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文檔簡介
1、第九章第九章微生物的分類微生物的分類v分類目的:分類目的:v建立各種生物的信息存取系統,以便建立各種生物的信息存取系統,以便人們查考、認識和利用各種生物。人們查考、認識和利用各種生物。v討論生物的系統發育,建立反映生物討論生物的系統發育,建立反映生物進化關系的自然分類系統,以提示生物進化關系的自然分類系統,以提示生物的本質特征及它們的內在聯絡和區別。的本質特征及它們的內在聯絡和區別。第一節第一節 微生物的分類單位與命名微生物的分類單位與命名v一、分類單位一、分類單位v1、正式的分類等級:主要的、次級、正式的分類等級:主要的、次級v界界 Kingdomv門門 Phylum或或Division亞門
2、亞門v綱綱 Class 亞綱亞綱v超目超目v目目 Order 亞目亞目v 科科 Family 亞科亞科v 族族v 亞族亞族v 屬屬 Genus Genus v 種種 Species2、非正式的分類等級:變種、型、菌株、非正式的分類等級:變種、型、菌株、型、群型、群v種:指一群在形狀和生理方面非常類似或差別微小的個體。v變種根本特征與典型菌株根本相符,而個別較次要的特征不相符合但又穩定的變異株。v亞種種的進一步細分單元,實驗室獲得的穩定變異株。是變種的同義詞。v型亞種以下的細分,當同種或同一亞種內不同菌株之間的性狀差別缺乏以區分為新的亞種時可以分為不同的型。v菌株或品系同種不同來源的純培育。v群
3、將兩種微生物和介于它們之間的種類統稱為“群。介于兩種微生物之間的種類,其特征彼此不易嚴厲區分,如大腸桿菌和產氣腸桿菌。二、微生物的學名二、微生物的學名v命名原那么:命名原那么:v 學名學名=屬名屬名+種名種名+初次定名人初次定名人+現名定現名定名人名人+定名年份定名年份v 學名學名=屬名屬名+種名種名+Subsp.或或var.)+亞種亞種或變種名或變種名v規定與常識:規定與常識:v屬名首字母大寫,種名全小寫;屬名首字母大寫,種名全小寫;v屬名、種名、亞種名用斜體字,其他用正體屬名、種名、亞種名用斜體字,其他用正體字且可省略。字且可省略。命名舉例命名舉例vBacillus subtilis 枯草
4、芽孢桿菌枯草芽孢桿菌vBacillus thuriuggiensys 蘇云金芽孢桿菌蘇云金芽孢桿菌vStaphylococcus aureus 金黃色葡萄球菌金黃色葡萄球菌第二節第二節 微生物的分類方法微生物的分類方法v一、傳統分類法一、傳統分類法v 1、形狀特征、形狀特征v 個體形狀特征個體形狀特征v 群體形狀特征:群體形狀特征: 固體培育基上;固體培育基上;v 液體培育基中液體培育基中v 2、生理生化特征v 營養類型;v 利用營養物質的才干:能否利用,利用才干大小,通常檢測微生物對碳源和氮源的利用才干;v 代謝產物: 如糖發酵 產酸產氣情況;產氨實驗 檢測NH3產生情況;硝酸鹽復原實驗 檢
5、測亞硝酸的存在;吲哚實驗 檢測吲哚的存在以判別色氨酸酶的存在;硫化氫實驗 檢測H2S的產生情況;明膠液化 測蛋白酶的產生v 某些生長條件:生長溫度范圍 最低、適、高,嗜冷、熱、溫;需氧情況 好氧 厭氧 兼性;生長酸堿度范圍v 3、生態學特征v 主要利用微生物在自然界中的分布情況,與其它生物之間的相互關系共生、寄生,它的致病性,它的對噬菌體的敏感性。v 4、血清學反響v 常采用免疫血清含Ab與抗原在體外進展可見反響而進展鑒別,特異性高,靈敏度高,微生物間的細小差別均能區別,用于在形狀和生理特征上難以區別的微生物。二、數值分類法二、數值分類法v 定義:用數值的方法來評價有機體分類單元之間的類似性,
6、并根據類似性的數值將分類單位歸為更高等級的分類單元的一種分類方法。v方法:選擇盡能夠多的分方法:選擇盡能夠多的分類特征并進展特征的測定類特征并進展特征的測定和搜集,將各項特征輸入和搜集,將各項特征輸入計算機,即根據程序計算計算機,即根據程序計算出類似性,根據類似性的出類似性,根據類似性的百分數分群歸類。百分數分群歸類。v對分類特征的處置遵照對分類特征的處置遵照“等重要原那么。等重要原那么。v三、化學分類法三、化學分類法v 主要是經過分析細胞的化學組成,所含的類主要是經過分析細胞的化學組成,所含的類脂、蛋白質、糖及代謝產物等判別細胞間的親脂、蛋白質、糖及代謝產物等判別細胞間的親緣關系。緣關系。v
