轉錄調控考核試題一、選擇題1.小麥做轉錄組通常建議測序數據量為[單選題]*4G6G8G10G√2.水稻葉片做轉錄組建議最少測多少數據量[單選題]*10Ｘ6G√20X10G30X12G3.轉錄組測序差異表達基因通路富集分析數據庫[多選題]*GO√NRPfamSwissportKEGG√4.轉錄組測序單個樣本RNA總量最低要求[單選題]*0.5ug√1ug1.5ug2ug答案解析：農學樣本1ug、醫學樣本0.5ug5.無參轉錄組序列拼接軟件[單選題]*ClusterVelvetTrinity√Blast6.RNA產品研究的種類包括哪些[多選題]*mRNA√LncRNA√rRNAtRNAcircRNA√sRNA√7.以下哪個方向可以通過百邁客轉錄組進行研究[多選題]*發育調控√環境適應√基因定位變異位點查找基因組注釋√8.以下關于生物學重復說法正確的是[單選題]*對同一個樣本檢測三次對同一個樣本取樣三次對三個樣本取樣三次√對三個樣本取樣一次，再檢測三次9.動物個體樣本做轉錄組，建議生物學重復為[單選題]*135√71010.轉錄組可以同時測到mRNA、lncRNA、circRNA的建庫方式是[單選題]*去rRNA，非鏈特異性建庫sRNA建庫普通轉錄組建庫去rRNA，鏈特異性建庫√11.影響有參轉錄組比對效率的因素的是[多選題]*基因組組裝質量√測序質量√數據污染√測序物種與參考基因組親緣關系√12.有參轉錄比對效率低于（）時，建議更換基因組或改做無參[單選題]*50.00%60.00%70.00%√80.00%90.00%13.所研究物種有參考基因組時，必須按找有參進行分析。[單選題]*正確錯誤√14.做完轉錄組一定要進行Q-PCR驗證，一般選擇驗證多少個差異基因[單選題]*0~55~1015~25√30~5060起15.Q-PCR與有參轉錄組分析結果的吻合度因在（）以上為宜[單選題]*40.00%50.00%60.00%√70.00%80.00%16.Q-PCR與轉錄組分析結果吻合度較低，可能的原因有[多選題]*實驗所用樣本弄混√沒有使用轉錄組同一批樣本進行Q-PCR驗證√驗證的差異基因表達量較低√驗證的差異基因差異不顯著√計算方法不對√17.以下屬于轉錄組高級分析的是[多選題]*可變剪切分析WGCNA分析√GO富集分析K均值聚類分析√KEGG富集分析18.以下關于Unigene和轉錄本的區別說法正確的是[多選題]*Unigene是triniy組裝的轉錄本√Unigene是組裝得到的該基因的最長轉錄本√Unigene是轉錄本的子集√轉錄本是Unigene的一部分轉錄本就是Unigene19.轉錄組差異分析的篩選標準默認為[單選題]*FoldChange≥2且FDR＜0.01√FoldChange≥2或FDR＜0.01FoldChange≥1且FDR＜0.01FoldChange≥1且FDR＜0.05FoldChange≥2且FDR＜0.0520.轉錄組差異分析的默認的篩選標準為FoldChange≥2且FDR＜0.01，此參數不可改變。[單選題]*正確錯誤√21.轉錄組差異分析的默認的篩選標準為FoldChange≥2且FDR＜0.01，以下哪種方式可以實現快速修改。[單選題]*反饋給售后技術支持指導客戶在云上分析√反饋給運營經理修改反饋給大區經理修改22.轉錄組差異分析時按FoldChange≥2且FDR＜0.01的標準進行篩選，發新差異基因較少，應該調整的參數是？[多選題]*FDR調小FDR調大√FoldChange調大FoldChange調小√23.轉錄組差異分析時FDR不建議選（）以上[單選題]*0.010.05√0.10.51224.轉錄組差異分析時FoldChange建議選（）以上[單選題]*11.52√2.53425.以下不屬于無參轉錄組Unigene注釋的數據庫的是[單選題]*GOKEGGNRSWISS-PROTNCBI√COG答案解析：對的26.整合了基因組、化學和系統功能信息的數據庫，旨在揭示生命現象的遺傳與化學藍圖的數據庫是[單選題]*GOKEGG√NRSWISS-PROTTrEMBL27.經過注釋的蛋白質序列數據庫，數據庫中的蛋白質功能經過了實驗驗證，注釋是精確的；[單選題]*GOKEGGNRSWISS-PROT√TrEMBL28.注釋信息最全面，注釋基因最多的數據庫[單選題]*GOKEGGNR√SWISS-PROTTrEMBL29.circRNA對mRNA直接調控作用（）[單選題]*正調控負調控正負調控√不調控30.全轉錄組測序技術適用條件[多選題]*有參考基因組√發高分文章√發多篇文章√關注RNA之間調控關系√31.全轉錄組我們最多推薦構建幾種文庫（）[單選題]*12√345答案解析：鏈特異性、鏈非特異性32.miRNA對靶基因調控作用（）[多選題]*植物內，堿基完全互補匹配，降解mRNA表達√動物內，部分堿基互補匹配，抑制mRNA表達√正調控負調控不調控33.