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文檔簡介

1、近年來,利用計算機進行文獻檢索已逐步代替?zhèn)鹘y(tǒng)的手工檢索,隨著Internet的普及,我們可以隨時隨地通過國際互聯(lián)網(wǎng)來檢索獲得免費的醫(yī)學(xué)文獻,這是一條文獻檢索新捷徑1,特別是進行MEDLINE檢索,既簡單又實用2。現(xiàn)在有多個機構(gòu)提供免費的網(wǎng)上MEDLINE檢索服務(wù),其中由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)所屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)建立的PubMed數(shù)據(jù)更新快3,檢索系統(tǒng)完善,深受廣大醫(yī)務(wù)工作者和圖書情報人員的歡迎。由于PubMed檢索系統(tǒng)在不斷完善和加強,要快速、全面、準(zhǔn)確地在近4千種醫(yī)學(xué)期刊、1千1百萬條數(shù)據(jù)中檢索出符合自己要求的資料4,并不容易。下面介紹最新版本(2000年9月版)的P

2、ubMed使用方法。1. 進入PubMed在瀏覽器的地址欄內(nèi)輸入Pubmed的網(wǎng)址: 后按回車鍵,就進入PubMed的主頁,開始檢索。2. 普通檢索在檢索式提問框中輸入一個或更多的詞(例如:vitamin c common cold),然后按回車鍵或用鼠標(biāo)點擊Go按鈕,PubMed就會利用自動詞語匹配功能將重要的詞或詞組用AND組合在一起進行檢索(見圖1)。輸入的詞可以是自由詞、主題詞、或其他指定字段。由于主題詞檢索的文獻更全面、更準(zhǔn)確,應(yīng)盡量使用主題詞/副主題詞檢索。對于某些新的技術(shù)詞匯、新藥、新方法、新疾病等,還沒有相應(yīng)的主題詞時,應(yīng)該用自由詞檢索。3. 高級檢索使用邏輯詞AND, OR,

3、 NOT(例如:vitamin c OR zinc)、指定文獻記錄字段名稱檢索、使用醫(yī)學(xué)主題詞(MeSH)/副主題詞組配格式檢索,如neoplasms/diet therapymh。不久返回檢索結(jié)果,檢索提問框仍出現(xiàn)在頁面頂端,并顯示您剛才輸入的檢索詞。您可以在提問框內(nèi)、點擊Details或Limits按鈕再修改檢索詞。3.1 PubMed檢索規(guī)則和語法布爾運算符AND,OR,NOT必須大寫,例如,vitamin c OR zinc;PubMed從左至右進行布爾運算。不過,你可以通過加圓括符改變運算順序,如common cold AND (vitamin c OR zinc)。括弧內(nèi)的字段是作

4、為一個整體來處理的。如果輸入的字段含有主題詞組,PubMed優(yōu)先按詞組檢索。如果不希望這樣,應(yīng)該加布爾運算符。例如輸入:air bladder fistula,PubMed會將air bladder作為詞組。此時應(yīng)輸入:air AND bladder AND fistula。字段標(biāo)記符(tag)使用規(guī)則:只能在詞后加字段標(biāo)記符,如:romatherapy mh,必須用封閉的方括弧 ,大小寫和空格會被忽略,如crabs mh = CrabsMH。日期格式:采用YYYY/MM/DDDP格式,如1998/03/06dp,1999/10 EDAT。月和日可以不寫。輸入日期范圍則用冒號連接,如1996:

5、1998dp,1998/01:1998/04dp。日期字段標(biāo)記符有3個:Date of Publication DP :出版日期Entrez Date EDAT :進入PubMed的日期。 MeSH Date MHDA:該引文被 MeSH 主題詞編入索引的日期。 期刊標(biāo)記符有3個: jsubseta - Abridged Index Medicus 只檢索醫(yī)學(xué)索引的期刊jsubsetd - Dental 只檢索牙科文獻索引的期刊jsubsetn - Nursing 只檢索護理學(xué)索引的期刊例如: neoplasms AND jsubseta 檢索須有摘要的文獻,使用 hasabstract。 如

