1、認識認識PubMed 讓它融入您的科研讓它融入您的科研學科館員：周成效學科館員：周成效認識PubMed讓它融入您的科研主要內容主要內容一、 認識認識PubMed二、 PubMed 檢索入門檢索入門三、PubMed高級檢索高級檢索四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索五、PubMed其他功能其他功能六、PubMed個性化服務個性化服務認識PubMed讓它融入您的科研Web of Science您的選擇？您的選擇？Google ScholarPubMedScopusScirus一、認識一、認識PubMed認識PubMed讓它融入您的科研

2、/guide/一、認識一、認識PubMedPubMed與與NCBI數據庫的關系圖數據庫的關系圖一、認識一、認識PubMed認識PubMed讓它融入您的科研認識PubMed讓它融入您的科研標引質量高標引質量高更新速度快更新速度快信息量大信息量大使用方便使用方便選擇選擇PubMedPubMed的的n n個理由個理由一、認識一、認識PubMed認識PubMed讓它融入您的科研PubMedABDCMedlineOldMedlineInProcessCitationsRecordsuppliedbypublisher一、認識一、認識PubMed認識PubMed讓它融入您的科研OLDMEDLINE:收錄了

3、收錄了1950195019651965年間的美國醫學索引（年間的美國醫學索引（IMIM）中的題中的題錄。錄。In Process Citations :是臨時性的數據庫，收錄準備進行標引的題錄和是臨時性的數據庫，收錄準備進行標引的題錄和文摘信息，每天都在接受新的數據，進行文獻的標引和加工，每周把文摘信息，每天都在接受新的數據，進行文獻的標引和加工，每周把加工好的數據加入到加工好的數據加入到MedlineMedline中，同時從中，同時從In Process CitationsIn Process Citations庫中庫中刪除。刪除。In Process CitationsIn Process

4、 Citations中的記錄標有中的記錄標有 PubMed - in processPubMed - in process的標記。的標記。Record supplied by publisher：出版商將期刊文獻信息電子版提供給出版商將期刊文獻信息電子版提供給PubMedPubMed后，每條記錄都標有后，每條記錄都標有 PubMed-as supplied by publisherPubMed-as supplied by publisher的標的標記，這些記錄每天都在不停地向記，這些記錄每天都在不停地向In Process CitationsIn Process Citations庫中傳送，

5、加庫中傳送，加入到入到In Process CitationsIn Process Citations后，原有的標記將改為后，原有的標記將改為 PubMed- in PubMed- in processprocess的標記。的標記。Medline：是美國國立醫學圖書館（是美國國立醫學圖書館（U.S.National Library of U.S.National Library of MedicineMedicine）最重要的書目文摘數據庫，內容涉及醫學、護理學、牙科最重要的書目文摘數據庫，內容涉及醫學、護理學、牙科學、獸醫學、衛生保健和基礎醫學。收錄了全世界學、獸醫學、衛生保健和基礎醫學。收

6、錄了全世界7070多個國家和地區多個國家和地區的的50005000余種生物醫學期刊，書目文摘條目余種生物醫學期刊，書目文摘條目15001500萬余條，時間起自萬余條，時間起自19661966年。標有年。標有 PubMed - indexed for MEDLINEPubMed - indexed for MEDLINE的標記的標記一、認識一、認識PubMed認識PubMed讓它融入您的科研/pubmed/檢索提問區檢索提問區文獻匹配文獻匹配臨床咨詢臨床咨詢特定主題咨詢特定主題咨詢期刊檢索期刊檢索主題檢索主題檢索高級檢索高級檢索一、認識一、認識

7、PubMed認識PubMed讓它融入您的科研2.1 單著者檢索單著者檢索2.1.1鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母全寫或縮寫鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母全寫或縮寫 如如: Alving c Fauci as koltilil s Geneau Wong julia s Ryan, james2.1.2 利用高級檢索中的利用高級檢索中的“Author”檢索檢索,選下拉選項定位選下拉選項定位二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研2.3.1直接輸入您所要檢索的關鍵詞或主題詞直接輸入您所要檢索的關鍵詞或主題詞,英文單詞英文單詞或短語（大寫或小寫均可）或短語（大寫或小寫均可

8、）,詞匯自動轉換功能進行檢索，詞匯自動轉換功能進行檢索，并將檢索結果直接顯示在主頁下方。并將檢索結果直接顯示在主頁下方。 如: sleep walking cause2.2 著者與主題聯合檢索著者與主題聯合檢索2.2.1 直接輸入作者姓名與主題詞直接輸入作者姓名與主題詞, , 不用不用AND 如如: : dodick dw migraine2.3 單主題檢索單主題檢索二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研2.4 期刊檢索期刊檢索2.4.1 輸入期刊名輸入期刊名，ISSN，Medline jounal title abbreviation如如: molecular

