根據滬國稅進200318號文上海市國家稅務局關于本市實行加工貿易聯網監管試點企業有關進料加工貿易業務退免稅操作問題的通知，對我區進料加工貿易進出口使用電子手冊管理的企業退免稅管理操作中的有關事宜暫明確如下：一、 電子手冊進出口業務錄入及提供資料(一)錄入：進料加工貿易方式發生的進出口業務應根據當年登記的電子手冊號碼于報關進出口的當月全部進行申報錄入，對深加工結轉進口料件并且未取得內銷增值稅專用發票部分由企業列表承諾后參照進料加工貿易方式錄入。對電子手冊項下進出口業務錄入均應嚴格按照國稅發（2006）102號文規定期限準確錄入，逾期未申報辦理的，稅務機關在比照中華人民共和國稅收征收管理法第六十二條有關規定進行處罰后再辦理相關手續。對企業當年發生進料料件復出、結轉料件、進料料件內銷等情況的，應于發生當月向主管稅務機關申報，根據相關報關單號和對應金額錄負數，調減料件。（二）提供資料：料件進口應提供進口報關單復印件，料件出口應提供出口報關單，對企業發生進料料件復出、結轉料件、進料料件內銷等情況的，應提供相應關單、稅單復印件。二、 電子手冊核銷：（一）操作要求：每年年度最后一個申報所屬期根據當年已錄入的電子手冊對應的進出口紀錄進行稅務核銷。企業應及時取得在電子手冊核銷時由海關確認出具的電子帳冊核銷期限內進出口報關單分類清表（以下簡稱分類清表，代替原來紙質手冊）并在年度稅務核銷時提供，并提供有關剩余邊角余料、剩余殘次品、按規定補稅項目等海關核銷情況資料。企業應根據海關出具的分類清表制作電子表格（主要包含報關單號、進出口方向）供退稅機關核對，對分類清表進出口明細與審核系統內已錄數據（包括審核歷史庫數據和稅務核銷當期調整錄入數據）不一致的應進行核實，對漏錄、錯錄數據進行說明調整，對分類清表關單號與審核系統內已錄數據（包括審核歷史庫數據和稅務核銷當期調整錄入數據）仍不符的，企業應逐項進行說明并提供相關關單復印件等證明材料。對電子手冊核銷項目的填報和紙質手冊核銷要求完全一致。當年度發生的深加工結轉出口額在年度稅務核銷時應及時錄入結轉產品欄次，對企業當年度實際發生但未體現在海關出具的分類清表上的，企業也應如實錄入相關深加工結轉出口金額并提供相應關單復印件。同時出口企業在核銷后下一年度進行當年度電子手冊稅務核銷時，出口企業還應根據分類清表深加工結轉數據再次提供相關關單復印件，同時扣除上年度申報的實際發生但未體現在海關出具的分類清表上的金額后填報。當年度新啟用電子帳冊的企業，如第一年年末海關還未辦理手冊核銷手續的，經企業說明承諾可暫按企業電子帳冊登記數進行稅務核銷，待次年取得該年度的核銷資料時，再按上述要求進行調整。對海關雖已辦理手冊核銷但企業未能提供分類清表的，企業必須向稅務機關提供確已向海關申請出具分類清表的書面報告，該本電子手冊暫不予進行稅務核銷，并不得進行次年度手冊登記及電子手冊項下進出口數據錄入。企業在辦理電子手冊稅務核銷時，應在核銷申請表備注欄注明分類清表核銷期間，如企業本次稅務核銷時提供的是2007年1月1日至2007年6月30日進出口的分類清表，則在備注欄注明“0701010630”。（二）提供資料：企業應提供海關確認出具的電子帳冊核銷期限內進出口報關單分類清表、補稅稅單、相應關單復印件等證明材料。（三）電子手冊核銷臺帳監管：專設電子手冊分類清表核銷臺帳對電子手冊進行跟蹤管理，核銷臺帳一式兩聯，一聯企業留存，一聯稅務機關留存，專管員在每次企業提供分類清表時按規定對紙質臺帳進行紀錄（同時在公共電子臺帳上進行登記），并將企業留存聯退還企業，稅務機關留存聯在專管員處妥善保管。三、 手冊登記：（一）操作要求：企業應在每年首次退免稅申報前(如所屬期為200701的申報為2007年的首次退免稅申報期)，填報加工貿易聯網監管試點企業電子帳冊年度計劃分配率核定表（以下簡稱核定表），向十四所登記新手冊，由十四所核定免抵退申報中企業進料加工進口料件進口與出口計劃分配率比例，并確定當年申報中進料加工電子帳冊錄入編碼。企業應憑十四所核準的核定表在每年首次退免稅申報時，按核準的計劃分配率和手冊登記號碼進行電子手冊登記。上述進出口計劃分配比例涉及的出口額、進口額，按上一年度進料加工手冊稅務核銷時確定的實際分配率作為當年電子手冊登記的計劃分配率，當年度進料加工進出口額按上一年度進料加工稅務核銷時確定的實際進出口額登記。即當年度免稅料件進料加工進口額（未按美元申報的，按上年末匯率折算美元額）=上一年度實際進口總值剩余邊角余料結轉料件進料料件內銷等其它調減料件。當年度進料加工出口額（未按美元申報的，按上年末匯率折算美元額）=上一年度實際直接出口總值剩余殘次成品使用免稅料件的結轉產品視同內銷等其它未出口產品當年首次啟用電子手冊的出口企業按照審核系統內上年度錄入的進料加工貿易方式下的進出口額（美元額）和上年度深加工結轉進出口額進行手冊登記，對當年因手冊升級需登記新手冊的，新手冊計劃分配率也按照上年度電子手冊稅務核銷結果核定。 有關電子帳冊每年的錄入編碼根據海關確定的電子帳冊按年擴充確定，方式為：電子帳冊號碼的第6、7位作為擴充碼，按年份的后兩位錄入。如海關確定的電子帳冊號碼為E22123000001，年份為2007年，則免抵退申報中該電子帳冊號碼應為E22123070001；年份為2008年，則為E22123080001。 （二）提供資料：除填報核定表（一式三份）外，每年首個申報期進行電子手冊登記、當年因手冊升級需登記新