中國(guó)知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)對(duì)科技體制機(jī)制改革的探索及影響（1998～2006年）

導(dǎo)讀：1997年12月中國(guó)科學(xué)院向中央提交了《迎接知識(shí)經(jīng)濟(jì)時(shí)代，建設(shè)國(guó)家創(chuàng)新體系》的研究報(bào)告。1998年2月4日，江澤民做出重要批示：“我認(rèn)為可以支持他們搞些試點(diǎn)，先走一步。真正搞出我們自己的創(chuàng)新體系。”1998年6月國(guó)務(wù)院正式批準(zhǔn)中國(guó)科學(xué)院開(kāi)展知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)。實(shí)施知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)以來(lái)，中國(guó)科學(xué)院在明確戰(zhàn)略定位和辦院方針、建立戰(zhàn)略研究體系與機(jī)制，重構(gòu)院宏觀管理組織體系、改革人事管理制度與機(jī)制、改革資源配置和預(yù)算制度、改革科技評(píng)價(jià)和獎(jiǎng)勵(lì)制度、調(diào)整科技布局與組織機(jī)構(gòu)、創(chuàng)新國(guó)內(nèi)外開(kāi)放合作模式等方面采取了一系列重大改革舉措，探索建立了現(xiàn)代科研院所制度，改革創(chuàng)新發(fā)展成效顯著，為科研事業(yè)單位改革提供了豐富的有借鑒意義的經(jīng)驗(yàn)。一引言1997年12月，中國(guó)科學(xué)院向中央提出了《迎接知識(shí)經(jīng)濟(jì)時(shí)代，建設(shè)國(guó)家創(chuàng)新體系》的戰(zhàn)略研究報(bào)告，系統(tǒng)分析了世界知識(shí)經(jīng)濟(jì)發(fā)展態(tài)勢(shì)及其給中國(guó)帶來(lái)的挑戰(zhàn)，提出了建設(shè)面向21世紀(jì)的中國(guó)國(guó)家創(chuàng)新體系的思路與新時(shí)期中國(guó)科學(xué)院的戰(zhàn)略選擇，建議國(guó)家組織實(shí)施“知識(shí)創(chuàng)新工程”。1998年2月4日，江澤民做出重要批示：“知識(shí)經(jīng)濟(jì)、創(chuàng)新意識(shí)對(duì)于我們二十一世紀(jì)的發(fā)展至關(guān)重要。科學(xué)院提出了一些設(shè)想，又有一支隊(duì)伍，我認(rèn)為可以支持他們搞些試點(diǎn)，先走一步。真正搞出我們自己的創(chuàng)新體系。”[1]1998年6月9日，國(guó)家科技教育領(lǐng)導(dǎo)小組第一次會(huì)議審議并原則通過(guò)了中國(guó)科學(xué)院《關(guān)于“知識(shí)創(chuàng)新工程”試點(diǎn)的匯報(bào)提綱》，決定由中國(guó)科學(xué)院作為國(guó)家創(chuàng)新體系建設(shè)的試點(diǎn)，率先啟動(dòng)知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)工作。中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)的總體目標(biāo)是：到2010年前后，把中國(guó)科學(xué)院建設(shè)成為瞄準(zhǔn)國(guó)家戰(zhàn)略目標(biāo)和國(guó)際科技前沿、具有強(qiáng)大和持續(xù)創(chuàng)新能力的國(guó)家自然科學(xué)和高技術(shù)的知識(shí)創(chuàng)新中心；成為具有國(guó)際先進(jìn)水平的科學(xué)研究基地、培養(yǎng)造就高級(jí)科技人才的基地和促進(jìn)中國(guó)高技術(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展的基地；成為有國(guó)際影響的國(guó)家科技知識(shí)庫(kù)、科學(xué)思想庫(kù)和科技人才庫(kù)。試點(diǎn)工作分三個(gè)階段實(shí)施：1998～2000年為啟動(dòng)階段，努力把試點(diǎn)單位建設(shè)成為代表中國(guó)科學(xué)水平的、面向21世紀(jì)的國(guó)家知識(shí)創(chuàng)新基地；2001～2005年為全面推進(jìn)階段，全面展開(kāi)80個(gè)左右研究所的試點(diǎn)工作，形成國(guó)家科研機(jī)構(gòu)新體制和現(xiàn)代科研院所制度；2006～2010年為優(yōu)化完善階段，實(shí)現(xiàn)知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)的總體目標(biāo)，大幅度提高創(chuàng)新能力。2000年12月21日，國(guó)家科教領(lǐng)導(dǎo)小組聽(tīng)取了中國(guó)科學(xué)院?jiǎn)?dòng)階段試點(diǎn)工作的匯報(bào)，審議了《中國(guó)科學(xué)院關(guān)于全面推進(jìn)知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)工作的報(bào)告》，批準(zhǔn)中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)工作自2001年轉(zhuǎn)入全面推進(jìn)階段。2006年發(fā)布的《中國(guó)科學(xué)院中長(zhǎng)期發(fā)展規(guī)劃綱要（2006—2020年）》進(jìn)一步指出：至2010年，大部分研究所成為具有一流的成果、一流的效益、一流的管理、一流的人才的國(guó)家科研團(tuán)體，全院整體實(shí)力進(jìn)入世界同類(lèi)研究機(jī)構(gòu)前5名。至2020年，全院研究機(jī)構(gòu)均達(dá)到“四個(gè)一流”的標(biāo)準(zhǔn)，實(shí)現(xiàn)建設(shè)“三個(gè)基地”的目標(biāo)，整體實(shí)力進(jìn)入世界同類(lèi)研究機(jī)構(gòu)前3名。為了加速推進(jìn)知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)，中國(guó)科學(xué)院直面問(wèn)題，勇于創(chuàng)新，在人事管理制度、資源配置和預(yù)算管理、科技評(píng)價(jià)與獎(jiǎng)勵(lì)制度等方面實(shí)施了一系列重要改革舉措，并且在改革實(shí)踐中不斷調(diào)整完善，對(duì)知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)順利實(shí)施起到了重要的推動(dòng)作用。二實(shí)施知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)的主要舉措1998～2010年，中國(guó)科學(xué)院實(shí)施知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)13年，通過(guò)組織開(kāi)展戰(zhàn)略研究，明確中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略定位，直面發(fā)展面臨的能力不足與科技體制改革難點(diǎn)問(wèn)題，調(diào)整辦院方針，建立戰(zhàn)略研究體系，重構(gòu)以規(guī)劃為核心的中國(guó)科學(xué)院宏觀管理組織體系，深入推進(jìn)人事管理制度與機(jī)制、資源配置和預(yù)算制度、科技評(píng)價(jià)和激勵(lì)制度等改革，調(diào)整科技布局與組織機(jī)構(gòu)，充分發(fā)揮了中國(guó)科學(xué)院在中國(guó)科技發(fā)展和體制機(jī)制改革方面的骨干引領(lǐng)作用和示范帶動(dòng)作用。（一）明確戰(zhàn)略定位和辦院方針1.