去除rRNA的建庫方式可以檢測的RNA有（）[多選題]*circRNA√miRNAmRNA√lncRNA√rRNA34.lncRNA適用的物種[單選題]*有參考基因組的物種√無參考基因組的物種有參無參均可有轉錄組信息的物種以上均是35.以下哪些屬于lncRNA特征[多選題]*長度大于200nt的非編碼RNA√高度保守性具有組織特異性以及時空特性√呈封閉環狀結構36.轉錄組組織樣本收集方法正確的是[多選題]*采樣后-20℃保存采樣后液氮速凍4h，轉入-20℃保存采樣后液氮速凍4h，轉入-80℃保存√采樣后-80℃保存采樣后液氮長期保存√37.下列屬于PB全長轉錄組和普通轉錄組的區別的是[多選題]*全長轉錄組可獲得全長轉錄本√可以更準確的分析融合基因、APA分析及AS分析√基于轉錄本水平進行定量，尋找差異轉錄本，分析更精細不需要跑Race擴全長，可以直接進行功能方面的驗證√38.下列屬于ONT全長轉錄組和普通轉錄組的區別的是[多選題]*全長轉錄組可獲得全長轉錄本√可以更準確的分析融合基因、APA分析及AS分析√基于轉錄本水平進行定量，尋找差異轉錄本，分析更精細不需要跑Race擴全長，可以直接進行功能方面的驗證√39.以下關于轉錄調控聯合分析的意義正確的是[多選題]*實驗設計多元化√系統性和延續性更強√文章的分析內容豐富√更有利于發高分文章√更有利于調控機制的挖掘√40.篩選差異表達circRNA的常規參數為|log2（FC）|___[單選題]*≥1√≥2≥0≥441.篩選差異表達circRNA的常規參數為FDR___[單選題]*≤0.001≤0.01√≤0.05≤0.142.篩選差異表達mRNA的常規參數為|log2（FC）|___[單選題]*≥1√≥2≥0≥443.篩選差異表達mRNA的常規參數為FDR___[單選題]*≤0.001≤0.01√≤0.05≤0.144.小RNA測序，一般推薦的數據量是（）[單選題]*10M√20M5M30M45.環狀RNA最主要且研究較多的作用機制是（）[單選題]*競爭性結合miRNA√直接作用于mRNA，抑制其翻譯調控蛋白質功能直接作用于lncRNA,影響其可變剪接46.植物全轉錄組常規的RIN值要求為（）[單選題]*≥7.5√≥8≥7≤7≤347.植物sRNA測序常規的RIN值要求為（）[單選題]*≥7.5√≥8≥7≤7≤348.植物mRNA測序常規的RIN值要求為（）[單選題]*≥7.5≥8≥7≥6≥6.5√49.獲取最全lncRNA信息的文庫構建的方式（）[單選題]*去rRNA并鏈特異建庫√調取polyA建庫去rRNA非鏈特異建庫線性RNA消化處理建庫50.普通轉錄組的文庫構建的方式（）[單選題]*去rRNA并鏈特異建庫調取polyA建庫√去rRNA非鏈特異建庫線性RNA消化處理建庫51.只檢測circRNA文庫構建的方式（）[單選題]*去rRNA并鏈特異建庫調取polyA建庫去rRNA非鏈特異建庫線性RNA消化處理建庫√52.ONT全長客戶關注低豐度Isoform，推薦數據量（）[單選題]*4G6G10G12G√答案解析：低豐度要提高測序量。53.可進行混樣測序的是（）[單選題]*PB全長ONT全長都可以√答案解析：都可以混樣測序54.circRNA去除rRNA的建庫方式一般測序數據量是（）[單選題]*植物≥6G，動物≥8G植物≥8G，動物≥6G植物≥12G，動物≥16G√植物≥16G，動物≥12G55.miRNA在哪一層面發揮調控作用[單選題]*轉錄水平轉錄后水平√蛋白互作水平表觀水平56.在百邁客云有參轉錄分析平臺的個性化分析基因挖掘中，搜索類型除了功能關鍵詞和基因序列，還有（）[單選題]*SNP位點基因ID√數據庫ID基因位置答案解析：可以通過基因id檢索57.百邁客云平臺主要的功能模塊有（）[多選題]*分析平臺√工具√數據庫√文章√學術圈√視頻√58.以下研究哪些可以應用轉錄組測序（）[多選題]*不同花色風信子研究√小鼠胚胎發育研究√水稻的耐低溫研究√病毒侵染煙草研究√答案解析：轉錄水平上有差異的皆可研究59.以下哪些情況不適合lncRNA測序（）[多選題]*有參考基因組的物種無參考基因組的物種√有轉錄組信息的物種√有全長轉錄組信息的物種√答案解析：lnc只適用于有參物種60.全長轉錄組可以做的分析？（）[多選題]*可變剪切√融合基因√基因家族√非編碼RNA√61.全長轉錄組平臺有（）[多選題]*illluminaNovseq6000PromethION√IyrsRSII√62.ONT通量最大平臺是哪一個（）[單選題]*PromethION√GridIONMinIONFlongle63.Nanopore數據信號識別模式（）[單選題]*電信號√熒光信號答案解析：ONT是電信號識別進行測序64.Nanopore測序特點？（）[多選題]*長度長√堿基修飾信息√DNA/RNA直接測序√實時可分析√65.ONT全長轉錄組平臺RNA建庫方式（）？[單選題]*PCR-cDNAdirectcDNAPCR-RNA√direcRNA66.Pacbio全長轉錄組滾環多少次以上被認為是CCS（）？[單選題]*1次2次3次√4次答案解析：矯正圈數3次以上被識別為CCS序列67.