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1、重組的DM分子是在DM連接酶的作用下,有Mg2、ATP存在的連接緩沖系統(tǒng) 中,將分別經(jīng)酶切的載體分子與外源DNA分子進(jìn)行連接。DNA連接酶有兩種:T4噬菌體DNA連接酶和大腸桿菌DNA連接酶。兩種DNA連接 酶都有將兩個(gè)帶有相同粘性末端的DNA分子連在一起的功能,而且T4噬菌體DM連 接酶還有一種大腸桿菌DNA連接酶沒(méi)有的特性,即能使兩個(gè)平末端的雙鏈DNA分子連 接起來(lái)。但這種連接的效率比粘性末端的連接率低,一般可通過(guò)提高T4噬菌體D7A 連接酶濃度或増加DNA濃度來(lái)提高平末端的連接效率。T4噬菌體DNA連接酶催化 DNA連接反應(yīng)分為3步:首先,T4 DNA連接酶與輔因子ATP形成W-ATP復(fù)

2、合物;然 后,酶-ATP復(fù)合物再結(jié)合到具有5'磷酸基和3'軽基切口的D對(duì)上,使DNA腺昔化; 最后產(chǎn)生一個(gè)新的磷酸二酯鍵,把切口封起來(lái)。連接反應(yīng)通常將兩個(gè)不同大小的片斷 相連。很多DNA聚合酶在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí)會(huì)在PCR產(chǎn)物雙鏈DNA每條鏈的3'端加上一 個(gè)突出的堿基A。pUCm-T載體是一種已經(jīng)線性化的載依,載體每條鏈的3'端帶有一 個(gè)突出的T。這樣,pUCm-T載體的兩端就可以和PCR產(chǎn)物的兩端進(jìn)行正確的AT配對(duì), 在連接酶的催化下,就可以把PCR產(chǎn)物連接到pUCm-T載體中,形成含有目的片斷的 重組載體。連接反應(yīng)的溫度在37T時(shí)有利于連接酶的活性。但是在這

3、個(gè)溫度下粘末端的氫鍵 結(jié)合是不穩(wěn)定的。因此采取折中的溫度,即12-16£,連接12-16h (過(guò)夜),這樣既 可最大限度地發(fā)揮連接酶的活性,又兼顧到短暫配對(duì)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。二.感受態(tài)制備原理細(xì)菌在0 ° C CaC4低滲溶液中脹成球形,丟失部分膜蛋白,成為容易 吸收外源DNA的感受態(tài)。三.B-半乳糖甘酶顯色反應(yīng)選擇法LacZ基因是大腸桿菌乳糖操縱子中的一個(gè)基因,可以編碼B半乳糖核昔酶。半乳糖核昔酶是由4個(gè)亞基組成的四聚體,可催化乳糖的水解.用X-Gal為底物 進(jìn)行染色時(shí),呈藍(lán)色。現(xiàn)在一些待定的質(zhì)粒(比如pUC/PBS等),常帶有B-半乳糖核昔酶的調(diào)控序列 和B半乳糖核昔酶N端1

4、46個(gè)氨基酸(a肽段)的編碼序列,在這個(gè)編碼序列里還 插入一個(gè)多克隆位點(diǎn)(HCS),它并不影響lacZ的表達(dá)。另外,常用的大腸桿菌帶有 B半乳糖核昔酹C端部分序列(0肽段),的編碼序列。在各自獨(dú)立的情況下,這 些質(zhì)粒與大腸桿菌各自編碼的卩一半乳糖核昔酶片段都沒(méi)有酶的活性。只有當(dāng)攜帶a 肽編碼信息的克隆載體成功進(jìn)入宿主細(xì)胞,在培養(yǎng)基誘導(dǎo)物IPTG的誘導(dǎo)下,載體質(zhì) 粒能夠合成B半乳糖核昔酶N端(a肽段),這樣就與宿主細(xì)胞合成的半乳糖 核昔酶C端部分序列(B肽段)互補(bǔ),形成完整的B半乳糖核昔酶活性蛋白。而當(dāng)外源基因插入到此種載體質(zhì)粒lacZ的多克隆位點(diǎn)后,會(huì)造成lacZ基因不能 表達(dá),從而不能合成B

