1、NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation）,美國國家生物技術(shù)信息中心/urlNCBI是NIH的國立醫(yī)學圖書館（NLM的一個分支。NCBI提供檢索的服務(wù)包括：1 GenBank（NIH遺傳序列數(shù)據(jù)庫）：一個可以公開獲得所有的DNAff列的注釋過的收集。GenBanK由NCBI受過分子生物學高級訓練的工作人員通過來自各個實驗室遞交的序列和同國際核酸序列數(shù)據(jù)庫（EMBU口DDBJ交換數(shù)據(jù)建立起數(shù)據(jù)庫的。它同日本和歐洲分子生物學實驗室的DNAR據(jù)庫共同構(gòu)成了國際核酸序列數(shù)據(jù)庫合作。這三個組織每天交換數(shù)據(jù)。其中的數(shù)據(jù)以指數(shù)形式增長

2、，最近的數(shù)據(jù)為它已經(jīng)有來自47000個物種的30億個堿基。2 MolecularDatabases（分子數(shù)據(jù)庫）：NucleotideSequence（核酸序列庫）：從NCBI其他如Genbank數(shù)據(jù)庫中收集整理核酸序列，提供直接的檢索。ProteinSequence（蛋白質(zhì)序列庫）：與核酸類似，也是從NCBI多個不同資源中編譯整理的，方便研究者的直接查詢。Structure（結(jié)構(gòu)）-關(guān)于NCBI結(jié)構(gòu)小組的一般信息和他們的研究計劃，另外也可以訪問三維蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分子模型數(shù)據(jù)庫（MMDB和用來搜索和顯示結(jié)構(gòu)的相關(guān)工具。MMD分子模型數(shù)據(jù)庫一一個關(guān)于三維生物分子結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫，結(jié)構(gòu)來自于X-ray晶

3、體衍射和NM電譜分析。Taxonomy（分類學）NCBI的分類數(shù)據(jù)庫，包括大于7萬余個物種的名字和種系，這些物種都至少在遺傳數(shù)據(jù)庫中有一條核酸或蛋白序列。其目的是為序列數(shù)據(jù)庫建立一個一致的種系發(fā)生分類學。3 LiteratureDatabases（文獻數(shù)據(jù)庫）（1） PubMe忌NLME供的一項服務(wù)，能夠?qū)EDLINEt超過1200萬條的上世紀六十年代中期至今的雜志引用和其他的生命科學期刊進行訪問，并可以連接到參與的出版商網(wǎng)絡(luò)站點的全文文章和其他相關(guān)資源。（2） PMC/PubMeCenter:也是NLM勺生命科學期刊文獻的數(shù)字化存儲數(shù)據(jù)庫，用戶可以免費獲取PMC勺文章全文，除了部分期刊要求

4、對近期的文章付費。（3） OMIM（孟德爾人類遺傳）：有關(guān)人類基因和無序基因的目錄數(shù)據(jù)庫由VictorA.McKusick和他的同事共同創(chuàng)造和編輯的，由NCBI網(wǎng)站負責開發(fā)，具中也包括對MEDIN歐多資源和Entrez系統(tǒng)的序列記錄，以及NCBI中其他有關(guān)資源的鏈接。（4） Books：NCBI的書庫不斷收集生物醫(yī)學方面的書籍，提供這些書籍的出版信息、摘要、目錄和全文的連接，用戶可以直接在檢索文本框內(nèi)輸入一個觀念就可以查詢。4 NCBI提供的附加的軟件工具有：開放閱讀框?qū)ひ捚?ORFFinder),電子PCR和序列提交工具Sequin和BankIt。所有的NCBI數(shù)據(jù)庫和軟件工具可以從WWWF

5、TP來獲得。NCBI還有E-mail服務(wù)器，提供用文本搜索或序列相似搜索訪問數(shù)據(jù)庫一種可選方法。NCBI網(wǎng)站上還提供了一些諸如研究熱點問題、研究小組情況、教育培訓、聯(lián)系方式等信息，還提供了到NIH、NLM等的鏈接。使用方法:用戶可以免費登陸NCBI的網(wǎng)站，NCBI為使用者提供了方便的檢索系統(tǒng)和檢索方法：1. Entrez是NCBI為用戶提供整合所有數(shù)據(jù)庫的訪問序列，定位，分類，和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的搜索和檢索工具系統(tǒng)，同時也提供序列和染色體圖譜的圖形視圖。用戶進入系統(tǒng)或者進入任意一個數(shù)據(jù)庫，都會看到簡單檢索的界面，選擇數(shù)據(jù)庫輸入關(guān)鍵詞即可進行查詢。Entrez也提供條件限制和高級檢索、布爾邏輯查詢。使用