無參轉錄組獲取基因的方式（）?[單選題]*基因組GFF文件Trinity組裝得到Unigene√答案解析：無參轉錄組只有組裝得到Unigene才能得到基因信息68.NanoporeR9芯片一次讀取多少個堿基的信號？[單選題]*65√4369.Nanopore單堿基準確性是多少？轉錄組數據校正后準確性是多少？[多選題]*85.00%√99.00%99.90%√99.99%70.百邁客ONT全長轉錄組平臺有哪些（）？[多選題]*MinON√GridionX5√PromethION√SequelII71.百邁客PB全長轉錄組平臺有哪些（）？[多選題]*Sequel√PromethIONRSIISequelII√72.miRNA特點（）?[多選題]*長度約20-24nt√組織特異性√階段特異性√73.ONT-RNA送樣質量要求（）?[多選題]*1.8<OD260/280<2.0√1.8<OD260/230<2.02.0<OD260/230<2.2√1.8<OD260/230<2.074.全轉錄組應用方向（）？[多選題]*生長發育√環境適應√免疫互作√突變表型√75.circRNA主流作用機制（）？[多選題]*作為miRNA海綿吸附√與蛋白結合√自身翻譯蛋白√76.下列哪個技術在百邁客可以做病毒鑒定（）？[單選題]*sRNA√lncRNAcircRNAmRNA77.Nanopore全長轉錄組，如果客戶關注可變剪接，你應該推薦至少多少數據量？[單選題]*2G4G6G√78.Nanopore全長轉錄組產品的優勢在哪里？[多選題]*可在轉錄本水平進行準確定量√可進行結構方面的分析，例如可變剪接分析、APA分析、融合基因分析√可同時對lncRNA進行定量√Direct-RNA建庫方式可以同時進行轉錄本的定量和RNA甲基化修飾分析√79.下列對Nanopore全長轉錄組產品可以在轉錄本水平進行準確定量，而Illumina測序不行的理解正確的是？[多選題]*二代RNA-seq測序讀長最多只有150bp,當Read正好比對到轉錄本共享的exon區域時，便無法區分Read的來源轉錄本。√三代測序無需拼接準確獲取一個基因的多種全長轉錄本表達信息。√二代RNA-seq在識別復雜轉錄本isoform方面存在固有限制，需要對短reads進行拼接并利用生物信息學手段對其進行分析，可能會存在拼接錯誤或者是拼接不完整，不能準確鑒定復雜轉錄本,更不用談定量。√低豐度轉錄本由于其表達豐度低，二代測序的短reads極少測到該轉錄本特異性reads，最終出現該低豐度轉錄本假陰性結果，表達豐度低并不一定沒有作用，而三代測序只要測到一條合格reads即可證明其存在，并對其結構進行準確分析。√80.以下哪些是PB全長轉錄組的應用方向（）？[多選題]*基因結構√完善基因組注釋√輔助后續研究√結合二代進行基因定量√81.以下哪些是miRNA的作用機制（）？[多選題]*翻譯抑制√mRNA的降解√靶向負調控mRNA√靶向負調控其他非編碼RNA√82.lncRNA長度是大于（）nt?[單選題]*100200√30040083.以下哪些是lncRNA的功能（）？[多選題]*轉錄沉默√轉錄激活√染色體修飾√核內運輸√84.以下哪些是lncRNA的特點（）？[多選題]*保守性低√保守性高具有組織特異性以及時空特性√在細胞內外豐度不同√85.lncRNA的分類（）？[多選題]*反義長鏈非編碼RNA√內含子非編碼RNA√基因間區的lncRNA√正義長鏈非編碼RNA√86.以下是circRNA特點是（）？[多選題]*沒有線性RNA穩定對核酸酶不敏感√呈封閉環狀√不易降解√87.以下哪些是全長轉錄組的優勢（）？[多選題]*短平快：材料的獲取和試驗的實施較容易進行，基本不需要進行分子實驗即可發表文章，因此從測序分析到文章發表周期短；√性價比高：所測即所得，無需Race實驗擴全長，節約大量經費、時間；無參物種獲得全長轉錄本序列，可作為后續轉錄組項目的參考序列；√基因結構研究利器：可準確鑒定可變剪接、可變多聚腺苷酸化、融合基因和基因家族等；√研究熱點：隨著測序平臺和分析技術的成熟，越來越多的研究采用三代全長轉錄組闡釋科學問題，三代全長轉錄組已然成為熱點研究對象。研究物種從模式生物向經濟作物、藥用植物、水產、動物和昆蟲等轉移，研究物種更加豐富。√88.二代測序數據質量值Q30的意思是（）[單選題]*堿基錯誤率1%堿基錯誤率0.1%√堿基錯誤率0.01%89.無參轉錄組序列組裝中N50的意思是（）[單選題]*組裝轉錄本的平均長度組裝轉錄本按長度從小到大排序，加到總長度的1/2時的序列長度√組裝轉錄本總長度的1/290.在組裝轉錄本篩選lncRNA時，編碼潛能預測的工具和數據庫有（）[多選題]*CPC√CNCI√Pfam√CPAT√SWISS-PROT91.BMKlncRNA靶基因預測的方法有（）[多選題]*根據lncRNA與gene的位置關系預測順式靶基因√通過樣本間lncRNA與mRNA的表達量相關性分析方法來預測lncRNA的反式靶基因√在lncRNA靶基因數據庫中搜索92.