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文檔簡介
PUBMED
一、MedLine數據庫簡介Medline數據庫是當前國際上公認最權威的生物醫學數據庫。是當前檢索外文文獻使用頻率最高的數據庫。版權歸美國國立醫學圖書館期刊收錄:1966年70多個國家和地區,37種語言,近5600種期刊外文數據庫檢索數據庫類型為題錄型數據庫,其內容有印刷型檢索工具IndexMedicus(美國醫學索引,IM)、IndextoDentalLiterature(牙科文獻索引)、InternationalNursingIndex(國際護理學索引)。大部分為英語語種的文獻,91%,文獻來源以美國為主,45%,53%帶有英文文摘,覆蓋基礎醫學,臨床醫學,護理學,口腔,衛生保健等一、MedLine數據庫簡介Medline數據庫按照提供服務的方式,共有三種服務形式:1、Medline數據庫國際聯機檢索2、MedlineCD-ROM3、基于WWW的因特網查詢系統PubMed
二、MedLine數據庫服務形式Medline數據庫國際聯機檢索是最早期的服務方式。用戶終端通過電話線連接美國國立醫學圖書館Medline數據庫的主機直接進行檢索。檢索費用高。二、MedLine數據庫使用形式MedLineCD-ROM
出版商將數據庫制成光盤,然后郵寄給用戶。不同出版商的數據庫檢索界面略有不同,我國主要引進Ovid(原SilverPlatter)公司產品。檢索界面與CBMdisc類似。二、MedLine數據庫使用形式PubMed(=Public+Medicine)
是美國家醫學圖書館(NLM)下屬的國家生物技術信息中心(NCBI)開發的、基于WWW的因特網檢索系統PubMed。包括MEDLINE和PREMEDLINE的完整內容,部分被MEDLINE認為超出范圍的文章和雜志。PubMed是比MEDLINE的更大的集合。是生物醫學領域最重要最權威的二次文獻數據庫二、MedLine數據庫使用形式
PubMedPubMed檢索系統由隸屬于美國國立醫學圖書館(NLM)的國家生物信息中心(NCBI)于1997年推出的基于Internet的免費生物醫學文獻檢索系統,是檢索生物醫學期刊論文的重要工具,可免費檢索MEDLINE、PREMEDLINE,部分記錄還可鏈接到全文。網址:/pubmed/;PubMed是檢索外文醫藥文獻最主要的題錄數據庫。約5%的文獻免費獲取全文。PUBMED數據類型:期刊論文、綜述、以及與其他數據資源鏈接。特點:免費提供題錄和文摘提供與原文的網址鏈接(部分免費獲取5%)提供檢索詞自動轉換匹配操作簡便、快捷PUBMED數據庫特點收錄范圍廣:MEDLINE收錄的部分生命科學相關文章的非醫學專業期刊(物理、天文、化學等)收錄記錄新:在MEDLINE數據標引前的最新題錄文獻類型全:提供電子原文鏈接(部分免費)PubMed與MEDLINE的區別PubMed主頁檢索框檢索工具使用說明PUBMED數據來源PubMed中的數據來源于以下四個部分:(1)MedlinePubMed的主體部分,記錄末尾標有[PubMed-indexedforMedLine]。(2)PreMedline臨時性的醫學數據庫,收錄最新出版的文獻,縮短文獻報道時差。PreMedline中的記錄每天有進有出,新進的記錄標有[PubMed-inprocess],標引好主題詞和文獻類型等字段的記錄轉入Medline。PubMed數據來源3)PublisherSuppliedCitations是出版商直接向PubMed遞送的電子文獻,記錄標記:[PubMed-assuppliedbypublisher]。(4)OldMEDLINE目前含有1951-1965年的150多萬條題錄,不含有摘要,保持舊版MeSH詞表的標引。記錄標記:[PubMed-OLDMEDLINE]。
PubMed數據來源
數據來源PubMed中的數據來源于以下四個部分:(1)MedlinePubMed的主體部分,記錄末尾標有[PubMed-indexedforMedLine]。(2)PreMedline臨時性的醫學數據庫,收錄最新出版的文獻,縮短文獻報道時差。PreMedline中的記錄每天有進有出,新進的記錄標有[PubMed-inprocess],標引好主題詞和文獻類型等字段的記錄轉入Medline。PubMed數據來源
4種數據來源中,只有第(1)和第(4)來源的記錄標引了MeSH詞,因此當用主題詞檢索時可檢索出來,而第(2)和第(3)來源的記錄則未做MeSH詞標引(是最新和最近發表的文獻),因此用主題詞檢索時不能檢索到。PubMed數據來源