6、: neoplasms AND hasabstract 檢索印刷前的引文,使用pubstatusaheadofprint。 例如: pubstatusaheadofprint AND gene 3.2. PubMed的檢索語法檢索語法格式是:檢索詞tag 布爾運算符 檢索詞tag例如:要檢索作者Dr. Crick在1993年撰寫的關(guān)于DNA的文獻,格式是:dna mh AND crick au AND 1993 dp 要檢索關(guān)于熱或潮濕與多發(fā)性硬化的關(guān)系,格式是:(heat OR humidity) AND multiple sclerosis 檢索學(xué)齡前兒童哮喘治療的英文綜述文獻,格式是:

7、asthma/therapy mh AND review pt AND child, preschool mh AND english la 3.3 作者姓名檢索輸入作者姓名時應(yīng)采用姓+名(名的首字母縮寫,不用標(biāo)點符號)的格式,例如SmithJA。PubMed將自動地截取作者姓名中名的首字母以適應(yīng)不同的名縮寫。如果只輸入作者的姓,PubMed會在包括作者字段在內(nèi)的所有字段進行檢索,但如果作者的姓是一個MeSH詞的時候除外,例如輸入Yang,則PubMed將只檢索:Yin-YangMeSH或YangText Word。此外,如果使用雙引號將作者的姓全稱和名的第一個首字母引起來,并用作者檢索字段標(biāo)

8、識符au限制,如smith jau,PubMed將關(guān)閉自動截詞,且檢索姓名中名只有一個字母縮寫的作者。3.4 期刊名檢索包括期刊名全稱(如molecular biology of the cell)、期刊名MEDLINE縮寫(如mol biol cell)、國際標(biāo)準(zhǔn)連續(xù)出版物號(ISSN,如1059-1524)。例如,如果輸入New England Journal of Medicine,PubMed將按N Engl J Medta查詢。應(yīng)注意: 如果雜志名也是一個MeSH詞,例如Gene Therapy, Science, 或 Cell,PubMed只會按MeSH詞來檢索,要想檢索雜志名,必

9、須加字段標(biāo)記ta,如 gene therapy ta。 對一個單詞的雜志名,也必須加字段標(biāo)記ta。 盡量使用期刊名全稱和期刊名MEDLINE縮寫檢索,在早期的文獻中,ISSN號是不能保證檢索完全的。 如果雜志名帶有參數(shù)或引號,應(yīng)該去掉這些參數(shù)或引號,如:J Hand Surg Am應(yīng)該以 J Hand Surg Am 鍵入。3.5 截詞檢索可以在詞尾加*號,來檢索有一樣詞頭的所有詞, 如輸入 bacter*,則會檢索 bacter, bacteria, bacterium, bacteriophage 等詞,但不會檢索帶有空格的詞組,如 bacteria control。PubMed只能檢索前

10、150個相符合的詞。此外,截詞檢索將關(guān)閉自動詞語匹配功能,也不能進行擴展檢索。如:heart attack*不會匹配MeSH詞,也不會擴展檢索myocardial infarction、myocardial stunning、shock、cardiogenic這些方面的文獻。3.6 強制詞組檢索(規(guī)定Pubmed檢索一個詞組)一般情況下,如果PubMed檢索在常用詞組列表中已有的詞組,如poi-son ivy,PubMed就會把它作為一個詞組來檢索。但有時Pubmed可能找不到相應(yīng)的詞組,如果輸入的詞組,在PubMed的詞組表中沒有時,PubMed 會拆分詞組,如您輸入:single cell

11、,PubMed會分成 single 和 cell 分別檢索,如要強制檢索single cell,必須加雙引號,使得PubMed將其當(dāng)作一個詞來進行檢索,即寫成 single cell。需注意的是,使用雙引號規(guī)定PubMed進行詞組檢索,PubMed就不會執(zhí)行自動詞語匹配功能和擴展檢索功能。3.7 檢索細節(jié)點擊Details按鈕,可以查看和編輯檢索情況,即可以增加或刪除檢索詞,如圖2。還可以從檢索細節(jié)窗口保存檢索項目:點擊URL按鈕后,用瀏覽器的書簽(或收藏夾)菜單將目前的檢索項目作為URL地址以書簽形式保存,以便下次再檢索。4. 限定檢索(Limits)如圖3,可以對多個選項限定檢索,以縮小檢