如某老師二代雙端測序的數據量要求為6G，以下正確的是（）[單選題]*雙端R1，R2數據量各為6G雙端R1和R2總數據量為6G√93.二代轉錄組測序reads比對到參考基因組時，大部分reads應該比對到基因組的哪個區域？[單選題]*intergenticintronexon√5‘UTR3’UTR94.百邁客在二代轉錄組表達量歸一化時使用的量化標準為（）[單選題]*FPKM√RPKMTPMCPM95.GO數據庫中對通路的二級功能分類包括（）[多選題]*BP√CC√MF√AR96.關于ORF和CDS正確的是（）[多選題]*CDS是基因中實際翻譯出蛋白質序列√ORF是指位于起始密碼子和終止密碼子之間的核苷酸序列區域。√所有CDS都是ORF√不是所有的ORF都是CDS√97.有參轉錄組分析中基因結構分析主要包含（）[多選題]*新的可變剪接預測√SNP（InDel）分析√基因結構優化分析√新基因發現√98.有參轉錄組分析中文庫質量評估的內容包括（）[多選題]*mRNA片段化隨機性檢驗√插入片段長度檢驗√轉錄組測序數據飽和度檢驗√99.轉錄組進行樣品的重復性評估時使用的評估指標為（）[單選題]*皮爾遜相關系數√斯皮爾曼相關系數肯德爾相關性系數100.轉錄組中構建蛋白互作網絡的數據庫是（）[單選題]*NRSWISS-PROTTrEMBLSTRING√101.無參轉錄組進行reads組裝方式正確的是（）[單選題]*同物種的測序樣品合并組裝√各樣品分別組裝生物學重復樣品合并組裝102.百邁客在miRNA表達量歸一化時使用的量化標準為（）[單選題]*FPKMRPKMTPM√CPM103.WGCNA分析在云平臺上要求樣本數要大于多少？[單選題]*3個4個5個√6個104.轉錄組差異分析時有生物學重復樣品和沒有生物學重復樣品的差異分析軟件分別是（）[單選題]*DEseq2、EBseq√EBseq、DEseq2105.在callSNP時，人類全基因組的ti（轉換）/tv（顛換）ratio約為（）[單選題]*3左右0.5-12.0-2.2√106.樣品的測序深度計算方式為（）[單選題]*reads數/參考基因組大小堿基數/參考基因組大小√107.老師想要比對結果可視化，一般推薦的軟件為（）[單選題]*ucscgenomebrowsersamtoolsIGV√108.cleandata是rawdata經過哪些過濾步驟得到的？[多選題]*去除含有接頭的Reads√去除質量值Q≤10的堿基數占整條Read的50%以上的Reads√去除N的比例大于10%的Reads√109.miRNA進行靶基因預測時，植物和動物分別用的軟件為（）[單選題]*miRanda、TargetFinderTargetFinder、miRanda√110.轉錄組的文庫構建流程順序為（）[多選題]*連接接頭√樣品檢測√PCR富集√mRNA富集、反轉錄√末端修復、3'加A√文庫質控、上機檢測√111.轉錄組表達量數據格式為（）？[單選題]*FPKM√TPMCPMCounts112.轉錄組計算差異基因用的表達量數據格式為（）？[單選題]*FPKMTPMCPMCounts√113.轉錄組進行WGCNA分析時樣本數和樣本重復要求是什么（）?[單選題]*不少于5個樣本，每個樣本不少于3個生物學重復√不少于3個樣本，每個樣本不少于5個生物學重復不少于5個樣本，每個樣本不少于5個生物學重復不少于3個樣本，每個樣本不少于3個生物學蟲谷114.有參轉錄組的建庫類型（）？[單選題]*第一條鏈特異性建庫第二條鏈特異性建庫非鏈特異性√去線性鏈特異性建庫115.全長轉錄組RNA總量為（）?[單選題]*3ug√20ug30ug40ug116.獲取最全lncRNA信息的文庫構建的方式（）?[單選題]*去rRNA并鏈特異建庫√調取polyA建庫去rRNA非鏈特異建庫117.ceRNA是指團結在以（）為核心的RNA調控網絡周圍？[單選題]*mRNAmiRNA√lncRNAcircRNA118.以下哪些物種適合做全轉錄組（）？[多選題]*有參考基因組物種√無參考基因組物種普通二代轉錄組研究的比較多，對基因功能比較清楚√研究非編碼RNA與基因的轉錄調控關系√119.以下哪些是對全轉錄組的客戶定位（）？[多選題]*經費相對比較充足√有二代轉錄組研究基礎或一定的了解√關注非編碼RNA與基因的轉錄調控關系√希望發表5分以上的文章√120.以下哪些是Pacbio全長轉錄組的關鍵技術（）？[多選題]*ZMW孔√DNA聚合酶和熒光標記dNTP√全長cDNA合成√BluePippin篩選目的片段√121.病毒樣本在百邁客可以做哪個產品（）?[單選題]*lncRNAsRNA√circRNAmRNA122.sRNA有哪些類型（）？[多選題]*microRNA√piRNA√NatRNA√phasiRNA√123.二代測序相比較三代測序來說有哪些劣勢（）？[多選題]*無法獲得基因全長√多倍體或雜合物種（無參）轉錄本拼接錯誤率高√無參轉錄組的定量準確性偏低√無法準確檢測可變剪接位點√無法準確檢測融合基因√124.