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SZDB/ZSZDB/Z92—2014生物基因信息數據庫建設與管理規范2014-01-23發布2014-02-01實施深圳市市場監督管理局發布 Ⅱ Ⅲ 1 1 1 4 4 5 5 本國家遺傳學研究所管理的核酸序列數據庫。在我國,雖然生物基因信息數據庫的建設在快速發展,但1對應相同或相似的符號(在核酸中是A、T(或U)、C和G,在蛋白質中是氨基2基因組測序過程中,基于構建文庫獲得的一定大小片段兩端的序列確定一些重疊群之間的順序關將數據以它的語義來呈現出它的外觀,但是隱藏起它的實現細節,用來減少數據的復雜度,使得工3生物數據存儲biologicaldatas直接附加存儲direct-attach在局部區域網絡中配置一臺中央備份服務器,數據全部通過網絡傳輸到本地備份服務器上進行備4存儲區域網無服務器備份storageareanet持續數據保護continuousdataprDNA:脫氧核糖核酸(Deoxyri56.1.2倫理審查委員會的成員組成應涉及多學科和多部門,并且有能力對所有倫理6.5.2數據庫的日常工作包括數據采集、數據分析、數據存儲、數據使用、數據備和對原始數據進行生物信息分析得到的數據。從已有生物基因信息數據庫下載的——第一行是序列標識以及相關的描述信息6GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAA+FASTA序列由標準的IUB/IUPAC核酸代碼表示,如表1所示。FASTA文件每行不應超過80個字符。一個AAACCGCGCAGTTATTTAAAATATGAATATTTTAAAACTTTTCTTTGTTTTTGTGGCAATGTCTCTGGTGTCATGTAGTACAGCCGCTCCAGCAAAAAGCTURYMKSWHBVDN-——第一列為序列的編號,編號的有效字符為大小寫字母(a-z和A-Z)、數字(0-9)和一些特殊7——第六列為得分,是注釋信息可能性的說明,可以是序列相似性比對時的E-value值或基因預測——第八列為起始編碼的位置,僅對注釋類型為“CDS”有效——第九列為序列的屬性,以多個鍵值對組成的注釋信息描述,鍵與值之間用“=”,不同的鍵值1.+.ID=id0;Dbxref=taxon:1032845sy.+.ID=gene0;Name=Rh054_00005;Dbxre.+0ID=cds0;Name=YP_00476371.+.ID=gene1;Name=Rh054_00010;Dbxre在進行數據處理過程中,不同的生物信息分析軟件得到的數據格式各不相同。7.1.2不同數據格式之間可以用特定的軟件進行相互轉換。在數據采集過程中7.1.3在數據采集過程中,應對數據進行嚴格的科學性審查。對于涉及人的基8測序數振 數據過濾b測序數振 數據過濾b拼接與組突變和變異:檢測序列重復性分析突變和變異:檢測序列重復性分析基因預測基因注釋基因組注釋可變剪切和融合基因檢:測注2:序列比對,比較測序序列和參考序列的相似性或不相似性,尋找核苷酸的連續產生模式,找出基因序列中的注6:基因組注釋,利用生物信息學方法和工具,對基因組所有基因的生物學功能進行注釋,包括序列的重復性分97.4.1應按存儲文件的用戶分組和重要性設置相應的使用權限。文件的用戶分rwx 7.4.2應由數據庫管理機構任命系統管隸屬于數據庫管理機構,具有存儲系統最高管理權限,負責存儲系7.4.3除管理員賬戶外,一般賬戶通過向一般管理員提供申請表獲得。賬號申7.5.3數據備份應填寫數據備份申請表。數據申請表應包括備份的內容描述、7.5.4數據備份過程中,應為文件和文件夾創建備份標記,備份時只需選中那7.7.1.2數據庫中各種對象的命名和程序代碼的編寫應規范,數據庫應用系統7.7.1.4根據計算機硬件和網絡設計確定情況對數據庫進行邏輯設計和物理設計,根據應用系統的事物大小和服務器的性能調整數據庫服務器的系統參數,選擇合適的數據類型,盡可能使數據庫性能達到

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