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文檔簡介
第R語言學習VennDiagram包繪制韋恩圖示例目錄引言一需要安裝和導入的包二使用函數及參數三知道各個數據集的個數以及重疊(交叉)的個數2.1兩個已知數據集的韋恩圖2.2三個已知數據集的韋恩圖四根據數據集合繪制韋恩圖4.1四個數據集合4.2五個數據集合
引言
本版塊會持續分享一些常用的結果展示的圖形。
在得到數據之后,我們經常會用到維恩圖來展示各個數據集之間的重疊關系。本文簡單的介紹R語言中的VennDiagram包繪制數據集的維恩圖。
一需要安裝和導入的包
install.packages("VennDiagram")
library(grid)
library(VennDiagram)
二使用函數及參數
所有參數說明點擊下載
可以看到參數有很多,不用擔心,下文的例子會給出常用的調整參數以及說明。
三知道各個數據集的個數以及重疊(交叉)的個數
2.1兩個已知數據集的韋恩圖
#圓的大小不會根據數據量多少改變
venn.plot-draw.pairwise.venn(80,30,10,c("First","Second"),scaled=FALSE)
grid.draw(venn.plot)
venn.plot-draw.pairwise.venn(80,30,10,c(First,Second))
grid.draw(venn.plot)
venn.plot-draw.pairwise.venn(area1=80,#區域1的數
area2=30,#區域2的數
cross.area=2,#重疊的個數
category=c("First","Second"),#分類命名
fill=c("blue","red"),#12區域分別的填充顏色
lty="blank",#12區域的邊框線類型
cex=2,#12區域內部數字的字體大小
cat.cex=2,#分類名稱的字體大小
cat.dist=0.09,#分類名稱距離邊的距離實際調整
cat.just=list(c(-1,-1),c(1,1)),#分類名稱的位置,圈內或者圈外
ext.pos=30,#線的角度默認是正上方12點位置
ext.dist=-0.05,#外部線的距離跟根據圓圈的大小適當調整
ext.length=0.85,#外部線長度
ext.line.lwd=2,#外部線的寬度
ext.line.lty="dashed")#外部線為虛線);
grid.draw(venn.plot)
2.2三個已知數據集的韋恩圖
venn.plot-draw.triple.venn(area1=80,area2=70,area3=50,n12=38,n23=18,n13=28,n123=8,category=c("First","Second","Third"),fill=c("blue","red","green"),lty="blank",cex=2,cat.cex=2,cat.col=c("blue","red","green"))
grid.draw(venn.plot)
四根據數據集合繪制韋恩圖
4.1四個數據集合
A-sample(1:1000,500,replace=FALSE);
B-sample(1:1000,600,replace=FALSE);
C-sample(1:1000,700,replace=FALSE);
D-sample(1:1000,800,replace=FALSE);
E-sample(1:1000,900,replace=FALSE);
venn.plot-venn.diagram(#數據列表
x=list(A=A,B=B,C=C,D=D),
filename="Venn_4set.tiff",#保存路徑
col="transparent",#指定圖形的圓周邊緣顏色transparent透明
fill=c("blue","green","yellow","grey50"),#填充顏色
alpha=0.50,#透明度
label.col=c("orange","white","grey50","white","white","white","white","white","darkblue","white","white","white","white","darkgreen","white"),
cex=1.2,#每個區域label名稱的大小
cat.col=c("darkblue","darkgreen","orange","grey50"),#分類顏色
cat.cex=1.2,#每個分類名稱大小
cat.dist=0.07,
cat.pos=0,#
cat.fontfamily="serif",#分類字體
rotation.degree=270,#旋轉角度
margin=0.2)
4.2五個數據集合
venn.plot-venn.diagram(
x=list(A=A,B=B,C=C,D=D,E=E),
filename="Venn_5set.tiff",
col="black",
fill=c("dodgerblue","goldenrod1","darkorange1","seagreen3","orchid3"),
alpha=0.50,
cat.col=c("darkblue","darkgreen","orange","grey50","purple"),
cat.cex=1.5,
cat.fontface="bold",
margin=0.05);
VennDiagram函數包最大能繪制5個數據
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