全長轉錄組在給客戶推薦數據量的時候應該考慮哪些（）？[多選題]*基因組大小√是否為多倍體√是否關注低豐度轉錄本定量√是否關注結構方面的研究√125.Pacbio全長轉錄組數據下機之后分析中如何獲取全長（）？[多選題]*生成CCS序列并polish√全長序列的識別√isoform水平聚類得到一致性序列√126.Pacbio全長轉錄組下機數據是（）格式？[單選題]*fastqfast5bam√fasta127.下列哪些軟件可用于lncRNA的預測（）？[單選題]*CPCCNCICPATpfam以上都是√128.Nanopore全長轉錄組下機數據且用于后續分析是（）格式？[單選題]*fastq√fast5bamfasta129.利用Asprofile進行可變剪切分析時,需要對組裝得到的gtf文件先進行處理后再分析,處理gtf用到的工具是（）？[單選題]*cufflinksuffcomparecuffmerge√cuffquant130.Nanopore全長轉錄組在計算差異基因時利用的表達量數據類型是（）？[單選題]*FPKMCPMCounts√TPM131.PB2+3利用二代輔助定量計算差異基因時利用的表達量數據類型是（）？[單選題]*Counts√FPKMCPMTPM132.Nanopore全長轉錄組基因表達量數據格式為（）？[單選題]*FPKMCPM√CountsTPM133.如何判斷一條序列是全長序列（）？[單選題]*有5'端測序引物有3‘端測序引物有5‘、3’端測序引物有5‘、3’端測序引物和polyA尾巴√134.全長轉錄組分析中如何保證轉錄本準確性（）？[多選題]*通過一致性序列CCSreads保證數據一定準確性√全長轉錄本分類后的聚類√通過非全長轉錄本對全長轉錄本進行進一步校正√如果有二代轉錄組數據，可以進一步對全長轉錄組數據進行校正√135.下列關于全長轉錄組進行混樣測序時說法正確的是[單選題]*建議混樣不超過6個√建議混樣越多越好不能混樣136.如果老師特別關注可變剪切，需要多少數據量合適[單選題]*2G4G6G√137.Pacbio可以做到定量[單選題]*正確錯誤√答案解析：PB不能定量，零模波導孔的利用率不是100%，歷史測了很多次，準確率提高了，但是數據量不是飽和的，所以不能定量138.我們公司有多臺三代儀器，包括ONT和Pacbio[單選題]*正確√錯誤139.有參轉錄組分析審核報告時要求最低的比對效率是多少[單選題]*50.00%65.00%√70.00%85.00%答案解析：合同無要求，報告交付要求65%140.跟客戶探討樣品準備的時候需要注意的是[多選題]*時間點√組織部位√處理方法√物種基因組情況√141.二代轉錄組的測序方案是什么[單選題]*SE50PE250PE150√PE300142.二代轉錄組建庫打斷的片段大小為多少[單選題]*350bp150bp450bp270bp√143.對于談二代轉錄組項目遇到價格競爭怎么辦[多選題]*推次賬號來競爭√拼價格獲取總樣品數申請去申請價格√了解客戶經費情況√144.目前，百邁客可以做代謝與哪些產品的聯合分析[多選題]*轉錄組√GWAS蛋白組√微生物多樣性√145.差異倍數log2FC>1代表FC大于幾及差異倍數為幾[單選題]*12√34146.數據質控時，保證Q30達到多少？[單選題]*0.750.80.85√0.9147.客戶手里的材料表型很明顯，但材料是雜合的，并不影響客戶做轉錄組的結果[單選題]*對√錯148.云平臺上的“與轉錄組聯合分析”只能用在百邁客測的數據進行免費聯合分析[單選題]*對√錯149.全長轉錄組有幾種測序平臺[多選題]*PacBio√IlluminaNanopore√BGI150.Nanopore的堿基判讀是依據什么產生？[單選題]*電流信號√熒光信號151.Nanopore測序有什么優勢？[多選題]*無需擴增，無堿基偏好性√可以定量√低豐度轉錄本可以被檢測到√鑒定到的全長轉錄本多√152.PacBio全長轉錄組報告可否上云？[單選題]*可以√不可以答案解析：目前報告與結果數據已經可以推云，只是沒有對應個性化分析153.pb全長轉錄組為什么要同時做二代錄組[單選題]*沒辦法定量√二代用來糾錯三代數據二代轉錄組更加準確154.pb全長轉錄組是否是HIFI模式[單選題]*是√不是155.pb全長轉錄組單cell可以產出多少數據？（下機數據）[單選題]*100G200G300G√400G156.PB全長轉錄組單cell可以大概得到多少CCS[單選題]*1-2G√20G左右50G200G157.PB全長轉錄組包cell一個cell可以測幾個樣本？（每個樣本測60G數據量）[單選題]*2345√158.ONT全長轉錄組能檢測到的可變剪接有幾種？[單選題]*575或7√159.PB和ONT全長轉錄組哪個能做到轉錄本準確定量呢？[單選題]*PBONT√PB和ONTillumina160.如果老師研究物種沒有參考基因組，優先推薦做哪種轉錄組？