2)乳糖操縱子 mRNA分子的啟動(dòng)區(qū)(P)位于阻遏基因(I)與操縱區(qū)(O)之間,不能單 獨(dú)起始半乳糖苷酶和透過酶基因的高效表達(dá)。(
33、3)乳糖操縱子的操縱區(qū)是DNA 上的一小段序列(僅為26bp) ,是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn)。(4)當(dāng)阻遏物與操縱區(qū)相結(jié)合時(shí),lacmRNA 的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。( 5 ) 誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合, 改變其三維構(gòu)象, 使之不能與操縱區(qū)相結(jié)合, 誘發(fā) lac mRNA 的合成。色氨酸操縱子轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控通過核糖體與mRNA 前導(dǎo)序列結(jié)合,對(duì)轉(zhuǎn)錄終止進(jìn)行調(diào)控。Attenuator( 衰減子 ): 是位于轉(zhuǎn)錄單位開始區(qū)的一種內(nèi)部終止子,由核糖體在mRNA 上的位置決定該終止發(fā)夾是否形成。若不形成發(fā)夾, RNA 聚合酶通讀終止子,基因得以表達(dá)。當(dāng)缺乏色氨酸時(shí),核糖體在trp 密碼子上暫停,此密碼子是1 區(qū)的
34、一部分。所以 1 區(qū)被核糖體隔離, 不能與 2 區(qū)堿基配對(duì), 這意味著在 4 區(qū)轉(zhuǎn)錄之前2 區(qū)已和 3 區(qū)配對(duì), 迫使 4 區(qū)保持單鏈形式,不能形成終止子發(fā)夾, RNA 聚合酶穿越衰減子繼續(xù)轉(zhuǎn)錄。核糖體可以合成前導(dǎo)肽,并延伸到 mRNA 上的 UGA 密碼子, UGA 密碼子位于1 區(qū)與 2 區(qū)之間。 當(dāng)核糖體前進(jìn)到此點(diǎn)時(shí), 通過 2 區(qū)并阻止其形成堿基配對(duì), 導(dǎo)致 3 區(qū)與 4 區(qū)配對(duì),產(chǎn)生終止子發(fā)夾。因此,在這種情況下,RNA 聚合酶在衰減子處終止。乳糖操縱子(lac operon) 的結(jié)構(gòu)1 、結(jié)構(gòu)基因(1) lacZ:編碼b 半乳糖甘酶(使乳糖水解)(2) lacY:編碼b 半乳糖昔透
35、過酶(使 b 半乳糖苷透過細(xì)胞壁、質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi))(3) lacA:編碼b 半乳糖昔乙酰轉(zhuǎn)移酶(將乙酰基轉(zhuǎn)移到b 半乳糖背上)2 、調(diào)節(jié)基因( regulatory gene )( 1 )概念: 其產(chǎn)物參與調(diào)控其他結(jié)構(gòu)基因表達(dá)的基因( 2 )特點(diǎn):( 、可在結(jié)構(gòu)基因群附近、也可遠(yuǎn)離結(jié)構(gòu)基因( 、不僅對(duì)同一條DNA鏈上的結(jié)構(gòu)基因起作用,而且能對(duì)不同DNA鏈上的結(jié)構(gòu)基因起作用( 3 )調(diào)控蛋白:類型:a、阻遏蛋白(repressive protein )與操縱元件結(jié)合后能減弱或阻止所調(diào)控基因轉(zhuǎn) 錄的調(diào)控蛋白 b、激活蛋白(activating protein ):與操縱元件結(jié)合后能增強(qiáng)或啟動(dòng)所調(diào)控
36、基 因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白( 、操縱元件(operator )( 1 )與啟動(dòng)子鄰近或與啟動(dòng)子部分序列重疊( 2 )具有回文結(jié)構(gòu),能形成十字形結(jié)構(gòu)。( 3 )與不同構(gòu)像的蛋白質(zhì)結(jié)合,可以分別起阻遏或激活基因表達(dá)的作用4 、啟動(dòng)子(promoter)是指能被RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。( 1 ) -10 序列 - Pribnow 盒: TATAA;T( 2 ) -35bp 序列: TTGACA操縱子至少有一個(gè)啟動(dòng)子,一般在第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因5'上游,控制整個(gè)結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄5、終止子(terminator )是給予 RNA 聚合酶轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)的 DNA 序列(1)不依賴p
