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1、如何上傳序列如何上傳序列How to submit sequence劉崇靈2014.3 為什么要上傳序列?為什么要上傳序列? 上傳序列的方法有哪些?上傳序列的方法有哪些? 具體提交步驟是怎樣?具體提交步驟是怎樣?為什么要上傳序列?為什么要上傳序列?v可簡化數據篇幅,用可簡化數據篇幅,用GenBank登錄號代替登錄號代替v可資源共享,便于掌握研究進展可資源共享,便于掌握研究進展v可輕松查找到相關序列信息可輕松查找到相關序列信息 。上傳序列的方法有哪些?上傳序列的方法有哪些?進入進入NCBI主頁主頁從左側列表進入從左側列表進入“Data and software”右側右側“Quick Link”選
2、擇提交方法選擇提交方法上傳序列的方法上傳序列的方法BankitSequin 在線提交在線提交,需注冊,需注冊 適合單個或少量適合單個或少量 序列的提交序列的提交 序列注釋不復雜序列注釋不復雜 需下載軟件需下載軟件 適合批量序列提交適合批量序列提交 更更多多選項和功能,選項和功能, 可以批量修改可以批量修改該兩種方法大同小異,接下來以該兩種方法大同小異,接下來以sequinsequin方法為例介紹。方法為例介紹。用用Sequin提交序列步驟:提交序列步驟:1. 下載下載Sequin軟件,安裝軟件,安裝2. 準備提交前的材料準備提交前的材料3. 運行運行Sequin,并按照要求,并按照要求填填 寫
3、相應內容,保存提交內容寫相應內容,保存提交內容 (.sqn格式)格式)4. 正式提交:將生成的正式提交:將生成的“.sqn” 文件以附件形式發郵件至文件以附件形式發郵件至 , 并簡要說明提交內容。并簡要說明提交內容。1. 下載下載Sequin軟件,安裝軟件,安裝用用Sequin提交序列步驟:提交序列步驟:1. 下載下載Sequin軟件,安裝軟件,安裝2. 準備提交前的材料準備提交前的材料3. 運行運行Sequin,并按照要求,并按照要求填填 寫相應內容,保存提交內容寫相應內容,保存提交內容 (.sqn格式)格式)4. 正式提交:將生成的正式提交:將生
4、成的“.sqn” 文件以附件形式發郵件至文件以附件形式發郵件至 , 并簡要說明提交內容。并簡要說明提交內容。2. 準備提交前的材料準備提交前的材料準備材料準備材料序列序列(Fasta格式)格式)聯系信息聯系信息序列信息序列信息序列文件序列文件 格式必需是格式必需是Fasta,擴展名不限,擴展名不限 序列內容僅為常見的序列內容僅為常見的5種堿基(種堿基(A/T/C/G/U)聯系信息聯系信息注意:注意:聯系信息可保存,聯系信息可保存,并導出為模板。并導出為模板。序列信息序列信息用用excel表列出該序列相關信息表列出該序列相關信息例如:例如:Organism、Isolate/Strain、Country、Collection-date、 Host、Serotype.一般僅在批量提交時需要準備序列信息。一般僅在批量提交時需要準備序列信息。Sequin操作
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