6、新的Linkout服務(wù)，外部資源可以被鏈接到Entrez記錄。2. BLAST1一個NCBI開發(fā)的序列相似搜索程序，還可作為鑒別基因和遺傳特點的手段。BLASTS夠在小于15秒的時間內(nèi)對整個DNAt據(jù)庫執(zhí)行序列搜索。NCBIE/Education/index.html網(wǎng)址詳情:這是NCBI在線教育資源的索引頁，從這里出發(fā)你會找到NCBI提供的教學資源，這些教程不僅囊括了NCBI網(wǎng)站提供的最常用的工具和數(shù)據(jù)庫(BLAST，Entrez，PubMed，NCBINews，Resourcepublications，MapViewerexercises，Structure

7、,NCBIHandboo3的使用方法和信息，還有一些相關(guān)的分子生物學的基礎(chǔ)入門知識(NCBIscienceprimer.)。教程大多不僅有文字圖片還有動畫，直觀易懂，目的就是一個讓大家盡可能快而有效的掌握好NCBI的使用，在這個聚寶盆里淘到真金。當然您如果想對所有NCBI的數(shù)據(jù)庫和工具有更透徹深入的了解，請絕對不要錯過共24章的NCBI手冊(NCBIHandbook)/books/bv.fcgi?rid=handbook/urlGenBank數(shù)據(jù)庫簡介1. GenBank屬于一個序列數(shù)據(jù)庫的國際合作組織，包括EMBU口DDBJ是NIH遺傳序列數(shù)據(jù)庫，一個所有可以公開獲得的

8、DNAff列的注釋過的收集。GenBank日本和歐洲分子生物學實驗室的DN徽據(jù)庫共同構(gòu)成了國際核酸序列數(shù)據(jù)庫合作。唯一人類基因序列集合（UniGene）,人類基因組基因圖譜，分類學瀏覽器，同國立癌癥研究所合作的癌癥基因組剖析計劃（CGAP等數(shù)據(jù)庫。GenBank以指數(shù)形式增長，核酸堿基數(shù)目大概每14個月就翻一個倍。2. 紀錄樣本-關(guān)于GenBank的各個字段的詳細描述，以及同Entrez搜索字段的交叉索引。3. 訪問GenBank-通過EntrezNucleotides來查詢。用accessionnumber，作者姓名，物種，基因/蛋白名字，還有許多其他的文本術(shù)語來查詢。關(guān)于Entrez更多的

9、信息請看下文。用BLAS怵在GenBan刷其他數(shù)據(jù)庫中進行序列相似搜索。用E-mail來訪問Entrez和BLASTS以通過Query和BLAST務(wù)器。另外一種選擇是可以用FTP下載整個的GenBan麻口更新數(shù)據(jù)。4. 增長統(tǒng)計-參見公布通知的，5. 公布通知，最新-最近和即將有的變化，GenBan加分類，數(shù)據(jù)增長統(tǒng)計，GenBan珀勺引用。6. 公布通知，舊-同上相同，是過去公布的統(tǒng)計。7. 遺傳密碼-15個遺傳密碼的概要。用來確保GenBank中紀錄的編碼序列被正確的翻譯。向GenBankgl交數(shù)據(jù)：1. 關(guān)于提交序列數(shù)據(jù)，收到accessionnumber,和對紀錄作更新的一般信2. B

10、ankIt-用于一條或者少數(shù)條提交的基于WWW提交工具軟件。（請在提交前用VecScreen去除載體）3. Sequin-提交軟件程序，用于一條或者很多條的提交，長序列，完整基因組，alignments，人群/種系/突變研究的提交。可以獨立使用，或者用基于TCP/IP的“networkaware”模式，可以鏈接到其他NCBI的資源和軟件比如Entrez和PowerBLAST（請在提交前用VecScreen去除載體）4. ESTs-表達序列標簽，短的、單次（測序）閱讀的cDNAff列。也包括來自于差異顯示和RAC改驗的cDNAff列。5. GSSs-基因組調(diào)查序列，短的、單次（測序）閱讀的cDN