[單選題]*PB2+3√PBONT161.二代轉錄組目前主流的建庫測序的文庫是什么？[單選題]*PE100PE150√PE250SE50答案解析：二代雙端測序，PE150文庫162.二代轉錄組如果老師研究的基因表達豐度很低，一般推薦數據量多少？[單選題]*4G6G8G10G√答案解析：轉錄組通常6G，但是基因豐度比較低的話，建議推薦測10G163.老師覺得轉錄組的整體結果里面差異基因比較少，想多找一些差異基因，下面哪些調整參數是正確的？[多選題]*增加FC值減少FC值√FDR值改為0.01FDR值改為0.05√164.百邁客ONT全長轉錄組的建庫方式是？[單選題]*directcDNAPCRRNA.PCRcDNA√directRNA165.ONT說的cleandata是一致性序列去冗余之后的嗎[單選題]*是不是√答案解析：不是，cleandata就是原始數據去除了接頭序列，polyA等信息166.分析數據的時候，可變剪切結果是否也要結合表達數據[單選題]*是√不是答案解析：可變剪切是從結構上分析基因的一個變化情況，表達量是分析不同可變剪切體的具體表達，二者結合去分析，可以將問題分析的更透徹167.對于無參物種做全長轉錄組，我們首推的是PB2+3，對于有參的物種，怎么推薦平臺做全長轉錄組？[多選題]*若參考基因組質量不好，推薦PB2+3√參考基因組可以用的，老師關注轉錄本定量，推薦ONT√參考基因組可以用的，老師關注可變剪切，推薦ONT答案解析：關注可變剪切的話，推PB168.PB全長轉錄組三代也是需要做生物學重復嗎？[單選題]*是不是√答案解析：三代做一個混樣就可以，作為參考169.ONT目前主推的是6G數據量，是否可以滿足？[單選題]*是√不是答案解析：對于大部分中高豐度轉錄本都可以了170.關于smallRNA測序，以下說法錯誤的是？[單選題]*先天鏈特異性單堿基精確切膠PE50測序√不用湊樣，快速上機171.關于鏈特異性建庫流程，以下順序正確的是？1.采用去除rRNA的方式去除rRNA。2.合成第一條cDNA鏈，然后在合成第二條鏈時候加入dUTP代替dTTP。3.使用USER酶消化掉第二條鏈，只保留第一條鏈。4.3‘端加加A，加接頭。5.PCR擴增，Illumina測序。[單選題]*1234512435√1423523145172.全轉錄組可以得到幾種RNA的分析結果？[單選題]*1234√173.全轉錄組構建哪幾種文庫？[多選題]*circRNA文庫lncRNA文庫√mRNA文庫sRNA文庫√174.全轉錄組可以獲得幾份分析報告？[單選題]*1334√175.lncRNA可以預測哪幾種靶向關系？[多選題]*lncRNA--mRNA√lncRNA--miRNA√lncRNA--circRNA以上都是176.miRNA可以預測哪幾種靶向關系？[單選題]*miRNA--mRNAmiRNA--lncRNAmiRNA--circRNA以上都是√177.circRNA可以預測哪幾種靶向關系？[多選題]*circRNA--mRNA√circRNA--miRNA√circRNA--lncRNA以上都是178.去核糖體文庫構建circRNA的特點是？[多選題]*可以同時比較circRNA和其它線性RNA分子的特點√鑒定的circRNA更準確circRNA檢出的效率更高高峰度circRNA檢出效果和去線性文庫相當√179.為什么不建議客戶選擇低豐度表達基因進行PCR驗證[單選題]*低表達基因序列不準確低表達基因未測到飽和，定量不準確√以上都是180.全轉錄組可以構建的調控網絡有？[多選題]*ceRNA網絡√共表達相關性網絡√蛋白互作網絡√轉錄因子調控網絡√181.lncRNA預測靶基因的方式有？[單選題]*順式靶基因預測：上下游100kb范圍內反式靶基因預測：序列互補原理以上都是√182.非編碼RNA的核酸送樣要求總量是多少？[單選題]*1ug√2ug3ug4ug183.非編碼RNA在植物中的應用有？[多選題]*調控開花的時間√調節生殖器官的發育√對非生物和生物脅迫的響應√參與組織器官發育調控√184.非編碼RNA在動物中的應用有？[多選題]*免疫調節√疾病發生√性別控制√肌肉發育√185.miRNA可以獲得哪些miRNA?[單選題]*已知miRNA新miRNA以上都是√186.轉錄因子相關的分析內容有哪些？[單選題]*轉錄因子預測轉錄因子結合位點分析以上都是√187.Pacbio是否可以分析無參考基因組物種？[單選題]*是√不是188.ONT全長轉錄組是否可以分析無參考基因組物種？[單選題]*是不是√189.ONT全長轉錄組是否可以結合二代轉錄組聯合分析？[單選題]*是不是√190.小基因組Pacbio推薦的數據量一般為多少G?[單選題]*20G√40G60G80G191.我們公司HI-C互作有哪些優勢？[單選題]*擁有獨家專利的建庫分析流程，高酶切效率可以獲取更多的互作位點，分析結果準確可靠擁有豐富的項目經驗，不同類型物種及樣本處理方式建庫成功率高達90%以上有多篇成功案例以上都是√192.HI-C互作是否可以接收凍存樣本？