5、半乳糖核昔酶;而對(duì)于空載體,lacZ基因正常表達(dá),通過(guò)a 互補(bǔ)合成B半乳糖核昔酶,分解培養(yǎng)基里的色素底物X-gal,最終形成藍(lán)色的化合 物,出現(xiàn)藍(lán)色菌斑。實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備:清洗,5個(gè)100ml錐形瓶(外加1個(gè)小的),6副培養(yǎng)皿,3個(gè)小試劑瓶, 接種環(huán),涂布棒。準(zhǔn)備100ml超純水。溶液:LB300ml(液體50ml+50ml,固體100ml),0. lmol/L CaC12 10ml, lOOmg/mlAmp 1 ml, 20mg/mlX-gal 1 ml, 200mg/ml IPTG 1 ml o大腸桿菌菌液lml。感受態(tài)細(xì)胞連接產(chǎn)物4管4x5= 20ul 做 4 份目的基因T載體T4連接酶10x沖

6、液4 x 4uL4xluL4x0. 5uL4xluL滅菌:5個(gè)lOOnd錐形瓶(外加1個(gè)小的),6副培養(yǎng)皿,3個(gè)小試劑瓶,接種 環(huán),涂布棒,10ml超純水,LB培養(yǎng)基 1.5mlEP管,大小槍頭,過(guò)濾用具2副0. lmol/L CaC12實(shí)際配置20mg/ml X-gal X-gal為5-漠-4-氯-3引喙-B-D半乳糖昔。用二基甲醜 胺(DMF)溶解X-gal配制成的20mg/ml (取0. 02gX-gal,用DMF定容為lml)的貯存 液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中,裝有X-gal溶液的試管須用鋁箔封裹以防因受光 照而被破壞,并應(yīng)貯存于-20X:o X-gal溶液無(wú)須過(guò)濾除菌。(DMF二

7、甲基甲酰胺; Dimethylfo r mam ide; NtNDi methyl formamide; DMF; CAS: 68-12-2 理化性質(zhì):無(wú)色、 淡的胺味的液體。分子式C3-H7-N-0o分子量73. 10。相對(duì)密度0.9445(25°C)。熔點(diǎn) -61°Co沸點(diǎn)152. 8°Co ) 溶于DMSO,溶解度可達(dá)20mg/mlo也溶于DMF溶于DMSO, 溶解度可達(dá)20mg/mlo也溶于DMF200mg/ml IPTG在0. 8ml蒸榴水中溶解0. 2g IPTG后,用蒸館水定容至lml,用 0. 22u m濾器過(guò)濾除菌,貯存于-20。(2。LB培養(yǎng)基

8、:配制每升培養(yǎng)基,應(yīng)該在950 ml去離子水中加入:腹化蛋白腺10g酵母提取物 5g NaCl 10R揺動(dòng)容器直至溶質(zhì)溶解用5mol/LNa0H調(diào)pH至7. 3用去離子水定容至 1L在15psi高壓下蒸汽滅菌20min. ( 100mlLB培養(yǎng)基加入15g瓊脂粉為固體培養(yǎng) 基)0. lmol/LCaC12:取0. 11098g氯化鈣固體定容至10mlAmp (lOOmg/ml):溶解0. lg氨節(jié)青霉素鈉鹽于足量的水中,最后定 容至lml,用0.22 m m濾膜過(guò)濾除菌.實(shí)驗(yàn)過(guò)程(一).目的基因片段與載體連接器材旋渦混合器,微量移液取樣器,移液器吸頭,1.5ml微量離心管,雙 面離心管架,臺(tái)式