11、Aff歹1，exontrap獲得的序列，cosmid/BAC/YAC末端，及其他。6. HTGs-來自于大規(guī)模測序中心的高通量基因組序列，未完成的（階段0，6.2） 和完成的（階段3）序列。（注意：完成的人類的HT的歹1可以同時在GenBank和HumanGenomeSequencing面上訪問。）7. STSs-序列標簽位點。短的在基因組上可以被唯一操作的序列，用于產(chǎn)生作圖位點。8. 注：SNPs-人類的和其他物種的遺傳變異數(shù)據(jù)可以提交到NCBI數(shù)據(jù)庫的單核苷酸多態(tài)性庫中（dbSNP）。國際核苷酸序列數(shù)據(jù)庫合作組織：1. GenBank，DDBJ，EMBL-合作計劃的概述，并鏈接到相應(yīng)的主頁

12、。GenBank，DDBJ（DNADataBankofJapan），andEMBL（EuropeanMolecularBiologyLaboratory）數(shù)據(jù)庫共享的數(shù)據(jù)是每天都交換的，因此他們是相等的。數(shù)據(jù)紀錄的格式和搜索方式可能會不一樣，但是accessionnumber，序列數(shù)據(jù)和注解都是一模一樣的。即，你可以用accessionnumberU12345在GenBankDDB或EMBW查找相應(yīng)紀錄，得到的結(jié)果是完全一樣的序列數(shù)據(jù)，參考內(nèi)容等等2. DDBJ/EMBJ/GenBank#性表一特性表格式和標準被合作數(shù)據(jù)庫用在序列記錄的注釋上，使得數(shù)據(jù)共享成為可能，包括詳細的描述生物特性和特性

13、限定語的附錄，以及IUPAC規(guī)定的核甘酸和氨基酸的代號。FTPGenBankandDailyUpdates：1. GenBank普通文件格式一參見GenBank己錄樣本和在GenBan公布通知中的詳細描述，下載大多數(shù)最近的完全公告和日常積累或非積累更新數(shù)據(jù)。2. ASN.1格式一摘要句法記號1,國際標準組織（ISO）數(shù)據(jù)表示格式，下載大多數(shù)最近的完全公告和日常積累或非積累更新數(shù)據(jù)。3. FASTA格式定義行號后只跟隨序列數(shù)據(jù)（示例），參見描述數(shù)據(jù)庫的readme文件，包括nt.Z（每天更新的非冗余BLASTS酸數(shù)據(jù)庫，包括GenBank+EMBL+DDBJ+PDB,但是不包括EST,STS,G

14、SS,orHTGS序歹U）,nr.Z（每日更新的非冗余蛋白質(zhì)），est.Z,gss.Z,htg.Z,sts.Z,和其它文件。分子數(shù)據(jù)庫：1、 核酸序列1、Entrez核酸：用accessionnumber,作者姓名，物種，基因/蛋白名字，以及很多其它的文本術(shù)語來搜索核酸序列記錄（在GenBank+PDB中）。更多的關(guān)于Entrez的信息見下。如果要檢索大量數(shù)據(jù)，也可使用BatchEntrez（批量Entrez）。2、 RefSeq：NCBI數(shù)據(jù)庫的參考序列。校正的，非冗余集合，包括基因組DNAcontigs,已知基因的mRNA舌口蛋白，在將來，整個的染色體。Accessionnumbers用N

15、T_xxxxxx,NM_xxxxxx,NP_xxxxxx,和NC_xxxxxx的形式來表示。3、 dbEST:表達序列標簽數(shù)據(jù)庫，短的、單次（測序）閱讀的cDNAff列。也包括來自于差異顯示和RAC改驗的cDNAff列。4、 dbGSS：基因組調(diào)查序列的數(shù)據(jù)庫，短的、單次（測序）閱讀的cDNA序列，exontrap獲得的序列，cosmid/BAC/YAC末端，及其他。5、 dbSTS：序列標簽位點的數(shù)據(jù)庫，短的在基因組上可以被唯一操作的序列，用于產(chǎn)生作圖位點。6、 、dbSNP:單核甘酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫，包括SNPs小范圍的插入/缺失，多態(tài)重復單元，和微衛(wèi)星變異。7、 完整的基因組：8、 參見下面