[單選題]*是√否193.HI-C互作優先建議客戶提供什么類型樣本？[單選題]*新鮮樣本√凍存樣本194.HI-C互作推薦動物的組織樣量是多少？[單選題]*1ug2ug√3ug4ug195.HI-C互作推薦的細胞量是多少？[單選題]*10^610^7√10^810^9196.HI-C互作推薦的真菌送樣量是多少？[單選題]*1ug√2ug3ug4ug197.HI-C互作推薦的植物送樣量是多少？[單選題]*1ug2ug3ug4ug√198.HI-C互作使用的植限制性內切酶是幾堿基酶？[單選題]*四堿基酶√五堿基酶六堿基酶199.HI-C互作使用的植限制性內切酶是什么？[單選題]*DpnII√HindⅢ200.HI-C互作可以獲得全基因組范圍內所有的互作區域？[單選題]*是√否201.HI-C互作可以分析哪些三維結構？[單選題]*A/BcompartmentsTAD分析Loop分析以上都是√202.HI-C互作分析到loop結構最少需要達到多少分辨率？[單選題]*10K√20K30K40K203.HI-C互作分析到loop結構最少需要多少深度？[單選題]*50X100X150X√200X204.HI-C互作的測序平臺是？[單選題]*Illumina√PacbioNanopore205.HI-C互作可以和其他哪些組學進行聯合分析？[多選題]*ATAC-seq√ONT全長轉錄組√RNA-seq√qPCR√206.無參物種是否可以做HI-C互作？[單選題]*是否√207.HI-C互作的應用場景有?[多選題]*抗逆脅迫√性別分化√數量品質√種間比較√208.ATAC-Seq數據處理指標中N（%）的標準是多少？[單選題]*≤10≤5√≤15≤2209.ATAC-Seq中的peak結果指標，要求peak數目為多少？[單選題]*≥10000√≥15000≥20000≥5000210.ATAC-Seq中堿基質量Q30標準是？[單選題]*≥85≥80√≥90≥95211.ATAC-Seq一般情況下，推薦數據量是多少？[單選題]*100Mreads150Mreads50Mreads√30Mreads212.ATAC-Seq實驗原理是?[單選題]*Tn5酶切√連接酶213.ATAC-Seq主要研究那部分染色質？[單選題]*全部染色質閉合染色質開放染色質√214.ATAC-Seq的是用Illumina平臺測序的嗎？[單選題]*是√不是215.ATAC-Seq差異Peak分析默認的篩選標準為FoldChange≥1.5且FDR＜0.05[單選題]*是√不是216.百邁客ATAC-Seq的產品的優勢有？[多選題]*靈敏性高√有ATAC-seq+轉錄組聯合分析的流程√實驗重復性好√217.代謝組能檢測到分子量多大的物質[單選題]*500以下1000以下√1500以下2000以下全都能檢測218.代謝組檢測的儀器平臺可以分為哪幾類[單選題]*色譜和質譜氣相和液相氣質和液質√TOF和QQQ219.普通非靶代謝組需要多少個生物學重復[多選題]*臨床樣本n≥10臨床樣本n≥30√動物樣本n≥6動物樣本n≥10√植物和微生物n≥3個植物和微生物n≥6個√220.目前代謝組學技術的局限？[多選題]*對未知物的鑒定√多平臺數據整合√檢測物種限制√研發出可供查詢的標準數據庫√代謝組學與其他組學數據的整合√221.普通非靶向代謝組能定性到多少種物質？[單選題]*幾百種約1000種√幾萬種全都能檢測222.以下哪些樣品可以做代謝組？[多選題]*牛血清√小鼠糞便√重金屬處理的水體√四膜蟲化石風干的中藥材√擬南芥根系上√223.提供某幾個物質的標準品，針對性做絕對定量[單選題]*普通非靶（LC/GC）靶標代謝組√頂空進樣非靶標植物高通量靶標動物高通量靶標224.動植物或微生物樣本，沒有明確的研究目標[單選題]*普通非靶（LC/GC）√靶標代謝組頂空進樣非靶標植物高通量靶標動物高通量靶標225.研究細菌在特定培養條件下基礎代謝的情況[單選題]*普通非靶（LC/GC）√靶標代謝組頂空進樣非靶標植物高通量靶標動物高通量靶標226.研究牛體內脂質合成與降解情況[單選題]*普通非靶（LC/GC）靶標代謝組脂質非靶√植物高通量靶標動物高通量靶標227.泛泛的看看樣品中脂質的變化情況[單選題]*普通非靶（LC/GC）靶標代謝組脂質非靶√植物高通量靶標動物高通量靶標228.腸道內所產生的短鏈脂肪酸含量變化[單選題]*普通非靶（LC/GC）短鏈脂肪酸代謝√脂質非靶植物高通量靶標動物高通量靶標229.我公司目前關于定量蛋白質產品有哪些[多選題]*Label-free√iTRAQ膠條鑒定PRM√乙酰化TMT√230.關于label-free，以下描述正確的是[多選題]*每個樣品分別上機進行檢測√適用于大樣本量√無需同位素標記，成本低√周期相對較短√231.目前我們蛋白組學應用的是Thermo公司的哪種平臺[多選題]*Q-exactive√5600TripleTOFQ-exactiveHF√D.Lumos232.