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文檔簡介
1、傳染病模型摘要當今社會,人們開始意識到通過定量地研究傳染病的傳播規(guī)律,建立傳染病的傳播模型,可以為預測和控制傳染病提供可靠、足夠的信息。本文利用微分方程穩(wěn)定性理論對傳統(tǒng)傳染病動力學建模方式進行綜述,且針對甲流,SARS等新生傳染病模型進行建模和分析。不同類型的傳染病的傳播過程有其各自不同的特點,我們不是從醫(yī)學的角度一一分析各種傳染病的傳播,而是從一般的傳播機理分析建立各種模型,如簡單模型,SI模型,SIS模型,SIR模型等。本文中,我們應用傳染病動力學模型來描述疾病發(fā)展變化的過程和傳播規(guī)律,運用聯(lián)立微分方程組體現(xiàn)疫情發(fā)展過程中各類人的內(nèi)在因果聯(lián)系,并在此基礎上建立方程求解算法。然后,通過借助M
2、atlab程序擬合出與實際較為符合的曲線并進行了疫情預測,評估各種控制措施的效果,從而不斷完善文中的模型。本文由簡到難、全面地評價了該模型的合理性與實用性,而后對模型和數(shù)據(jù)也做了較為扼要的分析,進一步改進了模型的不妥之處。同時,在對問題進行較為全面評價的基礎上又引入更為全面合理的假設,運用雙線性函數(shù)模型對衛(wèi)生部的措施進行了評價并給出建議,做好模型的完善與優(yōu)化工作。關鍵詞:傳染病模型,簡單模型,SI,SIS,SIR,微分方程,Matlab一、問題重述有一種傳染病(如SARS甲型H1N1正在流行,現(xiàn)在希望建立適當?shù)臄?shù)學模型,利用已經(jīng)掌握的一些數(shù)據(jù)資料對該傳染病進行有效地研究,以期對其傳播蔓延進行必
3、要的控制,減少人民生命財產(chǎn)的損失。考慮如下的幾個問題,建立適當?shù)臄?shù)學模型,并進行一定的比較分析和評價展望。1、不考慮環(huán)境的限制,設單位時間內(nèi)感染人數(shù)的增長率是常數(shù),建立模型求t時刻的感染人數(shù)。2、假設單位時間內(nèi)感染人數(shù)的增長率是感染人數(shù)的線性函數(shù),最大感染時的增長率為零。建立模型求t時刻的感染人數(shù)。3、假設總人口可分為傳染病患者和易感染者,易感染者因與患病者接觸而得病,而患病者會因治愈而減少且對該傳染病具有很強的免疫功能,建立模型分析t時刻患病者與易感染者的關系,并對傳染情況(如流行趨勢,是否最終消滅)進行預測。二、問題分析1、這是一個涉及傳染病傳播情況的實際問題,其中涉及傳染病感染人數(shù)隨時間
4、的變化情況及一些初始資料,可通過建立相應的微分方程模型加以解決。2、問題表述中已給出了各子問題的一些相應的假設。3、在實際中,感染人數(shù)是離散變量,不具有連續(xù)可微性,不利于建立微分方程模型。但由于短時間內(nèi)改變的是少數(shù)人口,這種變化與整體人口相比是微小的。因此,為了利用數(shù)學工具建立微分方程模型,我們還需要一個基本假設:感染人數(shù)是時間的連續(xù)可微函數(shù)。三、模型假設模型二和模型三的假設條件:假設一:在疾病傳播期內(nèi)所考察地區(qū)的總人數(shù)N不變,即不考慮生死,也不考慮遷移。人群分為易感染者(Susceptible)和已感染者(Infective)兩類(取兩個詞的第一個字母,稱之為SI模型),以下簡稱健康者和病人
5、。時刻t這兩類人在總人數(shù)中所占比例分別記作s(t)和i(t)。假設二:每個病人每天有效接觸的平均人數(shù)是常數(shù),稱為日接觸率。當病人與健康者接觸時,使健康者受感染變?yōu)椴∪恕<僭O三:模型三在假設一和假設二的基礎上進行考慮,然后設病人每天治愈的比例為稱為日治愈率。病人治愈后成為仍可被感染的健康者,顯然1/N是這種傳染病的平均傳染期。模型四的假設條件:假設四:總人數(shù)N不變。人群分為健康者、病人和病愈免疫的移出者(Removed三類,稱SIR模型。三類人在總數(shù)N中占的比例分別記作s(t),i(t)和r(t)。假設五:病人的日接觸率為K,日治愈率為N(與SI模型相同),傳染期接觸為。二大/2四、符號說明t某
