1、pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1 1pubmed數(shù)據(jù)庫檢索石金pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2 2pubmed數(shù)據(jù)庫檢索pubmed及相關(guān)數(shù)據(jù)庫認(rèn)識pubmedpubmed檢索方法pubmed定題推送服務(wù)pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3 3pubmed及相關(guān)數(shù)據(jù)庫 ncbi(national center for biotechnology information，美國國立生物技術(shù)信息中心)ncbi是目前國際上幾個重要分子生物信息網(wǎng)站之一，其成立的原因是為已故的參議院議員claude pepper發(fā)現(xiàn)計算信息處理方法對生物醫(yī)學(xué)研究的重要性，因此，在19

2、88年11月4日成立ncbi。ncbi是national institutes of health（nih）底下的national library of medicine（nlm）的部門之一。由于nlm具有建立與維護(hù)生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫經(jīng)驗，且因它是nih的單位，因此可執(zhí)行計算分子生物計劃。nih目前是全世界最大的生物醫(yī)學(xué)研究單位。 ncbi成立的主要任務(wù)為： 提供生物醫(yī)學(xué)的分析與計算工具，協(xié)助研究人員了解生物的語言-dna在健康與疾病中所扮演的角色 發(fā)展新技術(shù)協(xié)助了解調(diào)控健康與疾病的基本分子與遺傳過程， 包括建立儲存與分析分子生物、生化與遺傳學(xué)知識的自動系統(tǒng)；促進(jìn)研究與醫(yī)學(xué)社群使用數(shù)據(jù)庫與軟件；協(xié)

3、調(diào)生物技術(shù)信息的傳遞與管理；執(zhí)行以計算機(jī)為基礎(chǔ)的進(jìn)階信息分析過程，用以分析生物重要分子的結(jié)構(gòu)與功能。pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4 4可檢索的數(shù)據(jù)庫 books 出版社提供之?dāng)?shù)字生醫(yī)圖書與醫(yī)生參考書籍?dāng)?shù)據(jù)庫 cancer chromosomes 美國國立癌癥研究所的mitelman database of chromosome aberrations in cancer數(shù)據(jù)庫里已經(jīng)整合好的cytogenetic、臨床與文獻(xiàn)相關(guān)數(shù)據(jù) conserved domain database（cdd），蛋白質(zhì)功能區(qū)塊保留序列數(shù)據(jù)庫 3d domains，蛋白質(zhì)功能區(qū)塊立體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù) gen

4、e，包含許多物種的基因數(shù)據(jù)庫 genome，包含超過800種物種的基因組數(shù)據(jù)庫 gensat，小鼠中樞神經(jīng)系統(tǒng)基因表現(xiàn)圖譜 geo datasets，基因表現(xiàn)實驗與生物芯片數(shù)值結(jié)果數(shù)據(jù) geo profiles，基因表現(xiàn)圖譜 homologene，同源基因批注數(shù)據(jù)庫 journals，期刊文獻(xiàn)（包含pubmed） mesh，醫(yī)學(xué)主題詞數(shù)據(jù)庫 ncbi web site，所有ncbi網(wǎng)頁 nlm catalog，美國國立醫(yī)學(xué)圖書館館藏書目、期刊、視聽數(shù)據(jù)目錄 nucleotide sequence database，核酸序列數(shù)據(jù)庫（包含genbank、refseq和pdb等三大序列數(shù)據(jù)庫）pub

5、medpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索5 5可檢索的數(shù)據(jù)庫 online mendelian inheritance in man (omim)，人類遺傳疾病相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 popset，族群演化分析相關(guān)研究資料 protein sequence database，蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫（包含swiss-prot、pir、prf、pdb等數(shù)據(jù)庫與從genbank、refseq核酸序列轉(zhuǎn)譯之蛋白質(zhì)序列資料） pubchem bioassay，化學(xué)成分之生物活性篩選資料 pubchem compound，小分子化學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu) pubchem substance，具生物活性之化學(xué)物質(zhì)篩選數(shù)據(jù) pubmed，