進行蛋白搜庫時，我們首先的數據庫是[單選題]*uniprot數據庫（或NCBI）選擇所研究物種同批樣品轉錄組數據構建的蛋白庫√uniprot數據庫（或NCBI）選擇任意物種uniprot數據庫（或NCBI）選擇近源物種233.對于篩選得到的差異蛋白可以采用以下哪些手段進行下游的驗證實驗[多選題]*2DPRM√Westernblot√ELISA√234.在進行定量蛋白組學研究的時候，以下哪種樣品需要去除高峰度蛋白[多選題]*動物組織血清√血漿√細胞235.下列物質代謝組不能檢測的是[多選題]*農藥殘留（四環素）蛋白質√微生物多樣性√色氨酸236.以下關于代謝組上機檢測說法正確的是[單選題]*同一批次實驗允許分批次檢測同一批次實驗必須同一批次檢測√同一批次實驗可以分2次上機檢測同一組重復實驗同批次上機檢測即可237.代謝組中物質分離主要用的技術是[單選題]*色譜技術√質譜技術238.代謝組中物質分離可用GC進行，該技術主要是利用物質的哪些特點進行分離的[多選題]*沸點差異√熔點差異極性差異√吸附性質差異√兩相中的分配系數239.代謝組中物質分離可用LC進行，該技術主要是利用物質的哪些特點進行分離的[單選題]*沸點差異熔點差異極性差異吸附性質差異兩相中的分配系數√240.下列關于靶向代謝組學方法描述錯誤的是[多選題]*只能對少數已知代謝物進行定性和定量檢測既可以檢測已知物質，也可以檢測未知代謝物√靈敏度高，定量準確√靈敏度低，定量不準確241.下列關于非靶向代謝組學方法描述錯誤的是[多選題]*可以檢測數百至數千種代謝物質√既可以檢測已知物質，也可以檢測未知代謝物√定量和定性準確性相對較差√靈敏度高，定量和定性準確性較為準確242.細胞樣本做代謝組送樣重復說法正確的是[單選題]*每組不少于1個重復每組不少于3個重復√每組不少于2個重復可以不做重復243.百邁客可以做的蛋白質組學包括[多選題]*蛋白雙向電泳iTRAQ√TMT√lab-free√PRM√DIA√244.定量蛋白質組學中需要用同位素標記的是[多選題]*iTRAQ√TMT√lab-freePRMDIA245.以下屬于PRM產品優勢的是[多選題]*無需抗體√需要抗體輔助無物種限制√只部分物種適用一次檢測多個定量指標√246.以下哪些可以作為篩選差異代謝物的條件（）？[多選題]*均值差異倍數√t檢驗√VIP√247.質譜儀包括以下哪幾個部分（）？[多選題]*樣品引入√離子源√質量分析器√檢測器√248.TMT最多可同時標記（）個樣品？[單選題]*481016√249.TMT方案設計的原則有（）？[多選題]*生物學重復可分批上機√不同組織部位不要放在一組標記中檢測√需要比較的差異分組放在一組標記中√不同物種間需要比較的話可以搭橋250.iTRAQ與TMT的不同點是（）？[單選題]*實驗原理實驗流程標記試劑種類√實驗過程中需要酶解251.對于篩選得到的差異蛋白可以采用以下哪些手段進行下游的驗證實驗？（）[多選題]*2DPRM√Westernblot√ELISA√252.關于TMT實驗以下描述正確的有（）？[多選題]*需要標記試劑進行標記√實驗過程中需要進行酶解和液相分組√樣品單獨上機進行檢測不需要去除高峰度蛋白253.以下哪些樣本類型不能承諾指標（）？[多選題]*堅硬組織（樹皮、毛發、老化皮膚、骨組織、支架、昆蟲殼組織、貝殼、鈣化組織）√含高豐度蛋白的體液（血液、尿液、唾液、腦脊髓液、卵泡液、細胞或菌類培養基上清）√含高豐度蛋白的組織或細胞（卵細胞、肌肉組織、肌細胞相關組織、種子）√蛋白較少的組織或細胞（動物精子細胞、老化葉片、植物莖、果肉）√微生物√藻類（細菌真菌通常覆蓋度60%以上）√254.不同物種不同組織間差異蛋白比較，建議老師做什么（）？[單選題]*label-free√itraqTMT255.相同物種不同組織間差異蛋白比較，建議老師做什么（）？[單選題]*label-free√itraqTMT256.搭橋能解決itraq/TMT不同物種不同組織差異蛋白不能比較的問題嗎（）？[單選題]*能不能√257.搭橋能解決itraq/TMT相同物種不同組織差異蛋白不能比較的問題嗎（）？[單選題]*能不能√258.代謝組目前的檢測技術主要有哪些？（）[單選題]*LC-MSLC-MS、GC-MS、NMR√GC-MSNMR259.以下哪種說法是正確的？（）[單選題]*代謝組可以分批送樣檢測后合并結果客戶在其他公司測的代謝原始數據都可以在百邁客進行重新鑒定普通非靶LC-MS是相對定量√頂空非靶是絕對定量260.普通非靶LC-MS適用于哪些客戶？（）[多選題]*沒有明確的研究目標,希望比較樣品中代謝物的差異,縮小研究范圍√轉錄組+代謝組聯合分析鎖定關鍵通路中的基因和代謝物√希望檢測數量較多的物質,能夠覆蓋大部分種類的物質√初級代謝物√相對定量√261.蛋白質組學可以用來發現什么（）？[多選題]*蛋白質的表達水平√亞細胞定位√翻譯后的修飾√蛋白與蛋白相互作用√262.蛋白質修飾組學分幾個餾份嗎？（）[單選題]*123√4263.蛋白質組學的生物學重復如