6、一具體時刻x(t)病人人數(shù)九每天每個病人有效接觸的人數(shù)N總人數(shù)s(t)健康者總人數(shù)i(t)病人總人數(shù)i0初始時刻病人的比例tm病人的最大值口、日治愈率1/平均傳染率二接觸率r(t)移出者So初始時刻健康者的比例五、模型的建立與求解模型1在這個最簡單的模型中,設時刻t的病人人數(shù)x(t)是連續(xù)、可微函數(shù),并且每天每個病人有效接觸(足以使人致病的接觸)的人數(shù)為常數(shù)人,考察t至產(chǎn)十位病人人數(shù)的增加,就有x(tt)x(t)-,x(t)t再設t=0時有xo有個病人,即得微分方程dx='x,x(0)=x0(1)dt方程(1)的解為x(t)=xoe,t(2)結果表明,隨著t的增加,病人人數(shù)x(t)無限
7、增長,這顯然是不符合實際的。建模失敗的原因在于:在病人有效接觸的人群中,有健康人也有病人,而其中只有健康人才可以被傳染為病人,所以在改進的模型中必須區(qū)別這兩種人。模型2(SI模型)根據(jù)假設,每個病人每天可使Xs(t)個健康者變?yōu)椴∪耍驗椴∪藬?shù)為Ni(t),所以每天共有,由5代)4)個健康者被感染,于是兒Nsi就是病人數(shù)Ni的增加率,即diNNsi(3)dt又因為s(t)i(t)=1(4)再記初始時刻(t=0)病人的比例為i0,則dii(1-i),i(0)=iodt(6)方程(5)是Logistic模型。它的解為1.t-1e-io由(5),(6)式及圖1可知,第一,當i=1/2時d到達最大值:
8、,這個時刻為dtdtmtm=Tn一-1io這時病人增加的最快,可以認為是醫(yī)院的門診量最大的一天,預示著傳染病高潮的到來,是醫(yī)療衛(wèi)生部門關注的時刻。tm與,成反比,因為日接觸率,表示該地區(qū)的衛(wèi)生水平,九越小衛(wèi)生水平越高。所以改善保健設施、提高衛(wèi)生水平可以推遲傳染病高潮的到來。第二,當tT8時iT1,即所有人終將被傳染,全變?yōu)椴∪耍@顯然不符合實際情況。其原因是模型中沒有考慮到病人可以治愈,人群中的健康者只能變成病人,病人不會再變成健康者。模型3(SIS模型)有些傳染病如傷風、痢疾等愈合后免疫力很低,可以假定無免疫性,于是病人被治愈后變成健康者,健康者還可以被感染再變成病人,所以這個模型成為SIS
9、模型。考慮到這一模型的假設條件,于是有Ni(t+&)-i】=KNsi&-NNi(8)可得微分方程di=Zj(1-i)-內(nèi)i(0)=i0(9)dt定義昨%(10)其中仃是整個傳染期內(nèi)每個病人有效接觸的平均人數(shù),稱為接觸數(shù)。得到(11)didt=-"-(1-1/二)'模型4(SIR模型)大多數(shù)傳染者如天花流感肝炎麻疹等治愈后均有很強的免疫力,所以病愈的人既非健康者(易感染者),也非病人(已感染者),因此他們將被移除傳染系統(tǒng),我們稱之為移除者,記為R類。SIR模型是指易感染者被傳染后變?yōu)楦腥咀。胁≌呖梢员恢斡a(chǎn)生免疫力,變?yōu)橐瞥摺H藛T流動圖為:S-I-R。
10、1.模型構成:(12)在假設1中顯然有:s(t)+i(t)+r(t)=1(13)對于病愈免疫的移出者的數(shù)量應為N=Nidt不妨設初始時刻的易感染者、染病者、恢復者的比例分別為s0(so>0),i0(i0>0),r0=0,則SIR基礎模型用微分方程組表示如下:di.it.=九Si一出dt(14)ds.一二一Sidtdr=Nidts(t),i(t)的求解極度困難,在此我們先做數(shù)值計算來預估計s(t),i(t)的一般變化規(guī)律。2,數(shù)值計算在方程(3)中設入=1,仙=0,3,i(0)=0.02,s(0)=0.98,用MATLAB軟件編程:functiony=ill(t,x)a=1;b=0.
