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文檔簡介
1、Trizol法提RNA試劑及材料:Trizol(3號冰箱 4 3層)、三氯甲烷、異丙醇(以上二者在有機廚)、75%乙醇(按DEPC水:無水乙醇=1:3配制)、DEPC水(以上二者在3號冰箱203層)、肺動脈平滑肌細胞儀 器:4離心機、移液槍、Nano drip 2000(微量紫外分光光度儀)、1.5mlEP管、200l EP管、EP管插板、冰盒準備: 1、配制DEPC水:取一個500ml藍蓋瓶,用去離子水洗滌,加入超純水500ml,想瓶中加入DEPC母液0.5ml,震蕩搖勻,在通風廚內常溫過夜,滅活RNA酶,第二天將瓶子蓋擰松,高溫高壓消毒滅菌(121,30min),消毒后分裝在1.5mlEP
2、管中,4保存。2、新鮮標本的保存(備用于RNA提取):取新鮮標本,先放入液氮中,然后凍存于-80。3、動物組織提RNA前處理:用PBS沖洗干凈后,按50-100mg加入1ml Trizol,用電動勻漿器或者一次性研磨杵充分勻漿,最好在冰上進行。注:均質50-100 毫克組織樣本需要 1 毫升的TRIzol 試劑,使用特富龍玻璃或強力均質機 (Polytron, or Tekmars TISSUMIZER TISSUMIZER 或相當的儀器)。均質時樣本體積不應超過TRIzol 試劑體積的10。 b. 單層細胞 直接在培養皿中裂解細胞,3.5 厘米直徑的皿中加入TRIzol 試劑1 毫升,并通過
3、抽吸幾次促進細胞裂解。TRIzol 試劑的添加量基于培養的面積而不是細胞的數目(每10 平方厘米加入1 毫升)。TRIzol 試劑量不足可能會導致分離出的RNA 有DNA 的污染。 步 驟:1. 將處理完的35mm細胞皿從細胞培養箱中取出,用預冷的 PBS 清洗 1-2 次,迅速加入 已經預冷的Trizol液1ml,室溫孵5分鐘。2.收集標本懸浮于1.5ml EP管內,加入200ul三氯甲烷,用手上下震蕩15秒,使之充分混勻成乳狀,室溫孵育3分鐘。3.標本12000rpm,4離心15分鐘(離心機提前預冷),然后小心取出離心管,置于冰上(注意:避免搖晃)。4.用槍頭慢慢吸取上清液(盡可能多吸,但
4、避免吸到中間白色蛋白層),置于一新EP管中。5.向管中加入0.5ml異丙醇,混勻,室溫孵育10分鐘。6.標本再置于離心機內,12000rpm ,4離心10分鐘。7.棄上清,加入事先配好的75%乙醇1ml(用DEPC水和100%乙醇配制),震蕩,7500rpm 4離心5分鐘。8.倒掉上層乙醇,并保持離心管于倒置狀態固定于離心管架上,待酒精揮發干(干燥5-10min即可)。若管壁殘留酒精較多,可用槍頭吸干,但避免吸到RNA沉淀。9.加入20ulDEPC水,槍尖置于液面下吹打3次,混勻。室溫放置5-10分鐘,溶解RNA。10.置于冰上,吸取1ul RNA樣本用紫外核酸蛋白分析儀(14樓)測RNA濃度
5、。評價標準:260/280接近2,不低于1.8才可用。測RNA濃度步驟:準備一管DEPC水(空白對照);a、連接nanodrip2000,打開電腦桌面軟件b、nuclide-TYPE選擇RNA-加1-2ul水- 點擊Blank來進行空白對照檢測并保存參比圖譜,雖然不需要在每個樣品之間進行空白校準,但我們建議在檢測多個樣品時,最好每30min進行一次空白校準。30min后,最后一次做空白檢測的時間將顯示在軟件下面的狀態欄上。c、用無塵紙擦干上下基座上的樣品后,再加1-2ul水-點擊measure,結果應該是差不多為一水平線,吸光值變化應不超過0.04A(10mm光程),顯示濃度在+0.5以內。d
6、 、用無塵紙擦干上下基座上的樣品后,再加入待測RNA溶液1ul,讀數。11.80保存或供逆轉錄用即可。RNA逆轉錄合成cDNA試劑:TakaRa試劑盒(#AK5301)儀器:PCR儀步驟:1.計算RNA需要量:反應體系中所需RNA的量為1000ng,體系為20ul(10ul+10ul)。用200ulEP管,加入RNA的體積為V=1000ng/RNA濃度。剩余體積用無RNA酶的水(試劑盒內有)定容至10ul。樣本 RNA體積 RNA酶Fee H2O1 3.33 6.672 5.53 4.473 5.64 4.36NC 5.47 4.53681 2.62 7.382.配制反應試劑混合液(Takara試劑盒,2號冰箱,20,一層)。RAN Fee H2O 3 185X Prim Buffer 4 24(最后再加)Prim RT Enzyme 1 6Rando引物 1 6Oligo引物 1 6總體積 10 60 (總共配的份數要比需要的多2個體系,原因:有損耗)3.吸取10ul反應混合物加至每管(每管10ul反應試劑混合物+10ulRNA液),混勻后置于冰上,14樓行逆轉錄。(1)37 15分鐘(反應時間)(2)85 5秒鐘(逆轉錄酶失活)(3)4 保存(相當于4冰箱)操作
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