9、biology of the cell cellta 1087-0156 2.4.2 用用single citation matcher中的期刊名稱檢索中的期刊名稱檢索2.4.3 用用journal database檢索檢索二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研2.5 日期或日期范圍檢索日期或日期范圍檢索2.5.1 日期的錄入格式為日期的錄入格式為YYYY/MM/DD2.6 檢索期刊子集（輯）檢索期刊子集（輯）2.6.1 檢索詞檢索詞AND jsubset 數據庫首字母。可供檢索的期數據庫首字母?？晒z索的期刊子庫有刊子庫有3 3種，分別使用進行限定。種，分別使用

10、進行限定。l Abridged Index Medicus(有有120種重要核心醫學期刊種重要核心醫學期刊)l Dentall Nursing l如：如：neoplasms AND jsubseta二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研2.7 檢索帶文摘的記錄檢索帶文摘的記錄2.7.1 檢索詞檢索詞AND has abstract, , 要注意的是在要注意的是在19751975年前年前出版的文章，其出版的文章，其MEDLINE記記錄中沒有文摘錄中沒有文摘 如如: : liver cancer AND has abstract二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識

11、PubMed讓它融入您的科研2.8.1 布爾邏輯運算符布爾邏輯運算符(AND, OR, NOT) 如：如：Oncology AND (treatment OR research )2.8.2 截詞符截詞符( * ) 如如: : bacter*2.8.3 詞組檢索詞組檢索 ( “ ”) 如如: : “Single cell”2.8.4 通配符通配符( ? ) 如如: : “en?oblast”2.8 組配組配/截詞截詞/短語檢索短語檢索二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研字段標識字段名稱簡要說明ADAffiliation第一責任者的工作單位、地址，合同號ALLAl

12、l Fields全字段AUAuthor Name著者姓名EDATEntrez Date錄入PubMed系統數據庫的日期IPIssue期刊的期號TAJournal Title期刊名稱或ISSN號LALanguage語言文種MHDAMeSH Date標引MeSH主題詞的日期MAJRMeSH Major Topic主要MeSH主題詞MHMeSH Terms全部MeSH主題詞PGPage Number期刊頁碼DPPublication Date文獻出版日期PTPublication Type文獻類型包括綜述、臨床試驗、信件等TWText Words題名詞和文摘詞TITitle words題名詞VIVo

13、lume期刊卷號2.9 PubMed檢檢索字段標識索字段標識二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研1默認SUMMARY（簡要格式）顯示2可標記后點擊Display Settings鍵3默認每頁顯示20條4最多一次可保存10000條記錄5可用瀏覽器的打印功能2.10 PubMed檢索結果顯示及處理檢索結果顯示及處理 二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研2.11 PubMed基本檢索基本檢索舉例舉例Clinical cancer research 2009diabete

14、 AND jsubsetn“embryonic stem cell*”swine flu* OR swine influ* OR H1N1 OR SIV二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研 1 1明確所要檢索的內容。明確所要檢索的內容。 先分析這一問題中的關鍵詞語，主要由先分析這一問題中的關鍵詞語，主要由 維生素維生素CC，和和 普通感冒普通感冒 構構成。即成。即 VITAMIN CVITAMIN C和和 COMMON COLDCOMMON COLD。 2 2分析所要檢索的兩個相關詞語的關系。分析所要檢索的兩個相關詞語的關系。 根據我們的日常生活經驗，可以將兩個

15、關鍵詞之間的關系定義為根據我們的日常生活經驗，可以將兩個關鍵詞之間的關系定義為“AND”,AND”, 在檢索框內鍵入在檢索框內鍵入“VITAMIN C” AND COMMON COLDVITAMIN C” AND COMMON COLD2.12 PubMed基本檢索演示基本檢索演示u檢索課題一檢索課題一 維生素維生素C C對于普通感冒的防治作用對于普通感冒的防治作用二、二、PubMed檢索入門檢索入門認識PubMed讓它融入您的科研u檢索課題二檢索課題二 檢索檢索2000-20052000-2005年以后有關年以后有關Crohn病藥物治療研究的文獻病藥物治療研究的文獻Crohn Disease