6、科學(xué)文獻(xiàn)報導(dǎo)數(shù)據(jù)庫 pubmed central，科學(xué)文獻(xiàn)數(shù)字全文數(shù)據(jù)庫 site search，可搜尋ncbi的網(wǎng)頁與ftp snp，單點(diǎn)核酸多樣性數(shù)據(jù)庫(dbsnp) structure，分子模型數(shù)據(jù)(mmdb) taxonomy，以核酸或蛋白質(zhì)為基礎(chǔ)的分類學(xué)信息 unigene，人類unique基因序列數(shù)據(jù)庫 unists，unique序列卷標(biāo)地址數(shù)據(jù)庫pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索6 6pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索7 7pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索8 8pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索9 9pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)

7、庫檢索1010pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1111pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1212pubmed檢索方法pubmed基本檢索pubmed高級檢索pubmed主題檢索臨床查詢檢索pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1313pubmed基本檢索 在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點(diǎn)擊go按鈕，pubmed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。 例如：檢索腫瘤 (cancer)方面的文章。 在檢索框中輸入：“cancer”，再點(diǎn)擊“go”按鈕。 pubmed將自動地

8、利用它的“自動詞匯匹配”功能將重要的詞語結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉(zhuǎn)換成mesh詞表中規(guī)范的用詞進(jìn)行檢索，比如，檢索“cancer” 將自動轉(zhuǎn)換為：neoplasmsmesh terms or neoplasmsall fields or cancerall fieldspubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1414pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1515a ba b a bpubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1616 pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1717pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索1818pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索

9、1919pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2020pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2121pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2222pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2323pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2424pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2525pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2626 pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2727pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2828pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索2929pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3030pubmedpub

10、med數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3131pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3232pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3333pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3434pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3535醫(yī)學(xué)主題詞表數(shù)據(jù)庫(mesh database)利用主題詞進(jìn)行檢索方法:1、點(diǎn)擊主頁右下角的mesh database進(jìn)入主題詞檢索界面；2、輸入檢索詞后，點(diǎn)擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關(guān)主題詞；3、點(diǎn)擊該主題詞進(jìn)一步顯示該主題詞的定義、樹狀結(jié)構(gòu)、組配的副主題詞；4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點(diǎn)擊send to按鈕，進(jìn)入檢索表達(dá)式瀏覽窗口；5、點(diǎn)擊s

11、earch pubmed將顯示檢索結(jié)果。pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3636pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3737pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3838pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索3939pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4040注意：mesh檢索的不足 人工標(biāo)引費(fèi)時，最新論文還未標(biāo)mesh詞（ in process），用mesh會漏檢。 medline不收錄的文獻(xiàn)，supplied by publisher的文獻(xiàn)，不標(biāo)mesh詞。 新詞、一些很專指的概念沒有對應(yīng)的規(guī)范詞。 查上述類型的文獻(xiàn)需結(jié)合自由詞檢索pubmedpub

12、med數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4141檢索舉例試在pubmed中檢索有關(guān)“更昔洛韋用于防治器官移植后巨細(xì)胞病毒感染”的文獻(xiàn)。（查準(zhǔn)）1. 課題分析： 更昔洛韋（ganciclovir）+器官移植（organ transplantation）+巨細(xì)胞病毒感染（cytomegalovirus infection）2.初步檢索策略： ganciclovirmesh and organ transplantation mesh and cytomegalovirus infectionsmesh檢索舉例檢索舉例pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4242檢索舉例檢索舉例pubmedpubmed數(shù)據(jù)

13、庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索43433. 使用副主題詞進(jìn)一步提高查準(zhǔn)率。(ganciclovir/administration and dosagemesh) or(ganciclovir/therapeutic usemesh) and organ transplantationmesh and (cytomegalovirus infections/drug therapymesh or cytomegalovirus infections/prevention and controlmesh)檢索舉例檢索舉例pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索44444. 使用主要主題詞限定(organ t

14、ransplantationmajr) and (cytomegalovirus infections/drug therapymajr or cytomegalovirus infections/prevention and controlmajr) and (ganciclovir/administration and dosagemajr or ganciclovir/therapeutic usemajr)檢索舉例檢索舉例pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4545 pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4646 pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4747pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4848pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索4949pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索5050my ncbi是pubmed的自助式信息推送服務(wù)先在pubmed注冊并定制檢索式后，my ncbi自動推送更新信息；用戶可定制多個課題跟蹤服務(wù)； pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索5151step1、注冊my ncbistep2、定制檢索式step3、選擇：自動推送數(shù)量、頻率、格式等step4、激活：進(jìn)入注冊郵箱激活鏈接pubmedpubmed數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索5252step1