DB13T 5112-2019 棉花雜交種真實性和純度檢測技術(shù)規(guī)程 SSR分子標(biāo)記法_第1頁
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文檔簡介

DB13河北省市場監(jiān)督管理局發(fā)布I本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1-2009給本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:張建宏、田海燕、唐麗媛、張素君、崔瑞敏、張香云、劉存敬、李1棉花雜交種真實性和純度檢測技術(shù)規(guī)程SSR分子標(biāo)記法本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了利用簡單重復(fù)序列(simplesequencerepeats,SSR)分子標(biāo)記進(jìn)實性和純度檢測的術(shù)語和定義、原理、儀器設(shè)備、試劑及溶液配制、引物、樣品準(zhǔn)本標(biāo)準(zhǔn)適用于基于SSR分子標(biāo)記的棉花雜交種真實性和下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注明日期的引用文件,僅文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本GB/T3543.2農(nóng)作物種子檢驗規(guī)程扦樣GB/T3543.4農(nóng)作物種子檢驗規(guī)程是指由幾個核苷酸(一般為2~6個)為重復(fù)單元的多達(dá)幾十至幾百次的串聯(lián)重復(fù)重復(fù)次數(shù)的不同,進(jìn)而形成SSR座位的多態(tài)性,根據(jù)SSR座位兩側(cè)保守的單拷貝序列設(shè)計2指品種DNA鑒定優(yōu)先選用的一套SSR引物,具有多態(tài)性高、重復(fù)性好等綜合特性,可用于品種DNA得樣品單株的SSR電泳帶型。將受檢樣品與標(biāo)準(zhǔn)樣品的帶型進(jìn)行差異比較和分析,通過棉花雜交種5儀器設(shè)備、試劑及溶液配制、引物儀器設(shè)備見附錄Ⅰ,試劑及溶液配制見附錄Ⅱ,引物相關(guān)信息見附錄Ⅲ。GB/T3543.2的規(guī)定執(zhí)行,種子發(fā)芽按GB/T35),DNA提取、PCR擴(kuò)增、PCR產(chǎn)物檢測具體試驗操作步驟見附錄I在36對核心引物中,按照染色體隨機選擇26對引物進(jìn)行擴(kuò)增,比較受檢樣品和標(biāo)準(zhǔn)樣品在每8.1.2某核心引物在受檢樣品和標(biāo)準(zhǔn)樣品間擴(kuò)增出的條帶不完全一致,當(dāng)表現(xiàn)異類型的單株數(shù)≤28.1.3某核心引物在受檢樣品和標(biāo)準(zhǔn)樣品間擴(kuò)增出的條帶不完全一致,當(dāng)表現(xiàn)異類型的單株數(shù)>239棉花雜交種純度檢測采用品種純度來表示棉花雜交種的純度。利用15對核心引物檢測至少80個受檢樣品,統(tǒng)計每實株;電泳譜帶與標(biāo)準(zhǔn)譜帶不一致的位點數(shù)>24---電泳檢測系統(tǒng):電泳儀、電泳槽及配套的);5););););););m)葡糖糖(C6H12O6);w)過硫酸銨[(NH4)2S2O8];);kPa(121℃)條件下滅菌20min,4℃儲存。6在80mL水中加入16.0g氫氧化鈉,溶B.2.30.5mol/L乙二胺四乙酸二鈉溶液(EDTA—Na2pH8.0)冷卻至室溫,用4mol/L氫氧化鈉溶液調(diào)pH至8滅菌20min,4℃儲存。再分別加入100mL1mol/LTris-Hcl(pH8.0)溶液、10mL0.5mol/LEDTA—Na2(pH8.0)溶液,定容至1000mL。在103.4kPa(121℃)條件下滅菌20min,4℃儲存。0.5mol/LEDTA—Na2(pH8.0)溶液,定容至1000m分別量取5mLTris-Hcl(pH8.0)溶液和1mkPa(121℃)條件下滅菌20min,4℃儲存。B.2.105×三羥甲基氨基甲烷/硼酸電泳緩沖液(7量取680mL水,加入80mL無水乙醇在1000mL水中加入10g氫氧化鈉和5mL甲醛,根據(jù)膠板數(shù)81NAU20832NAU22723NAU22774NAU10715MUCS101AGCCTTCTCTCTCCTTCAG6NAU12697NAU22748AATTTGTCCAGATTCATTCT9NAU1085NAU1369CTATCACCCTTCTCTAGTTNAU3377AAAAGAAAACAGGGTCAAAANAU2190NAU2343NAU5120AGAATGGCATCTGAAGGCGANAU3948GACAGTCATAAACACCATCNAU2026NAU905AAGCAAGGGAGGTAATCCTTNUA1042NAU3519AAGATAAGGAAGTGAAACGTGACAAGCAGGCCAAGAGAACAGAAGGCACGTTGCAAGTGT9),D.1.565℃左右水浴40min(可以延長至幾個小時期間不斷搖晃。利用26對SSR核心引物(見附錄Ⅲ)對標(biāo)準(zhǔn)樣品和受檢樣品DNA進(jìn)行擴(kuò)增。--將玻璃板洗凈后,用去離子水沖洗干凈后晾干。玻璃板徹底干燥后,將其組裝成電泳膠板,灌膠槽內(nèi)(槽內(nèi)加入溶解的1%瓊脂糖溶液)進(jìn)行封底。在50mLH2O中加入30mL30%Acrylamide、20mL5×TBE、80mL酸銨混合后立即灌膠。待膠充滿整個凝膠夾層,然后輕輕的插入梳子。灌膠過程中防止出現(xiàn)氣待膠凝固后,將玻璃板安裝到電泳槽上,在上槽和下槽中分別加入0.5×TBE緩沖液,使凝膠夾層能浸泡在緩沖液中,拔出梳子。每個點樣孔加樣品1.2μL,在160V恒電壓下電泳2h5min。電泳結(jié)束后,小心分開兩塊玻璃板,取下凝膠放入盛有固定液固定:將固定液倒入染膠槽內(nèi),放入凝膠,

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