PMIDPubMed中的每條記錄都有一個唯一的識別號,即PMID(PubMedUniqueIdentifier)號,用PMID號快速檢索到該ID號對應的文獻。Epubaheadofprint如果期刊是SCI收錄的,以后就能查到(SCIE收錄的則未必)但是要想在WebofScience(SCI)上查到,必須等到,正式出版后,有了期卷號、出版頁碼等信息后,才有可能WebofScience查到.電子出版物PubMed主頁面分為3部分檢索區主要功能區輔助功能區二、PubMed主頁簡介檢索區主要功能區輔助功能區檢索區位于主頁上方,通過點擊數據庫欄列表中PubMed旁邊的下拉菜單,根據實際檢索需要可以更改數據庫主要用來檢索的數據庫有:alldatabase、PubMed、Protein、Nucleotide、GSS、EST、Structure、Genome等),高級檢索(Advanced),點擊Help可查看檢索幫助,在檢索式輸入框中輸入檢索式,點擊“Search”按鈕,可執行檢索操作。二、PubMed主頁簡介2.主要功能區:
包括UsingPubMed、PubMedTools和MoreResources三部分。
1)UsingPubMed
主要介紹如何使用PubMed,分為PubMedQuickStartGuide、FullTextArticles、PubMedFAQs、PubMedTutorials和NewandNoteworthy共5個部分。其中:
PubMedQuickStartGuide:介紹如何快速掌握使用PubMed。
FullTextArticles:
介紹如何獲得電子版全文;
PubMedFAQs:介紹在使用PubMed時的一些常見問題。
PubMedTutorials:詳細介紹PubMed使用指南。
NewandNoteworthy:PubMed未來更新告示。2)PubMedTools包括PubMedMobile、SingleCitationMatcher、BatchCitationMatcher、ClinicalQueries和Topic-SpecificQueries五個部分,其中:PubMedMobile:是PubMed手機版。SingleCitationMatcher和BatchCitationMatcher:為單一/批量引文匹配檢索工具,是用不完整的文獻信息為線索來查特定文獻的工具。ClinicalQueries:可實現將檢索范圍限定為與臨床相關的診斷、治療、病因和預后四個方面。Topic-SpecificQueries:是指按某一特殊主題來檢索文獻。二、PubMedTools
3)MoreResources
包括MeSHDatabase、JournalsinNCBIDatabases、ClinicalTrials、E-Utilities和LinkOut五個部分。其中:MeSHDatabase:是具有檢索功能的MeSH詞表。可實現主題詞檢索方式,即通過主題詞組配副主題詞來檢索文獻。JournalsinNCBIDatabases:供查詢PubMed和Entrez其他數據庫收錄期刊的信息。ClinicalTrials:可瀏覽定期更新的有關政府和私人資助的臨床研究項目信息。E-Utilities:可實現自動化大批量的從Entrez數據庫下載數據。并且提供了幾種常用的程序語言以供選擇,像Perl,Python,Java,和C++等。LinkOut:是指外部資源鏈接。自動詞語匹配。Cookies交互功能:利用Cookies保留檢索史;使用粘貼板保存檢索結果。Web瀏覽器都必須設在啟用Cookies狀態下鏈接點多,部分在網上免費獲得全文原文傳遞服務(二)PubMed檢索特點詞匯自動轉換功能強制檢索功能截詞檢索功能鏈接功能PubMed系統的主要功能在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入檢索詞,系統將按順序使用如下4種索引,對檢索詞進行轉換后再檢索。
(1)MeSH轉換表(MeSHTranslationTable),包括MeSH詞、參見詞、副主題詞等。如果系統在該表中發現了與檢索詞相匹配的詞,就會自動將其轉換為相應的MeSH詞和Textword詞(題名詞和文摘詞)進行檢索。例如:鍵入“Vitaminh",系統將其轉換成"Biotin[MeSHTerms]ORVitaminh[Textword]"后進行檢索。