16、Genom口Maps部分，包括各種物種資源，人，小鼠，大鼠，酵母，線蟲，瘧原蟲，細菌，病毒，viroids，質(zhì)粒。9、 發(fā)UniGene:被整理成簇的ESTffi全長mRNAF歹1，每一個代表一種特定已知的或假設(shè)的人類基因，有定位圖和表達信息以及同其它資源的交叉參考。序列數(shù)據(jù)可以以cluster形式在Unigene網(wǎng)頁下載，完整的數(shù)據(jù)可以從FTP站點repository/UniGene目錄下下載。1） 人類：UniGene2） 小鼠：UniGene3） 大鼠：UniGene4） 斑馬魚：UniGene3、 BLAST：將你的序列同核酸庫中的的序列比較，檢索相似的序列。（更詳細的信息見下面Too

17、ls/Sequence相似搜索部分）蛋白序列：1、Entrez蛋白：用accessionnumber,作者姓名，物種，基因/蛋白名字，以及很多其它的文本術(shù)語來搜索蛋白序列記錄（在GenPept+Swiss-Prot+PIR+RPF+PDB中）。更多的關(guān)于Entrez的信息見下。如果要檢索大量數(shù)據(jù)，也可使用BatchEntrez（批量Entrez）。RefSeqNCBI數(shù)據(jù)庫的參考序列。Curated,非冗余集合包括基因組DNAcontigs,已知基因的mRNAs5蛋白，在將來，整個的染色體。Accessionnumbers用NT_xxxxxx,NM_xxxxxx,NP_xxxxxx,和NC_x

18、xxxxx的形式來表示。FTPGenPept下載“，這個文件包含了從GenBank/EMBL/DDj錄中翻譯過來的FASTA格式的氨基酸序列，這些記錄都有一到兩個CDS$性的描述。2、完整基因組：參見下面Genom等口Maps部分，包括各種物種資源，人，小鼠，大鼠，酵母，線蟲，瘧原蟲，細菌，病毒，viroids，質(zhì)粒。1） Entrez基因組：提供了一個編碼區(qū)的概要和各種物種的分類表（TaxTable）。編碼區(qū)概要列出了在基因組中所有的的蛋白，并提供鏈接到FASTA文件和BLAST分類表總結(jié)了蛋白BLAS吩析的結(jié)果，建議他們的可能功能，并用顏色編碼的圖來顯示物種同其它物種之間的關(guān)系（參見下面G

19、enomes和Maps,'部分Entrez基因組的一般描述）2） FTP基因組蛋白：從ftp站點的genbank/genomes目錄下下載各種物種的FASTA&式的氨基酸序列*faa和蛋白表文件*ptt。參見readme文件。蛋白表也可以在Entrez基因組中看到。3、PROW:Web上的蛋白資源，關(guān)于大約200種人類的CCffl胞表面分子的簡短官方向?qū)А；ハ鄼z索，為每個CD抗原提供大約20中標準信息的分類（生化功能，配體，等等）4、 BLAST：將你的序列同蛋白庫中的的序列比較，檢索相似的序列。（更詳細的信息見下面Tools/Sequence相似搜索部分）結(jié)構(gòu)：1、結(jié)構(gòu)主頁一

20、關(guān)于NCBI結(jié)構(gòu)小組的一般信息和他們的研究計劃，另外也可以訪問分子模型數(shù)據(jù)庫（MMDB和用來搜索和顯示結(jié)構(gòu)的相關(guān)工具。5、 MMD：B分子模型數(shù)據(jù)庫一個關(guān)于三維生物分子結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫，結(jié)構(gòu)來自于X-ray晶體衍射和NM電譜分析。MMDBI來源于Brookhaven蛋白數(shù)據(jù)庫（PDB三維結(jié)構(gòu)的一部分，排除了那些理論模型。MMDB新組織和驗證了這些信息，從而保證在化學和大分子三維結(jié)構(gòu)之間的交叉參考。數(shù)據(jù)的說明書包括生物多聚體的空間結(jié)構(gòu)，這個分子在化學上是如何組織的，以及聯(lián)系兩者的一套指針。利用將化學，序列，和結(jié)構(gòu)信息整合在一起，MMDB劃成為基于結(jié)構(gòu)的同源模型化和蛋白結(jié)構(gòu)預測的資源服務(wù)。MMDB記錄