16、mhAND drug therapy sh AND 2000：2005 edat二、二、PubMed檢索入門檢索入門2.12 PubMed基本檢索演示基本檢索演示認識PubMed讓它融入您的科研君欲善其事必先利其器三、PubMed高級檢索高級檢索認識PubMed讓它融入您的科研檢索事半功倍檢索事半功倍Clipboard HistoryFilterDetails檢索框三、PubMed高級檢索高級檢索認識PubMed讓它融入您的科研明確你所要檢索明確你所要檢索的關鍵概念及詞的關鍵概念及詞語，即關鍵字語，即關鍵字考慮到關鍵字的考慮到關鍵字的類似說法，即有類似說法，即有可能出現的同義可能出現的同義詞詞

17、通過限定等，精通過限定等，精煉你的檢索范圍煉你的檢索范圍通過布爾通過布爾（BOOLEAN）運算來提高你的運算來提高你的效率效率多向有經驗的人多向有經驗的人求教求教PubMed三、PubMed高級檢索高級檢索認識PubMed讓它融入您的科研 3.1 3.1 Filterl在這里可以進行以下設定：在這里可以進行以下設定： 將搜索范圍設定在一個特定的域。將搜索范圍設定在一個特定的域。 將搜索范圍設定在特定的年齡組、性別組、人類或動物學范圍。將搜索范圍設定在特定的年齡組、性別組、人類或動物學范圍。 也可以將搜索限定在某一語種出版的或某一特定的文章類型也可以將搜索限定在某一語種出版的或某一特定的文章類型

18、, ,如綜述如綜述 設定只搜索包含摘要的文獻。設定只搜索包含摘要的文獻。 設定搜索設定搜索EntrezEntrez數據庫或數據庫或PublicationPublication數據庫。數據庫。 設定搜索范圍為設定搜索范圍為PubMedPubMed數據庫的某一子數據庫（如數據庫的某一子數據庫（如Abridged Index Abridged Index Medicus Medicus 或或AIDSAIDS相關的條目）。相關的條目）。 需要注意的是：限制了出版物類型、年齡、人或動物、性別中的任何一項，檢索將只在需要注意的是：限制了出版物類型、年齡、人或動物、性別中的任何一項，檢索將只在Medline

19、中進行檢索（因為這些特征限制只有中進行檢索（因為這些特征限制只有Medline中才有）中才有）。三、PubMed高級檢索高級檢索認識PubMed讓它融入您的科研人或動物實驗選擇性別選擇語種選擇期刊分類選擇： 核心臨床醫學牙科期刊護理期刊 Medline期刊年齡選擇出版物類型選擇認識PubMed讓它融入您的科研認識PubMed讓它融入您的科研l看到最近100次的查詢結果。l如果兩次查詢內容相同，PubMed會將頭一次的去除。l當點擊 Clear History可以將History中的所有內容清除3.2 History三、PubMed高級檢索高級檢索認識PubMed讓它融入您的科研3.3 Clip

20、board 貼板可以幫助你保存或查看在一個或多個查詢中選擇的條目。貼板可以幫助你保存或查看在一個或多個查詢中選擇的條目。l可以打印、保存、訂購剪貼板中的內容。可以打印、保存、訂購剪貼板中的內容。l條目復選框選中，單擊條目復選框選中，單擊“send to clipboard”就可以將其加入剪貼板中。就可以將其加入剪貼板中。l剪貼板中最大的儲存數是剪貼板中最大的儲存數是500500條。條。l剪貼板中的內容在剪貼板中的內容在8 8小時內沒有任何操作，將會自動消失。小時內沒有任何操作，將會自動消失。三、PubMed高級檢索高級檢索認識PubMed讓它融入您的科研 3.4 Details3.4 Deta

21、ils 即在提問框中鍵入的檢索詞被即在提問框中鍵入的檢索詞被PubMedPubMed自動地轉換成了哪些自動地轉換成了哪些詞，并使用了什么樣的檢索規則和檢索語法。詞，并使用了什么樣的檢索規則和檢索語法。三、PubMed高級檢索高級檢索認識PubMed讓它融入您的科研Result區顯示檢索結果的記錄區顯示檢索結果的記錄總數，點擊這個數字，可回到總數，點擊這個數字，可回到檢索結果顯示屏檢索結果顯示屏Translation區顯示檢索詞轉換區顯示檢索詞轉換的詳細情況的詳細情況Database區顯示檢索的數據庫區顯示檢索的數據庫UserQuery區顯示用戶鍵入區顯示用戶鍵入的檢索詞或檢索式的檢索詞或檢索式