37、因子的終止子(2)依賴p因子的終止子在一個(gè)操縱元中至少在結(jié)構(gòu)基因群最后一個(gè)基因的后面有一個(gè)終止子大腸桿菌乳糖操縱子(lactose operon)包括3個(gè)結(jié)構(gòu)基因:Z、丫和A,以及啟動(dòng)子、控 制子和阻遏子等。轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是在啟動(dòng)區(qū)和操縱區(qū)進(jìn)行的。LacI-阻抑蛋白,LacZ-3 -糖昔酶,LacY-透性酶,LacA-轉(zhuǎn)乙酰基酶。三種酶的功能: .3 -半乳糖酶:將乳糖分解成半乳糖和葡萄糖 . 滲透酶:增加糖的滲透,易于攝取乳糖和半乳糖 .轉(zhuǎn)乙酰酶:3 -半乳糖轉(zhuǎn)變成乙酰半乳糖lac 操縱子小結(jié)通常情況(葡萄糖供應(yīng)正常)阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,基因不轉(zhuǎn)錄。細(xì)胞外的乳糖通過透性酶吸收到細(xì)胞內(nèi);細(xì)胞內(nèi)
38、的3 -半乳糖昔酶將乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)楫惾樘恰.惾樘墙Y(jié)合到乳糖阻抑物上使之從操縱序列上脫離,聚合酶迅速開始 lacZYA 基因的轉(zhuǎn)錄。 這就是負(fù)控誘導(dǎo)。然而,還需要細(xì)菌生長(zhǎng)系統(tǒng)中缺少葡萄糖,使cAMP 含量增加,才有足夠量的 cAMP 與CRP結(jié)合形成CRP-cAMP復(fù)合物結(jié)合于Plac上游。使DNA雙螺旋發(fā)生彎曲,轉(zhuǎn)錄才可以有 效地進(jìn)行。組氨酸操縱子:與His降解代謝有關(guān)的兩組酶類被稱為hut酶(histidine utilizing enzyme),控制這些酶合成的操縱子被稱為 hut operon 。由一個(gè)多重調(diào)節(jié)的操縱子控制,有兩個(gè)啟動(dòng)子,兩個(gè)操縱區(qū)及兩個(gè)正調(diào)控蛋白。轉(zhuǎn)錄后調(diào)控1、 翻譯起始的
39、調(diào)控遺傳信息的翻譯起始于mRNA上的核糖體結(jié)合位點(diǎn)(RB9 -起始密子AUG上游的一段非翻譯區(qū)。在 RBS中有SD序列,與核糖體16S rRNA的3'端互補(bǔ)配對(duì),促使核糖體與mRNA相結(jié)合。RBS的結(jié)合強(qiáng)度取決于 SD序列的結(jié)構(gòu)及與 AUG的距離。SD與AUG相距一般以410核 苷酸為佳, 9 核苷酸最佳。2、 mRNA 穩(wěn)定性對(duì)轉(zhuǎn)錄水平的影響所有細(xì)胞都有一系列核酸酶,用來清除無用的 mRNA。一個(gè)典型的mRNA半衰期為2-3min。mRNA 分子被降解的可能性取決于其二級(jí)結(jié)構(gòu)。SD序列的微小變化,往往會(huì)導(dǎo)致表達(dá)效率成百上千倍的差異,這是由于核甘酸的變化改變了形成mRNA 5'
40、端二級(jí)結(jié)構(gòu)的自由能, 影響了 30S亞基與mRNA的結(jié)合,從而造成了蛋白 質(zhì)合成效率上的差異。三、蛋白質(zhì)的調(diào)控作用細(xì)菌中有些mRNA 結(jié)合蛋白可激活靶基因的翻譯。相反, mRNA 特異性抑制蛋白則通過與核糖體競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合mRNA 分子來抑制翻譯的起始。大腸桿菌中的核糖體蛋白就存在翻譯抑制現(xiàn)象。四、反義RNA 的調(diào)節(jié)作用RNA 調(diào)節(jié)是原核基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的另一種重要機(jī)制。細(xì)菌相應(yīng)環(huán)境壓力的改變,會(huì)產(chǎn)生一些非編碼小RNA分子,能與 mRNA中的特定序列配對(duì)并改變其構(gòu)象,導(dǎo)致翻譯過程的開啟或關(guān)閉等作用。第七八章操縱子(operon) :是指數(shù)個(gè)功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,構(gòu)成信息區(qū),連同其上游的
41、調(diào)控區(qū)(包括啟動(dòng)子和操縱基因)以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)所構(gòu)成的基因表達(dá)單位, 所轉(zhuǎn)錄的 RNA 為多順反子。在原核生物中,若干結(jié)構(gòu)基因可串聯(lián)在一起,其表達(dá)受到同一調(diào)控系統(tǒng)的調(diào)控,這種基因的組織形式稱為操縱子。反式作用因子( trans-acting factor) :能直接或間接地識(shí)別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。弱化子:在trp mRNA 5'端有一個(gè)長(zhǎng)162bp的mRNA片段被稱為前導(dǎo)區(qū),其中123150位堿基序列如果缺失, trp 基因表達(dá)可提高6-10 倍。 mRNA 合成起始以后,除非培養(yǎng)基中完全沒有色氨酸,轉(zhuǎn)錄總是在這個(gè)區(qū)域終止,產(chǎn)生一個(gè)