明晰中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略定位實(shí)施知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)工作面臨的首要問(wèn)題是明確中國(guó)科學(xué)院在國(guó)家創(chuàng)新體系中的戰(zhàn)略定位。中國(guó)科學(xué)院在啟動(dòng)知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)之初，就按照“全球眼光，中國(guó)國(guó)情，著眼當(dāng)前，面向未來(lái)”的指導(dǎo)思想，從深刻認(rèn)識(shí)經(jīng)濟(jì)全球化、知識(shí)經(jīng)濟(jì)和世界科技發(fā)展新態(tài)勢(shì)帶來(lái)的機(jī)遇與挑戰(zhàn)出發(fā)，注重把握當(dāng)代科技、經(jīng)濟(jì)和社會(huì)發(fā)展的客觀規(guī)律，研究世界主要國(guó)家發(fā)展階段與創(chuàng)新體系的歷史演進(jìn)，全面正確地理解國(guó)家創(chuàng)新體系建設(shè)目標(biāo)和國(guó)立科研機(jī)構(gòu)戰(zhàn)略定位，深入分析中國(guó)科學(xué)院實(shí)施知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)的基礎(chǔ)和面臨的問(wèn)題，明確自身作為國(guó)家戰(zhàn)略科技力量的戰(zhàn)略定位，主要從事基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性科技創(chuàng)新，并在此過(guò)程中不斷向社會(huì)輸送人才、傳播知識(shí)和轉(zhuǎn)移技術(shù)，成為國(guó)家知識(shí)創(chuàng)新體系的核心。1999年，江澤民視察知識(shí)創(chuàng)新工程并為中國(guó)科學(xué)院建院50周年題詞，要求中國(guó)科學(xué)院“攀登科學(xué)技術(shù)高峰，為我國(guó)經(jīng)濟(jì)發(fā)展、國(guó)防建設(shè)和社會(huì)進(jìn)步做出基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性、前瞻性的創(chuàng)新貢獻(xiàn)”，進(jìn)一步明確了中國(guó)科學(xué)院的戰(zhàn)略定位。2.調(diào)整中國(guó)科學(xué)院辦院方針中國(guó)科學(xué)院的辦院方針是準(zhǔn)確把握知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)工作方向的需要。在知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)實(shí)踐中，中國(guó)科學(xué)院不斷明晰發(fā)展愿景、使命和目標(biāo)。2002年，中國(guó)科學(xué)院從自身戰(zhàn)略定位出發(fā)，按照“既要保持一定的歷史連續(xù)性，更要把握時(shí)代特點(diǎn)，與時(shí)俱進(jìn)，面向未來(lái)”的思路，將原來(lái)的辦院方針“把主要力量動(dòng)員和組織到為國(guó)民經(jīng)濟(jì)和社會(huì)發(fā)展服務(wù)的主戰(zhàn)場(chǎng)，同時(shí)保持一支精干力量從事基礎(chǔ)研究和高技術(shù)創(chuàng)新”調(diào)整為“面向國(guó)家戰(zhàn)略需求，面向世界科學(xué)前沿，加強(qiáng)原始科學(xué)創(chuàng)新，加強(qiáng)關(guān)鍵技術(shù)創(chuàng)新與系統(tǒng)集成，攀登世界科技高峰，為我國(guó)經(jīng)濟(jì)建設(shè)、國(guó)家安全和社會(huì)可持續(xù)發(fā)展不斷做出基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性、前瞻性的重大創(chuàng)新貢獻(xiàn)”。調(diào)整后的辦院方針體現(xiàn)了國(guó)家對(duì)中國(guó)科學(xué)院的戰(zhàn)略定位，不僅要服務(wù)于國(guó)家經(jīng)濟(jì)社會(huì)可持續(xù)發(fā)展和國(guó)家安全，也要攀登世界科學(xué)高峰。一是始終將面向國(guó)家戰(zhàn)略需求放在首位；二是加強(qiáng)原始科學(xué)創(chuàng)新和加強(qiáng)關(guān)鍵技術(shù)創(chuàng)新與系統(tǒng)集成并舉；三是發(fā)揮中國(guó)科學(xué)院在資源、環(huán)境、生態(tài)等研究方面的優(yōu)勢(shì)，為中國(guó)社會(huì)可持續(xù)發(fā)展重大科學(xué)決策提供支撐；四是推動(dòng)科技創(chuàng)新成果轉(zhuǎn)化，為中國(guó)產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整和經(jīng)濟(jì)快速增長(zhǎng)做貢獻(xiàn)。（二）建立戰(zhàn)略研究體系與機(jī)制1.戰(zhàn)略研究明確科技目標(biāo)中國(guó)科學(xué)院在實(shí)施知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)之初，成立了由200余位中青年科學(xué)家、戰(zhàn)略科學(xué)家和管理專家參加的9個(gè)戰(zhàn)略研究組，先后召開(kāi)了有上千人次參加的各類(lèi)研討會(huì)，系統(tǒng)研究分析了世界科技發(fā)展態(tài)勢(shì)和中國(guó)經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展與國(guó)家安全的重大戰(zhàn)略需求，并經(jīng)學(xué)部和海外專家的咨詢與評(píng)議，形成了《優(yōu)先發(fā)展領(lǐng)域方向和重大項(xiàng)目戰(zhàn)略研究》報(bào)告，引導(dǎo)各研究所將科技力量向重點(diǎn)領(lǐng)域方向凝聚。在知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)全面推進(jìn)階段，推出了科技創(chuàng)新戰(zhàn)略行動(dòng)計(jì)劃，組織實(shí)施了科技創(chuàng)新跨越發(fā)展戰(zhàn)略，按照“領(lǐng)域前沿、重要方向和重大項(xiàng)目”三個(gè)層次部署實(shí)施了一批創(chuàng)新項(xiàng)目。領(lǐng)域前沿項(xiàng)目以基礎(chǔ)研究和高技術(shù)前沿探索為主，原則上由各研究所自主部署；重要方向項(xiàng)目主要開(kāi)展基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性研究，與科技布局調(diào)整、創(chuàng)新基地和人才創(chuàng)新隊(duì)伍建設(shè)相結(jié)合；重大項(xiàng)目以解決中國(guó)經(jīng)濟(jì)發(fā)展、國(guó)家安全和社會(huì)可持續(xù)發(fā)展的重大戰(zhàn)略性科技問(wèn)題為主要目標(biāo)，采取頂層設(shè)計(jì)、統(tǒng)一規(guī)劃、自上而下的組織方式。2.