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詞匯自動轉換功能
刊名轉換表(JournalTanslationTable),包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN號。刊名輸全稱或MEDLINE認可的標準縮寫形式.該轉換表能把鍵入的刊名全稱轉換為MEDLINE縮寫后進行檢索。如:在檢索提問框中鍵入:“newenglandjournalofmedicine",PubMed將其轉換為"NEnglJMed"后進行檢索。
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詞匯自動轉換功能
短語表(Phraselist)。該表中的短語來自MeSH、含有同義詞或不同英文詞匯書寫形式的統一醫學語言系統和補充概念(物質)名稱表。如果PubMed系統在MeSH和刊名轉換表中未發現與檢索詞相匹配的詞,就會查找短語表。
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詞匯自動轉換功能
著者索引(AuthorIndex)。如果鍵入的詞語未在上述各表中找到相匹配的詞,或者鍵入的詞是一個后面跟有1~2個字母的短語,PubMed即查著者索引著者姓名,姓在前,名首字母在后。布爾邏輯運算式:(運算符須大寫)
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詞匯自動轉換功能
PubMed允許使用雙引號(“
”)來強制系統進行短語檢索。例如,在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“Singlecell”,并用雙引號引起來,然后點擊“Go”,系統會將其作為一個不可分割的詞組在數據庫的全部字段中進行檢索。使用雙引號檢索,會自動關閉詞匯轉換功能。強制檢索功能PubMed允許使用“*”號作為通配符進行截詞檢索。如:鍵入“bacter*”,系統會找到那些前一部分是bacter的單詞(如Cia,bacterium,bacteriophage等),并對其分別進行檢索。截詞功能只限于單詞,對詞組無效。如:“infection*”包括“infections”,但不包括“infectioncontrol”等使用截詞功能時,PubMed系統會自動關閉詞匯轉換功能截詞檢索功能Limits(檢索限制選擇)字段限制:著者、刊名、篇名、濾過(filter原文收藏處)等數據輸入時間:默認檢索可回溯到1950年,限制選擇30天-10年7種文獻類型限制7種語種限制12種子文檔:(01年新增2種SpaceLifeSciencesandBioethics)PubMed的輔助檢索鏈接相關文獻。PubMed系統中的每條文獻記錄均有一個相關文獻鏈接,在檢索結果的顯示狀態下,每條記錄的右邊均有“RelatedArticles”超鏈接。點擊該鏈接,系統按文獻的相關度從高到低顯示相關文獻。鏈接功能詞語(主題)檢索著者檢索刊名檢索布爾邏輯檢索日期或日期范圍檢索檢索帶文摘的記錄(四)PubMed檢索方法詞語(主題)檢索主題詞檢索:1)在檢索欄中選擇MeSH數據庫,輸入主題詞進入檢索;2)使用MeSHDatabase。基本檢索:使用檢索欄(數據庫為PubMed)例:查找哮喘的藥物治療(asthma,drugtherapy)查找聞玉梅教授的文獻(Wenym[au])11條主題詞檢索副主題詞主題詞檢索選擇相應主題詞,點開“Sendto”下拉鍵,選擇“seachboxwithand”,“seachboxwithor”
,“seachboxwithnot”注意:在此頁面一定不能點擊“Go”按鈕。查找醛糖還原酶抑制劑(aldosereductaseinhibitor)預防糖尿病腎病(DiabeticKidneyDiseases)的方面文獻。詞語(主題)檢索——基本檢索在提問框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫,格式為:著者姓<空格>名字首字母縮寫,例如wenym.如果在著者姓名前后使用雙引號,并用著者字段標識——[au]加以限定,如“wenym”[au],那么系統只檢索著者字段著者檢索
PubMed記錄字段說明P135-136
文摘第一著者單位地址出版商提供文獻識別號著者群版權說明參
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