42、僅有140 個(gè)核苷酸的 RNA 分子,終止trp基因轉(zhuǎn)錄。這個(gè)區(qū)域被稱為弱化子,該區(qū) mRNA 可通過自我配對(duì)形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu)。順式作用元件(cis-acting element) 影響自身基因表達(dá)活性的非編碼DNA 序列。斷裂基因 ( splite gene ) : 真核生物結(jié)構(gòu)基因, 由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成, 去除非編碼區(qū)再連接后, 可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì), 這些基因稱為斷裂基因。基因的分子生物學(xué)定義:產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA 所必需的全部核苷酸序列。基因表達(dá)的時(shí)間特異性:基因表達(dá)的空間特異性: 填空題1 、真核生物中反式作用因子的 DNA 結(jié)合結(jié)
43、構(gòu)域有:螺旋轉(zhuǎn)角螺旋,堿性螺旋-環(huán)-螺旋,鋅指,堿性亮氨酸拉鏈,同源域蛋白。2、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子按功能可以分為:基本轉(zhuǎn)錄因子和特異轉(zhuǎn)錄因子。3、真核生物有3類RNA聚合酶,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄rRNA基因的RNA聚合酶是:RNA聚合酶I4、典型的原核啟動(dòng)子的四個(gè)特征是:轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),原核基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)通常是嘌呤,-10 區(qū), -35 區(qū)。5 、乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)基因有: lacZ, lacY, lacA。選擇題1 、在什么情況下,乳糖操縱子的轉(zhuǎn)錄活性最高(A)A 高乳糖,低葡萄糖B高乳糖,高葡萄糖C 低乳糖,低葡萄糖D低乳糖,高葡萄糖2 、在真核基因表達(dá)調(diào)控中, ( B )調(diào)控元件能促進(jìn)轉(zhuǎn)錄的速率。A 弱
44、化子B 增強(qiáng)子C repressorD TATA Box3 、外顯子是( D )B DNA 被水解斷裂開的片段D 真核生物基因的編碼序列C )B hnRNA 上只有外顯子而無內(nèi)含子序列D 除去外顯子的過程稱為剪接A 基因突變的表現(xiàn)C 不轉(zhuǎn)錄的 DNA4、關(guān)于外顯子和內(nèi)含子的敘述,正確的是(A 僅外顯子在DNA 模板上有相應(yīng)的互補(bǔ)序列C 除去內(nèi)含子及連接外顯子的過程稱為剪接5 、不屬于轉(zhuǎn)錄后修飾的是(C )B 5'端加帽子結(jié)構(gòu)D 內(nèi)含子切除B 真核生物的轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)D 真核生物轉(zhuǎn)錄終止修飾點(diǎn)D )B mRNA 選擇性剪接D 外顯子切除A 腺苷酸聚合C 外顯子切除6 、 AAUAAA 序列是( D )A 啟動(dòng)子的辨認(rèn)序列C 真核生物的反式作用因子7、下列哪項(xiàng)不是真核生物轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控機(jī)制(A 5'端加帽和3'端多聚腺甘酸化C mRNA運(yùn)輸?shù)目刂茊柎痤}1 、乳糖操縱子的作用機(jī)制。答: ( 1 )乳糖操縱子的組成:大腸桿菌乳糖操縱子含Z, Y, A 三個(gè)結(jié)構(gòu)基因 ,分別編碼半乳糖苷酶, 透酶和半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶, 此外還有一個(gè)操縱序列 O, 一個(gè)啟動(dòng)子P 和一個(gè)調(diào)節(jié)基因 I。( 2 ) 阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié): 沒有乳糖存在時(shí),
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