12、索范圍,提高檢索準(zhǔn)確率。完成后將出現(xiàn)如圖4的核對框,顯示限定的字段。限定字段檢索的項目有:4.1 字段選擇可選擇:所有字段(All Fields)、作者地址、作者姓名、期刊名、ISSN號碼、語種、MeSH詞、副主題詞、頁碼、出版日期、自由詞、標(biāo)題詞、期刊卷號、數(shù)據(jù)庫更新代碼、物資名稱等22個選項,默認選項為All Fields。4.2必須有摘要的文獻(Only Items with Abstracts )為復(fù)選框,選中后檢索出的文獻均有摘要。注意1975年前的文獻是沒有摘要的。4.3 出版形式(Publication Types)包括:Clinical Trial 臨床試驗Editorial

13、編輯按語Letter 讀者來信Meta-Analysis 薈萃分析Practice Guideline 實踐指南Randomized Controlled Trial 隨即對照試驗Review 綜述4.4 出版語種(Languages )PubMed 引用了近40種語言的期刊。但下拉式菜單中只有最常檢索的幾種語言供選擇:英語、法語、德語、意大利語、日語、俄語和西班牙語。如您沒有限制語言,PubMed會檢索所有語種出版的文獻。語種的字段標(biāo)記符一般取英文的前3個字母表示,如漢語為chi,德語為ger,但日語例外,為jpn。4.5 年齡(Ages )可在下拉式菜單中選擇其中一項。All Infant

14、: birth-23 month 出生到23月齡的嬰兒All Child: 0-18 years 018歲的兒童All Adult:19+ years 所有成年人(19歲以上)Newborn: birth-1month 新生兒(出生到1個月)Infant: 1-23 months 嬰兒Preschool Child: 2-5 years 25歲的學(xué)齡前兒童Child: 6-12 years 612歲兒童Adolescent: 13-18 years 青春期1318歲Adult:19-44 years 1944歲成年人Middle Aged:45-64 years 4564歲Aged:65+ y

15、ears 65歲以上80 and over: 80+ years 80歲以上4.6 性別(Gender)4.7 人或動物(Human or Animal) 4.8 子項(Subsets )包括:目前有9個數(shù)據(jù)庫或過濾檢索系統(tǒng)可選:AIDS、AIM、Dental、MEDLINE、Nursing、PreMEDLINE 、Publisher、PubRef、Toxicology。其中MEDLINE, PreMEDLINE和出版商直接提供的電子出版物文獻( Publishers)較常用。4.9 文獻進入MEDLINE的時間有30天、60天、90天、180天、1年、2年、5年和10年選擇。4.10 出版或

16、進入MEDLINE的時間段應(yīng)輸入時間范圍。按照年/月/日的格式。5. 利用預(yù)覽/索引(Preview/Index)檢索使用預(yù)覽/索引可以:預(yù)覽檢索出的文獻數(shù)量,加快顯示速度、一次性地增加檢索詞來精確檢索、增加檢索詞來檢索某些特殊領(lǐng)域、從索引中查看和選擇檢索詞。例如:要檢索以chickenpox為頭的MeSH詞,先選擇在下拉式菜單的MeSH Terms,在檢索框內(nèi)輸入chickenpox,再點擊Index按鈕。滾動索引Index窗,高亮顯示chickenpox vaccine,點擊AND按鈕,Chickenpox vaccine 就會出現(xiàn)在檢索提問框內(nèi)(圖5)。注意: Preview/Index