構(gòu)建全院戰(zhàn)略研究體系2004年組織研究中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略研究體系，2005年組建中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略研究中心，加強(qiáng)院屬政策與管理、自然科學(xué)史、文獻(xiàn)情報(bào)研究機(jī)構(gòu)隊(duì)伍建設(shè)，凝聚和培養(yǎng)戰(zhàn)略研究人才，建設(shè)國(guó)家科學(xué)思想庫(kù)研究支撐體系，建設(shè)中國(guó)科學(xué)院決策與管理支撐體系，優(yōu)化和加強(qiáng)戰(zhàn)略研究相關(guān)的學(xué)科布局，開(kāi)展國(guó)家中長(zhǎng)期科技發(fā)展相關(guān)戰(zhàn)略研究和中國(guó)科學(xué)院中長(zhǎng)期發(fā)展戰(zhàn)略問(wèn)題研究以及相關(guān)基礎(chǔ)理論探索與前沿研究，為國(guó)家宏觀管理部門(mén)決策和中國(guó)科學(xué)院科學(xué)決策與管理以及科學(xué)思想傳播提供重要支撐。2006年發(fā)布的《中國(guó)科學(xué)院中長(zhǎng)期發(fā)展規(guī)劃綱要（2006—2020年）》明確提出：“建設(shè)由規(guī)劃職能部門(mén)、戰(zhàn)略研究平臺(tái)和專業(yè)研究機(jī)構(gòu)、科技創(chuàng)新基地戰(zhàn)略研究組、研究所戰(zhàn)略研究組等構(gòu)成的戰(zhàn)略研究體系，形成持續(xù)開(kāi)展戰(zhàn)略研究的機(jī)制，準(zhǔn)確把握國(guó)家戰(zhàn)略需求，敏銳關(guān)注世界科技前沿，成為院重大決策的基礎(chǔ)，成為規(guī)劃體系的支撐。”2010年中國(guó)科學(xué)院發(fā)布關(guān)于加強(qiáng)戰(zhàn)略研究體系建設(shè)的指導(dǎo)意見(jiàn)，明確提出：“加快構(gòu)建覆蓋院機(jī)關(guān)、科技創(chuàng)新基地和院屬各單位的全院戰(zhàn)略研究體系，充分依靠科學(xué)家、管理專家，建立多層次、系統(tǒng)性、有重點(diǎn)持續(xù)開(kāi)展戰(zhàn)略研究的機(jī)制，為我院發(fā)展方向、戰(zhàn)略重點(diǎn)、項(xiàng)目遴選等決策提供基礎(chǔ)、依據(jù)和建議。”3.健全戰(zhàn)略研究工作機(jī)制明確規(guī)劃職能部門(mén)、戰(zhàn)略研究平臺(tái)（系統(tǒng)性、綜合性和前瞻性戰(zhàn)略研究）、專業(yè)研究機(jī)構(gòu)、重要領(lǐng)域科技路線圖研究組、科技創(chuàng)新基地戰(zhàn)略研究組（項(xiàng)目遴選與科技布局）、研究所戰(zhàn)略研究組在中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略研究體系中的戰(zhàn)略定位，注重發(fā)揮規(guī)劃戰(zhàn)略布局的主導(dǎo)作用和中國(guó)科學(xué)院科技政策與管理研究會(huì)聯(lián)系全院戰(zhàn)略研究隊(duì)伍的網(wǎng)絡(luò)作用，定期召開(kāi)中國(guó)科學(xué)院年度戰(zhàn)略研討會(huì)、領(lǐng)域（基礎(chǔ)研究、高技術(shù)、資源環(huán)境）戰(zhàn)略研討會(huì)、學(xué)科戰(zhàn)略論壇，研討國(guó)家科技發(fā)展戰(zhàn)略問(wèn)題、領(lǐng)域發(fā)展戰(zhàn)略問(wèn)題和學(xué)科發(fā)展戰(zhàn)略問(wèn)題及相關(guān)理論方法，分析科學(xué)技術(shù)領(lǐng)域重大進(jìn)展和發(fā)展態(tài)勢(shì)并提交戰(zhàn)略研究報(bào)告。建立年度戰(zhàn)略研究報(bào)告和信息交流制度，加強(qiáng)國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)格局和主要國(guó)家重要政策動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)，加強(qiáng)國(guó)家重大科技任務(wù)追蹤分析并定期報(bào)告相關(guān)信息和情況。建立戰(zhàn)略研究評(píng)價(jià)與信譽(yù)制度，將戰(zhàn)略研究體系各組成部分戰(zhàn)略研究情況納入中國(guó)科學(xué)院評(píng)價(jià)體系。發(fā)布了《科學(xué)發(fā)展報(bào)告》《高技術(shù)發(fā)展報(bào)告》《中國(guó)可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略研究報(bào)告》等年度報(bào)告，定期發(fā)布《重要國(guó)家和國(guó)際組織關(guān)注的重大問(wèn)題》《國(guó)際科技競(jìng)爭(zhēng)力分析報(bào)告》《國(guó)家創(chuàng)新體系各單元競(jìng)爭(zhēng)分析報(bào)告》《中國(guó)科學(xué)院研究所態(tài)勢(shì)分析報(bào)告》等研究報(bào)告以及戰(zhàn)略情報(bào)研究報(bào)告等。戰(zhàn)略研究為國(guó)家科技創(chuàng)新相關(guān)規(guī)劃和中國(guó)科學(xué)院發(fā)展規(guī)劃的研究編制提供了重要支撐，也為中國(guó)科學(xué)院政策規(guī)劃執(zhí)行與動(dòng)態(tài)調(diào)整提供了重要支撐。（三）重構(gòu)宏觀管理組織體系中國(guó)科學(xué)院組建規(guī)劃戰(zhàn)略局，重點(diǎn)加強(qiáng)全院規(guī)劃體系建設(shè)。中國(guó)科學(xué)院將確立科技目標(biāo)作為研究所進(jìn)入知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)序列的首要標(biāo)準(zhǔn)，在總體設(shè)計(jì)基礎(chǔ)上，按照“成熟一個(gè)、啟動(dòng)一個(gè)”的原則，規(guī)范程序，嚴(yán)格論證，逐所審核，明確任務(wù)，以研究所進(jìn)入試點(diǎn)序列為抓手，推動(dòng)研究所進(jìn)一步明確科技創(chuàng)新目標(biāo)，對(duì)自身學(xué)科布局和重點(diǎn)發(fā)展領(lǐng)域進(jìn)行調(diào)整，取得了明顯的效果，凸顯了戰(zhàn)略研究和規(guī)劃對(duì)中國(guó)科學(xué)院宏觀管理的重要作用。2006年中國(guó)科學(xué)院發(fā)布的《中國(guó)科學(xué)院中長(zhǎng)期發(fā)展規(guī)劃綱要（2006—2020年）》明確提出：“建立規(guī)劃體系、執(zhí)行體系、資源配置體系與評(píng)價(jià)體系相互制約、相互促進(jìn)的新的科技創(chuàng)新宏觀管理體制。”2006年《中國(guó)科學(xué)院中長(zhǎng)期發(fā)展規(guī)劃綱要實(shí)施意見(jiàn)》[2]明確提出，要建立以規(guī)劃綱要為主體的規(guī)劃體系。一是建立由院級(jí)規(guī)劃和所級(jí)規(guī)劃構(gòu)成的兩級(jí)三類(lèi)規(guī)劃體系，明確院級(jí)規(guī)劃（規(guī)劃綱要、配套規(guī)劃及專門(mén)規(guī)劃）和所級(jí)規(guī)劃（規(guī)劃綱要、配套規(guī)劃及專門(mén)規(guī)劃）定位及編制重點(diǎn)。二是建立規(guī)劃編制立項(xiàng)、審批管理、專家咨詢論證制度。三是建立規(guī)劃制定、發(fā)布、執(zhí)行、評(píng)估、修訂的規(guī)劃全過(guò)程管理工作機(jī)制，院級(jí)規(guī)劃發(fā)布由院黨組批準(zhǔn)，所級(jí)規(guī)劃報(bào)院審批。四是建立規(guī)劃銜接協(xié)調(diào)機(jī)制，院級(jí)規(guī)劃必須與國(guó)家規(guī)劃銜接，所級(jí)規(guī)劃必須與院級(jí)規(guī)劃和國(guó)家規(guī)劃銜接，使規(guī)劃制定過(guò)程成為集思廣益、凝聚目標(biāo)、明確重點(diǎn)、達(dá)成共識(shí)的過(guò)程，使規(guī)劃成為謀劃未來(lái)、謀劃全局發(fā)展的重要方法論和指導(dǎo)工作的行動(dòng)指南。