7、四、遺傳分類法四、遺傳分類法v1、NDA堿基堿基 G+C含量分析含量分析v 同種微生物同種微生物DNA組成穩定,親緣關系越近,組成穩定,親緣關系越近,堿基的組成越近。堿基的組成越近。v2、核酸雜交、核酸雜交v DNADNA雜交,雜交,DNARNA雜交,親緣雜交,親緣關系相近的微生物,其核酸的堿基組成,陳列順關系相近的微生物,其核酸的堿基組成,陳列順序越相近,雜交率越高。序越相近,雜交率越高。第三節第三節 微生物分類系統微生物分類系統v一、生物分類系統一、生物分類系統v定義:指按親緣關系分群歸類編排成的系統定義:指按親緣關系分群歸類編排成的系統v 生物界中的分類系統,因不同的人采用的生物界中的分
8、類系統,因不同的人采用的分類方法、分類根據不同,因此構成的生物分類方法、分類根據不同,因此構成的生物分類系統不同,有將生物界分成:分類系統不同,有將生物界分成:v 二界:植物界、動物界二界:植物界、動物界v 三界:植物界、動物界、原生生物界三界:植物界、動物界、原生生物界v 四界、五界、六界的。四界、五界、六界的。v 六界系統是我國學者提出的:病毒界、原六界系統是我國學者提出的:病毒界、原核生物界、真核原生生物界、真菌界、植物核生物界、真核原生生物界、真菌界、植物界、動物界。界、動物界。v 在這六界系統中,微生物屬于病毒界、原在這六界系統中,微生物屬于病毒界、原核生物界、真核原生生物界和真菌界
9、。核生物界、真核原生生物界和真菌界。 二、微生物分類系統二、微生物分類系統v二細菌分類系統二細菌分類系統v1、“伯杰氏細菌鑒定手冊伯杰氏細菌鑒定手冊v第八版開場放棄了從界第八版開場放棄了從界種的完好的分類體系,將種的完好的分類體系,將細菌歸屬于原核生物界,下分藍細菌和細菌。將細細菌歸屬于原核生物界,下分藍細菌和細菌。將細菌進一步分成菌進一步分成19部分,對藍細菌未作進一步分類。部分,對藍細菌未作進一步分類。v 第九版新版內容有較大變動,全書共分四卷,第九版新版內容有較大變動,全書共分四卷,細菌歸屬于原核生物界的四個門中:薄壁、厚壁、細菌歸屬于原核生物界的四個門中:薄壁、厚壁、柔膜、疵壁菌門。柔
10、膜、疵壁菌門。v2、“細菌和放線菌的鑒定前蘇聯克拉西里尼科夫細菌和放線菌的鑒定前蘇聯克拉西里尼科夫v3、“細菌分類學法國普雷沃細菌分類學法國普雷沃v二放線菌分類系統二放線菌分類系統v1、美國瓦克斯曼分類系統、美國瓦克斯曼分類系統v2、蘇聯克拉西里尼科夫、蘇聯克拉西里尼科夫v三酵母菌分類系統三酵母菌分類系統v 荷蘭荷蘭 羅德羅德Lodder分類系統分類系統v四霉菌分類系統四霉菌分類系統v 尚未構成較好的分類系統尚未構成較好的分類系統v 對于真菌分類,目前有對于真菌分類,目前有Ainsworth Alexopoulos Smith等分類系統,把酵母、霉菌歸等分類系統,把酵母、霉菌歸屬于真菌門下,分
11、五個亞門,酵母、霉菌分屬于各屬于真菌門下,分五個亞門,酵母、霉菌分屬于各個亞門中:鞭毛菌亞門,接合菌亞門,子囊菌亞門,個亞門中:鞭毛菌亞門,接合菌亞門,子囊菌亞門,擔子菌亞門,半知菌亞門。擔子菌亞門,半知菌亞門。第四節第四節 微生物的鑒定微生物的鑒定v主要步驟:純化、測定一系列必要的目的、查找權威性鑒定主要步驟:純化、測定一系列必要的目的、查找權威性鑒定手冊手冊v鑒定技術的不同程度:鑒定技術的不同程度:v細胞的形狀和習性:形狀特征、運動、酶反響、營養要求及細胞的形狀和習性:形狀特征、運動、酶反響、營養要求及生長條件等生長條件等v細胞組分程度:細胞壁成分、氨基酸庫、脂類、醌類、光合細胞組分程度:細胞壁成分、氨基酸庫、脂類、醌類、光合色素等的分析色素等的分析v蛋白質程度:氨基酸序列分析、凝膠電泳和血清學反響等蛋白質程度:氨基酸序列分析、凝膠電泳和血清學反響等v基因或基因或DNA程度:核酸分子雜交、程度:核酸分子雜交、G+
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