9、離心機(jī),干式恒溫氣浴。試劑T載體,T4 DNA連接酶,連接酶緩沖液,無(wú)菌dd Water。操作步驟PCR產(chǎn)物與T載體直接連接:(1)事先將干式恒溫儀(或冰盒里的水)溫度設(shè)定在1416。C。(2)取4個(gè)滅菌的200ul M量離心管,加入:(需要調(diào)整)4ml目的基因; lml T 載體;0.5ml T4 DNA 連接酶(TAKARA, 350U/ul) ; lml 連接酶緩沖液 10 x buffer ; 3. 5 ml dd Water 總量 10ml 體系。(3)述混合液輕輕震蕩后再短暫離心,然后置于14° C干式恒溫儀(或14° C 水中)中保溫過(guò)夜(12-16h) &l

10、t;>(4)連接后的產(chǎn)物可以立即用來(lái)轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞或置4° C冰箱備用。(二)大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的制備細(xì)菌轉(zhuǎn)化儀器:旋渦混合器,微量移液取樣器,移液器吸頭,50ml微量離心管, 1.5ml微量離心管,臺(tái)式冷凍離心機(jī),制冰機(jī),恒溫?fù)u床,分光光度計(jì), 超凈工作臺(tái),恒溫培養(yǎng)箱,搖菌試管,三角燒瓶,接種環(huán),恒溫?fù)u床,培 養(yǎng)皿(已鋪好固體LB-Amp),酒精燈,玻璃涂棒,恒溫培養(yǎng)箱,濾膜和過(guò) 濾器試劑:E. coli 粛護(hù),LB 培養(yǎng)基,0. 1 mol/L CaC12 溶液,無(wú)菌 dd Water , LB培養(yǎng)基(不加抗菌素),LB培養(yǎng)基(加抗菌素),無(wú)菌dd water, IPTG,

11、 X-galo步驟(1)在超凈工作臺(tái)中,將lml大腸桿菌菌液加入100ml LB液態(tài)培養(yǎng)基(不含 抗菌素),37X2搖床培養(yǎng)過(guò)夜。(2)取0.5ml上述菌液轉(zhuǎn)接到含有50mL LB培養(yǎng)基的三角燒瓶中,37°C下 250r/min 搖床培養(yǎng) 2'3h,測(cè)定 0D590 為 0. 35、0. 4 左右(<0.40.6,細(xì)胞數(shù)<108/mL, 此為關(guān)鍵參數(shù)!)。(注意:此步搖菌的時(shí)候,要有一管不加菌的LB培養(yǎng)液同時(shí)搖 菌)(3)將lml菌液加入到4支1.5mL預(yù)冷無(wú)菌的聚丙烯離心管中,于冰上放置 10min,然后于 4°C, 5000rpm 離心 5min。(

12、4)將離心管倒置以倒盡上清液,加入lml冰冷的0. 1 mol/L CaC12溶液, 立即在渦旋混合器上混勻,插入冰中放置30min。(5)4乜,5000rpm離心5min,棄上清液后,用100 u L冰冷的0. 1 mol/L CaC12 溶液垂懸,插入冰中放置2h,可以直接用作轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),或立即放入-4攝氏度冰柜中 保藏。(6)事先將恒溫水浴的溫度調(diào)到42弋。(7)從-70£超低溫冰柜中取出一管(100 PL)感受態(tài)菌,立即用手指加溫融 化后插入冰上,冰浴5、10min。(8)加入5uL連接好的質(zhì)粒混合液(DNA含量不超過(guò)100ng),輕輕宸蕩后敖 置冰上20min。(9)輕輕搖勻

13、后插入42乜水浴中90s進(jìn)行熱休克,然后迅速放回冰中,靜置 3min。(10)在超凈工作臺(tái)中向上述各管中分別加入300 p L LB培養(yǎng)基(不含抗菌素) 輕輕混勻,然后固定到揺床的彈簧架上37乜宸蕩lh。(11)在超凈工作臺(tái)中取上述轉(zhuǎn)化混合液200 uL,分別滴到含合適抗菌素(Amp 100ug/L)的固體LB平板培養(yǎng)皿中,再在平板上滴加40 pL 20mg/ml X-gal, 7 u L 200mg/nil IPTG,用酒精燈燒過(guò)的玻璃涂布棒涂布均勻(注意:一個(gè)不含抗生素作為 對(duì)照組,玻璃涂布棒上的酒精熄滅后稍等片刻,待其冷卻后再涂,菌液涂皿操作時(shí), 應(yīng)避免反復(fù)來(lái)回涂布,因?yàn)楦惺軕B(tài)細(xì)菌的細(xì)胞