建立規(guī)劃體系，旨在加強(qiáng)規(guī)劃對(duì)全院改革發(fā)展的統(tǒng)籌協(xié)調(diào)功能，建立規(guī)范的規(guī)劃制定、發(fā)布、決策與動(dòng)態(tài)管理制度。建立執(zhí)行體系，旨在強(qiáng)化科技創(chuàng)新基地對(duì)重大科技創(chuàng)新活動(dòng)的組織管理功能，強(qiáng)化專業(yè)局為科技創(chuàng)新基地提供管理支撐的功能，建立適時(shí)調(diào)整機(jī)構(gòu)設(shè)置與職能的機(jī)制，不斷優(yōu)化科技項(xiàng)目組織與支持方式。建立資源配置體系，旨在加強(qiáng)人財(cái)物等資源管理部門(mén)間的協(xié)調(diào)聯(lián)動(dòng)，按創(chuàng)新發(fā)展需求、創(chuàng)新績(jī)效和創(chuàng)新活動(dòng)規(guī)律統(tǒng)籌配置資源，加強(qiáng)資源使用監(jiān)督與績(jī)效考核，建立導(dǎo)向明確、分類(lèi)管理、鼓勵(lì)競(jìng)爭(zhēng)、注重績(jī)效的資源配置體系。建立評(píng)估體系，旨在堅(jiān)持質(zhì)重于量、分類(lèi)評(píng)價(jià)、科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)、公開(kāi)公正的評(píng)估原則，開(kāi)展對(duì)重大科技創(chuàng)新活動(dòng)及效益、機(jī)構(gòu)、人員與政策執(zhí)行等評(píng)估，包括綜合質(zhì)量評(píng)估、政策導(dǎo)向評(píng)估、科技布局評(píng)估、創(chuàng)新能力監(jiān)測(cè)及發(fā)展態(tài)勢(shì)分析。（四）改革人事管理制度在實(shí)施知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)之初，中國(guó)科學(xué)院在全國(guó)率先推行了崗位聘任制度，建立了“崗位聘任、項(xiàng)目聘用和流動(dòng)人員相結(jié)合”的新型用人制度，建立了體現(xiàn)績(jī)效優(yōu)先原則的三元結(jié)構(gòu)分配制度，形成了人員能進(jìn)能出、職務(wù)能上能下、待遇能高能低的用人新機(jī)制，為優(yōu)秀人才脫穎而出創(chuàng)造了良好的制度環(huán)境，為科研事業(yè)單位人事制度改革提供了經(jīng)驗(yàn)。1.實(shí)行崗位聘任制度1999年，中國(guó)科學(xué)院率先實(shí)行了全員聘用合同制，打破計(jì)劃經(jīng)濟(jì)時(shí)期形成的“鐵飯碗”和“終身制”，實(shí)行事業(yè)單位人員合同管理，實(shí)現(xiàn)了科研事業(yè)單位用人制度的重大轉(zhuǎn)變。各研究所按1998年在編人數(shù)的1/3設(shè)置創(chuàng)新崗位、核算創(chuàng)新經(jīng)費(fèi)，其中對(duì)外招聘崗位不低于20%。2001年，實(shí)施了以“按需設(shè)崗、按崗聘任、擇優(yōu)上崗、動(dòng)態(tài)更新”為主要內(nèi)容的崗位聘用制，停止職稱評(píng)定工作，提高聘任標(biāo)準(zhǔn)、嚴(yán)格聘任程序，實(shí)現(xiàn)了評(píng)聘并軌，實(shí)現(xiàn)了競(jìng)爭(zhēng)擇優(yōu)上崗，顯著增強(qiáng)了科技人員的競(jìng)爭(zhēng)意識(shí)，有效激發(fā)了科技人員的創(chuàng)新活力，一批青年學(xué)術(shù)帶頭人嶄露頭角，隊(duì)伍整體素質(zhì)和創(chuàng)新能力顯著提高，人才結(jié)構(gòu)日趨合理。例如，在4個(gè)數(shù)學(xué)類(lèi)研究所合并基礎(chǔ)上組建的數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院，原有160名研究員中只有60人被聘為首批創(chuàng)新崗位研究員。2.實(shí)行項(xiàng)目聘用制度在嚴(yán)格創(chuàng)新崗位聘任制度的同時(shí)，中國(guó)科學(xué)院配套實(shí)行了項(xiàng)目聘用制度，允許研究所和項(xiàng)目負(fù)責(zé)人根據(jù)科技創(chuàng)新需要自主招聘項(xiàng)目聘用人員，實(shí)行有期限的合同聘用，不占事業(yè)編制，突破了事業(yè)編制的局限性。在人才使用上“不求所有，但求所用”，滿足了對(duì)科研人才的動(dòng)態(tài)需求。對(duì)博士后試行項(xiàng)目聘用管理，增強(qiáng)了博士后的崗位意識(shí)，不僅吸引集聚了大批高素質(zhì)科研骨干，也為社會(huì)培養(yǎng)了一批高層次科技人才。實(shí)行高級(jí)訪問(wèn)學(xué)者制度，不僅吸引了一批優(yōu)秀人才到中國(guó)科學(xué)院工作，而且加強(qiáng)了中國(guó)科學(xué)院對(duì)外學(xué)術(shù)交流與合作。對(duì)研究生實(shí)行研究助理制度，促進(jìn)了流動(dòng)科研隊(duì)伍建設(shè)和科研教育結(jié)合。截至2010年底，項(xiàng)目聘用人員約有9700人，占中國(guó)科學(xué)院職工總數(shù)的14%。3.推行人事代理制度為了推進(jìn)崗位聘任制度改革，中國(guó)科學(xué)院實(shí)行部分人事管理職能的委托代理，對(duì)新進(jìn)人員全部實(shí)行人事代理，逐步實(shí)現(xiàn)人事關(guān)系管理與人員使用分離，體現(xiàn)了人才社會(huì)化。在中國(guó)社會(huì)保障機(jī)制尚不健全的環(huán)境下，中國(guó)科學(xué)院鼓勵(lì)“人才+成果”進(jìn)入市場(chǎng)發(fā)展高技術(shù)企業(yè)，積極向社會(huì)輸送人才。采取“離崗安置”等多種方式，積極穩(wěn)妥推進(jìn)轉(zhuǎn)崗分流工作。4.推行新型分配制度中國(guó)科學(xué)院在深入研究基礎(chǔ)上全面推行體現(xiàn)績(jī)效優(yōu)先的“基本工資、崗位津貼、績(jī)效獎(jiǎng)勵(lì)”的“三元結(jié)構(gòu)”分配制度，由原來(lái)的簡(jiǎn)單從對(duì)外爭(zhēng)取項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)中提取獎(jiǎng)勵(lì)，逐步轉(zhuǎn)向按照科技創(chuàng)新貢獻(xiàn)確定績(jī)效獎(jiǎng)勵(lì)，根據(jù)財(cái)政部有關(guān)規(guī)定按照知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)經(jīng)費(fèi)的15%～20%設(shè)立創(chuàng)新崗位津貼。同時(shí)，試行了研究所法定代表人年薪制、特殊拔尖人才協(xié)議工資制、項(xiàng)目聘用人員的合同工資制，積極探索知識(shí)和技術(shù)要素參與分配的多種分配形式，形成了以“三元結(jié)構(gòu)”分配制度為主體、多種分配形式并存的收入分配體系，打破了人員收入分配的“大鍋飯”，有效地激勵(lì)了科技人員創(chuàng)新積極性，提高了對(duì)優(yōu)秀人才的凝聚力。中國(guó)科學(xué)院作為人事部科研事業(yè)單位分配制度改革試點(diǎn)，為探索科研事業(yè)單位收入分配模式提供了寶貴的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)。（五）改革資源配置和預(yù)算制度中國(guó)科學(xué)院堅(jiān)持以資源配置制度改革帶動(dòng)管理創(chuàng)新，調(diào)整資源配置方針，改革資源配置機(jī)制，按照國(guó)家預(yù)算制度改革要求建立了新型預(yù)算制度，實(shí)現(xiàn)了從單一分配國(guó)家財(cái)政撥款向廣泛吸納社會(huì)創(chuàng)新資源的轉(zhuǎn)變，從按計(jì)劃平均分配資源向競(jìng)爭(zhēng)擇優(yōu)重點(diǎn)支持轉(zhuǎn)變，從院統(tǒng)一安排各類(lèi)科技資源向充分發(fā)揮院所兩級(jí)資源集成優(yōu)勢(shì)轉(zhuǎn)變。