21、以ASN.1格式存儲，可以用Cn3D,Rasmol,或Kinemage來顯示。另外，數(shù)據(jù)庫中類似的結(jié)構(gòu)已經(jīng)被用VAST確認，新的結(jié)構(gòu)可以用VASTsearch來同數(shù)據(jù)庫進行比較。3、Cn3D“Seein3-D',一個用于NCBI數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)和序列相似顯示工具，它允許觀察3-D結(jié)構(gòu)和序列一結(jié)構(gòu)或結(jié)才結(jié)構(gòu)同源比較。Cn3D用起來就象你瀏覽器上的一個幫助工具。4、VAST一源量同源比較搜索工具一一個在NCBI開發(fā)的計算算法，用于確定相似的蛋白三維結(jié)構(gòu)。每一個結(jié)構(gòu)的“結(jié)構(gòu)鄰居”都是預先計算好的，而且可以通過MMD的結(jié)構(gòu)概要頁面的鏈接訪問。這些鄰居可以用來確認那些不能被序列比較識別的遠的同源性。

22、5、VAST搜索結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)相似搜索服務(wù)。比較一個新解出的蛋白結(jié)構(gòu)和在MMDB/PDB據(jù)庫中的結(jié)構(gòu)的三維坐標。VAST®索計算一系列可能會被交互瀏覽的結(jié)構(gòu)鄰居，用分子圖形來觀察重疊和同源相似。分類學：1、NCBI的分類數(shù)據(jù)庫主頁關(guān)于分類計劃的一般信息，包括分類資源和同NCBI分類學家合作的外部管理者的列表。2、分類瀏覽器一搜索NCBI的分類數(shù)據(jù)庫，包括大于70000個物種的名字和種系，這些物種都至少在遺傳數(shù)據(jù)庫中有一條核酸或蛋白序列。可以檢索一個特定種或者更高分類（如屬，科）的核酸，蛋白，和結(jié)構(gòu)記錄。如果有新物種的序列數(shù)據(jù)被放到數(shù)據(jù)庫中，這個物種就北加到（分類）數(shù)據(jù)庫中。NCBI的分類數(shù)

23、據(jù)庫的目的是為序列數(shù)據(jù)庫建立一個一致的種系發(fā)生分類學。文獻數(shù)據(jù)庫概要：1、PubMed一個關(guān)于生物醫(yī)藥科學的檢索系統(tǒng)，包括引用，摘要，和雜志的索引術(shù)語。它包括直接由出版商提供給NCBI的文獻引用以及鏈接到在出版商網(wǎng)址上的全文的URLsPubMe血括MEDLIN醫(yī)口PREMEDLINE完整內(nèi)容。它還包括一些被MEDLINEA為超出范圍的文章和雜志，（這些文章或雜志）由于內(nèi)容或在某一時期不在索引范圍內(nèi)。因此PubMe配比MEDLINE勺更大的集合。2、雜志瀏覽器一允許你去查找收錄到PubMedS統(tǒng)的雜志的名字，MEDLINE勺縮寫，或ISSN號碼。3、PubRef（開發(fā)中）一一個關(guān)于來自于廣大范圍

24、的科學雜志的數(shù)目記錄，和鏈接到出版商網(wǎng)址的全文。PubRef包含了PubMEd加上了來自其它學科的雜志出版商提供的引用和摘要。因此它是比PubMed更大的集合。這個計劃的啟動是因為NASg求為科學領(lǐng)域的核心刊物提供一個“白皮書”服務(wù)。4、PubMed中心（開發(fā)中）一PubMed中心是一個無障礙的NIH資源，用于在生命科學領(lǐng)域中同業(yè)互查的基礎(chǔ)研究報告。從2000年一月開始接受雜志文章。所有在PubMe葉心的材料將由目前任一主要的摘要和索引服務(wù)中列出的雜志提供，或者在編輯委員會中擁有3個以上有主要資金機構(gòu)的研究經(jīng)費的擁有人的雜志提供。5、 OMIM在線人類孟德爾遺傳經(jīng)常更新的人類基因和遺傳失調(diào)的目