22、對檢索策略進行編輯對檢索策略進行編輯三、PubMed高級檢索高級檢索認識PubMed讓它融入您的科研文獻太多，如何保證查全和查準？四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索v何為何為MeSH？vMeSH是是Medical Subject Headings的縮略詞，即醫學主的縮略詞，即醫學主題詞，是用規范化的醫學術語來描述生物醫學概念。題詞，是用規范化的醫學術語來描述生物醫學概念。q論述文獻中心的主題詞稱主要主題詞論述文獻中心的主題詞稱主要主題詞q論述主題某一方面的內容的詞稱為副主題詞論述主題某一方面的內容的詞稱為副主題詞 Mesh詞表幫助您！4.1 MeSH Database的運用的

23、運用認識PubMed讓它融入您的科研四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索認識PubMed讓它融入您的科研詞義解釋詞義解釋四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索認識PubMed讓它融入您的科研副主題詞四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索認識PubMed讓它融入您的科研四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索主題詞的邏輯匹配檢索四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索認識PubMed讓它融入您的科研檢出結果限定在主要主題詞可提高查準率限制擴展檢索，只需檢索單個主題詞四、四、Pu

24、bMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索認識PubMed讓它融入您的科研在 MeSH Database 中查找關鍵詞 ?如何聯合檢索兩個 MeSH Terms ?如何在 MeSH Database 中利用副主題檢索 ?4.2 MeSH檢索實例演示檢索實例演示四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索認識PubMed讓它融入您的科研4.2 MeSH檢檢索實例演示索實例演示nosebleedmeasles outbreaksmeasles outbreaks statistics四、四、PubMed醫學主題詞表檢索醫學主題詞表檢索認識PubMed讓它融入您的科研五、五、PubMed其他功

25、能其他功能實現單篇文章的一對一檢索實現多篇文章的一次性檢索一次最多可檢索PubMed中100條文獻紀錄, 獲得文獻的PMID認識PubMed讓它融入您的科研選擇相應類別選擇檢索范圍檢索結果更加貼近臨床的需要五、五、PubMed其他功能其他功能認識PubMed讓它融入您的科研限定于各類不同的醫學臨床主題進行檢索五、五、PubMed其他功能其他功能認識PubMed讓它融入您的科研實現實現PubMedPubMed與核酸和蛋白與核酸和蛋白質序列數據庫、基因組數質序列數據庫、基因組數據庫、分類學數據、圖書據庫、分類學數據、圖書等數據庫之間的多向鏈接等數據庫之間的多向鏈接, ,多向查詢多向查詢五、五、Pu

26、bMed其他功能其他功能認識PubMed讓它融入您的科研與PubMed建立聯系的網站，如某篇文獻所對應期刊的出版商，文獻全文、相關數據庫及網站等。五、五、PubMed其他功能其他功能認識PubMed讓它融入您的科研五、五、PubMed其他功能其他功能認識PubMed讓它融入您的科研eUtils(Entrez Programming Utilities) l通過通過eUtils eUtils 這個程序設計模塊這個程序設計模塊, , 可以通過我們自己設計可以通過我們自己設計的應用程序平臺的應用程序平臺, , 獲取獲取NCBI NCBI 數據庫的數據數據庫的數據, , 從而實現這從而實現這些數據資源

27、的深度開發使用。些數據資源的深度開發使用。l實現自動化的大批量的從實現自動化的大批量的從EntrezEntrez數據庫下載數據。并且提數據庫下載數據。并且提供了幾種常用的語言以供選擇，像供了幾種常用的語言以供選擇，像Perl, Python, Java, Perl, Python, Java, 和和 C+C+等。等。五、五、PubMed其他功能其他功能認識PubMed讓它融入您的科研免費期刊的獲取免費期刊的獲取pPubMedPubMed提供了免費全文期刊網址提供了免費全文期刊網址 Pubmed Central /pmc/journals/ /

28、p向作者索要向作者索要p作者主頁作者主頁五、五、PubMed其他功能其他功能認識PubMed讓它融入您的科研六、六、PubMed的個性化服務的個性化服務認識PubMed讓它融入您的科研保存檢索式(生成URL或HTML實現共享)檢索結果的分類過濾特定功能的參數設置六、六、PubMed的個性化服務的個性化服務書目管理設置認識PubMed讓它融入您的科研經由2000多位專家學者的評價推薦，提供目前世界上最重要的生物學論文資訊及研究趨勢。特色是收錄每篇具有科學價值的文獻，而考慮這些文獻在哪在些期刊里發表PubMed里檢索出最核心的文獻Faculty of 1000與pubmed的完美結合六、六、PubMed的個性化服務的個性化服務認識PubMed讓它融入您的科研PubMed快速檢索功快速檢索功能的實現能的實現NCBI Search ToolkitNCBI Search Toolkit安裝NCBI Search Toolkit劃詞右擊直接進行pubmed檢索六、六、PubMed的個性化服務的個性化服務認識PubMed讓它融入您的科研Pu