1.調(diào)整資源配置方針中國(guó)科學(xué)院調(diào)整了資源配置方針，從資源短缺時(shí)期過(guò)分強(qiáng)調(diào)平衡平均，調(diào)整為“整體規(guī)劃、保證重點(diǎn)、擇優(yōu)支持、鼓勵(lì)競(jìng)爭(zhēng)、優(yōu)化配置、動(dòng)態(tài)調(diào)整”的新方針，充分發(fā)揮資源配置的杠桿作用，提高資源配置效率，保證知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)工作的順利實(shí)施。在試點(diǎn)實(shí)踐的基礎(chǔ)上，中國(guó)科學(xué)院進(jìn)一步調(diào)整資源配置方針為“績(jī)效優(yōu)先、鼓勵(lì)創(chuàng)新、競(jìng)爭(zhēng)向上、協(xié)同發(fā)展、創(chuàng)新增值”，力圖實(shí)現(xiàn)科技創(chuàng)新增值循環(huán)。2.改革資源配置制度按照新的資源配置方針，中國(guó)科學(xué)院確定了院所兩級(jí)資源配置的宏觀比例，加大了對(duì)發(fā)展迅速的科技領(lǐng)域和新興交叉學(xué)科以及科技創(chuàng)新隊(duì)伍建設(shè)的投入，建立了與研究所績(jī)效掛鉤的創(chuàng)新試點(diǎn)經(jīng)費(fèi)動(dòng)態(tài)調(diào)整和擇優(yōu)支持新機(jī)制。一是堅(jiān)持“發(fā)展快先支持，發(fā)展好多支持”，在研究所進(jìn)入創(chuàng)新試點(diǎn)序列的過(guò)程中，選擇改革發(fā)展處于前列的研究所先行試點(diǎn)，通過(guò)“時(shí)間差”體現(xiàn)資源重點(diǎn)支持。在研究所全面進(jìn)入試點(diǎn)后，根據(jù)研究所創(chuàng)新績(jī)效和評(píng)價(jià)結(jié)果，對(duì)做出重大創(chuàng)新貢獻(xiàn)、評(píng)價(jià)結(jié)果名列前茅的研究所進(jìn)行獎(jiǎng)勵(lì)性經(jīng)費(fèi)支持，對(duì)評(píng)價(jià)結(jié)果相對(duì)靠后的研究所適度核減創(chuàng)新經(jīng)費(fèi)。二是堅(jiān)持對(duì)外競(jìng)爭(zhēng)經(jīng)費(fèi)比例。根據(jù)研究所科技創(chuàng)新工作性質(zhì)，確定了各研究所對(duì)外競(jìng)爭(zhēng)經(jīng)費(fèi)與院撥經(jīng)常性經(jīng)費(fèi)的比例，其中基礎(chǔ)研究和社會(huì)公益性創(chuàng)新保持在3∶7左右，高技術(shù)研究與發(fā)展保持在7∶3至6∶4，對(duì)不能達(dá)到對(duì)外競(jìng)爭(zhēng)經(jīng)費(fèi)比例的研究所，相應(yīng)核減院經(jīng)常性經(jīng)費(fèi)，并在研究所評(píng)價(jià)中減分，有效地調(diào)動(dòng)了研究所對(duì)外合作競(jìng)爭(zhēng)和聚集社會(huì)創(chuàng)新資源的積極性。三是堅(jiān)持重大創(chuàng)新項(xiàng)目、重要方向項(xiàng)目和基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)院所兩級(jí)匹配支持，其中重大創(chuàng)新項(xiàng)目保持在1∶2左右，重要方向項(xiàng)目保持在1∶1左右，基本建設(shè)項(xiàng)目保持在7∶3左右，有效地調(diào)動(dòng)了研究所的積極性，保證了項(xiàng)目的有效實(shí)施，并使項(xiàng)目實(shí)施與研究所的發(fā)展有機(jī)結(jié)合。3.探索預(yù)算制度改革中國(guó)科學(xué)院借鑒國(guó)際經(jīng)驗(yàn)并結(jié)合自身特點(diǎn)，改革按人平均分配資源的做法，積極探索符合國(guó)家預(yù)算制度改革要求、適應(yīng)科技創(chuàng)新活動(dòng)特點(diǎn)的預(yù)算管理制度，逐步實(shí)現(xiàn)研究所全部收入與支出納入年度預(yù)算管理，根據(jù)定員定額、分類(lèi)分檔、總量調(diào)整的原則，建立以研究所發(fā)展績(jī)效和態(tài)勢(shì)為主要依據(jù)的經(jīng)濟(jì)資源配置制度體系，運(yùn)用預(yù)算手段推動(dòng)事業(yè)的發(fā)展。在知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)啟動(dòng)階段，實(shí)施“基本事業(yè)費(fèi)+創(chuàng)新經(jīng)常性經(jīng)費(fèi)”的配置模式，重在推動(dòng)研究所改革。在知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)二期，實(shí)施“總量不變、取消基數(shù)、結(jié)構(gòu)調(diào)整”的配置模式，重在推動(dòng)研究所整體學(xué)科建設(shè)與發(fā)展。在知識(shí)創(chuàng)新工程三期，實(shí)施“基本運(yùn)行費(fèi)+基本科研費(fèi)”為核心的資源配置模式，重在提升研究所運(yùn)行保障和前瞻布局能力。（六）改革科技評(píng)價(jià)和獎(jiǎng)勵(lì)制度中國(guó)科學(xué)院持續(xù)推進(jìn)科技評(píng)價(jià)和激勵(lì)制度改革，在十余年研究所績(jī)效評(píng)價(jià)實(shí)踐基礎(chǔ)上，不斷完善知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)研究所評(píng)價(jià)體系和評(píng)價(jià)方法，堅(jiān)持“質(zhì)重于量、分類(lèi)導(dǎo)向、公開(kāi)公正、科學(xué)嚴(yán)肅”的原則，不斷探索完善研究所評(píng)價(jià)體系，建立了評(píng)價(jià)結(jié)果與研究所資源配置及法人代表年薪掛鉤機(jī)制。1.調(diào)整研究所評(píng)價(jià)指標(biāo)體系和評(píng)價(jià)方法1999～2001年，中國(guó)科學(xué)院試點(diǎn)研究所評(píng)價(jià)重點(diǎn)是“創(chuàng)新任務(wù)完成情況評(píng)價(jià)”和“基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性與前瞻性貢獻(xiàn)”評(píng)價(jià)，并于2000年將“創(chuàng)新文化建設(shè)”納入試點(diǎn)研究所評(píng)價(jià)體系。2002年，試行了以“重大創(chuàng)新貢獻(xiàn)評(píng)價(jià)”“分類(lèi)導(dǎo)向評(píng)價(jià)”“基礎(chǔ)指標(biāo)測(cè)評(píng)”為主要類(lèi)型的研究所績(jī)效評(píng)價(jià)體系。分類(lèi)導(dǎo)向評(píng)價(jià)進(jìn)一步強(qiáng)化了評(píng)價(jià)對(duì)于科研活動(dòng)的導(dǎo)向作用，“基礎(chǔ)指標(biāo)測(cè)評(píng)”則演變?yōu)椤把芯克a(chǎn)出評(píng)價(jià)”與“研究所可持續(xù)發(fā)展能力評(píng)價(jià)”。從2004年起，試行“綜合質(zhì)量評(píng)估”“政策導(dǎo)向評(píng)價(jià)”“基礎(chǔ)指標(biāo)測(cè)評(píng)”相結(jié)合的研究所績(jī)效評(píng)價(jià)體系。