南開大學

今各微皮物學與技術教育郎童點實驗宦

2009年度工作報告

2010年1月

目錄

一、基本信息................................................1

二、研究方向、內容.........................................1

1微生物功能基因組學與進化..............................1

2分子病毒學與免疫......................................1

3應用微生物學與技術....................................2

三、承擔課題...............................................2

四、人員組成...............................................3

五、發表論文...............................................14

六、出版著作...............................................16

七、專利成果...............................................16

八、獲獎情況...............................................17

九、研究工作和水平........................................18

十、學術交流..............................................36

1主辦或參加國內外學術會議.............................31

2邀請專家來訪或接受邀請出訪..........................32

H■＞儀器設備............................................36

十二、存在的問題，下一年發展思路.........................40

附件......................................................41

一、實驗室基本信息

1.實驗室中英文名稱：

中文名稱：分子微生物學與技術教育部重點實驗室

英文名稱：KeyLaboratoryofMolecularMicrobiologyandTechnology,

MinistryofEducation

2.學科領域：分子微生物學與技術

3.研究類別：應用基礎研究

4.建設承擔單位：南開大學

單位負責人：饒子和

5.建設地點：南開大學泰達生物技術學院，天津經濟技術開發區宏達街23號1區

南開大學生命科學學院，天津市南開區衛津路94號

二、實驗室研究方向、內容

南開大學分子微生物學與技術教育部重點實驗室以分子微生物學與技術領域重

大問題為研究內容，研究方向及具體研究內容為：

1.微生物功能基因組學與進化

在完成全基因組或部分基因組破譯和分析的基礎上，全面采用蛋白組學、代謝組

學、系統生物學等現代組學的研究方法對重要病原微生物（大腸桿菌、志賀氏菌、沙

門氏菌、霍亂弧菌等）和重要工業微生物（石油微生物、殺蟲微生物、工業真菌、極

端微生物等）進行深入系統的研究，探索微生物學重大基礎理論問題；重點研究嗜熱

采油微生物的重要功能基因、油藏微生物的群落結構及功能菌群協同作用、枯草芽泡

桿菌核黃素代謝網絡及大腸桿菌琥珀酸代謝網絡、重要病原微生物的致病和進化機

理、進化基因組學、微生物糖組學和重要病原微生物檢測用分子標識等重大課題。

2.分子病毒學與免疫

結合國家重大傳染病預防與控制的戰略目標，重點研究人類免疫缺陷病毒

（HIV）、人類皰疹病毒（HSV2和HHV8）和禽流感病毒的復制及致病機理、宿主

抗病毒免疫及病毒與宿主之間的相互關系，揭示其作用規律，研發病毒疫苗和基因

治療載體。主要研究病毒/宿主相互作用及病毒超感染對HIV致病性的影響、分析

人類皰疹病毒與宿主免疫應答的關系、探索禽流感病毒對宿主免疫應答影響的機

理；構建人/動物嵌合免疫缺陷病毒并建立相應的模型；設計和構建新型HIV疫苗

及基因治療載體等內容。

3.應用微生物學與技術

充分發揮南開大學在現代真菌學、資源細菌學和微生物催化等研究領域的優

勢，對醫藥微生物、農業微生物、工業微生物、能源微生物及環境微生物等應用領

域的重大技術問題進行研究，建立微生物生物活性物質篩選、提取和分離的模型及

技術體系；構建高表達、高性能、新用途的基因工程菌株，建立相關的高效生物催

化與生物轉化技術體系；實現生物物質轉化過程的模擬、優化、放大與技術集成；

解決技術應用過程的瓶頸問題。

三、實驗室承擔課題

2009年由我實驗室承擔的科研課題共77項，縱向課題68項，其中包括新增

課題14項、延續課題36項、完成課題27項。

新增課題（14項）包括：

863項目1項

973項目1項

“十一五”國家重大科學研究計劃1項

國家自然科學基金重點、面上項目5項

教育部科研項目1項

天津市重點、攻關、基金項目2項

橫向合作項目1項

學校及其他部門項目2項

延續課題（36項）包括：

863項目6項

973項目6項

“十一五”國家重大科學研究計劃6項

國家自然科學基金重點、面上項目7項

教育部科研項目4項

天津市重點、攻關、基金項目5項

橫向合作項目1項

國際合作項目1項

完成課題（27項）包括：

863項目2項

“十一五”國家重大科學研究計劃1項

國家自然科學基金重點、面上項目7項

教育部科研項目2項

天津市重點、攻關、基金項目6項

橫向合作項目7項

國際合作項目2項

四、實驗室人員組成

2009年實驗室有固定人員33名，其中研究人員25名，含教授（博導）12名，

副教授9名；固定研究人員中，45歲（含45歲）以下的正、副教授14名，22位

中青年高級研究人員在國、內外獲得博士學位，8位實驗室實驗及管理人員全部為

碩士以上學位。

實驗室主任

王磊教授

各研究方向學術帶頭人

微生物功能基因組學與進化王磊教授

馮露教授

分子病毒學與免疫耿運琪教授

王金忠教授

應用微生物學與技術喬明強教授

劉方教授

白鋼教授

朱旭東教授

杰出人才

長江學者獎勵計劃特聘教授：

-王磊教授（2002年）

-馮露教授（2009年）

杰出青年科學基金獲得者：

-王磊教授（2002年）

-馮露教授（2007年）

新世紀百千萬人才國家級人選:

-王磊教授（2006年）

教育部跨世紀優秀人才支持計劃:

-王磊教授（2001年）

教育部新世紀優秀人才支持計劃:

-曹又佳教授（2004年）

-朱旭東教授（2005年）

-馮露教授（2005年）

-喬明強教授（2006年）

-白鋼教授（2007年）

科技創新人才獎獲得者

-王磊教授（2007年）

談家楨生命科學創新獎獲得者

-王磊教授（2009年）

南開大學校級教學名師

-劉方教授（2007年）

全國模范教師

-王磊教授（2009年）

實驗室學術委員會

主任：

鄧子新——中國科學院院士，上海交通大學生命科學技術學院院長

副主任：

趙國屏——中國科學院院士，國家人類基因組南方研究中心執行主任

耿運琪——南開大學微生物功能基因組與檢測技術教育部工程研究中心主

任，教育部科學技術委員會委員

委員：（以姓氏拼音字母為序）

黃力——微生物資源前期開發國家重點實驗室主任

金奇——中國醫學科學院病原生物學研究所所長，病毒基因工程國家重

點實驗室常務副主任

饒子和——中國科學院院士，南開大學校長

王磊——南開大學泰達生物技術學院院長，分子微生物學與技術教育部

重點實驗室主任，微生物功能基因組學天津市重點實驗室主任,

吳建國——武漢大學病毒學國家重點實驗室主任

徐建國——中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所所長，傳染病預防控

制國家重點實驗室主任

閆章才——國家自然科學基金委員會，處長

趙進東——中國科學院院士，中國科學院水生生物研究所常務副所長

秘書：

曹勃陽——泰達生物技術學院副教授，博士

表1實驗室主要成員

重點實驗室成員

方向

姓名性別年齡學位專業從事主要工作

王磊男47博士微生物學功能基因組與進化

生

微馮露女46博士微生物學功能基因組

功

物曹勃陽女43博士微生物學功能基因組

基

能

周大煒女42博士分析化學功能基因組

組

因

學

與馮云女38碩士生物信息學生物信息學

進

化王威男31博士微生物學功能基因組

劉斌男29博士微生物學功能基因組

王荃女29博士微生物學功能基因組

王敏女30博士微生物學功能基因組

耿運琪男61一分子病毒學病毒學研究

分子曹又佳女45博士生物化學分子病毒與免疫學

病毒王金忠男40博士分子病毒學病毒學研究

學與王穎女38博士微生物學功能基因組

免疫喬文濤女40博士分子病毒學病毒學研究

李悅女27博士微生物學分子病毒學

喬明強男46博士微生物學現代真菌學

劉方女50博士微生物真菌產物研究

白鋼男42博士微生物微生物藥物學

應用

朱旭東男45博士分子真菌學致病真菌的分子機理

微生高分子聚合物的

宋存江男48博士生命環境科學

物學微生物合成與降解

與技李明春女41博士微生物學真菌分子生物學

陳月華女55—微生物學資源細菌學

術

蔡峻男38博士微生物學資源細菌學

馬挺男33博士微生物學資源細菌學

徐海津男博士微生物學現代真菌學

尹春燕女48碩士管理

褚佳強男33碩士管理

管理

張曉女23碩士管理

丁鵬男28碩士管理

續表1

郭璽男30碩士實驗大型儀器維護

吳俊麗女30碩士實驗大型儀器維護

實驗

徐艷麗女30碩士實驗大型儀器維護

劉粉霞女31碩士實驗大型儀器維護

客座研究人員

邵一鳴：47周歲，中國疾病預防控制中心性病艾滋病預防控制中心首席專

1家，病毒與免疫研究室主任。南開大學陳省身講席教授；國家杰出青年基

金獲得者；2002年衛生部突出貢獻中青年專家

DavidGutnick：以色列特拉維夫大學生命科學學院資深教授。微生物學權

2

威學術期刊FemsReview的主編

3黃顯宗：臺灣東吳大學微生物系教授，曾任東吳大學理學院院長

侯少斌：資深研究員，美國DepartmentofMicrobiology,Collegeof

4

NaturalSciences,UniversityofHawai?i

何斌：46周歲，南開大學特聘講座教授，AssociateProfessor,Department

ofmicrobiology,UniversityofIllinoisatChicago.,Chicago,IL,