25、錄，有鏈接到其它相關(guān)的文獻參考，序列記錄，和相關(guān)數(shù)據(jù)庫。6、書籍一同書籍出版商合作NCBI為網(wǎng)絡(luò)改編了教科書，并把他們鏈接到PubMe土生物醫(yī)藥書目數(shù)據(jù)庫。這是為了給PubMedS供背景信息，這樣使用者可以探究在PubMec®索結(jié)果中不熟悉的概念。目前收錄的書有：7、 MolecularBiologyoftheCell,3rded.AlbertsB.,BrayD.,LewisJ.,RaffM.,RobertsK.,WatsonJ.D.,1994,GarlandPublishing.8、 外部鏈接一個登記服務(wù)，用于建立從在Entrez中的特定的文章，雜志，或生物數(shù)據(jù)到外部網(wǎng)址的鏈接。第

26、三方可以提供一個URL資源名字，關(guān)于他們網(wǎng)址的簡要的描述，和關(guān)于從NCBI數(shù)據(jù)的哪里他們希望建立鏈接的詳細說明。這個詳細說明可以用對Entrez有效的布爾查詢來寫，也可以用特定的文章或序列的標志列表來寫。這樣NCBIPubMed勺用戶將可以通過“NCBI小房間”服務(wù)（開發(fā)中）來選擇哪個外部鏈接在他們的搜索中是可見的。9、引用匹配一允許你找到任何一篇在PubMe嗷據(jù)庫中白文章的PubMedID或MEDLINEUID給出書目信息（雜志，卷，頁碼等）。10、 單篇文章的引用匹配。11、 許多文章的批量引用匹配。12、 E-mail引用匹配也是可以的，也可以用于單篇或許多文章。如果要獲得幫助文件，給e

27、mail=citation_matcherGenomesandMapsOverview：1、 Entrez基因組：人，小鼠，大鼠，酵母，線蟲，瘧原蟲，細菌，病毒，viroids，質(zhì)粒，和真核細胞器。2、 Entrez基因組（各種物種）3、Entrez基因組一超過800種在GenBan被完整測序的物種，包括大于500種病毒，25種細菌，酵母，和許多viroids，質(zhì)粒，和細胞器。還包括正在進行中的基因組，比如人，小鼠，線蟲，瘧原蟲，果蠅，利什曼原蟲，水稻，和玉米。提供完成的基因組/染色體的圖形概覽，并可以探究那些逐步細化的區(qū)域。也提供那些已經(jīng)被NCBI工作人員分析過的物種的編碼區(qū)的摘要和TaxT

28、ables。另外，EntrezMapViewer,Entrez基因組的一個軟件組成部分，提供整合的果蠅（細胞遺傳學和序列圖譜）和人類（細胞遺傳學，遺傳連鎖，序列，放射雜交，和其它圖譜）的染色體圖譜的瀏覽。4、 通過每個物種的Entrez基因組頁面來下載350kb的基因組。5、 通過NCBIftp站點來下載350kb的基因組參見在genbank/genomes目錄下的readme文件，ftp鏈接在每個物種的Entrez基因組頁面上也有。NCBI站點地圖一其他基因組數(shù)據(jù)介紹：1、小鼠基因組1)小鼠基因組資源向?qū)В喊褟母鱾€中心來的各種小鼠相關(guān)的資源整合在一起，包括序列，圖譜，和克隆信息以及指向小鼠種

29、系和突變資源的指針。2)小鼠基因組測序：小鼠基因組計劃的測序進展，HTGff列contigs(可以用大小和染色體號來瀏覽)由測序中心的數(shù)據(jù)建立，可以contig或染色體的形式來下載。3)小鼠UniGene:被整理成簇的ESTffi全長mRN航列，每一個代表一種特定已知的或假設(shè)的基因，有定位圖和表達信息以及同其它資源的交叉參考。序列數(shù)據(jù)可以以cluster形式在Unigene網(wǎng)頁下載，完整的數(shù)據(jù)可以從FTP站點repository/UniGene目錄下下載4) 位點鏈接(LocusLink)：為校正過的序列和遺傳位點的描述信息提供一個單次查詢界面。LocusLink給每個位點發(fā)布一個穩(wěn)定的ID，