研究所綜合質(zhì)量評(píng)估旨在提升研究所科研創(chuàng)新質(zhì)量，改變了過(guò)去以定量評(píng)價(jià)為主的方法，試行以同行專家定性評(píng)價(jià)為主、以基礎(chǔ)指標(biāo)測(cè)評(píng)為參考的評(píng)價(jià)方法，聘請(qǐng)國(guó)內(nèi)外著名專家到研究所實(shí)地考察與函評(píng)相結(jié)合，逐步建立與國(guó)際接軌的研究所評(píng)價(jià)規(guī)范。2.積極探索評(píng)價(jià)結(jié)果與資源配置掛鉤的新方式評(píng)價(jià)是科研管理的重要手段，評(píng)價(jià)結(jié)果是資源配置的重要依據(jù)。中國(guó)科學(xué)院通過(guò)不斷改進(jìn)評(píng)價(jià)體系，不斷探索評(píng)價(jià)結(jié)果與資源配置掛鉤方式，初步形成了與研究所創(chuàng)新經(jīng)費(fèi)和研究所法人代表年薪掛鉤的制度。2000年，中國(guó)科學(xué)院開(kāi)始將績(jī)效評(píng)價(jià)結(jié)果與研究所創(chuàng)新經(jīng)費(fèi)掛鉤，4類(lèi)研究所分類(lèi)評(píng)價(jià)結(jié)果的排序居首的4個(gè)研究所得到300萬(wàn)元?jiǎng)?chuàng)新經(jīng)費(fèi)獎(jiǎng)勵(lì)，4類(lèi)研究所評(píng)價(jià)結(jié)果排序最后的研究所則核減20%的創(chuàng)新經(jīng)費(fèi)。2002年，按照基礎(chǔ)研究發(fā)展、高技術(shù)研究發(fā)展、社會(huì)可持續(xù)發(fā)展、科技和高技術(shù)產(chǎn)業(yè)化等進(jìn)行分類(lèi)評(píng)價(jià)的結(jié)果排序靠前的4個(gè)研究所和做出重大創(chuàng)新貢獻(xiàn)的13個(gè)研究所各增加了200萬(wàn)～300萬(wàn)元的創(chuàng)新經(jīng)費(fèi)，對(duì)4類(lèi)研究所分類(lèi)進(jìn)行基礎(chǔ)指標(biāo)測(cè)評(píng)的結(jié)果排序靠后的12個(gè)研究所則分別扣減了10%～20%的創(chuàng)新經(jīng)費(fèi)。1999年，中國(guó)科學(xué)院開(kāi)始進(jìn)行研究所法人代表年薪制試點(diǎn)，2003年試點(diǎn)范圍擴(kuò)大到59個(gè)研究所。研究所績(jī)效評(píng)價(jià)結(jié)果作為確定試點(diǎn)研究所所長(zhǎng)年薪的一項(xiàng)重要指標(biāo)，權(quán)重占70%。2006年發(fā)布的《中國(guó)科學(xué)院中長(zhǎng)期發(fā)展規(guī)劃綱要（2006—2020年）》，明確對(duì)研究所定期進(jìn)行綜合質(zhì)量評(píng)估，主要內(nèi)容包括職能定位、目標(biāo)實(shí)現(xiàn)、投入產(chǎn)出、科技活動(dòng)及管理水平、發(fā)展態(tài)勢(shì)等。實(shí)行研究所分檔管理制度，以綜合質(zhì)量評(píng)估結(jié)果為主要依據(jù)，將研究所分為優(yōu)秀、良好、合格三檔。分檔結(jié)果作為確定研究所基本科研費(fèi)、創(chuàng)新崗位數(shù)、所長(zhǎng)年薪及進(jìn)行組織結(jié)構(gòu)調(diào)整的一個(gè)重要因素。分檔工作以5年為周期，其間可根據(jù)重大科技貢獻(xiàn)與創(chuàng)新能力監(jiān)測(cè)結(jié)果，對(duì)研究所檔次進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。3.積極推進(jìn)科技獎(jiǎng)勵(lì)制度改革2002年，中國(guó)科學(xué)院對(duì)科技獎(jiǎng)勵(lì)制度進(jìn)行了重大改革，取消科技成果獎(jiǎng)，新設(shè)兩年一屆的“中國(guó)科學(xué)院杰出科技成就獎(jiǎng)”。一是改革了獎(jiǎng)勵(lì)評(píng)審方法。建立了開(kāi)放式的推薦、評(píng)審模式，在院屬單位推薦之外增加了院內(nèi)外5名同行專家推薦的規(guī)定，規(guī)定院外評(píng)審專家的比例不能低于10%，并將國(guó)外同行專家對(duì)初評(píng)結(jié)果的書(shū)面評(píng)價(jià)意見(jiàn)作為評(píng)獎(jiǎng)的重要依據(jù)。這種征詢國(guó)外同行專家評(píng)價(jià)意見(jiàn)的做法，已被國(guó)家科技獎(jiǎng)勵(lì)辦公室在2004年度國(guó)家自然科學(xué)獎(jiǎng)和技術(shù)發(fā)明獎(jiǎng)初評(píng)之后采納。二是確立了高標(biāo)準(zhǔn)、嚴(yán)要求、寧缺毋濫和以人為本的評(píng)獎(jiǎng)原則。獎(jiǎng)勵(lì)對(duì)象從過(guò)去獎(jiǎng)勵(lì)科研成果轉(zhuǎn)變?yōu)楠?jiǎng)勵(lì)科技人員，獎(jiǎng)勵(lì)成果注重原創(chuàng)和學(xué)科交叉與系統(tǒng)集成，獎(jiǎng)勵(lì)優(yōu)秀集體有利于培育科研團(tuán)隊(duì)合作精神，有效地激發(fā)科學(xué)家的創(chuàng)造潛能，在基礎(chǔ)研究和應(yīng)用基礎(chǔ)研究中做出世界一流的原創(chuàng)性成就，在滿足國(guó)家戰(zhàn)略需求的科技工作中做出擁有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的高技術(shù)創(chuàng)新與集成系統(tǒng)和高技術(shù)產(chǎn)業(yè)化成就，在公益性科技活動(dòng)中做出具有顯著社會(huì)效益的重大貢獻(xiàn)。（七）調(diào)整科技布局與組織機(jī)構(gòu)中國(guó)科學(xué)院積極調(diào)整組織結(jié)構(gòu)，通過(guò)推進(jìn)知識(shí)創(chuàng)新基地建設(shè)、科研機(jī)構(gòu)重組、非法人研究單位布局和應(yīng)用開(kāi)發(fā)類(lèi)研究機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制等措施，完善全院科技布局和組織機(jī)構(gòu)調(diào)整。院屬法人研究機(jī)構(gòu)由1997年的123個(gè)調(diào)整為2010年的99個(gè)。1.調(diào)整重點(diǎn)領(lǐng)域方向中國(guó)科學(xué)院加速將重點(diǎn)領(lǐng)域方向從以學(xué)科為主聚焦到關(guān)系中國(guó)當(dāng)前與長(zhǎng)遠(yuǎn)持續(xù)發(fā)展的戰(zhàn)略必爭(zhēng)領(lǐng)域和重要基礎(chǔ)交叉前沿。在知識(shí)創(chuàng)新工程一期，通過(guò)研究基地建設(shè)帶動(dòng)科技布局調(diào)整。首批建設(shè)了數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院和上海生命科學(xué)研究基地、北京物質(zhì)科學(xué)研究基地、北京地球科學(xué)研究基地等研究基地。在戰(zhàn)略性基礎(chǔ)研究、可持續(xù)發(fā)展相關(guān)科技創(chuàng)新研究、戰(zhàn)略高技術(shù)創(chuàng)新研究（民用）、國(guó)家安全戰(zhàn)略高技術(shù)創(chuàng)新研究、自然科學(xué)前沿和大科學(xué)創(chuàng)新研究等方面，重點(diǎn)部署了一批領(lǐng)域和方向。在知識(shí)創(chuàng)新工程二期，更加關(guān)注國(guó)家戰(zhàn)略需求和科技發(fā)展前沿的緊密結(jié)合，確定了重點(diǎn)發(fā)展的九大領(lǐng)域。