14、壁有了變化,過(guò)多的機(jī)械擠壓涂布會(huì)使 細(xì)胞破裂,影響轉(zhuǎn)化率。)。(12)在涂好的培養(yǎng)皿上做上標(biāo)記,先放置在37X:恒溫培養(yǎng)箱中30min直到表 面的液體都滲透到培養(yǎng)基里后,再倒置過(guò)來(lái)敖入37乜恒溫培養(yǎng)箱過(guò)夜。(13)在被細(xì)菌污染的桌面上噴灑70%乙醇,擦干桌面。(14)觀察平板上長(zhǎng)出的菌落克隆,以菌落之間能互相分開(kāi)為好。注意白色菌 斑O(三)轉(zhuǎn)化克隆的篩選和鑒定器材旋渦混合器,小鑲子,微量移液取樣器,移液器吸頭,1.5ml微量離心管, 雙面離心管架,干式恒溫氣浴(或恒溫水浴鍋),制冰機(jī),恒溫?fù)u床,超凈工作臺(tái), 酒精燈,無(wú)菌牙簽,搖菌管。試劑LB培養(yǎng)基(加抗菌素),PCR用試劑,引物,質(zhì)粒提取用試

15、劑,酶切需要 的限制性且酶及其緩沖液,65%甘油(65%甘油,0. lmol/LMgS04, 0. 025mol/L Tris Cl pH8. 0) o操作步驟 方法一:快速PCR篩選法(1)在轉(zhuǎn)化的平板培養(yǎng)基上隨機(jī)選取4個(gè)邊緣清晰的白色菌落,并用記號(hào)筆 在其所在的培養(yǎng)皿底部玻璃背面畫(huà)圈做標(biāo)記編號(hào)。(2)在0. 2ml PCR微量離心管中配制25u 1反應(yīng)體系。dd water 16 u 110XPCR buffer (不含 MgC12) 2. 5 p 125mM MgC12 1. 5 U12. 5mmol/L dNTP 2 u 1 (每種 dNTP 終濃度 0加M)10 u mol/L Pr

16、imer 1 1 u 1 (12.525pmoles )10umol/L primer2 1 u 1 (12.525pmoles)模板質(zhì)粒 用小tip頭輕輕粘一下選中的白色菌落,再伸入PCR混合液中洗一洗Taq 酶 0.5U1 ( 1. 5u)總體積25 y 1(2)根據(jù)廠商的操作手冊(cè)設(shè)置PCR儀的循環(huán)程序(本實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)設(shè)置為WZ): 94°C5min 94°Clmin 60°Clmin 72°C IminSOsgoto29 times 72°C10min(2)PCR結(jié)束后,取10u 1產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳(與原始插入片斷同時(shí)比 對(duì))。觀察膠上是否有預(yù)計(jì)的主要產(chǎn)物帶。(3)按照編號(hào)找到培養(yǎng)皿中的原菌斑。根據(jù)需要進(jìn)行放大培養(yǎng)提取其質(zhì)粒(4)提取到的質(zhì)粒與原先的空載體(或已知分子量的質(zhì)粒)再對(duì)比電泳,以進(jìn) 步確認(rèn)。方法二:提質(zhì)粒再PCR或酶切鑒定(1)在超凈工作臺(tái)中取3支無(wú)菌揺菌管,各加入3mL LB (含50mg/mL氨節(jié)青寄 素),用記號(hào)筆寫(xiě)好編號(hào)。(2)在超凈工作臺(tái)中將70%乙醇浸泡的小躡子頭用酒精燈烤過(guò),鍍?nèi)∫恢o(wú)菌牙 簽。用牙簽的尖部接觸轉(zhuǎn)化的平板培養(yǎng)基上的一個(gè)白色菌落,然后將牙簽放入盛有 3mLLB

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