30、并提供官方的命名，序列accesssionnumber，Unigene簇，圖譜信息，和相關(guān)的網(wǎng)址。LocusLink是NCBI,人類基因命名委員會，OMIMF口其它組織的合作結(jié)果。LocusLink目前包含人類，小鼠，大鼠，斑馬魚，和果蠅的位點，物種可以被分開或合在一起查詢。70000 個物種的序列數(shù)據(jù)，可以用物種字段來限5) Entrez：包括了來自制記錄只在小鼠搜索。6) 人類/小鼠同源圖：UniversityofCaliforniaatDavis的M.F.Seldin建立，一張比較人和老鼠在同源區(qū)段DNA1基因的表，按在每個基因組上的位置排列。2、 大鼠基因組1)大鼠UniGene:被整

31、理成簇的ESTffi全長mRN航列，每一個代表一種特定已知的或假設(shè)的基因，有定位圖和表達信息以及同其它資源的交叉參考。序列數(shù)據(jù)可以以cluster形式在Unigene網(wǎng)頁下載，完整的數(shù)據(jù)可以從FTP站點repository/UniGene目錄下下載2) 位點鏈接(LocusLink)：為校正過的序列和遺傳位點的描述信息提供一個單次查詢界面。LocusLink給每個位點發(fā)布一個穩(wěn)定的ID，并提供官方的命名，序列accesssionnumber，Unigene簇，圖譜信息，和相關(guān)的網(wǎng)址。LocusLink是NCBI,人類基因命名委員會，OMIMK其它組織的合作結(jié)果。LocusLink目前包含人類，

32、小鼠，大鼠，斑馬魚，和果蠅的位點，物種可以被分開或合在一起查詢。3、 斑馬魚基因組1)斑馬魚UniGene:被整理成簇的ESTW全長mRN航列，每一個代表一種特定已知的或假設(shè)的基因，有定位圖和表達信息以及同其它資源的交叉參考。序列數(shù)據(jù)可以以cluster形式在Unigene網(wǎng)頁下載，完整的數(shù)據(jù)可以從FTP站點repository/UniGene目錄下下載2) 位點鏈接(LocusLink)：為校正過的序列和遺傳位點的描述信息提供一個單次查詢界面。LocusLink給每個位點發(fā)布一個穩(wěn)定的ID，并提供官方的命名，序列accesssionnumber，Unigene簇，圖譜信息，和相關(guān)的網(wǎng)址。Lo

33、cusLink是NCBI,人類基因命名委員會，OMIMF口其它組織的合作結(jié)果。LocusLink目前包含人類，小鼠，大鼠，斑馬魚，和果蠅的位點，物種可以被分開或合在一起查詢。4、 果蠅基因組1) 黑腹果蠅主頁：提供所有可使用的果蠅資源的概要，用圖形的方式顯示了染色體，允許你通過Entrez基因組瀏覽器的方法來搜索整個基因組的細胞遺傳和序列信息。Entrez基因組提供了對于一個物種一致的遺傳，物理，和序列數(shù)據(jù)的圖形界面。當你用一個基因的代號來搜索時，它給出搜索結(jié)果的一個圖形的基因組視圖，從那你可以放大到你所感興趣的區(qū)域的更詳細的圖譜視圖，并且鏈接到序列數(shù)據(jù)和包含更多信息的相關(guān)資源。2) 黑腹果蠅

34、基因組測序的狀態(tài)：描述了目前在GenBank，EntrezGenome，s和FTP站點中的數(shù)據(jù)的范圍3) Entrez圖譜瀏覽器：整合的染色體圖譜圖譜瀏覽器是Entrez基因組的一個軟件組成部分，用來顯示一個或多個用共同標記或基因名字互相align過的圖譜，以及用相同序列進行比較過的序列圖譜。在人類基因組數(shù)據(jù)和搜索技巧文件中有關(guān)于目前可以使用的果蠅的序列和細胞遺傳學圖譜。Entrez圖譜瀏覽器的幫助文件提供了關(guān)于如何使用這個工具的一般說明。4) 位點鏈接(LocusLink)：為校正過的序列和遺傳位點的描述信息提供一個單次查詢界面。LocusLink給每個位點發(fā)布一個穩(wěn)定的ID，并提供官方的命名，序列accesssionnumber，Unigene簇，圖譜信息，和相關(guān)的網(wǎng)址。LocusLink是NCBI,人類基