在知識(shí)創(chuàng)新工程三期，著力加強(qiáng)具有明確目標(biāo)導(dǎo)向的交叉和重大科學(xué)前沿，加快信息科技創(chuàng)新基地，光電和空間科技創(chuàng)新基地，先進(jìn)能源科技創(chuàng)新基地，納米、先進(jìn)制造與新材料創(chuàng)新基地，人口健康與醫(yī)藥創(chuàng)新基地，先進(jìn)工業(yè)生物技術(shù)創(chuàng)新基地，先進(jìn)可持續(xù)農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新基地，生態(tài)與環(huán)境科技創(chuàng)新基地，資源與海洋科技創(chuàng)新基地，依托大科學(xué)裝置的綜合研究基地等10個(gè)基地建設(shè)，通過(guò)科技創(chuàng)新基地建設(shè)帶動(dòng)領(lǐng)域和方向調(diào)整。2.建設(shè)知識(shí)創(chuàng)新基地中國(guó)科學(xué)院按照具有明確的戰(zhàn)略目標(biāo)和鼓勵(lì)交叉綜合以及空間相對(duì)集中的原則，在基礎(chǔ)科學(xué)研究、生命科學(xué)與生物技術(shù)、資源環(huán)境科學(xué)研究以及高技術(shù)研究與發(fā)展領(lǐng)域，重點(diǎn)建設(shè)了18個(gè)優(yōu)勢(shì)較強(qiáng)、規(guī)模較大的綜合研究基地。基礎(chǔ)科學(xué)研究領(lǐng)域包括北京物質(zhì)科學(xué)基地、國(guó)家天文臺(tái)、數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院、合肥物質(zhì)科學(xué)研究院、大科學(xué)研究基地等；生命科學(xué)與生物技術(shù)領(lǐng)域包括上海生命科學(xué)研究院、北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)與生態(tài)環(huán)境研究基地、西南生物資源與生物多樣性保護(hù)研究基地等；資源環(huán)境科技領(lǐng)域包括北京地球科學(xué)研究基地、西北資源環(huán)境與可持續(xù)發(fā)展研究基地、長(zhǎng)江流域生態(tài)環(huán)境與可持續(xù)發(fā)展研究基地、東北高效農(nóng)業(yè)與生態(tài)系統(tǒng)管理研究基地、海洋科學(xué)研究基地等；高技術(shù)研究發(fā)展領(lǐng)域包括上海高技術(shù)研究發(fā)展基地、北京信息科學(xué)技術(shù)研究發(fā)展基地、東北新材料與先進(jìn)制造技術(shù)研究發(fā)展基地、光電研究院、戰(zhàn)略能源研究基地等。3.重組院屬科研機(jī)構(gòu)知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)啟動(dòng)后，中國(guó)科學(xué)院通過(guò)研究所定位調(diào)整、研究所整合等方式進(jìn)行了重組。1998～2010年對(duì)46個(gè)研究所進(jìn)行重組，整合組建了16個(gè)研究所（院），包括數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院、理化技術(shù)研究所、地理科學(xué)與資源研究所、國(guó)家天文臺(tái)、地質(zhì)與地球物理研究所、遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所、金屬研究所、長(zhǎng)春光學(xué)精密機(jī)械與物理研究所、東北地理與農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所、上海生命科學(xué)研究院、合肥物質(zhì)科學(xué)研究院、廣州地球化學(xué)研究所、寒區(qū)旱區(qū)環(huán)境與工程研究所、新疆理化技術(shù)研究所、新疆生態(tài)與地理研究所、廣州能源研究所。例如，在原數(shù)學(xué)研究所、應(yīng)用數(shù)學(xué)研究所、計(jì)算數(shù)學(xué)與工程計(jì)算研究所和系統(tǒng)科學(xué)研究所合并的基礎(chǔ)上組建數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院，有利于集中優(yōu)勢(shì)力量，解決重大數(shù)學(xué)科學(xué)問(wèn)題，推進(jìn)數(shù)學(xué)在國(guó)民經(jīng)濟(jì)和社會(huì)發(fā)展中的應(yīng)用研究。在原遺傳研究所和發(fā)育生物學(xué)研究所基礎(chǔ)上，整合原石家莊農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究所，組建遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所，顯著提升了研究所在水稻基因組功能基因的分離鑒定、轉(zhuǎn)基因技術(shù)、作物優(yōu)良品種選育和推廣等領(lǐng)域創(chuàng)新能力。同期，7個(gè)法人科研機(jī)構(gòu)定位調(diào)整并更名：過(guò)程工程研究所、微電子研究所、上海微系統(tǒng)與信息技術(shù)研究所、上海應(yīng)用物理研究所、亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所、國(guó)家授時(shí)中心、對(duì)地觀測(cè)與數(shù)字地球科學(xué)中心。4.新建共建科研機(jī)構(gòu)中國(guó)科學(xué)院瞄準(zhǔn)世界科技發(fā)展前沿和經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展需要，布局新建青藏高原研究所、國(guó)家納米科學(xué)中心、光電研究院、地球環(huán)境研究所、北京基因組研究所5個(gè)法人研究機(jī)構(gòu)，與地方政府共建煙臺(tái)海岸帶研究所、蘇州納米技術(shù)與納米仿生研究所、深圳先進(jìn)技術(shù)研究院、青島生物能源與過(guò)程研究所、寧波材料技術(shù)與工程研究所、廣州生物醫(yī)藥與健康研究院、城市環(huán)境研究所7個(gè)法人研究機(jī)構(gòu)。在交叉新興學(xué)科方向新建了30多個(gè)非法人研究單位。（八）創(chuàng)新國(guó)內(nèi)外開(kāi)放合作模式1.探索與國(guó)內(nèi)其他創(chuàng)新主體合作新模式按照“優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)、合作雙贏”的思路，著力加強(qiáng)院校和院地合作。拓展前沿交叉領(lǐng)域研究，促進(jìn)成果轉(zhuǎn)化。提升滿足需求的能力。依托大科學(xué)裝置，通過(guò)共建機(jī)構(gòu)、合作培養(yǎng)人才、聯(lián)合承擔(dān)國(guó)家任務(wù)等多種方式，與大學(xué)建立起了功能互補(bǔ)、競(jìng)爭(zhēng)合作、聯(lián)合互動(dòng)的關(guān)系，與北京大學(xué)、清華大學(xué)共建了國(guó)家納米科學(xué)中心，與上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院共建了上海健康科學(xué)研究所，與大學(xué)共同籌建了2個(gè)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室、6個(gè)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室以及82個(gè)聯(lián)合研究中心1萬(wàn)多名客座研究員和高級(jí)訪問(wèn)學(xué)者。