11、3;y=a*x(1)*x(2)-b*x(1);-a*x(1)*x(2);ts=0:50;x0=0.20,0.98;t,x=ode45('ill',ts,x0);plot(t,x(:,1),t,x(:,2)pauseplot(x(:,2),x(:,1)輸出的簡明計算結果列入表1。i(t),s(t)的圖形以下兩個圖形,is圖形稱為相軌線,初值i(0)=0.02,s(0)=0.98相當于圖2中的P0點,隨著t的增,(s,i)沿軌線自右向左運動.由表1、圖1、圖2可以看出,i(t)由初值增長至約t=7時達到最大值,然后減少,t一oo,i-o,s(t)則單調(diào)減少,t一oo,s-0.039
12、8.并分析i(t),s(t)的一般變化規(guī)律.表1i(t),s(t)的數(shù)值計算結果t012345678i(t)10.02000.03900.07320.12850.20330.27950.33120.34440.3247s(t)0.98000.95250.90190.81690.69270.54380.39950.28390.2027t910152025130354045i(t)0.28630.24180.07870.02230.00610.00170.00050.00010s(t)0.14930.11450.05430.04340.04080.04010.03990.03990.0398107
13、,63.相軌線分析我們在數(shù)值計算和圖形觀察的基礎上,利用相軌線討論解(t),s(t)的性質(zhì)。(s,i)|s>0,i>0,s+i<1(15)在方程(14)中消去dt并注意到(T的定義,可得所以:dds|s=50=io(16)di1-1dsIsb)iidii0s1丁r-1d(T利用積分特性容易求出方程(5)的解為:(17)1si=(s°i°)-s=-ln在定義域D內(nèi),(17)式表示的曲線即為相軌線,如圖3所示.其中箭頭表示了隨著時間t的增加s(t)和i(t)的變化趨向卜面根據(jù)(14),(17)式和圖3分析s(t),i(t)和r的變化情況(t一麗它們的極限值分別
14、記作Sg,/和.1 .不論初始條件s0,i0如何,病人將消失,即:tTs,i-02 .最終未被感染的健康者的比例是,在式中令i=0得到,是方soi0-s-1ln=0一二s在(0,1/b)內(nèi)的根.在圖形上是相軌線與s軸在(0,1/6)內(nèi)交點的橫坐標3 .若%>1/*則開始有5=工-11ao,i(t)先增加,令5=21=0,可dsl.s(TJdsIs(T)得當s=1/o-時,i(t)達到最大值:1im=%-i0-(1.ln二So)a然后s<1/(T時,有d_J工_il<o,所以i(t)減小且趨于零,s(t)則單調(diào)減小dsIS(T)至S®,如圖3中由P1(So,i0)出發(fā)
15、的軌線4 .若%<1/,則恒有5=211<0,i(t)單調(diào)減小至零,s(t)單調(diào)減小至s*dsIs)如圖3中由P2(s0,i0)出發(fā)的軌線可以看出,如果僅當病人比例i(t)有一段增長的時期才認為傳染病在蔓延,那么1/(7是一個閾值,當生>1/(即(T>1/s0)時傳染病就會蔓延.而減小傳染期接觸數(shù)(T,即提高閾值1/6使得s0W1/(T(即(T&1/、),傳染病就不會蔓延(健康者比例的初始值s。是一定的,通常可認為生接近1)。并且,即使s0>1/,減小時,本增加(通過作圖分析),im降低,也控制了蔓延的程度.我們注意到在6=人a中,人們的衛(wèi)生水平越高,日接
16、觸率入越小;醫(yī)療水平越高,日治愈率N越大,于是(7越小,所以提高衛(wèi)生水平和醫(yī)療水平有助于控制傳染病的蔓延.從另一方面看,os=九s.1/N是傳染期內(nèi)一個病人傳染的健康者的平均數(shù),稱為交換數(shù),其含義是一病人被仃s個健康者交換.所以當s0<1/即仃s0M1時必有.既然交換數(shù)不超過1,病人比例i(t)絕不會增加,傳染病不會蔓延。5 .群體免疫和預防:根據(jù)對SIR模型的分析,當生M1/。時傳染病不會蔓延.所以為制止蔓延,除了提高衛(wèi)生和醫(yī)療水平,使閾值1/(7變大以外,另一個途徑是降低s,這可以通過比如預防接種使群體免疫的辦法做到。忽略病人比例的初始值i0有s°=1-r0,于是傳染病不會
17、蔓延的條件s0<1/仃可以表為1ro-1-a這就是說,只要通過群體免疫使初始時刻的移出者比例(即免疫比例)就可以制止傳染病的蔓延。這種辦法生效的前提條件是免疫者要均勻分布在全體人口中,實際上這是很難做到的。據(jù)估計當時印度等國天花傳染病的接觸數(shù)(7=5,至少要有80%勺人接受免疫才行。據(jù)世界衛(wèi)生組織報告,即使花費大量資金提高ro,也因很難做到免疫者的均勻分布,使得天花直到1977年才在全世界根除。而有些傳染病的(7更高,根除就更加困難。6 .模型驗證:支的實際數(shù)據(jù),dt上世紀初在印度孟買發(fā)生的一次瘟疫中幾乎所有病人都死亡了。死亡相當于移出傳染系統(tǒng),有關部門記錄了每天移出者的人數(shù),即有了Ke
18、rmack等人用這組數(shù)據(jù)對SIR模型作了驗證。首先,由方程(12),(14)可以得到包-si-si-sd1dtdt1一.一一.一上式兩邊同時乘以dt可=-ds=ydr,兩邊積分行sr。r°Kr=lns|;=-二=所以:再一加=idts(t)(8)=N(1-r-s)=口(1-r-生力)(9)當rwl/仃時,取(13)式右端eTaylor展開式的前3項得:22-=J(1-r-S00s0r-So)(10)dt2在初始值ro=0下解高階常微分方程得r(t)=j(包二一1):thg一)(11)S0:L2其中口2=(%。1)2+2號i。2,th中=包從而容易由(10)式得出:Ctdr_12dt2so二2ch2。;-)然后取定參數(shù)S0,6
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