5

USA,南開大學生命科學學院兼職教授、博士生導師，中國病毒雜志編委。

研究領域為腫瘤病毒學

6張宏方：男，陜西中醫學院教授，研究方向為中藥免疫學

MaqsudulAlam：美國夏威夷大學微生物學系教授，兼馬來西亞科技大學化

7

學生物學中心主任

8YuriyA.Knirel:俄羅斯有機化學研究所教授

9林敏：研究員，中國農科院生物技術研究所所長，研究方向為環境微生物

10唐兵：41周歲，教授，武漢大學生命科學學院微生物系主任

梁臣：男，加拿大McGill大學副教授，研究方向為內科醫學、微生物學及

11

免疫科學

劉震乾：男，堪薩斯大學醫學中心教授，長期致力于AIDS致病機制、疫苗

12

研究和嵌合病毒研究(SHIV)

實驗室博士、碩士研究生

博士后博士生碩士生共計

年度出站在讀畢業在讀畢業在讀畢業在讀

（人）（人）（人）（人）（人）（人）（人）（人）

2009年141155228534144

博士后5人

出站：李國強

在讀：湯宇譚國民姜民楊超

博士生66人

畢業：黃海東陶劍王春玲袁芳宋敏王敏劉雪倩劉暢李悅

劉力宣成昊

在讀：姚宏明靳永新王雪茄牛寶龍王澤方李瑞青高衛華劉沐之趙玲俠

曹名鋒郭文斌江筠王常榮李寧劉峰牛宏江陳芝慧張聃

李鵬云曲麗媛朱宏飛周哲敏李艷霞胡波李洋周光朋李丹

任巖李曉敏郭丹董雙鵬劉宇李萍李芳芳孫亞民倪志偉

蔣玲艷段志峰劉曉輝吳亞峰王健蘇揚姚雪常銳許豐雯

李志杰郭紅彥楊煒李轉賈瑞肖亮劉東謝池楚軒轅錚錚

碩士生107人

畢業：馮樹人劉學釗張海州呂晶華趙玲俠胡丹劉娜謝成君朱之燕

康海蔚吳興武張靜姚英劉彬張天政王遠根韓洪起拜曉勃

李健韓苗苗王蘇日古嘎

在讀：黃渝健李^」」牟銳米曉媛劉力偉代森劉全力王丹丹姜德州

蘇俊杰袁宇高媛媛申應德賈晶月梁凱強劉云李召雨高配科

司鳳斌李丹萍曹美娜紀凱華齊義濱孫村民王聰蘇文平孫秀梅

李保賓耿偉濤李強解慧王媛媛田春雨楊Yi/'i魏冬梅張煥新

楊斌李榮榮王晶晶閆江錢云云文留青姚芳芳蔣貝朱淵

王海艷阮曉娟韓艷芳劉昭何欣劉衍偉楊志豪周加利王曉婷

張永富李冠男陳苗竇巖李昆馬星鮑會靜石孝勇劉昭

李偉偉裴秀芝劉岳琪張敏郭婷婷蓋園明張其程劉瑞康李欣

許璇徐丹杜建森高楊王明曉王榮敏馬慶林許鑫那鐵軍

劉傳賈海云

五、發表論文

2009年實驗室共發表論文53篇，其中SCI收錄論文35篇，論文總影響因子為

72.378,見表2。

表22009年發表論文一覽表

序刊物及出版年、卷、類別（SCI,

論文或專著名稱作者

號社名稱期、頁影響因子）

國內、外刊物

JiePan,JinWang,Zhengfu

Zhou,YongliangYan,Wei

IrrE,aGlobalRegulatorof

Zhang,WeiLu,Shuzhen

ExtremeRadiationResistance

Ping,QilinDai,Menglong2009

inDeinococcusradiodurans,

1Yuan,BinFeng,XiaoguangPLoSONE4(2),

EnhancesSaltTolerancein

Hou,YingZhang,Ruiqiang,e4422

EscherichiacoliandBrassica

Ma,TingtingLiu,LuFeng,

napus

LeiWang,MingChen*,and

MinLin*

ZheminZhou,XiaominLi,

DerivationofEscherichiacoliBinLiu,LotharBeutin,

2009

2O157:H7fromitsO55:H7JianguoXu,YanRen,PLoSONE

Accepted

PrecursorLuFeng,RuitingLan,Peter

R.Reeves,LeiWang*

Dephosphorylationof

VerpootenD,FengZ,

eIF2{alpha}Mediatedbythe2009Dec.