構(gòu)建院地合作工作體系，實(shí)施以地方需求為牽引的東、中、西三大板塊的院地合作、科技成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化戰(zhàn)略，建設(shè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新與育成中心、科技園區(qū)和中介型技術(shù)轉(zhuǎn)移中心等成果轉(zhuǎn)化平臺(tái)，為區(qū)域創(chuàng)新發(fā)展提供科技支撐。2.探索對(duì)外合作交流新模式中國(guó)科學(xué)院堅(jiān)持“獨(dú)立自主、合作共贏，立足前沿、著眼長(zhǎng)遠(yuǎn)，突出重點(diǎn)、注重實(shí)效”的原則，加強(qiáng)與國(guó)際科技界共同開(kāi)展戰(zhàn)略研究，與德國(guó)馬普學(xué)會(huì)、英國(guó)皇家學(xué)會(huì)建立戰(zhàn)略研究機(jī)制，定期與日本、美國(guó)、澳大利亞等召開(kāi)雙邊高層戰(zhàn)略研討會(huì)，實(shí)施“中國(guó)科學(xué)院外國(guó)專家特聘研究員計(jì)劃”“中國(guó)科學(xué)院外籍青年科學(xué)家計(jì)劃”“中國(guó)科學(xué)院愛(ài)因斯坦講席教授計(jì)劃”“中國(guó)科學(xué)院國(guó)際組織梯隊(duì)建設(shè)計(jì)劃”“中國(guó)科學(xué)院國(guó)際組織任職人員出訪資助計(jì)劃”“中國(guó)科學(xué)院—發(fā)展中國(guó)家科學(xué)院獎(jiǎng)學(xué)金計(jì)劃”“中國(guó)科學(xué)院對(duì)外合作重點(diǎn)項(xiàng)目計(jì)劃”等，與法國(guó)、俄羅斯、德國(guó)、美國(guó)等國(guó)的科研機(jī)構(gòu)、大學(xué)和企業(yè)等共建聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室（研究所），與香港大學(xué)等6所大學(xué)成立了13個(gè)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室，設(shè)立了“中國(guó)科學(xué)院國(guó)際科技合作獎(jiǎng)”等國(guó)際獎(jiǎng)項(xiàng)，推動(dòng)國(guó)際合作，與港澳臺(tái)合作逐步從一般性交流向?qū)嵸|(zhì)性合作轉(zhuǎn)變，從分散合作向重大集成合作轉(zhuǎn)變，從單邊合作向多邊合作轉(zhuǎn)變，從跟蹤模仿向牽頭組織轉(zhuǎn)變，從學(xué)術(shù)合作為主向?qū)W術(shù)、技術(shù)合作并重轉(zhuǎn)變，從短期合作為主向短期、長(zhǎng)期合作結(jié)合轉(zhuǎn)變，提高了中國(guó)科學(xué)院創(chuàng)新能力和在國(guó)際學(xué)界中的地位。三知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)工作成效與影響中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)不僅顯著提升了中國(guó)科學(xué)院的科技創(chuàng)新能力，帶動(dòng)了國(guó)家創(chuàng)新體系與基礎(chǔ)能力建設(shè)以及中國(guó)全社會(huì)創(chuàng)新意識(shí)的提升，增強(qiáng)了中國(guó)科技界創(chuàng)新自信，擴(kuò)大了中國(guó)科學(xué)家的國(guó)際影響力，而且為深化科技體制機(jī)制改革和推進(jìn)創(chuàng)新文化建設(shè)提供了寶貴實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)，對(duì)其他科研機(jī)構(gòu)和大學(xué)的改革創(chuàng)新發(fā)展有重要的引領(lǐng)示范作用。（一）知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)的總體成效中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)（1998～2010年）成效顯著，總體呈現(xiàn)良好發(fā)展態(tài)勢(shì)。一是重大創(chuàng)新成果不斷涌現(xiàn)，取得了一批事關(guān)現(xiàn)代化全局的戰(zhàn)略高技術(shù)創(chuàng)新成果和一批事關(guān)經(jīng)濟(jì)社會(huì)全面協(xié)調(diào)可持續(xù)發(fā)展的重大公益性科技創(chuàng)新成果，在重要基礎(chǔ)前沿領(lǐng)域取得了一批原創(chuàng)成果。二是科技布局更加合理，確立了新的科技創(chuàng)新目標(biāo)，培育了一批新的科技生長(zhǎng)點(diǎn)，學(xué)科布局更加適應(yīng)世界科技發(fā)展趨勢(shì)和國(guó)家經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展需要。三是體制機(jī)制改革取得突破，用人制度、分配制度、資源配置制度、評(píng)價(jià)獎(jiǎng)勵(lì)制度改革探索，加速了創(chuàng)新資源向創(chuàng)新能力強(qiáng)、創(chuàng)新效率高的創(chuàng)新單元集聚，形成了競(jìng)爭(zhēng)向上、協(xié)同發(fā)展的良好局面。四是科技創(chuàng)新隊(duì)伍代際轉(zhuǎn)移順利完成，人才結(jié)構(gòu)日趨合理，一批青年科研和管理帶頭人嶄露頭角，創(chuàng)新能力顯著提高，在國(guó)際科學(xué)界的學(xué)術(shù)地位與影響顯著提高。五是創(chuàng)新文化建設(shè)成效日益顯現(xiàn)，“科學(xué)、民主、愛(ài)國(guó)、奉獻(xiàn)”的傳統(tǒng)、“唯實(shí)、求真、協(xié)力、創(chuàng)新”的院風(fēng)和“依法辦院、以德興院”的理念逐步深入人心，科研人員精神面貌煥然一新。從科研產(chǎn)出來(lái)看，中國(guó)科學(xué)院科技產(chǎn)出數(shù)量快速提升，產(chǎn)出質(zhì)量呈現(xiàn)較快提升勢(shì)頭，國(guó)際學(xué)術(shù)影響力顯著提升。中國(guó)科學(xué)院在86個(gè)國(guó)立科研機(jī)構(gòu)學(xué)術(shù)影響力排名中，有14個(gè)學(xué)科居于前10位，化學(xué)、材料科學(xué)、數(shù)學(xué)、工程學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、環(huán)境與生態(tài)學(xué)、地球科學(xué)、物理學(xué)8個(gè)學(xué)科位居前5位。1999年1月至2009年2月，按入圍《工程科學(xué)索引（ESI）》論文被引頻次世界科研機(jī)構(gòu)排名，中國(guó)科學(xué)院材料科學(xué)、化學(xué)位居第1位，物理學(xué)、工程學(xué)、數(shù)學(xué)分別位居第6位、第7位、第8位。1998～2010年，累計(jì)申請(qǐng)國(guó)內(nèi)專利47119件，其中83.7%為發(fā)明專利，累計(jì)獲國(guó)內(nèi)專利授權(quán)22546件。1998～2010年共獲得國(guó)家自然科學(xué)獎(jiǎng)、國(guó)家技術(shù)發(fā)明獎(jiǎng)和國(guó)家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)367項(xiàng)，其中獲國(guó)家自然科學(xué)獎(jiǎng)數(shù)量占全國(guó)總數(shù)的40%。2014年以來(lái)連續(xù)4年獲得國(guó)家自然科學(xué)一等獎(jiǎng)。2016年獲得8435件發(fā)明專利授權(quán)，自2014年自然出版集團(tuán)首次發(fā)布自然指數(shù)榜單以來(lái)，中國(guó)科學(xué)院一直名列全球?qū)W術(shù)機(jī)構(gòu)首位。[3]（二）知識(shí)創(chuàng)新工程試