17、 只能顯示最近三次檢索的預(yù)覽結(jié)果。而歷史(History)窗口能顯示多達過去100次的檢索請求。6. 利用歷史記錄(History)檢索PubMed 能保存您所有的檢索請求和結(jié)果。歷史窗口顯示檢索序號、檢索請求、檢索時間、檢出的文獻數(shù)(圖6)。點擊檢索結(jié)果數(shù)字,可以閱讀檢索出的文獻。也可以將歷史檢索合并,重新檢索。方法是在檢索序號前加#號,如 #2 AND #6, 或 #3 AND (drug therapy OR diet therapy)。再按Go按鈕開始重新檢索。注意: 歷史記錄最多保存100條。若PubMed 停止使用1小時,歷史記錄就會被刪除。PubMed是利用 cookies 來保

18、存檢索歷史的,要使用此功能,您的瀏覽器必須設(shè)置為accept cookies。 7. 利用剪貼板(Clipboard)檢索方法與利用歷史記錄檢索相同,見圖7。注意:剪貼板最多可加入500條檢索。若PubMed 停止使用1小時,剪貼板記錄就會被刪除。PubMed 是利用 cookies 來保存剪貼板記錄的,要使用此功能,您的瀏覽器必須設(shè)置為accept cookies。 可對剪貼板內(nèi)的檢索項目再檢索,如要限制為檢索英文文獻,可以這樣: #0 AND english la。這不會影響或替代剪貼板內(nèi)容。8. 檢索結(jié)果的處理8.1 顯示(Displaying)在檢索窗輸入檢索詞后進行檢索,PubMed

19、 最初返回是檢索結(jié)果是文獻題錄格式,不含摘要,如圖7、8。如需查看摘要,點擊Display按鈕即可。PubMed默認以概要(summary)形式顯示檢索出的文獻。也可以選擇其他幾種顯示形式:大綱(Brief),文摘(Abstract),引文(Citation), MEDLINE and ASN.1。方法:顯示某篇引文:單擊藍色的有下劃線的作者名,顯示該篇的摘要等。顯示所有引文:先在下拉式菜單里選擇顯示形式,再點擊 Display 按鈕。顯示所選的引文:先選中作者名前是選擇框,在下拉式菜單里選擇顯示形式,再點擊 Display 按鈕。8.2 顯示形式主要有以下幾種形式:概要(Summary):顯

20、示作者名,題目,期刊名,記錄狀態(tài)(Record Status), 非英語文獻語種提示,文獻類型(綜述),無文摘提示(No abstract available),PubMed 和 MEDLINE 統(tǒng)一標(biāo)識碼。大綱(Brief):作者名,文獻題目的前30個單詞,統(tǒng)一標(biāo)識碼。摘要(Abstract):顯示期刊名,記錄狀態(tài)(Record Status), 非英語文獻語種提示,文獻類型(綜述),作者名,作者所屬單位,題目,文摘(如果有的話),錯誤(Erratum),收回(Retraction),注釋( Comments), PubMed 和 MEDLINE 統(tǒng)一標(biāo)識碼。引文(Citation):在摘要

21、(Abstract)形式上增加顯示MeSH詞、作為文獻標(biāo)題的人名(Personal Name as Subject),化學(xué)物質(zhì)、研究項目批號、SI數(shù)據(jù)庫進入號碼。MEDLINE :完全 MEDLINE 記錄形式,可以下載檢索出的文獻到某些檢索軟件再處理。ASN.1 :ASN.1 (1號文摘語法符號)是一個通用于各種計算機平臺檢索的國際標(biāo)準(zhǔn)。XML/SGML :即擴展標(biāo)記語言,是由國際互聯(lián)網(wǎng)聯(lián)盟(W3C)維護的一種標(biāo)準(zhǔn),它定義用于信息結(jié)構(gòu)的標(biāo)記語言的語法規(guī)則。其顯示形式與HTML相似。8.3 純文本形式(Text)點擊Text 按鈕,可以顯示純文本形式。要回到PubMed顯示形式,按瀏覽器的Backup按鈕就可。8.4 每頁顯示文獻數(shù)(Show)PubMed 默認每頁顯示20篇文獻,點擊Show按鈕,可以改變每頁顯示數(shù)。8.5 保存(Saving)可以保存檢索出的全部文獻或所選的部分文獻。注意: 在當(dāng)前頁點擊保存按鈕,可以保存檢索的所有的文獻,盡管其他頁的文獻還沒有顯示。最大保存量是10,0

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