研發費用加計扣除備案和申報管理（一）享受研發費用加計扣除優惠政策基本流程享受研發費用加計扣除優惠政策主要有以下關鍵資料和程序：1.年度納稅申報前進行優惠備案并準備好留存備查資料；2.填寫并報送“研發支出”輔助賬匯總表；3.在年度納稅申報表中填報研發費用加計扣除優惠附表及欄次。完整流程見上圖。（二）研發費用加計扣除優惠備案的要點1.自行判斷。根據76號公告規定，企業應自行判斷其是否符合研發費用加計扣除政策規定的條件。2.履行備案。研發費用加計扣除實行備案管理，凡享受研發費用加計扣除優惠的，企業應當不遲于年度匯算清繳納稅申報時，向主管稅務機關報送企業所得稅優惠事項備案表和研發項目文件，履行備案手續。按照76號公告規定，研發費用加計扣除優惠不屬于定期減免稅事項，在費用化項目發生當期或者資本化項目形成無形資產后的攤銷期間，應每年履行備案手續；企業同時存在多個享受優惠研發項目的，應當按不同項目分別進行核算，并按項目分別進行備案。2015年度及以前按照原政策已審核立項的跨期研發項目延續至2016年度及以后的，在享受優惠年度，應每年履行備案手續。屬于跨地區經營匯總納稅企業，其分支機構享受研發費用加計扣除稅收優惠。應由二級分支機構按規定向其主管稅務機關備案后，總機構匯總所屬二級分支機構已備案優惠事項，在年度納稅申報時填寫匯總納稅企業分支機構已備案優惠事項清單一并報送。3.留存備查資料。企業對報送的備案資料、留存備查資料的真實性、合法性承擔法律責任。企業應按照97號公告，將相關資料留存備查，保存期限為相關研發項目享受優惠結束后10年。企業應當按照稅務機關要求限期提供留存備查資料，以證明其符合稅收優惠政策條件。或者企業不能提供留存備查資料，留存備查資料與實際生產經營情況、財務核算、相關技術領域、產業、目錄、資格證書等不符，不能證明企業符合稅收優惠政策條件的，稅務機關將追繳其已享受的減免稅，并按照稅收征管法規定處理。（三）享受研發費用加計扣除優惠政策的留存備查資料根據97號公告，企業應保留下列留存備查資料：1.自主、委托、合作研究開發項目計劃書和企業有權部門關于自主、委托、合作研究開發項目立項的決議文件；2.自主、委托、合作研究開發專門機構或項目組的編制情況和研發人員名單；3.經科技行政主管部門登記的委托、合作研究開發項目的合同；4.從事研發活動的人員和用于研發活動的儀器、設備、無形資產的費用分配說明（包括工作使用情況記錄）；5.集中研發項目研發費用決算表、集中研發項目費用分攤明細情況表和實際分享收益比例等資料；6.“研發支出”輔助賬；7.企業如果已取得地市級（含）以上科技行政主管部門出具的鑒定意見，應作為資料留存備查;8.省稅務機關規定的其他資料。（四）享受研發費用加計扣除優惠政策但匯算清繳期結束前未備案的處理方法根據76號公告規定，企業已經享受稅收優惠，但在匯繳期間未按照規定備案的，企業發現后應當及時補辦備案手續，同時提交企業所得稅優惠事項備案管理目錄列示優惠事項對應的留存備查資料。企業已經享受稅收優惠，但在匯繳期間未按照規定備案的，稅務機關發現后，應當責令企業限期備案，同時提交企業所得稅優惠事項備案管理目錄列示優惠事項對應的留存備查資料。（五）享受研發費用加計扣除優惠政策匯算清繳時的有關規定企業年度納稅申報時，根據研發支出輔助賬匯總表填報研發項目可加計扣除研發費用情況歸集表，在年度納稅申報時隨申報表一并報送主管稅務機關。（六）預繳所得稅時不能享受研發費用加計扣除優惠根據國家稅務總局關于發布企業所得稅優惠事項辦理辦法的公告（國家稅務總局公告2015年第76號）的規定，研發費用稅前加計扣除政策屬于匯繳享受優惠項目，因此企業實際發生的研發費用，在年度中間預繳所得稅時，允許據實計算扣除，在年度終了進行所得稅年度匯算清繳納稅申報時，再依照規定享受加計扣除優惠政策。（七）企業集團集中開發的研發費用分攤需要關注關聯申報企業集團根據生產經營和科技開發的實際情況，對集中研發項目按照財稅2015119號文件規定歸集的可加計扣除的研發費用，按照權利和義務相一致、費用支出和收益分享相配比的原則，合理確定研發費用的分攤方法，在受益成員企業間進行分攤，由相關成員企業分別計算加計扣除。企業集團應將集中研發項目的協議或合同、集中研發項目研發費用決算表，集中研發項目費用分攤明細情況表和實際分享收益比例等資料提供給相關成員企業。協議或合同應明確參與各方在該研發項目中的權利和義務、費用分攤方法等內容。根據國家稅務總局關于完善關聯申報和同期資料管理有關事項的公告（國家稅務總局公告2016年第42號）的規定，企業集團開發、應用無形資產及確定無形資產所有權歸屬的整體戰略，包括主要研發機構所在地和研發管理活動發生地及其主要功能、風險、資產和人員情況等應在主體文檔中披露。（八）享受研發費用加計扣除的研發項目無需事先通過科技部門鑒定或立項自2016年1月1日起，企業申報享受研發費用加計扣除優惠，無需事前通過科技部門鑒定。企業自主研發的項目，需經過企業有權部門審核立項。也就是說，不需經過科技部門和稅務部門進行立項備案，只需企業內部有決策權的部門，如董事會等做出決議即可。政府及相關部門支持的重點項目，根據政府部門立項管理的相關要求，需科技部門備案的特殊情況除外，但稅務部門對自主研發項目沒有登記的硬性要求。委托研發及合作研發的項目立項則需要科技部門登記。技術合同認定管理辦法（國科發政字200063號）第六條規定：未申請認定登記和未予登記的技術合同，不得享受國家對有關促進科技成果轉化規定的稅收、信貸和獎勵等方面的優惠政策；97號公告規定，委托及合作研發的，需提供經科技行政主管部門登記的委托、合作研究開發項目的合同留存備查。因此，經科技行政主管部門登記的委托、合作研發項目合同是享受研發費用加計扣除的要件之一。（九）稅企雙方對研發項目有異議的由稅務機關轉請科技部門鑒定科技部 財政部 國家稅務總局關于進一步做好企業研發費用加計扣除政策落實工作的通知（國科發政2017211號）規定，稅務部門事中、事后對企業享受加計扣除優惠的研發項目有異議的，應及時通過縣（區）級科技部門將項目資料送地市級（含）以上科技部門進行鑒定；由省直接管理的縣/市，可直接由縣級科技部門進行鑒定。鑒定部門在收到稅務部門的鑒定需求后，應及時組織專家進行鑒定，并在規定時間內通過原渠道將鑒定意見反饋稅務部門。鑒定時，應由3名以上相關領域的產業、技術、管理等專家參加。企業承擔省部級（含）以上科研項目的，以及以前年度已鑒定的跨年度研發項目，不再需要鑒定。（十）當年符合條件未享受加計扣除優惠的可以追溯享受企業符合財稅2015119號文件規定的研發費用加計扣除條件而在2016年1月1日以后未及時享受該項稅收優惠的，可以追溯享受并履行備案手續，追溯期限最長為3年。(十一)正確處理稅務核查與企業享受研究費用加計扣除優惠政策的關系國家稅務總局關于進一步做好企業研究開發費用稅