Valyi-NagyT,MaY,JinH,

3{gamma)134.5ProteinofJVirol.p.12626-5.308

YanZ,ZhangC,CaoY,

HerpesSimplexVirus112630

HeB.

FacilitatesViralNeuroinvasion.

Thegamma134.5proteinof

JinH,MaY,PrabhakarBS,2009

herpessimplexvirus1is

FengZ,Valyi-NagyT,YanMay;83

4requiredtointerferewithJVirol.5.308

Z,VerpootenD,ZhangC,(10):4984-

dendriticcellmaturationduring

CaoY,HeB.4994.

productiveinfection.

續表2

FanYang,Yu-PingXu,Jian

Li,Su-SuDuan,Ying-JieFu,

YunZhang,YanZhao,The

CloningandcharacterizationofWen-TaoQiao,Qi-MinInternational2009,

anovelintracellularproteinChen,Yun-QiGeng,Journalof41(11):

54.009

p48.2thatnegativelyregulatesChang-YanChe,Ying-LiBiochemistry2240-

cellcycleprogressionCao,YingWang,LeiZhang,andCell2250

LinLong,JieHe,Quan-CaiBiology

Cui,Shu-ChangChen,

Shu-HuiWang,LiLiu.

DetectionofEnterobacter

Journalof

sakazctkiiandotherpathogensMinWang,BoyangCao,2009,

Clinical

6associatedwithpowderedQiliGao,YaminSun,Pei47(10):3.945

Mircohiolog

infantformulausingaDNALiu,LuFeng,LeiWang*3178-84

microarrayy

GenomicSequencingReveals

ThomasFerenci,Zhemin

RegulatoryMutationsand2009,

Zhou,ThuBetterdge,YanJournalof

7RecombinationalEventsinthe191(12):3.636

Ren,YuLiu,LuFeng,PeterBacteriology

WidelyUsedMC4100Lineage4025-4029

R.Reeves,andLeiWang*

ofEscherichiacoliK12

CLPinducesapoptosisinhuman

Wang,C.L.,Ng,T.B.,X.H.

leukemiaK562cellsthroughCa2+2009,276:

8Cao,Y.Jiang,Liu,Z.K.,CancerLetter3.398

regulatingextracellular-related221-227

T.Y.WenandLiu,F

proteinkinaseERKactivation.,

Metaboliccontrolanalysisof2009,

HuaiL,ChenN,YangW,Biochemistry

9L-cysteineproducingstrain74⑶：3.379

BaiG(Mose)

TS1138ofPseudomonassp.288-922

Twonovelmetal-independent

XueqianLiu,YanpengDong,2009,

long-chainalkylalcohol

10JingZhang,AixiangZhang,Microbiology155(pt6)2.841

dehydrogenasesfromGeobacillus

LeiWang,LuFeng*2078-85

thermodenitrificansNG80-2

CandidaalbicansFerricreductaseYongLiang,LeiGui,

FRP1wasregulatedbyinteractionDong-shengWei,WenFEMSYeast2009,

112.812

directlywithtranscriptionfactorZheng,LaijunXing,Research.9:270-277

RimlOlp.Ming-chunLi

AnovelDPP-IV-resistant

analogofglucagon-like2009,

GaoZ,TangY,ChenJ,Bai

peptide-1(GLP-1):KGLP-130(10):

12R,ZhangQ,HouY,LuY,Peptides2.565

aloneorincombinationwith1874-

BaiG

long-actingPLGA1881

microspheres.

續表2

ZhenzhouWu,Zhengzheng

Xuanyuan,RuiqingLi,

Mutranspositioncomplex

DezhouJiang,ChangLi,Journalof

mutagenesisinLactococcuslactis2009,106

13HaijinXu,YanlingBai,Applied2.501

-identificationofgenesaffecting(1):41-48

XiumingZhang,HilkkaMicrobiology

nisinproduction

Turakainen,PerSaris,Harri

Savilahti,MingqiangQiao

Sphingomonassanxanigenenssp.HuangHD,WangW,MaT,IntJSysEvol2009,59:

142.384

nov.,isolatedfromsoilLiGQ,LiangFL,LiuRLMicrobiol719?723

Thermalpropertiesand

degradabilityofpoly(propylene

JianTao,CunjiangSong,Polymer

carbonate)/poly94(2009)

15MingfengCao,DanHu,LiDegradation2.32

(b-hydroxybutyrate-co-b-hydro575-583

Liu,NaLiu,ShufangWangandStability

xyvalcrate)(PPC/PHBV)

blends

YayueLi,BoyangCao,Bin

Moleculardetectionofall34Liu,DanLiu,QiliGao,XiaJournalof2009

16distinctO-antigenformsofPeng,JunliWu,DavidA.Medical58(1):2.19

ShigellaBastin,LuFengandMicrobiology69-81

LeiWang*

BoyangCao,MinWang,Lei

16S-23SrDNAinternalJournalof2009,

Liu,ZhcminZhou,Shaoping

17transcribedspacerregionsinMicrobiologic77(1):2.000

Wen,AntoniRozalski,

fourProteusspeciesalMethods109-118

LeiWang*

AndreiV.Perepelov,DanLi,

BinLiu,Sof'yaN.

FEMS

StructuralandgeneticSenchenkova,2009,

Immunology

18characterizationofEscherichiaDanGuo,SergeiD.Shevelev,57(1):1.972

andMedical

coli099antigenAlexanderS.Shashkov,80-87

Microbiology

XiGuo,LuFeng,YuriyA.

Knirel,LeiWang*

QuanWang,AndreiV.FEMS

Geneticandstructuralanalyses2009

Perepelov,LuFeng,YuriyImmunology

19ofEscherichiacoli0107and55(1),1.972

A.Knirel,YangLi,andMedical

0117O-antigens47-54

LeiWang*Microbiology

續表2

AndreiV.Perepelova*,

X^acheslavL.L'vov,Bin

AsimilarityintheO-acetylation

Liu,SofyaN.Senchenkova,2009,

patternoftheO-antigensofCarbohydrate

20MariyaE.Shekht,Alexander34⑸1.96

Shigellaflexneritypes1a,lb,Research

S.Shashkov,LuFeng,Petr687-692

and2a

G.Aparin,LeiWang,and

YuriyA.Knirel

AndreiV.Perepelova,

X^acheslavL.Uvov,Bin

Anewethanolamine

Liu,SofyaN.Senchenkova,2009

phosphate-containingvariantofCarbohydrate

21MariyaE.Shekht,Alexander344(12)1.96

theO-antigenofResearch

S.Shashkov,LuFeng,Petr1588-91

Shigellaflexneritype4a

G.Aparin,LeiWang,and

YuriyA.Knirel

AnalysisofGuoY,Rumschlag-BoomsE,

hemagglutinin-mediatedentryWangJ,XiaoH,YuJ,Wang2009Apr

22VirolJ.1.882

tropismofH5N1avianJ,GuoL,GaoGF,CaoY,2;6:39.

influenza.CaffreyM,RongL.

Theeffectofantioxidant

componentsfromroseEnvironmenta

Jiang,Y,Wong,J.H.,Z.F.Pi,

(Rosarogusa)flowersonIToxicology2009,

T.B.Ng,Wang,C.R.,Hou,J,

23catalyticactivityandand27:1.7

Chen,R.R.,Niu,H.J.and

mRNAexpressionofPhannacolog396-401.

F.Liu

antioxidantenzymesiny

erythrocyte.

Identificationofanti-asthmatic

ShiQ,LiuZ,YangY,GengActa2009,

compoundsinPericarpiumcitri

24P,ZhuYY,ZhangQ,BaiF,Pharmacol30(5):1.676

reticulataeandevaluationof

BaiGSin567-575

theirsynergisticeffects

Generationandapplicationof

polyclonalantibodyagainst

YQin,ZLiu,TZhang,

25replicationandtranscriptionSpringer20091.670

YWang,XLi,JWang

activatorofKaposi's

sarcoma-associatedherpesvirus

Development,characterization,

andevaluationofafusion

Biosci2009,

proteinofanovelglucagon-likeGaoZ,BaiG,ChenJ,Zhang

26Biotechnol73(3):1.39

peptide-1(GLP-1)analogandQ,PanP,BaiF,GengP.

Biochetn688-694.

humanserumalbumininPichia

pastoris

續表2

HongkaiZhang,XinLi,

Metastaticcelldetectionusinga

YunpengBai,RuifangNiu,Biotechnol.2009,

phagepeptidemodifiedlight

27YunfangJia,CuizhuZhang,Appl.53,1.288

addressablepotentiometric

LinZhang,XizengFengandBiochem.185-192.

sensor.

YoujiaCao